。CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可证(未经同行评审认证)是作者/资助者,他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。
Camille Houdelet、Eva Blondeau-Bidet、Mathilde Estevez-Villar、Xavier Mialhe、Sophie Hermet 等人。指示欧洲海鲈 (Dicentrarchus labrax) 性别和压力的循环微小 RNA:寻找新的生物标志物。海洋生物技术,2023 年,25 (5),第 749-762 页。�10.1007/s10126-023-10237-0�。�hal-04204152�
。CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可证下可用(未经同行评审认证)是作者/资助者,他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者此版本于 2024 年 12 月 18 日发布。;https://doi.org/10.1101/2024.12.17.628987 doi:bioRxiv 预印本
Rosalind Lee、Rhonda Feinbaum 和 V. Ambros (1993) 秀丽隐杆线虫异时基因 lin-4 编码小 RNA
治疗上的miRNA提出了挑战和机遇。因为它们在全球范围内调节基因表达会改变miRNA活性,这可能会恢复疾病状态的正常细胞功能。但是,一个miRNA可以针对数百个mRNA的miRNA网络的复杂性意味着治疗策略必须高度具体,以避免意外后果。一种方法是开发合成miRNA模拟物或抑制剂。miRNA类似物的设计是为了增加癌症等疾病中表达的miRNA的表达,而miRNA抑制剂可用于阻断过表达的miRNA的活性。研究这些基于miRNA的疗法的临床试验仍处于早期阶段,但作为治疗靶标的miRNA的潜力仍然很重要。研究这些基于miRNA的疗法的临床试验仍处于早期阶段,但作为治疗靶标的miRNA的潜力仍然很重要。
最近,有报道称,一种独特的非编码 RNA(称为转移 RNA 衍生的小 RNA (tsRNA))具有多种分子功能,包括在介导免疫的细胞中。由于分子量低,tsRNA 以前很难检测,因此一直被忽视,直到现在。在这篇综述中,我们深入研究了 tsRNA 的生物发生及其多种生物学功能,从转录调控到 mRNA 翻译的调节。我们重点介绍了当前证据表明它们参与免疫反应,以及 tsRNA 如何调节免疫以影响肿瘤生长和扩散、自身免疫性疾病病理和病原体感染。我们推测 tsRNA 可能作为细胞稳态和疾病的诊断标记物,并且 tsRNA 的治疗靶向可能对一系列人类疾病有益。更好地了解 tsRNA 在哺乳动物免疫系统中的功能将使我们能够利用 tsRNA 有效地进行临床治疗以应对人类健康问题。
大规模 RNA 测序和全基因组分析项目的最新进展揭示了一组异质性 RNA,统称为长链非编码 RNA (lncRNA),它们在许多不同的生物过程中发挥着核心作用。重要的是,据报道,lncRNA 的异常表达与多种人类病理学有关,包括多种肾脏疾病。这些观察结果提出了 lncRNA 可能代表肾脏疾病尚未开发的潜在治疗靶点的可能性。然而,关于 lncRNA 的功能及其对肾脏疾病的影响的几个重要问题仍有待仔细解决。在这里,我们概述了 lncRNA 的主要功能和作用机制,以及它们作为肾脏疾病治疗靶点的前景,强调了一些最典型的 lncRNA 在糖尿病肾病的发病机制和进展中的作用。
摘要背景和目的:心脏功能缺陷会导致心脏中细胞外基质蛋白的过度积聚。本研究旨在使用机器学习算法研究和分析与心脏纤维化有关的 miRNA。方法:从公共来源和相关临床数据库收集与健康个体和心脏纤维化患者中 miRNA 表达相关的数据集。我们选择了 50 人作为研究对象,其中包括 25 名健康对照者和 25 名心脏纤维化患者。采用不同的机器学习算法,包括支持向量机、随机森林和人工神经网络来分析、分类和预测 miRNA 表达变化在心脏纤维化中的作用。通过留一交叉验证和独立数据集对机器学习模型的验证有效地支持了结果的稳健性。报告的准确性、敏感性和特异性指标令人印象深刻。结果:两组间共发现 78 个 miRNA 存在差异表达(调整 P < 0.05),与对照组相比,心脏纤维化组有 47 个 miRNA 上调,31 个 miRNA 下调。比较每种方法选出的前 10 个 miRNA,并确定一组一致的 5 个 miRNA(miR-21-5p、miR-29a-3p、miR-29c-3p、miR-30b-5p 和 miR-133a-3p)作为区分心脏纤维化和对照样本最具参考价值的特征。结果显示,与对照组相比,心脏纤维化患者的 miR-21-5p、miR-29a-3p 和 miR-29c-3p 表达增加。相反,与患者相比,正常受试者中 miR-30b-5p 和 miR-133a-3p 的表达增加。发现具有径向基函数核的 SVM 算法是性能最佳的模型,其准确率为 92%,灵敏度为 88%,特异性为 96%,受试者工作特征曲线下面积 (AUC-ROC) 为 0.95。结论:总体而言,对患者体内 miRNA 的评估可作为监测患者和应用治疗策略的生物标志物。关键词:miRNA、心脏纤维化、机器学习、网络分析、生物标志物资金:无*本作品已根据 CC BY-NC-SA 许可发表。版权所有 © 作者引用本文为:Amin A、Rashki Ghalehnoo S、Mohajerian A、Samadi P、Torabahmadi A、Ahadi S、Hasanvand A、Nikdoust F。评估与心脏纤维化有关的 miRNA:基于机器学习的方法。伊朗红新月会医学杂志。2024,54.1-10。
收到的原件:10/01/2024出版接受:10/25/2024 Arlan Silva Freitas理解机构:EstacioSãoLuís中心SãoLuís,Maranhão,Brazil e-Mail:Mail e-Mail:Mail:Mail:Mail:Mail:Mail e-Mail:arlanfreitas@gmail.com@gmail.com rozenne kerley collo collo collo copi copi copie copi cairo:教授rozenne@gmail.com摘要Micronor(miRNA)是小的RNA片段,在调节基因表达中起着至关重要的作用,并参与了各种生物学过程,包括神经退行性疾病的发展。它们通过与信使RNA分子(mRNA)结合起作用,从而抑制蛋白质产生,从而影响细胞功能。最近的研究将miRNA与阿尔茨海默氏症和帕金森等疾病等疾病相关联,表明它们在这些疾病的病理中的重要性。本文献综述的工作探讨了miRNA的生物发生,详细介绍了其作用机理,并检查了其在基因调节中的作用。此外,它讨论了DNA甲基化与miRNA的表达之间的相互关系,表明表观遗传变化会影响这些调节剂的活性。miRNA脱颖而出,成为潜在的生物标志物,可能有助于早期诊断和监测神经退行性疾病。还考虑了有希望的治疗靶标,表明操纵其信号通路可以导致更有效的治疗的发展。因此,miRNA成为理解这些疾病基础机制的关键分子,开辟了有关创新和个性化治疗干预措施的新观点,不仅旨在减轻症状,还旨在调节病理学过程
摘要。除了化疗外,靶向疗法已被批准用于治疗局部晚期和转移性胃癌。治疗效果显著,但应实现更持久的反应和生存率的提高。因此,确定新的靶点和新的临床治疗方法至关重要。在这篇综述中,我们在文献中搜索了干扰可用药靶点并在临床前体内疗效模型中表现出疗效的下调 microRNA。作为可用药靶点,我们选择了跨膜受体、分泌因子和酶。我们确定了 38 个符合所述标准的 microRNA。共有 13 个 miR 靶向跨膜受体,9 个抑制分泌蛋白,16 个减弱酶。这些 microRNA 是胃癌重建治疗的靶点。对于所有已确定的 microRNA,必须进行进一步的靶点验证实验。胃癌 (GC) 是全球第三大癌症病因,也是第四大常见癌症,全球每年死亡人数为 700 000 人 (1)。从分子角度来看,已鉴定出以下亚型:Epstein–Barr 病毒、微卫星不稳定性、