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World File Search SystemNextSeq
NextSeqtm 1000和NextSeq 2000
文库，并比较了NextSeq 2000和Miseq系统之间的测序性能。在图书馆准备过程中，使用IDT进行Illumina DNA/RNA UD索引设置A到D，使用户可以生成384 16S库。在NextSeq 1000/2000 P2 300M试剂套件（600个周期）上运行384 16S库，具有标准SBS化学或NextSeq 1000/2000 P2 Xleap-SBS™试剂盒（600个循环），每样品可用于分类级别的每样品，以产生100,000至200,000的读取。用户可以在NextSeq 1000/2000 P2 300M试剂盒（600个循环）和400m读取的NextSeq 1000/2000 P2 XLEAP-SBS Reagent套件（600 Cycles）上生成300m总读取。NextSeq 1000/2000 P1 XLEAP-SBS试剂盒（600个循环）和NextSeq 1000/2000 P2 Xleap-SBS试剂盒（600个周期）的测序运行时间为34小时。相比，Miseq Reagent Kit V3（600个周期）的Miseq系统上的测序运行时间〜56小时。
20653医疗单
Next Generation Sequencing: Manual Process Eppendorf Concentrator Plus ABI 7500 Fast Real-Time PCR System Thermal cycler Qubit Tapestation 2200 Tapestation 4200 Fluoroskan microplate fluorometer Illumina NextSeq 500 NGS platform Illumina NextSeq 550Dx NGS platform Illumina NovaSeq 6000 NGS platform GEN-SOP-212 GEN-SOP-213 GEN-SOP-214 Gen-SOP-169 Gen-SOP-144 Gen-SOP-164基因组DNA，CTDNA和RNA从列出的样本类型中提取的房屋中提取，并从外部来源收到的样品作为主要样品
病毒监视面板V2病毒监视面板V2
富含病毒监视面板V2的库的较低读取深度要求允许多个测序系统选项，包括台式Miniseq™，Miseq™，NextSeq™550，NextSeq 1000和NextSeq 2000 Systems。病毒滴度，核酸样品质量，样品读取深度以及每个样品的读数影响病毒特异性读取和获得的序列覆盖范围的数量。良好质量样品的一般测序读取深度建议至少为每个样品总读数为2m，读取长度为2×150 bp。推荐的样品读取深度也随样本类型而变化。对于更复杂的样品（例如废水），建议至少每样品总读取800万。大量的脱靶读数。
将AVITI带到MSU基因组核心
•基因组分析仪•基因组分析仪II•Miseqs•HISEQ 2500•HISEQ 4000和NEXTSEQ 500•NOVASEQ 6000•NOVASEQ X
Illumina数据分析指南
Illumina在Imlumina平台上测序在Illumina平台上测序的cleanplex amplicon库工作流程设置建议建议使用Illumina的本地运行经理（LRM）DNA Amplicon分析模块进行分析。LRM DNA扩增子分析模块v2.1.0可在ISEQ（控制软件V1或V2），Miseq（MCS V3），NextSeq 500/550（NCS 4.0）和NextSeq 500DX（NCS 4.0）上获得。LRM DNA扩增子分析模块v3.0.0.14可在Miseq（MCS v4.0）上获得。这些说明是一个简单的摘要，描绘了如何为已经完成的运行设置分析，或设置新运行以包括分析。样品必须通过基因组进行分析以进行分析：如果在一个测序运行中存在不同的基因组，则只能设置新运行以用一个基因组进行运行分析。但是，这些样品可以在同一运行中进行测序，然后通过基因组分批分析。如果测序运行中的所有样本均来自同一基因组，则用户可以使用任何一种分析方法。此模块对齐扩增子读取针对清单文件中指定的参考，并要求变体针对目标区域。工作流程还产生了运行质量和覆盖信息的摘要报告。有用的提示和资源：●有关其他详细信息和故障排除，请参阅Illumina的最新本地运行经理DNA
Dovetail®Micro -C Kit用户指南 - 版本1.2
Dovetail®，DovetailGenomics®和Hirise®是美国和/或其他国家的Cantata Bio LLC的全资子公司Dovetail Genomics，LLC的商标。iLlumina®，HISEQ®，Miseq®，Miniseq®，ISEQ®，NextSeq®，NovaseQ®是Illumina，Inc。的注册商标。BeckmanCoulter™和Spriselect®是Beckman Coulter，Inc.Qubit®的商标或注册商标。Tapestation®和Bioanalyzer®系统是安捷伦技术的注册商标。Invitrogen®是Thermo Fisher Scientific Inc.的注册商标
在...
Biology: - Extraction of nucleic acids from human and environmental matrices - Preparation of essays in molecular biology (QPCR, DDPCR, DGGGE -PCR, PMA -QPCR) - Cellular crops - Cytotssicity test on cellular models of environmental matrices - Ames test - Preparation of analysis of Next Generation Sequencing (ION TORRENT ABD illuminates Nextseq 1000/2000) - 微生物培养物-MALDI -TOF质量光谱法 - 对抗生素的敏感性测试（磁盘扩散） - 实验室活动期间对学员的培训 - 书目研究
实现基于基因组的诊断
MiSeqDx、1 NextSeq 550Dx 2 和 NovaSeq 6000Dx 3 仪器具有易于遵循的工作流程和集成软件，可以进行准确、可靠的筛查和诊断测试。它们都基于我们成熟的NGS技术和合成测序（SBS）化学（图1、表1）。使用这些仪器，临床实验室可以开发、验证和执行自己的 NGS 测试，运行 Illumina 或第三方检测，并在办公室外研究 (RUO) 模式下开展各种临床研究应用（图 2）。
对于 TakeCare 实验室分析的取样人员
家族性高胆固醇血症（FH）的基因研究。调查包括两个阶段：1)卡罗琳斯卡 FH 面板，这是一种 SNP 面板测试，使用 Agena MassARRAY 系统和 iPLEX Gold 化学方法（根据 SWEDAC 的 ISO/IEC 17025 认证）分析三个最重要的 FH 基因中已知的 119 个突变和缺失。 2) 使用卡罗琳斯卡 FH 面板未发现突变的样本将使用 Devyser 的 FH v2 扩增子测序方法和 Illumina 的 NextSeq 仪器进行进一步分析。根据样本类型选择分析：血液、纯化 DNA 或唾液。
金刚，本杰明
摘要 简介 2 级和 3 级胶质瘤（G2/3 胶质瘤）合起来是成人中第二大恶性脑肿瘤群体。G2/3 胶质瘤的进展结果接近胶质母细胞瘤 (GBM) 的惨淡结果，但与 GBM 患者相比，澳大利亚复发性 G2/3 胶质瘤患者的试验很少。LUMOS 将是一项针对复发性 G2/3 胶质瘤患者的试点综合研究，旨在根据对同时期肿瘤组织的分子筛查，为患者匹配靶向疗法。未发现可操作或可用药物治疗的突变或没有匹配药物的参与者将组成对照组并接受标准治疗化疗。 LUMOS 试验的目的是在澳大利亚五个地点进行多中心研究，评估这种方法的可行性，旨在建立一个国家分子筛查平台，以同时期组织活检的突变分析为指导进行患者治疗。方法与分析本研究将是一项多中心试点研究，招募复发性 2/3 级胶质瘤患者，这些患者在诊断时或首次复发时曾接受过放疗和化疗。将从患者体内获取首次复发时的同龄肿瘤组织，定义为复发后 6 个月内且未接受后续干预治疗的组织。分子筛查将在参考实验室（PathWest，澳大利亚珀斯）通过靶向下一代测序进行。在病理学家审查组织学后，将从代表性的福尔马林固定石蜡包埋组织卷轴中提取 RNA 和 DNA，或从玻璃载玻片组织切片上进行显微切割。提取的核酸将通过 Qubit 荧光定量（赛默飞世尔科技）进行定量。根据制造商的说明，将使用 TruSight Tumor 170 (TST170) 试剂盒和在 NextSeq 550 (Illumina) 上测序的样本进行文库制备和靶向捕获，使用 NextSeq V.2.5 高输出试剂。