文库,并比较了NextSeq 2000和Miseq系统之间的测序性能。在图书馆准备过程中,使用IDT进行Illumina DNA/RNA UD索引设置A到D,使用户可以生成384 16S库。在NextSeq 1000/2000 P2 300M试剂套件(600个周期)上运行384 16S库,具有标准SBS化学或NextSeq 1000/2000 P2 Xleap-SBS™试剂盒(600个循环),每样品可用于分类级别的每样品,以产生100,000至200,000的读取。用户可以在NextSeq 1000/2000 P2 300M试剂盒(600个循环)和400m读取的NextSeq 1000/2000 P2 XLEAP-SBS Reagent套件(600 Cycles)上生成300m总读取。NextSeq 1000/2000 P1 XLEAP-SBS试剂盒(600个循环)和NextSeq 1000/2000 P2 Xleap-SBS试剂盒(600个周期)的测序运行时间为34小时。相比,Miseq Reagent Kit V3(600个周期)的Miseq系统上的测序运行时间〜56小时。
废水监视已成为公共卫生流行病学中的关键工具。特别是由19009年大流行的催化,现代文化独立的测序方法由于能够提供全面的观点而变得必不可少。在这项研究中,我们提出了一种创新的,综合的方法,用于同时病原体检测,抗菌耐药性(AMR)监测以及废水系统中的功能分析。通过利用Zymo Research提供的先进样品制备技术并利用PACBIO ONO SO-READ-READ测序,我们的目标是提高我们对废水环境中微生物动力学的理解。