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Illumina在Imlumina平台上测序在Illumina平台上测序的cleanplex amplicon库工作流程设置建议建议使用Illumina的本地运行经理（LRM）DNA Amplicon分析模块进行分析。LRM DNA扩增子分析模块v2.1.0可在ISEQ（控制软件V1或V2），Miseq（MCS V3），NextSeq 500/550（NCS 4.0）和NextSeq 500DX（NCS 4.0）上获得。LRM DNA扩增子分析模块v3.0.0.14可在Miseq（MCS v4.0）上获得。这些说明是一个简单的摘要，描绘了如何为已经完成的运行设置分析，或设置新运行以包括分析。样品必须通过基因组进行分析以进行分析：如果在一个测序运行中存在不同的基因组，则只能设置新运行以用一个基因组进行运行分析。但是，这些样品可以在同一运行中进行测序，然后通过基因组分批分析。如果测序运行中的所有样本均来自同一基因组，则用户可以使用任何一种分析方法。此模块对齐扩增子读取针对清单文件中指定的参考，并要求变体针对目标区域。工作流程还产生了运行质量和覆盖信息的摘要报告。有用的提示和资源：●有关其他详细信息和故障排除，请参阅Illumina的最新本地运行经理DNA
Illumina数据分析指南
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