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家族中的新型病毒Iflaviridae和Partitiviridae与公共东部萤火虫Photinus pyralis
A.pylalis iflavirus的序列信息的注释图1。该图的顶部代表10,561bp的基因组，每个KB在5'至3'方向上指示。显示了多蛋白的ORF的位置以及该动物酸序列的程度。该图的底部显示了核域和登录数，包括病毒外套蛋白，解旋酶和RNA依赖性RNA聚合酶。B.具有分支支持值的昆虫特异性iflavirus多蛋白氨基酸序列的系统发育。PPIV1以橙色显示。C. partiti样病毒的序列信息的注释图。分别显示了两个片段，以及分别为RDRP编码的ORF和每个段上的假设蛋白。在图的底部显示了Interpro域和登录号。
构建富含棕榈酰化 ACE2 的细胞外囊泡作为 COVID‐19 疗法
由一种新型严重急性呼吸综合征冠状病毒 2 (SARS-CoV-2) 引起的 2019 冠状病毒病 (COVID-19) 疫情不断扩大，已导致全球超过 430 万人死亡，引起了重大的公共卫生问题。[1–3] 最近在印度出现和传播的新型 SARS-CoV-2 谱系 B.1.617 与 COVID-19 的爆发和持续恶化有关。刺突蛋白中特定突变 L452R、E484Q 和 P681R 的组合可能增强传染性和免疫逃逸。鉴于 COVID-19 的规模和迅速传播，迫切需要有效的治疗策略。SARS-CoV-2 是一种正义 RNA 病毒，具有较大的单链 RNA 基因组，[4] 含有多个开放阅读框 (ORF)，编码结构蛋白刺突-包膜-膜-核衣壳和附件
上游开放阅读框的基因组编辑启用...
通过上游开放式阅读框（UORF）的翻译调节已成为控制从下游初级ORF（PORFS）1-5合成的蛋白质量的一般机制。我们发现，植物中内源性UORF的基因组编辑能够调节来自四个porfs的mRNA的翻译，这些porfs涉及发育或抗氧化生物合成。针对具有UORF启动密码子的区域的单个指定RNA可以产生多个突变。UORF编辑后，我们观察到四个porfs中的mRNA翻译数量不同。值得注意的是，编辑了LSGGP2的UORF，该UORF在生菜中编码了维生素C生物合成的关键酶，不仅增加了氧化应激耐受性，而且增加了抗坏血酸含量的含量约150％。这些数据表明，编辑植物UORFS提供了一种可推广，有效的方法来操纵mRNA的翻译，可用于剖析生物学机制并改善农作物。
食品与功能
严重急性呼吸综合征冠状病毒 2 (SARS-CoV-2) 被世界卫生组织 (WHO) 命名为 2019 冠状病毒病 (COVID-19)。1 这种呼吸道病毒已在世界范围内造成严重局势，并对成人和儿童群体产生持久的负面影响。2,3 SARS-CoV-2 属于感染脊椎动物的有包膜正链 RNA 病毒家族。4 其基因组由 14 个功能性开放阅读框 (ORF) 组成，其中包括编码非结构蛋白 (NSP) 以及辅助蛋白和结构蛋白的区域。5 当这种病毒感染宿主细胞时，ORF1a 和 ORF1b 分别通过核糖体移码翻译为多聚蛋白 pp1a 和 pp1ab。 6 然后，NSP 由两种病毒蛋白酶的作用形成，即主蛋白酶 (Mpro)，也称为胰凝乳蛋白酶样蛋白酶 3CLpro，以及木瓜蛋白酶样蛋白酶 (PLpro)。最后，具有少量宿主因子的 NSP 是病毒基因组复制的主要参与者，并且
研究入学考试（RET）的教学大纲...
第1节：研究方法显微镜技术：光，相比，荧光，共聚焦，扫描和传播电子显微镜，细胞测量法和流式细胞仪，固定和染色，荧光内杂交（FISH），GISH（GISH（GISH），基因组中的基因组合杂交）。使用分子方法访问微生物多样性，例如剥落梯度凝胶电泳（DGGE），温度梯度凝胶电泳（TGGE），扩增的RRNA限制分析，终末限制性片段长度多态性（T-RFLP），16S rdna测序，Metagenomics to BiioInmics and Intermins（Ww Ww Ww Ww） HTML, URLs, Netscape, Explorer, Google, PUBMED), database management system, database browsing, data retrieval, sequence and genome database, databases such as GenBank, EMBL, DDBJ, Swissprot, PIR, TIGR, TAIR, Searching for sequence database like FASTA and BLAST algorithm, multiple sequence alignment, phylogenetic analysis and detection of open reading帧（ORF）。
lbcas12a介导的棉叶卷曲的抑制作用
begomovirus具有传染性，并且严重影响了商业上重要的食物和粮食作物。棉叶卷曲的木木病毒（Clcumuv）是巴基斯坦棉花病毒最主要的特征之一，是对棉花产量的主要限制。目前，植物基因组编辑领域正在通过CRISPR/CAS系统应用（例如基础编辑，主要编辑和基于CRISPR的基因驱动器）进行革命。CRISPR/CAS9系统已成功用于模型和作物植物中的概念概念研究，以针对生物和非生物植物应力。CRISPR/CAS12和CRISPR/CAS13最近已在植物科学中应用于基础和应用研究。在这项研究中，我们使用了一种新型的方法，基于CRRNA的CAS12A工具箱，同时在多个位点靶向Clcumuv基因组的不同ORF。这种方法成功地消除了烟熏本尼亚娜和烟草的症状。从Clcumuv基因组设计了三个单独的CRRNA，针对四个不同ORF（C1，V1和C2和C3重叠区）的特定位点。基于CAS12A的构建体Cas12a-MV是通过金门三向克隆设计的，用于精确编辑Clcumuv Genome。cas12a-MV构建体是通过使用引物UBI-Intron-F1和M13-R1的整个基因组测序来确认的。通过农业纤维化方法，在4周大的尼古蒂亚纳本田植物中进行了瞬态测定。sanger测序表明，CAS12A-MV构建体在病毒基因组的靶位点上产生了相当大的突变。此外，对Sanger测序结果的潮汐分析显示了CRRNA1（21.7％），CRRNA2（24.9％）和CRRNA3（55.6％）的编辑效率。此外，Cas12a-MV构建体通过叶盘方法稳定地转化为烟草Tabacum，以评估转基因植物对Clcumuv的潜力。进行转基因分析，对烟草的转基因植物的DNA进行了PCR，以扩大具有特定底漆的Cas12a基因。传染性克隆在感染性测定中的转基因和非转基因植物（对照）中被农民接种。与具有严重症状的对照植物相比，含有Cas12a-MV的转基因植物表现出少数症状，并且保持健康。与对照植物相比，含有CAS12A-MV的转基因植物显示出病毒积累的显着降低（0.05）（1.0）。结果表明，多重LBCAS12A系统的潜在用途在模型和作物植物中针对贝诺维病毒中发展病毒抗性。
分析了地方性环境中的瘟疫反刍动物病毒（PPRV）暴发的时空风险：范围审查
1。引言一种称为Peste des Petits反刍动物（PPR）的病毒会影响小型反刍动物，主要是绵羊和山羊，但它也会感染家畜。PPR病毒（PPRV）是paramyxoviridae属的菌群的单链，非分段的RNA病毒（1）。PPRV的基因组跨越15,948个核苷酸（NT），并结构为六个开放式阅读帧（ORF）。由这些ORF编码的六种结构蛋白是聚合酶（P）或大蛋白（L），融合蛋白（F），磷酸蛋白（P），基质蛋白（M），黑凝集素蛋白（H）和核蛋白（N）。此外，非结构蛋白C和V由ORF转录单元（2）编码。通过使用部分基因序列的系统发育研究，通过系统发育研究从两种结构蛋白N或F中描述了四个谱系（3）这些PPRV的谱系分布在包括非洲，亚洲和欧洲在内的几个地理区域中（4）。所有四个PPRV谱系都存在于非洲，自1940年以来，西非国家一直局部局部病毒。当前的证据表明，谱系I病毒不再循环，因为自2001年以来就没有发现这种血统（5）。血统II主要出现在西非，尽管最近在刚果民主共和国（DRC）和坦桑尼亚报道了这一点（6）。北部和西部的北部都没有报道谱系III，尽管在科莫罗斯群岛以及东北，东部和中非都可以找到它。非洲最常见的血统IV已在15个不同的国家中记录在第15个国家中。（6）。迄今为止，它已在非洲的北部，西部，中部和东部地区进行了确定，并且正在逐渐向南移动。随着PPRV继续散布在以前未感染的地区，数以千万万的家庭小型反刍动物和野生动植物面临感染的风险。但是，在以前未感染的地区发现的PPRV感染以及被感染的国家的谱系混合物共同强调了PPR的地理和时间动态特征（7）。年度全球经济损失估计，这些损失的年度经济损失约为1.45美元，这些损失的一半，这些损失的一半，这些损失影响了非洲和一季度的ASIA。这些损失是由死亡率造成的，死亡率最高为20％，而发病率达到100％（8,9）。由于对绵羊和山羊农民的高影响力PPR，粮食和农业组织（FAO）和世界动物健康组织（以前称为OIE）已正式启动了一项全球旨在消除PPR的计划。
B细胞恶性肿瘤的正向和反向遗传学 硝酸盐对高血压患者口服微生物组和唾液生物标志物的影响 潮汐流与风能：与混合系统中短期存储结合使用的循环功率的值
癌症基因组测序已鉴定出数十个突变，在淋巴作用和白血病发生中起作用。验证负责B细胞肿瘤的驱动突变的验证是值得研究的突变体积以及由B细胞发育不同阶段引起的多个突变的复杂方式而变得复杂的。小鼠的正向和反向遗传策略可以提供对人类驱动基因的互补验证，在某些情况下，这些模型的人肿瘤的比较基因组学指导了对人类恶性肿瘤中新驱动因素的鉴定。我们回顾了使用插入诱变，化学诱变和外显子组测序进行的前向遗传筛选的集合，并讨论如何使用人类肿瘤基因组识别插入性诱变筛查中插入性诱变筛查中的高渗透覆盖范围如何鉴定在无法使用人类肿瘤基因组的速度下进行合作的突变。我们还比较了一组从PAX5突变小鼠中进行的独立进行的筛选，该筛网会在人类急性淋巴细胞性白血病（ALL）中观察到的一组常见突变集合。我们还讨论了使用CRISPR-CAS，ORF和SHRNA的反向遗传模型和筛选，以提供高吞吐量的体内证据，以实现致癌功能，重点是使用经体培养细胞的收养转移模型。最后，我们总结了在体内环境中提供候选基因的时间调节的小鼠模型，以证明其编码蛋白作为治疗靶标的潜力。
非洲猪瘟病毒质粒库 - CGSpace
非洲猪瘟病毒 (ASFV) 是一种大型、复杂的 DNA 病毒，属于 Asfarviridae 科，可引起非洲猪瘟 (ASF)，这是一种影响家猪和野猪种群的高致命疾病，死亡率高达 100%。这种疾病最初在非洲和撒丁岛流行，现已蔓延至全球，造成重大经济损失。尽管进行了广泛的研究，但全球尚未有有效的 ASFV 商业疫苗，这促使人们继续努力了解该病毒的遗传和功能特性。质粒是一种小的环状 DNA 分子，通过实现克隆、基因表达和蛋白质生产，在研究中发挥着至关重要的作用。本报告介绍了 ASFV 质粒库和相应数据库的开发，以支持 ASF 疫苗开发、基因功能分析和蛋白质表征方面的研究工作。该库包含编码 161 个 ASFV 开放阅读框 (ORF) 的质粒，这些质粒在 CMV 启动子的控制下克隆。质粒库有助于抗原筛选和功能测定，质粒内的限制酶位点可用于克隆和表达研究，确保 ASFV 研究的多功能性和可重复性。该质粒库的开发是加速 ASF 疫苗研究和推进分子研究的重要资源。它还为其应用于其他微生物奠定了基础，增强了其在更广泛的传染病研究中的实用性。
对二倍体和四倍体菊花中的细胞器基因组的比较分析及其亲戚
菊花含量，东亚本地的一种物种众所周知，是耕种的菊花的祖细胞之一，该物种以其观念和药用价值而生长。先前关于菊花的基因组研究在分析该植物谱系时，很大程度上忽略了质体基因组（质体）和线粒体基因组（有丝分裂基因组）的动力学。在这项研究中，我们测序并组装了二倍体和四倍体C的质体和有丝分裂组。芳香。我们使用了来自27种具有质体和有丝分裂组完整序列的数据，以探索细胞器基因组之间序列演化的差异。二倍体和四倍体C中的细胞器基因组的大小和结构通常相似，但四倍体C. indimum和C. indimum var。芳香族在有丝分裂组中包含独特的序列，这些序列还包含先前未描述的开放式阅读框（ORF）。跨菊花有丝分裂组的结构变化很大，但是从质体转移到有丝分裂基因组的序列得到了保存。最后，有丝分裂基因组和质子基因树之间观察到的差异可能是这两个基因组中基因之间序列演化速率差异的结果。总共提出的发现大大扩展了研究菊花细胞器基因组进化的资源，并可能在将来可以应用于保护，育种和基因库。