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nelisa：高通量，高质量平台可实现秘密对象的定量分析
摘要我们介绍了Nelisa，这是一个微型，高通量和高保真蛋白质分析平台。DNA寡核苷酸用于在光谱编码的微粒上预启动抗体对，并执行位移介导的检测，同时确保在非同源抗体对之间的空间分离。使用流式细胞术在高通量上进行成本效益，并在高通量上进行。我们组装了一个由191个目标组成的炎症面板，这些炎症面板多重地多路复用，而没有交叉反应性或对性能与1 plex信号的影响，其灵敏度低至0.1pg/ml，并且在平台上的测量值跨越8个幅度。然后，我们进行了一个大规模的PBMC分泌组筛选，具有细胞因子为肌扰动物和读出，测量了7,392个样品，一周不到一周的时间生成约1.5m蛋白质数据标记，与其他高度多重的免疫仪相比，吞吐量的显着进展。我们发现了447个显着的细胞因子反应，包括多个推测的细胞因子反应，这些反应在供体中保守和刺激条件。我们还验证了其在表型筛查中的用途，并提出了Nelisa在药物发现中的应用。
浆细胞的无细胞DNA分析阐明了新型机制...
核DNA的片段通过各种细胞死亡在生物流体中以无细胞的DNA（CFDNA）释放。在该项目中，我们通过研究细胞类型 - 特定的DNA甲基化模式来确定神经脊髓炎谱障碍（NMOSD）患者的血浆CFDNA来源。nmoSD是中枢神经系统（CNS）的一种自发疾病，其特征是在视神经和脊髓中主要观察到严重的炎症。NMOSD中血浆CFDNA的主要来源揭示为中性粒细胞。进一步的分析表明，源自NMOSD的血浆CFDNA在外周血单核细胞（PBMC）中增强了Type1干扰素的表达，从而阐明了中性粒细胞在建立NMOSD免疫特征的基础中的新作用。我们识别生物流体CFDNA起源的生物信息学方法是一种强大的方法，可以应用于各种类型的疾病，并有望阐明新型的病原机制。
复发性慢性淋巴细胞白血病的功能测试可指导精准医疗并绘制反应和耐药机制。指示病例
复发性慢性淋巴细胞白血病 (CLL) 经过靶向疗法的序贯治疗后预后不佳，代表着日益未得到满足的医疗需求。1,2 嵌合抗原受体 T 细胞 (CAR-T) 疗法或双特异性抗体等免疫疗法在这种情况下可能有效，但临床试验之外的患者不易获得。3 对肿瘤细胞进行直接药物测试可以表明治疗的弱点，4 在侵袭性难治性血液系统恶性肿瘤的治疗决策中实施这种方法可以改善治疗。5 因此，阐明多药难治性 CLL 的治疗敏感性可能会为该患者群体提供新的治疗概念。事实上，我们证明了体外对蛋白酶体抑制的敏感性，为在接受伊布替尼、艾代拉里斯、阿仑单抗和维奈克拉/利妥昔单抗治疗后复发的 CLL 指示病例中使用超说明书用药的枸橼酸伊沙唑米布提供了基础。我们报告了使用质谱流式细胞术、流式细胞术、体外杀灭试验和药物敏感性测试对指示患者在治疗前、治疗期间和治疗后 7 个时间点采集的外周血单核细胞 (PBMC) 进行的高分辨率细胞和功能分析。我们的研究结果可能表明疾病对治疗有反应和无反应状态的分子和细胞决定因素，并强调了直接药物测试在确定复发性 CLL 的有效个性化疗法方面的临床价值。在样本采集前已获得书面知情同意。该研究得到了挪威东南部地区医学和卫生研究伦理委员会的批准。指示患者在 70 岁时被诊断出患有 CLL。该疾病表现为未突变的 IGVH、突变的 TP53 和纯合的 del(13q14)。他的治疗史如图 1A 所示。患者对依鲁替尼和艾德拉利西布不耐受，随后接受阿仑单抗治疗，病情稳定 (图 1A)。病情进展后，CLL 接受维奈克拉/利妥昔单抗治疗，患者获得完全缓解 (CR)，微小残留病 (uMRD) 无法检测 (图 1A)。此时，治疗停止 (图 1A)。停止治疗近 2.5 年后，疾病复发，并伴有严重的骨髓衰竭。再次使用维奈克拉治疗失败 (图 1A)。从患者身上采集了连续外周血样本 (图 1A)。在 T1 收集的 PBMC（伊布替尼治疗后
MEK抑制剂在黑色素瘤细胞中的抗性
背景：本研究的目的是研究含有受体（KDR）遗传变异的激酶插入结构域对接受apatinib的化学疗法转移性转移性结直肠癌（CRC）患者治疗和安全性的影响。方法：总共有108例接受apatinib治疗的化学疗法转移性CRC患者回顾性地参与了这项研究。评估了患者治疗的功效。进行了预后，分别记录了安全性。分别获得了患者的血液标本和外周血单核细胞（PBMC），分别用于分析遗传变异和KDR基因mRNA Expres sion。提出了基因型状态与临床结果之间的关联。结果：108例接受Apatinib治疗的转移性CRC患者的客观缓解率（ORR）和疾病控制率（DCR）分别为5.6％和69.4％。生存分析结果表明，108例转移性CRC患者的无进展生存期（PFS）和总生存期（OS）为3.6个月（95％置信区间（CI）：3.03–4.17个月）和8.9个月（分别为95％CI：7.57-10.23个月）。随后，对KDR遗传变异的分析表明RS2071559具有临床意义。RS2071559的次要等位基因频率为0.22，基因型状态与Hardy-Weinberg平衡相对应（P = 0.949）。此外，两种基因型患者的中位OS分别为10.5和6.1个月（p = 0.007）。通过TC和CC基因型患者的组合，以主要的遗传方式进行预后和裂解，表明TT基因型和TC/CC基因型患者的中位PFS分别为4.1和3.0个月（P = 0.012）。此外，OS的多元COX回归分析表明，TC/CC基因型是OS的独立因素（危险比（HR）= 0.65，P = 0.021）。有趣的是，mRNA表达分析表明，根据RS2071559基因型状态，KDR在PBMC中的mRNA表达显着差异（P <0.001）。结论：apatinib对化学疗法 - 耐药性转移性CRC的患者表现出了潜在的优质临床结果。KDR多态性RS2071559可以用作接受Apatinib治疗的CRC患者预后评估的潜在生物标志物。关键字：结直肠癌，apatinib，含有受体的激酶插入结构域，遗传变异，生物标志物，临床结果，安全
第五国际Kat6a和Kat6b会议
iPSC，源自患者细胞并将其重编程为胚胎状状态，可以分化为各种细胞类型。这个过程需要几个月的时间，始于收集患者样本，尤其是血液样本，以分离外周血单核细胞（PBMC）。这些细胞被培养并重新编程为IPSC，该细胞受到质量控制，以确保成功重编程。IPSC银行的目的和好处Williams解释说，与动物研究相比，IPSC允许研究受影响的组织，这些组织本来很难获得并为人类疾病提供更好的模型。IPSC银行位于波士顿大学再生医学中心（CREM）中，是一个开放式资源。该计划旨在最大程度地减少研究人员通过共享这些资源来建立细胞系的时间，从而加速研究。
血液学，输血和细胞疗法
缩写：EBIS，红细胞岛； EMP，红细胞巨噬细胞蛋白； EPO，红细胞生成素； EPOR，促红细胞生成素受体； FPN1，铁蛋白1; HMOX-1，血红素加氧酶-1； HRG-1，血红素响应基因1； ICAM-4，细胞间粘附分子4; ICAM-4S，细胞间粘附分子4分泌； IGF1，胰岛素样生长因子； ITIM，免疫受体酪氨酸抑制基序； KLF1，类似Kruppel的因子1； MFG-E8，牛奶 - 脂肪 - 球蛋白E8; PBMC，外周血单核细胞； PS，磷脂酰丝氨酸； PSC，多能干细胞； RBC，红细胞； RPM，红色果肉巨噬细胞； SCD，镰状细胞疾病； SHP，SRC同源区2含域的磷酸酶； TRF，转铁蛋白； VCAM-1，血管细胞粘附蛋白1 *通讯作者在：坎皮纳斯大学，Unicamp，Campinas 13083-970，SP，巴西。电子邮件地址：renata.sesti@gmail.com（R。Sesti-Costa）。 https://doi.org/10.1016/j.htct.2022.07.002 2531-1379/2022Associaçãobrasileirade hemotologia，Shemoterapia e terapia e terapia celular。 由ElsevierEspaña，S.L.U。出版 这是CC BY-NC-ND许可证（http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/）下的开放访问文章。电子邮件地址：renata.sesti@gmail.com（R。Sesti-Costa）。https://doi.org/10.1016/j.htct.2022.07.002 2531-1379/2022Associaçãobrasileirade hemotologia，Shemoterapia e terapia e terapia celular。由ElsevierEspaña，S.L.U。出版这是CC BY-NC-ND许可证（http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/）下的开放访问文章。
口服免疫疗法中的过敏原B细胞反应 -
缩写：ABS，抗体； BCl-6，B-细胞淋巴瘤6; Bcl-XL，B-细胞淋巴瘤 - 超大； BCR，B细胞受体； Breg，B监管； CD，分化簇； CD40L，CD40配体； cDNA，互补的DNA； CMA，牛奶过敏； DEG，差异表达的基因； GFP，绿色荧光蛋白； HC，健康对照； IG，免疫球蛋白； il，白介素； LPS，脂多糖； nt，自然耐受性； OIT，口服过敏原免疫疗法； PBMC，外周血单核细胞；豌豆，接近扩展测定； RNA，核糖酸； RNA-seq，RNA测序； SIGE，特定的免疫球蛋白E； SIGG，特定的免疫球蛋白G； SIGG1，特异性免疫球蛋白G1； SIGG2，特异性免疫球蛋白G2； SIGG3，特异性免疫球蛋白G3; SIGG4，特异性免疫球蛋白G4； TGF-β，转化生长因子β； TLR，喜欢的受体。
不同浓度抗PD-1和抗PD-L1抗体对非小细胞肺癌患者免疫系统细胞活性的影响
将 PBMC 和支气管抽吸物部分放入三块 6 孔板中，在 37°C 和 5% CO 2 条件下培养 24 小时，培养液为 RPMI 1640 培养基（PAA Laboratories，美国），培养基中添加抗生素（1% 青霉素-链霉素-新霉素，Sigma Aldrich，美国），培养液为不同浓度的 nivolum-ab（5 µg/mL、10 µg/mL、20 µg/mL 培养物）（Bristol-Myers Squibb，美国）或 atezolizumab（150 µg/mL、300 µg/mL、600 µg/mL 培养物）（Roche，法国）。培养方法如图 1 所示。培养完成当天，从培养孔中回收细胞，并进行免疫表型分析。将外周血和支气管抽吸物中不用于培养的对照细胞分装到流式细胞仪管中，与一组单克隆抗体在 4°C 下孵育 30 分钟。然后用不含 Ca 2+ 和 Mg 2+ 离子的 PBS 缓冲液（离心参数：2000 rpm/5 分钟）洗去未结合抗体的残留物，并在流式细胞仪中对细胞免疫表型进行详细分析。反过来，将用单独的抗PD-1或抗PD-L1抗体进行短期培养的细胞在孵育24小时后，与结合有适当荧光染料的选定抗体（抗CD4-FITC、抗CD274-FITC、抗CD14-FITC、抗CD8-PE、抗CD14-PE、抗CD25-APC、抗CD69-APC、抗CD95-APC、抗CD279-APC（Becton Dickinson，美国））孵育。
CHF6297：一种具有鲁棒抗炎活性的新型有效和选择性p38 MAPK抑制剂，适合吸入肺部给药
抑制p38促丝分裂原激活蛋白激酶（MAPKS）是治疗急性和慢性肺炎性疾病的潜在治疗方法。 在这里，我们报告了CHF6297抗炎性作用的体外和体内表征，这是一种新型有效和选择性的p38α抑制剂，旨在吸入递送作为干粉配方。 CHF6297已被证明可以抑制p38α的酶活性，其亚纳摩尔效力（IC 50 = 0.14±0.06 nm），对p38γ和p38Δ的选择性> 1,000倍。 用脂多糖（LPS）以及用TNF-α或香烟烟雾提取物（CSE）刺激的人支气管上皮细胞（BEAS2B）刺激的人外周血单核细胞（PBMC）（PBMC），CHF6297，CHF6297抑制了blow insleukin（IL）-8 low low nOmolor potence。 CHF6297通过使用仅鼻子吸入装置作为微塑料干粉配方，与乳糖剂量依赖性地抑制了LPS诱导的中性粒细胞在支气管肺泡灌洗液（BALF）中抑制LPS诱导的中性粒细胞 - 抑制LPS诱导的嗜中性粒细胞 - 抑制LPS诱导的嗜中性粒细胞 - 抑制LPS诱导的中性粒细胞 - CHF6297。 chf6297对大鼠的剂量施用剂量依赖性地对抗IL-1β（0.3 mg/kg）诱导的嗜中性粒细胞中的嗜中性粒细胞（ED = 0.22 mg/kg），在BALF中IL-6水平增加（ED 50 = 0.82 mg/kg）。 在暴露于烟草烟雾（TS）的小鼠中，chf6297，鼻内给药（I.N.） 在0.03或0.3 mg/kg时持续4天，剂量依赖性地抑制了BALF中的抗皮质类固醇TS诱导的嗜中性粒细胞中的嗜中性粒细胞。 在炎热的鼠类粉尘螨（HDM）模型中，哮喘病毒A（IAV）（H3N3）（H3N3），CHF6297（0.1 mg/kg，i.n.）抑制p38促丝分裂原激活蛋白激酶（MAPKS）是治疗急性和慢性肺炎性疾病的潜在治疗方法。在这里，我们报告了CHF6297抗炎性作用的体外和体内表征，这是一种新型有效和选择性的p38α抑制剂，旨在吸入递送作为干粉配方。CHF6297已被证明可以抑制p38α的酶活性，其亚纳摩尔效力（IC 50 = 0.14±0.06 nm），对p38γ和p38Δ的选择性> 1,000倍。用脂多糖（LPS）以及用TNF-α或香烟烟雾提取物（CSE）刺激的人支气管上皮细胞（BEAS2B）刺激的人外周血单核细胞（PBMC）（PBMC），CHF6297，CHF6297抑制了blow insleukin（IL）-8 low low nOmolor potence。CHF6297通过使用仅鼻子吸入装置作为微塑料干粉配方，与乳糖剂量依赖性地抑制了LPS诱导的中性粒细胞在支气管肺泡灌洗液（BALF）中抑制LPS诱导的中性粒细胞 - 抑制LPS诱导的嗜中性粒细胞 - 抑制LPS诱导的嗜中性粒细胞 - 抑制LPS诱导的中性粒细胞 - CHF6297。 chf6297对大鼠的剂量施用剂量依赖性地对抗IL-1β（0.3 mg/kg）诱导的嗜中性粒细胞中的嗜中性粒细胞（ED = 0.22 mg/kg），在BALF中IL-6水平增加（ED 50 = 0.82 mg/kg）。 在暴露于烟草烟雾（TS）的小鼠中，chf6297，鼻内给药（I.N.）CHF6297。chf6297对大鼠的剂量施用剂量依赖性地对抗IL-1β（0.3 mg/kg）诱导的嗜中性粒细胞中的嗜中性粒细胞（ED = 0.22 mg/kg），在BALF中IL-6水平增加（ED 50 = 0.82 mg/kg）。在暴露于烟草烟雾（TS）的小鼠中，chf6297，鼻内给药（I.N.）在0.03或0.3 mg/kg时持续4天，剂量依赖性地抑制了BALF中的抗皮质类固醇TS诱导的嗜中性粒细胞中的嗜中性粒细胞。在炎热的鼠类粉尘螨（HDM）模型中，哮喘病毒A（IAV）（H3N3）（H3N3），CHF6297（0.1 mg/kg，i.n.）与已处理的IAV/HDM挑战小鼠相比，气道中性粒细胞显着降低。将CHF6297以无效的本质（0.03 mg/kg）的效果加入布德索尼德时，它增强了类固醇的抗炎性作用。Overall, CHF6297 effectively counteracted lung in fl ammation in experimental models where corticosteroids exhibit limited anti-in fl ammatory activity, suggesting a potential for the treatment of acute exacerbations associated with chronic obstructive pulmonary disease (COPD) and asthma, acute lung injury (ALI), and viral-induced hyperin fl ammation.
基于网络的综合蜂窝签名（LINCS）虚拟研讨会
AD Alzheimer's disease AE adverse event ALS amyotrophic lateral sclerosis API application programming interface AUD Alcohol Use Disorder CMap Connectivity Map DCIC Data Coordination and Integration Center DGE differential gene expression DIA data independent acquisition DToxS Drug Toxicity Signature Generation Center ECM extracellular matrix FAIR findable, accessible, interoperable, reusable FDA Food and Drug Administration GAN generative adversarial network GBM glioblastoma multiforme GCP global chromatin profiling GEO gene expression omnibus GR Growth Rate inhibition GREIN GEO RNA-seq Experiments Interactive Navigator (h)iPSC (human) induced pluripotent stem cell HMS Harvard Medical School KE knowledge environment LINCS Library of Integrated Network-based Cellular Signatures MEP Microenvironment Perturbagen MIT Massachusetts Institute of Technology ML Machine Learning MSDW Mount Sinai Data Warehouse NCATS National Center for Advancing Translational Sciences NIDDK National Institute of Diabetes and Digestive and Kidney Diseases NIH National Institutes of Health OSC Office of Strategic Coordination PBMC peripheral blood mononuclear cell PTM post-translational modification PRISM Profiling Relative Inhibition Simultaneously in Mixtures R&D research and development SMA脊柱肌肉萎缩TAS转录活性评分WGS全基因组测序