通过刺激的人外周血淋巴细胞表达IL-13。用佛波尔12-溶解剂13-乙酸盐(PMA; Sigma,Cat。编号p-8139; 50 ng/ml)和离子霉素(Sigma,Cat。编号I-0634; 1μg/ml)在Golgistop™蛋白传输抑制剂的存在下(CAT。 编号 554724)。 用BD Cytofix™固定缓冲液固定细胞(CAT。 编号 554655),然后用BD/WASH™缓冲液洗涤并染色(CAT。 编号 554723)fitc小鼠抗人CD4抗体(CAT。) 编号 566911)和任何BD Horizon™RY610 RY610 RY610 IgG1,κ同种型对照(CAT。 编号 571676;左图)或BD Horizon™RY610大鼠抗人IL-13抗体(Cat。 编号 571260/571320;右图)使用BD Biosciences的细胞内细胞因子免疫荧光染色用于流式细胞仪分析方案。 双变量伪色密度图显示IL-13(或Ig同型对照染色)的相关表达与CD4的相关表达是从具有完整淋巴细胞的正向和侧面光片段特征的封闭事件中得出的。 使用BD Symphony A5™单元分析仪系统和FlowJo™软件进行流式细胞仪和数据分析。I-0634; 1μg/ml)在Golgistop™蛋白传输抑制剂的存在下(CAT。编号554724)。用BD Cytofix™固定缓冲液固定细胞(CAT。编号554655),然后用BD/WASH™缓冲液洗涤并染色(CAT。编号554723)fitc小鼠抗人CD4抗体(CAT。编号566911)和任何BD Horizon™RY610 RY610 RY610 IgG1,κ同种型对照(CAT。编号571676;左图)或BD Horizon™RY610大鼠抗人IL-13抗体(Cat。编号571260/571320;右图)使用BD Biosciences的细胞内细胞因子免疫荧光染色用于流式细胞仪分析方案。双变量伪色密度图显示IL-13(或Ig同型对照染色)的相关表达与CD4的相关表达是从具有完整淋巴细胞的正向和侧面光片段特征的封闭事件中得出的。使用BD Symphony A5™单元分析仪系统和FlowJo™软件进行流式细胞仪和数据分析。
导致细胞社会的变化。为了克服这一局限性,在这个项目中,我们通过使用基于BD Rhapsody的新型单细胞RNA-SEQ(SCRNA-SEQ)方法来分析单细胞水平的发炎组织 - tas-seq。(Shichino等人2022,Commun。 Biol .1:602)。 就基因敏感性,检测细胞群体的检测和细胞 - 细胞相互作用的敏感性而言, tas-seq比其他主要的SCRNA-SEQ技术优于其他主要的SCRNA-SEQ技术。 通过使用这项技术,我们分析了二氧化硅诱导的肺纤维化模型,我们发现C1Q是肺间隙巨噬细胞的特定标记,C1Q充当了硅胶诱导的肺纤维化中的纤维化介质(Ogawa等人。 2022,生物化学。 生物。 res。 社区。 599:113-119)。 此外,我们开发了Tas-Seq,Tas-Seq2的更新版本,其中基因检测灵敏度及其实用性得到了增强。 tas-seq2不仅可以应用于基于纳米韦尔的系统(例如 bd rhapsody),但也要基于液滴的系统(例如 10x铬)和基于板的系统(例如 smart-seq2)。 tas-seq2在小鼠脾脏和人类冷冻的PBMC样品中,比原始10x Chroumimum V3(10x Tas-Seq2)的基因比原始10x chroumimus V3(10x Tas-Seq2)高1.5-2倍。 现在,我们正在开发用于高分辨率空间转录组学立体声的Tas-Seq2,用于分析固定细胞,并将其细胞吞吐量增加10-100倍。 此外,我们正在收集人间质肺病患者,纤维化大鼠肺和鼠2022,Commun。Biol .1:602)。tas-seq比其他主要的SCRNA-SEQ技术优于其他主要的SCRNA-SEQ技术。通过使用这项技术,我们分析了二氧化硅诱导的肺纤维化模型,我们发现C1Q是肺间隙巨噬细胞的特定标记,C1Q充当了硅胶诱导的肺纤维化中的纤维化介质(Ogawa等人。2022,生物化学。生物。res。社区。599:113-119)。 此外,我们开发了Tas-Seq,Tas-Seq2的更新版本,其中基因检测灵敏度及其实用性得到了增强。 tas-seq2不仅可以应用于基于纳米韦尔的系统(例如 bd rhapsody),但也要基于液滴的系统(例如 10x铬)和基于板的系统(例如 smart-seq2)。 tas-seq2在小鼠脾脏和人类冷冻的PBMC样品中,比原始10x Chroumimum V3(10x Tas-Seq2)的基因比原始10x chroumimus V3(10x Tas-Seq2)高1.5-2倍。 现在,我们正在开发用于高分辨率空间转录组学立体声的Tas-Seq2,用于分析固定细胞,并将其细胞吞吐量增加10-100倍。 此外,我们正在收集人间质肺病患者,纤维化大鼠肺和鼠599:113-119)。此外,我们开发了Tas-Seq,Tas-Seq2的更新版本,其中基因检测灵敏度及其实用性得到了增强。tas-seq2不仅可以应用于基于纳米韦尔的系统(例如bd rhapsody),但也要基于液滴的系统(例如10x铬)和基于板的系统(例如smart-seq2)。tas-seq2在小鼠脾脏和人类冷冻的PBMC样品中,比原始10x Chroumimum V3(10x Tas-Seq2)的基因比原始10x chroumimus V3(10x Tas-Seq2)高1.5-2倍。现在,我们正在开发用于高分辨率空间转录组学立体声的Tas-Seq2,用于分析固定细胞,并将其细胞吞吐量增加10-100倍。此外,我们正在收集人间质肺病患者,纤维化大鼠肺和鼠我们还建立了博来霉素诱导的肺纤维化模型的时间顺序scrna-seq数据中细胞 - 细胞通信的时间网络分析,并通过使用遗传修饰的小鼠来验证集线器细胞和相关的细胞外分子,并验证分子的作用。我们还建立了体内器官系统,该系统概括了博来霉素诱导的肺损伤的反应,并发现离体系统还可以诱导与鼠模型中无法观察到的与人类IPF相关的细胞集。
量表生物科学宣布在越来越多的单细胞奥甘装解决方案的投资组合中的进展,吉恩在网上和陈Zuckerberg细胞中提供的新单细胞数据集,吉恩发现数据库,因为扩展的产品组合开始运送给客户San Dieago,Sanive.San Dieago,San Dieago。可访问的成本,今天宣布了三个新数据集的可用性,展示了其新发布的产品的性能,包括Scalebio单细胞甲基化试剂盒,ScaleBio单细胞RNA v1.1带有扩展吞吐量的v1.1和Scalbio crispr指南富集套件,所有这些套件现在都是运输的。数据集可在ScaleBio网站上下载,此外,RNA数据集可通过Gene Discover Database在Chan Zuckerberg单元格中提供。“ ScaleBio的建立是为了以前所未有的规模启用广泛的单细胞多组学应用程序,而无需牺牲数据质量。我们已经提供了几个独特的套件,以将新的功能掌握在客户手中,并通过发布完整的公共数据集证明了我们对透明度的承诺,” Scalebio首席执行官Giovanna Prout说:“我们很高兴能够发挥唯一的商业可用的全基因组单基因组单细胞甲基化产品,并期待与研究人员使用它。此外,用甲基化试剂盒对2,000个PBMC进行了测序,以在所有产品中生成数据集。公司计划将来发布其他数据集,以显示其工具具有不同样本类型的鲁棒性和适用性。通过我们的单细胞RNA v1.1套件和CRISPR富集套件继续增加细胞吞吐量并降低每个细胞的成本,我们将帮助越来越大的超高吞吐量研究,尤其是在功能性和CRISPR筛查中,赋予我们的客户扩大单细胞OMICS的可能性。” ScaleBio生成了这些数据集用RNA和47,000个带有CRISPR的心脏类细胞的人类外周血单核细胞(PBMC),以使研究界能够了解公司套件的能力和高性能“我们对使用Scalbio套件进行单细胞RNA测序和甲基化生成的初始数据的鲁棒性给我们留下了深刻的印象,” Marble Therapeutics首席执行官Denitsa Milanova说。“我们期待利用公司不断扩大的单细胞OMICS工具的投资组合来研究细胞再生的新生物学。”现在,全球发货的新套件包括:
此前,过继细胞疗法 (ACT) 一直试图通过流式激活细胞分选 (FACS) 和体外扩增外周血中的 CD4+CD25+CD127lo/- Treg 来预防 1 型糖尿病 (T1D) 患者的自身免疫。然而,这种方法会产生表型稳定、胸腺来源的 FOXP3+/Helios+ (tTreg) 和不稳定、外周来源的 FOXP3+Helios- Treg (pTreg) 的异质群体。在这里,我们提出了一种使用 CD4+CD25+CD226- 谱系 FACS 分离 Treg 的新策略,其中 tTreg 的比例增加。流式细胞术评估典型谱系决定转录因子表明,与 CD127- Treg 相比,分离的 CD226- Treg 产生的 tTreg 百分比更高,而 pTreg 百分比更低,无论是在体外扩增 14 天之前 (tTreg:+∆4.70%,pTreg:-∆1.10%) 还是之后 (+∆3.57%,-∆4.43%)。扩增后,与 CD127- Treg 相比,CD226- Treg 显示出改变的细胞因子谱,其特征是细胞外 TGFb1 表达增加 (1.87 倍) 和细胞内 TGFb1 (1.15 倍) 表达增加,而 IL-10 (0.83 倍)、IFNg (0.86 倍)、IL-17A (0.92 倍) 和 TNFa (0.79 倍) 表达降低。 CD226- Tregs 表现出比 CD127- Tregs 更强的体外抑制作用(1:1 Treg:PBMC 比例时为 +∆22.0%)。CRISPR-Cas9 敲除 (KO) CD226 支持 CD226 在谱系不稳定性中的作用,与未编辑的 CD127- Treg 对照相比,CD127- CD226 KO Tregs 显示出更高的 tTreg(+∆39.0%)和更低的 pTreg(-∆13.9%)百分比。这些数据表明 CD226- Tregs 具有更高的表型稳定性,并且具有更强的体外抑制能力,这对 ACT 在预防或中止 T1D 方面具有重要意义。
了解介导疟疾保护的免疫机制对于改善疫苗发育至关重要。采用辐射衰减的恶性疟原虫孢子(PFRAS)疫苗接种可诱导对疟疾的高水平灭菌免疫力,并作为研究保护机制的有价值的工具。为了识别疟疾感染期间疫苗诱导的和检测相关的反应,我们对全血和PBMC进行了转录组分析,并从志愿者中对PFFRAS或非感染蚊虫的PBMC进行了深入的细胞分析,随后受控了人类疟疾感染(CHMI)。对模拟疫苗接种个体中CHMI的细胞亚群的深入单细胞分析表现出主要的炎症转录组反应。 全血转录组分析表明,在CHMI之前,与I型和II型干扰素和NK细胞反应相关的基因集增加了,而在受保护的疫苗中CHMI后一天,T和B细胞特征最早减少了。 相比之下,非保护疫苗和模拟疫苗接种的个体在CHMI之后表现出共享的转换变化,其特征是先天细胞的签名和炎症反应减少。 此外,免疫表型数据显示了VΔ2+γδT细胞,CD56+ CD8+ T效应记忆(TEM)细胞以及受保护的疫苗和发展血液阶段寄生虫之间的个体之间的非经典单核细胞的诱导谱,此后,感染了感染。 我们的数据提供了PFRAS诱导的保护和感染性CHMI的理解免疫机械途径的关键见解。对模拟疫苗接种个体中CHMI的细胞亚群的深入单细胞分析表现出主要的炎症转录组反应。全血转录组分析表明,在CHMI之前,与I型和II型干扰素和NK细胞反应相关的基因集增加了,而在受保护的疫苗中CHMI后一天,T和B细胞特征最早减少了。相比之下,非保护疫苗和模拟疫苗接种的个体在CHMI之后表现出共享的转换变化,其特征是先天细胞的签名和炎症反应减少。此外,免疫表型数据显示了VΔ2+γδT细胞,CD56+ CD8+ T效应记忆(TEM)细胞以及受保护的疫苗和发展血液阶段寄生虫之间的个体之间的非经典单核细胞的诱导谱,此后,感染了感染。我们的数据提供了PFRAS诱导的保护和感染性CHMI的理解免疫机械途径的关键见解。我们证明了疫苗诱导的免疫反应是在受pfras和非保护疫苗之间的异质性,并且PFRAS诱导的麦芽膜保护与干扰素,NK细胞和适应性免疫反应的早期和快速变化相关。试验注册:ClinicalTrials.gov NCT01994525。
新的免疫检查点正在出现,以提高对免疫药物的反应率。由于参与肿瘤微环境的免疫抑制,腺苷A 2A受体(A 2A R)被提议作为免疫发育的靶标。封锁2A R可以恢复肿瘤免疫力,从而改善患者的预后。在这里,我们描述了通过噬菌体显示的人A 2A R(HA 2A R)的有效,选择性和抑制肿瘤抗体拮抗剂的发现。We con- structed and screened four single-chain variable fragment (scFv) libraries—two synthetic and two immunized—against hA 2A R and antagonist-stabilized hA 2A R. After biopanning and ELISA screening, scFv hits were reformatted to human IgG and triaged in a series of cellular binding and functional assays to identify a lead candidate.铅候选者TB206-001散布了HA 2A R-Over表达HEK293细胞的纳摩尔结合;与小鼠和cynomolgus a 2a r的交叉反应性,但不是人类A 1,2b或3受体; HA 2A R在HA 2A R-r-evercress表达HEK293细胞和外周血单核细胞(PBMC)中的功能拮抗作用;结肠肿瘤的HUCD34-NCG小鼠中的肿瘤抑制活性。鉴于其治疗特性,TB206-001是将其纳入下一代双特异性免疫治疗药的良好候选者。
本研究评估了用基于抗独特型抗体(功能上模拟酵母杀伤毒素)的工程杀伤肽 (KP) 处理的猪免疫细胞的表型和细胞因子分泌的早期调节。使用猪生殖与呼吸综合征病毒 (PRRSV) 和猪圆环病毒 2 型 (PCV2) 作为体外抗原研究了 KP 对特异性免疫的影响。用 KP 和杂乱肽刺激健康猪的外周血单核细胞 (PBMC) 20 分钟、1、4 和 20 小时或保持不刺激。使用流式细胞术和 ELISA 分析细胞。使用相同的时间段进行 KP 预孵育/共孵育,以使用 ELISPOT 确定对病毒回忆干扰素-γ (IFN- γ ) 分泌细胞 (SC) 频率和单细胞 IFN- γ 生产力的影响。KP 诱导早期剂量依赖性转变至促炎性 CD172 α + CD14 +high 单核细胞和增加 CD3 + CD16 + 自然杀伤 (NK) T 细胞。KP 触发经典 CD4 − CD8 αβ + 细胞毒性 T 淋巴细胞 (CTL) 和双阳性 (DP) CD4 + CD8 α + Th 记忆细胞 (CD4 + CD8 α +low CD8 β +low) 上的 CD8 α 和 CD8 β 表达。一部分 DP 细胞也表达高水平的 CD8 α 。已鉴定的两种 DP CD4 + CD8 α +高 CD8 β +低/+高 CTL 亚群与肿瘤坏死因子 α (TNF- α ) 和 IFN- γ 分泌有关。KP 显著增强了 PRRSV 1 型和 PCV2b 特异性 IFN- γ SC 的反应性和交叉反应性。结果表明 KP 在刺激 Th1 偏向免疫调节方面有效,并支持将 KP 作为免疫调节剂或疫苗佐剂进行研究。
摘要:一些SARS-COV-2暴露的个体在没有明显感染的情况下会产生免疫力。我们确定了11个个体,他们在长时间紧密接触期间通过核酸测试而呈阴性,没有血清学诊断感染。由于这可以反映自然免疫力,可抵抗先前冠状病毒暴露的交叉反应性免疫,由于从头免疫反应引起的堕胎感染或其他因素,我们的目标是表征这些个体中针对SARS-COV-2的免疫力。血液被处理成血浆和外周血单核细胞(PBMC),并针对SARS-COV-2和常见的β-核纳维病毒OC43和HKU1筛选IgG,IgA和IgM抗体(AB)。还测量了血浆中的受体阻断活性和干扰素-Alpha(IFN-α)。列举了针对SARS-COV-2的循环T细胞,并在体外刺激后区分了CD4 +和CD8 + T细胞反应。Exposed uninfected individuals were seronegative against SARS-CoV-2 spike (S) and selectively reactive against OC43 nucleocapsid protein (N), suggesting common β -coronavirus exposure induced Ab cross-reactive against SARS-CoV-2 N. There was no evidence of protection from circulating angiotensin-converting enzyme (ACE2) or IFN- α .六个独立物具有针对SARS-COV-2的T细胞反应,其中四个涉及CD4 +和CD8 + T细胞。我们没有发现通过常见β-核心病毒引起的先天免疫或免疫力来保护SARS-COV-2的证据。自暴露以来,针对SARS-COV-2的细胞免疫反应与时间有关,这表明快速的细胞反应可能包含低于体液反应所需的阈值的SARS-COV-2感染。
Abbreviation Definition AE adverse event AESI adverse events of special interest BLA Biologics License Application BMI body mass index CDC US Centers for Disease Control CMC Chemistry, Manufacturing, and Control CoV Coronavirus 2019-nCoV 2019 novel Coronavirus COVID-19 Coronavirus Disease 2019 DART developmental and reproductive toxicity ELISpot enzyme-linked immunospot EUA Emergency Use Authorization FDA (US) Food and Drug Administration FIH first-in-human GMC geometric mean concentration GMFR geometric mean fold-rise GMT geometric mean titer HBV hepatitis B virus HCV hepatitis C virus HIV human immunodeficiency virus IFN γ interferon gamma IgG immunoglobulin G IL-2 interleukin 2 IL-4 interleukin 4 IM intramuscular(ly) IRR illness rate ratio LLN lower limit of normal LNP lipid nanoparticle MedDRA Medical Dictional for Regulatory Activities MERS Middle East respiratory syndrome modRNA nucleoside-modified RNA NAAT nucleic acid amplification test NHP nonhuman primate P2 S P2 mutant PBMC peripheral blood mononuclear cell PCR polymerase chain reaction PK药代动力学PT首选术语RBD受体结合结构域RNA RNA核糖酸RNA-LNP RNA RNA脂质纳米颗粒SAE SAE严重不良事件SARS严重急性呼吸综合症SARS-COV-2 SARS-COV-2 SARS COTORONAVIRUS-CORONAVIRUS-2;引起covid-19的病毒S尖峰糖蛋白SMQ标准化MEDDRA查询SOC系统器官类Th1 T辅助细胞类型1 TH2 T辅助细胞类型2美国美国USP美国Pharmacopeia
背景 COVID-19 后症状 (PCC) 影响全球数百万人,表现为持续的多系统症状。尽管有各种假设,但 PCC 背后的生物学机制仍不清楚。先前的研究将 PCC 与血液免疫细胞 DNA 甲基化组的改变联系起来,但其对肺细胞的随时间影响仍然未知。方法 2020-2021 年 COVID-19 后出现持续症状的患者 (n=13) 在入院时和一年后捐献了血液和痰液样本。同时收集症状和生理测试数据。纵向分析 DNA 甲基化 (DNAm) 谱并与健康对照者的大流行前 DNAm 数据进行比较。结果虽然外周血单核细胞 (PBMC) 没有显着变化,但在中性粒细胞和巨噬细胞富集级分中观察到纵向 DNAm 变化。这些变化与症状和生理指标显着相关。通路分析显示与心脏功能有关的细胞过程富集。结论我们确定了与心脏功能相关通路相关的肺免疫细胞纵向 DNAm 变化。这些变化与症状负担和心肺指标相关。结果提示了潜在的疾病机制并有助于诊断工具的开发。