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G蛋白偶联受体作为胶质母细胞瘤的治疗靶标
图2 G蛋白亚基激活后触发的G蛋白偶联受体的各种信号通路的示意图（A，B和C）。激动剂结合的GPCR在G A亚基上交换GDP，从而触发了G a（S，I，Q，12）从受体和G BC触发。（a）激活的G A S刺激膜相关的酶腺苷酸环化酶（AC），从而增加了ATP - CAMP转换。cAMP充当第二个使蛋白激酶A（PKA）的信使，该蛋白激酶A（PKA）可以磷酸化多个下游靶标。而g a i亚基抑制了交流。（b）激活的G A Q刺激膜结合的磷脂酶C（PLC）至裂解磷脂酰肌醇双磷酸盐（PIP 2）进入第二个使者三磷酸肌醇（IP 3）和二酰基甘油（DAG）。IP 3增加了细胞内钙浓度（Ca 2+），而膜结合的DAG通过将其从细胞质转移到质膜来激活PKC。GPCR激酶（GRK）磷酸化G蛋白独立的配体结合GPCR，以启动B- arrestin的募集并阻止G蛋白偶联。 GPCR-B - 抑制蛋白复合物促进内吞作用，运输配体 - GPCRs对内体进行分类，以回收到质膜或信号和各种细胞过程的信号传导和调节。 用Biorender（biorender.com）准备的数字。GPCR激酶（GRK）磷酸化G蛋白独立的配体结合GPCR，以启动B- arrestin的募集并阻止G蛋白偶联。GPCR-B - 抑制蛋白复合物促进内吞作用，运输配体 - GPCRs对内体进行分类，以回收到质膜或信号和各种细胞过程的信号传导和调节。用Biorender（biorender.com）准备的数字。
国际农业，环境与食品科学杂志
抽象的磷酸盐 - 溶解细菌是植物生长的细菌之一，可通过多种途径溶解土壤中不溶性的磷酸盐并促进植物生长。因此，它提供了一种替代选择，而不是应用破坏土壤化学和生态平衡的化学肥料。尽管最近关于磷酸盐溶解细菌的研究最近有所增加，但有关薄荷和茴香根际的研究仍然有限。需要研究可以溶解磷酸盐并替代化学肥料的不同根际局部细菌。已经确定，从薄荷（Mentha Piperita L.）和茴香（Foeniculum vulgare L.）根瘤菌获得的53种细菌分离株中，有15种在Pikovskaya Agar（PKA）介质上使用Maldi-tof MS MAST形成了一个透明（Halo）根源。评估了这些分离株的形态，生化和IAA产生以及通过NBRIP肉汤培养基中分离株对磷酸盐溶解的定量测量。从枯草芽孢杆菌MMS -7中注意到溶解度为281.6 mg l -1的最高效率。接下来是荧光症MMS -11，溶解值分别为263.4 mg l -1和苏云金芽孢杆菌MMS -3，溶解值分别为172.1 mg l -1。在磷酸盐溶解细菌分离株中，P溶解指数在PKA琼脂培养基上为1.2-3.7。此外，使用枯草芽孢杆菌MMS -7，在23.38 µg mL -1下的最高IAA产生。关键字：Mentha Piperita，foeniculum vulgare，磷酸盐溶解细菌，MALDI TOF MS接下来是荧光症MMS -11，其值为19.72 µg ml -1和苏云金芽孢杆菌，使用MMS -3，值为18.98 µg ml -1。这项研究表明，选定的局部分离株可以用作有效的基于磷酸盐的微生物肥料。
与其抑制剂复合的金属蛋白酶中氨基酸残基的质子化态：从头开始分子模拟
可能有助于PDB结构中HIS224和水分子之间的氢[3]。注意到，HIS223的PKA值较低，为5.51，对周围PLN残基没有任何空间障碍，这表明HIS223可以具有HID和HIE质子化状态。因此，我们考虑了HIS223的两个质子化状态，并根据Ab Inli算FMO计算评估的总能量确定了哪些更稳定。此外，我们在这里考虑了GLU141的三种类型的质子化状态，因为该残基位于抑制剂附近，GLU141和抑制剂之间的相互作用可能会受到GLU141质子化状态的变化的显着影响。在金属蛋白酶热蛋白的先前分子模拟[7，8]中，
β2-肾上腺肾上腺受体信号传导通过上调MCL1
有积累的证据表明，由于社会心理压力引起的交感神经系统的连续激活会增加对治疗的抵抗力，并通过β2-肾上腺受体信号传导加速肿瘤的生长（ADRB2）。但是，效应机制似乎特定于肿瘤类型。在这里我们表明，肾上腺素对ADRB2的激活对固定应激的响应增加，延迟了前列腺癌细胞中细胞毒性药物诱导的MCL1凋亡调节剂（MCL1）蛋白表达的丧失。因此，增加了前列腺癌异种移植对细胞毒性疗法的耐药性。肾上腺素对MCL1蛋白的影响取决于蛋白激酶A（PKA）活性，但与雄激素受体表达无关。此外，血液肾上腺素水平升高与人类前列腺活检中MCL1蛋白的表达呈正相关。总而言之，我们证明了压力会触发
咖啡因通过靶向torc1
饮食中的营养限制（饮食限制）已知会在各种生物中增加寿命。尽管将饮食限制到寿命增加的分子事件尚不清楚，但对酿酒酵母的模型的研究却暗示了几种营养敏感的激酶，包括雷帕霉素复合物1（Torc1），Sch9，Sch9，蛋白质激酶A（PKA）和RIM15。我们最近证明了TORC1通过直接磷酸化激活SCH9。现在，我们证明SCH9也通过直接磷酸化抑制RIM15。用特异性TORC1抑制剂雷帕霉素或咖啡因对酵母细胞的治疗可从TORC1- SCH9介导的抑制中释放RIM15，从而增加了寿命。这种激酶级联反应似乎在进化上是保守的，这表明咖啡因可能会在包括人在内的其他真核生物中延长寿命。
引用原始发表的论文（记录的版本）：Svedberg，P.，Inostroza，P.，Gustavsson，M。等（2023）。水生生态毒素的数据集
收集了有关2697种有机化学物质的水生生态毒理学的经验数据和计算机数据，以编译数据集，以评估当前质量结构活动关系（QSAR）模型和软件平台的预测能力。本文档为其创建提供了数据集及其数据管道。经验数据是从美国EPA Ecotox知识库（Ecotox）和EFSA（欧洲食品安全局）收集的，报告“ XML模式中的农药生态毒性学层的数据输入研究终点 - 数据库 - 数据库中”。仅保留了经合组织建议的藻类，水坝和鱼类的数据。使用Ecosar，Vega和Tox-Icity估计软件工具（T.E.S.T.）计算每种化学物质和六个端点中的QSAR毒性预测平台。最后，数据集用微笑，Inchikey，PKA和LOGP修改，从Webchem和PubChem收集。©2023作者。由Elsevier Inc.出版这是CC下的开放式访问文章（http://creativecommons.org/licenses/4.0/）
全基因组碱基编辑器筛选鉴定酵母中蛋白质丰度的调节剂
摘要 蛋白质是细胞中的关键分子，其丰度不仅在基因表达水平而且在转录后水平受到广泛调控。在这里，我们描述了一种酵母基因筛选方法，该方法能够系统地表征蛋白质丰度调控在基因组中的编码方式。该筛选方法结合了 CRISPR/Cas9 碱基编辑器来引入点突变，并对内源性蛋白质进行荧光标记以方便流式细胞仪读数。我们首先使用单个 gRNA 以及正向和负向选择筛选对酵母中的碱基编辑器性能进行了基准测试。然后，我们研究了 16,452 种基因扰动对代表各种细胞功能的 11 种蛋白质丰度的影响。我们发现了数百种调控关系，包括 GAPDH 同工酶 Tdh1/2/3 与 Ras/PKA 通路之间的新联系。许多已识别的调节因子特定于这 11 种蛋白质中的一种，但我们还发现了一些基因，这些基因在受到扰动时会影响大多数测试蛋白质的丰度。虽然更具体的调控因子通常作用于转录，但广泛的调控因子往往在蛋白质翻译中发挥作用。总的来说，我们的新筛选方法为蛋白质调控网络的组成部分、规模和连通性提供了前所未有的见解。
大麻素对胃肠道疾病的肠道运动，屏障渗透性和治疗潜力的影响
摘要：大麻素及其受体在调节胃肠道（GIT）蠕动和肠道屏障渗透性中起着重要作用。这篇评论批判性地评估了当前关于内源性大麻素和植物大麻素对GIT功能以及这些化合物潜在治疗应用的知识。在体内和体内临床前数据的结果表明，大麻素可以抑制和刺激肠蠕动，具体取决于各种因素。内源性大麻素以大麻素（CB）受体的方式影响蠕动；但是，它们与瞬态受体潜在阳离子通道亚家族V成员1（TRPV1）系统之间也存在重要的相互作用。植物大麻素，例如Δ9-四氢大麻酚（THC）和大麻二酚（CBD），主要通过CB1受体撞击肠运动。还发现它们可以改善肠道屏障完整性，主要是通过CB1受体刺激，还可以通过蛋白激酶A（PKA），与促丝裂料相关的蛋白激酶（MAPK）和腺苷酸环化酶信号通路，以及影响紧密连接（TJ）蛋白的表达。假定大麻素在GIT疾病中的抗炎作用是通过降低炎症因子（例如骨髓过氧化物酶（MPO）活性）和细胞因子水平调节的抗炎作用。总而言之，有前景是利用大麻素作为GIT疾病治疗的组成部分。
靶向 A-激酶锚定蛋白 12 磷酸化...
摘要 肝星状细胞 (HSC) 向活化状态的转分化会通过释放细胞外基质 (ECM) 成分增强肝纤维化，从而扭曲肝脏结构。由于可用的抗纤维化药物有限，可以考虑针对活化 HSC 的药物干预进行治疗。A-激酶锚定蛋白 12 (AKAP12) 是一种支架蛋白，可将蛋白激酶 A/C (PKA/PKC) 和细胞周期蛋白引导到特定位置，在时空上控制它们的生物学效应。研究表明，AKAP12 的支架功能会因磷酸化而改变。在之前发表的研究中，观察到了 AKAP12 磷酸化与 HSC 活化之间的关联。在这项研究中，我们证明，AKAP12 对内质网 (ER) 驻留胶原蛋白伴侣热休克蛋白 47 (HSP47) 的支架活性受到活化 HSC 中 AKAP12 位点特异性磷酸化的强烈抑制。CRISPR 定向基因编辑 AKAP12 的磷酸化位点可恢复其对 HSP47 的支架，抑制 HSP47 的胶原蛋白成熟功能和 HSC 活化。AKAP12 磷酸化编辑可显著抑制小鼠的纤维化、ER 应激反应、HSC 炎症信号和肝损伤。我们的总体研究结果表明 AKAP12 磷酸化具有促纤维化作用，可能成为肝纤维化治疗干预的靶点。
利用针对细胞蛋白的化合物抑制人类巨细胞病毒复制
收到日期：2022 年 7 月 12 日；接受日期：2022 年 8 月 29 日；发布日期：2022 年 10 月 10 日 作者隶属关系：1 伦敦大学圣乔治学院感染与免疫研究所，英国伦敦。 * 通讯作者：Blair L. Strang，bstrang@sgul.ac.uk 关键词：青蒿素；化合物；巨细胞病毒；药物；激酶；重新利用；筛选；病毒。 缩写：CLK2，细胞周期蛋白依赖性激酶样激酶 2；CREB，cAMP 反应结合蛋白；DYRK1A、DYRK1B、DYRK2，双特异性酪氨酸磷酸化调节激酶 1A、1B 和 2。；GCV，更昔洛韦；HCMV，人类巨细胞病毒； HIPK1 和 HIPK4，同源域相互作用蛋白激酶 1 和 4；HIV，人类免疫缺陷病毒；IE，立即早期；MAP4K4，丝裂原活化蛋白激酶激酶激酶 4。；MAPK，丝裂原活化蛋白激酶；MIEP，主要立即早期启动子；MNK，MAP 激酶相互作用丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶；MSK1，丝裂原和应激激活激酶 1；PKA，蛋白激酶 A；PLK1，polo 样激酶 1；PRKD1、PRKD2 和 PRKD3，蛋白激酶 D1-D3；PRKG1、PRKG2，cGMP 依赖性激酶 1 和 2；PRKX，蛋白激酶，x 连锁。； ROCK1、ROCK2、rho 相关、卷曲螺旋蛋白激酶 1 和 2；SARS-CoV-2、严重急性呼吸综合征冠状病毒 2；SLFN11、Schlafen 蛋白 11；VGCV、缬更昔洛韦。001795 © 2022 作者