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多摩学数据的整合加速了常见小麦特质的分子分析
多摩学数据的集成可以提供有关来自不同层的生物分子的信息，以系统地说明复杂的生物学。在这里，我们建立了一个多摩斯图集，其中包含132,570个转录本，44,473种蛋白质，19,970个磷蛋白和12,427架乙酰蛋白质，跨小麦植物和生殖相。使用此地图集，我们阐明了转录调节网络，翻译后修饰（PTM）的贡献以及转录水平对蛋白质丰度的贡献，以及小麦中的同性恋表达和PTM有偏见。与小麦发育和疾病有关的基因/蛋白质进行了系统的分析，从而确定了控制小麦晶粒质量和抗病性相关基因的种子蛋白的磷酸化和/或乙酰化修饰。最后，覆盖了Tahda9的独特蛋白质模块TAHDA9-TAP5CS1，该模块由TAHDA9指定TAP5CS1的去乙酰化，可通过增加的脯氨酸含量来调节对小麦冠状腐烂的抗小麦抗性。我们的Atlas对小麦和相关农作物中的分子生物学和育种研究具有巨大的希望。
针对Foxp3的翻译后修饰
健康的免疫系统对于宿主抵抗外部病原体和维持体内平衡至关重要。然而，免疫抑制性肿瘤微环境（TME）会损害抗肿瘤免疫，并促进肿瘤的进展，侵袭和转移。最近，许多研究发现FOXP3+调节性T（Treg）细胞是主要的免疫抑制细胞，通过促进各种肿瘤相关细胞的发展并抑制效应免疫细胞的活性来促进TME的形成。考虑到Treg在肿瘤进展中的作用，鉴定新的治疗药物以靶向和耗尽肿瘤中的Treg是关键的。尽管有几项研究开发了针对Treg的靶向缺失，以减少TME并支持肿瘤中效应T细胞的积累，但Treg靶向的治疗系统会系统地影响Treg人群，并可能导致自身免疫性疾病的发展。众所周知，在疾病条件下，FOXP3经历了几种定义的转化后修饰（PTMS），包括乙酰化，糖基化，磷酸化，泛素化，泛素化和甲基化。这些PTM不仅提升或减轻FOXP3的转录活性，还会影响Tregs的稳定性和免疫抑制功能。各种研究表明，参与PTM的酶的药理靶向可以显着影响Foxp3的PTM。因此，它可能会影响癌症和/或自身免疫性疾病的进展。总体而言，这项综述将帮助研究人员了解Tregs免疫抑制机制，FOXP3的翻译后法规以及对TME中Tregs靶向TREG的潜在治疗靶标和策略的进步，以改善抗肿瘤的免疫力。
1型糖尿病发病机理中的翻译修饰
1型糖尿病（T1D）的发病机理涉及遗传易感性，免疫过程和环境因素的复杂相互作用，从而导致免疫系统选择性破坏胰腺β细胞。新兴证据表明，固有的β细胞因子，包括β-细胞抗原的氧化应激和翻译后修饰（PTM），也可能有助于其免疫原性，从而为T1D的多面发病发病发明了新的光。在过去的30年中，PTMS产生的新皮标已被认为在T1D发病机理中发挥作用，但它们的参与仅在近年来才系统地研究。在这篇综述中，我们探讨了氧化性PTM，新皮上和T1D之间的相互作用，突出了氧化应激是免疫系统功能障碍，β细胞脆弱性和疾病发作的关键因素。
通过翻译后修改对胰岛素分泌的调节
胰岛素是一种从胰岛胰岛细胞中释放出的合成代谢激素，具有保持血糖稳态的独特能力（Cabrera等，2006； Da Silva Xavier，2018）。胰岛素对葡萄糖和其他营养素（例如氨基酸和游离脂肪酸）的分泌是一个复杂的过程，涉及多个信号通路的配位（Nolan等，2006; Henquin，2011）。这一过程的损害与糖尿病的发展直接相关（Schwartz等，2013）。因此，胰岛素分泌过程被认为是治疗糖尿病的有希望的靶标（Defronzo等，2014）。但是胰岛素分泌法规的细节仍然是一个未解决的问题。翻译后修饰（PTM）是在蛋白质上添加或去除化学基团的共价修改（Walsh等，2005）。通过调节蛋白质定位，降解和功能，它几乎与所有生理和病理过程密切相关（Walsh和Jefferis，2006; Khan等，2016; Morales-Tarre等，2021; Zhu and Hart and Hart，2021）。积累的证据表明，PTM广泛参与胰岛素分泌过程，目前，至少八种类型的PTMS已知与胰岛素分泌有关。例如，信号级联介导胰岛素分泌需要磷酸化（Campbell和Newgard，2021年）。sumoylation和棕榈酰化可以在多个阶段调节胰岛素分泌（Davey等，2019； Chamberlain等，2021）。这些表明乙酰化，泛素化和O-Glcnacylation与胰岛素基因转录有关（Mounier and Posner，2006; Ozcan等，2010; Sampley和Ozcan，2012）。甚至最近据报道，即使是一些研究的PTM，例如柠檬化和脱氨酸，也与胰岛素分泌有关。
表观遗传调节剂提供了了解疾病和治疗机会的途径
表观遗传学的领域解决了通过对基因组的非核扰动而产生的可遗传表型，以及在DNA的核肽序列上方发生的机械过程。例如，直接对DNA进行了直接修饰，组成染色质的组蛋白周围的DNA的组织以及翻译后修饰（PTM）在播音尾巴上形成的直接能力会影响基因调节和细胞命运诸如基因调节和细胞命运的决定。除了可遗传的epige-Netic国家可以是动态和可逆的（Jenuwein and Allis 2001）。新兴发现和尖端技术的使用为表观遗传调节剂控制的生理过程提供了见解。许多研究都记录了影响PTM的蛋白质编码基因中的异常表达以及种系和体细胞突变，调节基因组的组织格局以及发病机理，进而揭示了生物标志物和新颖的治疗靶标，以抗击许多疾病（Dawson and Kouzar-ides and and eN> 2012; rando and and and。2016; dobson
草图
我的研究重点是研究与年龄相关疾病的致病机制，例如癌症和神经退行性疾病。专注于前列腺癌和具有性偏见的癌症，以及脊柱骨骼肌肉萎缩和肌萎缩性侧面硬化症，我的研究有助于表明：1）翻译后修饰（PTM）：磷酸化和精氨酸甲基化的功能促进蛋白的功能和刺激性的毒性，使蛋白质的毒性具有启发性，并具有刺激性的毒性。因为这些PTM具有治疗潜力； 2）外围组织：我们有助于表明骨骼肌有助于体重减轻，能量不平衡和神经元变性，损害通常是主要的，并且不是神经元功能障碍和损失的继发性，而骨骼肌是一种有价值的治疗靶向靶向组织； 3）基因表达的表观遗传失调：我们表明，表观遗传作者是由作为转录因子的疾病蛋白招募的，并有助于与年龄相关的疾病的发病机理。基于我们的工作，将两种化合物，胰岛素样生长因子1和β-激动剂（clenbuterol）转化为SBMA的II期临床试验。
神经科学研究技术指南
信号转导和细胞内信号转导简介 298 研究蛋白质的基本工具 300 抗体的制备和使用 300 纯化蛋白质 302 免疫沉淀 (IP) 304 研究蛋白质表达 30 蛋白质印迹 (WB) 306 酶联免疫吸附试验 (ELISA) 308 放射免疫测定 (RIA) 310 免疫组织化学 (IHC) 312 免疫电子显微镜 (IEM) 312 报告蛋白 312 研究蛋白质 - 蛋白质相互作用 313 免疫共沉淀 (Co-IP) 313 蛋白质亲和层析 313 酵母双杂交试验 314 研究翻译后修饰 317 PTM 特异性试验 317 PTM 特异性抗体 320 研究蛋白质-DNA 相互作用 321 电泳迁移率分析 (EMSA) 323 染色质免疫沉淀 (ChIP) 325 荧光素酶分析 327 结论 328 推荐阅读和参考文献 328
表观遗传调节剂为理解疾病和治疗机会提供了途径
表观遗传学研究的是基因组的非遗传干扰产生的可遗传表型以及 DNA 核苷酸序列之上发生的机械过程。例如，对 DNA 的直接修饰、DNA 围绕构成染色质的组蛋白八聚体的组织以及翻译后修饰 (PTM) 在组蛋白尾部形成的直接能力会影响基因调控和细胞命运决定等可遗传特征。表观遗传状态不仅可遗传，而且可以动态且可逆（Jenuwein 和 Allis 2001）。新兴发现和尖端技术的使用为表观遗传调节剂控制的生理过程提供了见解。大量研究已经证实，蛋白质编码基因的异常表达以及种系和体细胞突变会影响 PTM、基因组组织格局的调控，进而影响发病机制，从而揭示出对抗多种疾病的生物标志物和新的治疗靶点（Dawson 和 Kouzarides 2012；Rando 和 Chang 2012；Sen 等人 2016；Dobson
细胞骨架新闻
引言乳腺癌（BC）是最常见的癌症，与全球女性最与癌症相关的死亡人数最多。bc发生在青春期后的所有年龄段的女性中。在2022年，有230万妇女被诊断出患有卑诗省的妇女，在全球范围内造成约670,000人死亡1。尽管在早期检测和治疗BC方面取得了进展，但转移，但显着使治疗复杂化，并且仍然是癌症相关死亡的主要原因2,3。转移是指癌细胞从原发性肿瘤部位扩散以在不同解剖部位建立的过程2。这些扩散的细胞很难治疗，快速生长，并且会导致在转移部位4的器官衰竭。因此，了解驱动BC转移的详细分子机制对于制定更有效的治疗干预措施至关重要。α-微管蛋白的乙酰化是一种与BC进展和转移3,5-7相关的机制。 这是一种翻译后修饰（PTM），通常发生在α-微管蛋白的赖氨酸40上，这是一种与β-微管蛋白二聚体的关键蛋白。 这些异二聚体是在5,8细胞中形成微管（MTS）聚合以形成微管（MTS）的构件。 PTM，例如乙酰化和驱虫率与癌症的细胞转化有关9。 例如，α-微管蛋白的乙酰化已被证明可以增强细胞的附着，迁移和重新分析，从而为转移势7提供选择性优势7。α-微管蛋白的乙酰化是一种与BC进展和转移3,5-7相关的机制。这是一种翻译后修饰（PTM），通常发生在α-微管蛋白的赖氨酸40上，这是一种与β-微管蛋白二聚体的关键蛋白。这些异二聚体是在5,8细胞中形成微管（MTS）聚合以形成微管（MTS）的构件。PTM，例如乙酰化和驱虫率与癌症的细胞转化有关9。例如，α-微管蛋白的乙酰化已被证明可以增强细胞的附着，迁移和重新分析，从而为转移势7提供选择性优势7。这些修饰通常与癌症的结果不良和增强的转移能力相关，这为将其定为潜在治疗剂的基本原理7,9。该新闻通讯将探讨α-微管蛋白乙酰化在BC转移中的作用，其生物学意义及其治疗潜力。