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噬菌体 x 右侧操纵子的核苷序列
限制性片段。为了制备微克量的 Hin 375、Hin 550 和 Hae 790（见图 1），将含有示踪量 lambda [32p]_ DNA（2 X 106 cpm）的 5 mg 纯化 lambda DNA 用 Hin（7）或 Hae（6）消化，乙醇沉淀，重悬于 500 ul DNA 缓冲液（5 mM NaCi、10 mM Tris-HCl，pH 7.4、1 mM EDTA）中，在含有 TBE（1）缓冲液的 3.5% 聚丙烯酰胺凝胶（6 mm X 20 cm X 40 cm）上以 320 V 电泳 23 小时。通过放射自显影定位含有适当限制性片段的凝胶部分，切除，并通过苯酚提取去除 DNA（10）。如前所述，从含有 32P 的 DNA 中分离出高比活度标记的限制性片段（2）。通过聚丙烯酰胺凝胶电泳确定每个片段的链长（1、2）。
美国的噬菌体疗法前进
噬菌体疗法是一种潜在的抗生素耐药性感染疗法，但在美国不像世界其他地区那样普遍使用。噬菌体疗法是前苏联和俄罗斯治疗细菌感染的历史实践。由于噬菌体自然存在于环境中，因此只有经过基因工程的合成噬菌体才能获得制药公司的专利，这使得在美国很难融入临床护理。但是，抗生素耐药性和生物技术的最新进展的日益增长的成本正在促使美国政府机构与工业合作，以支持开发合成噬菌体以打击抗生素耐药性。尽管很少有噬菌体疗法临床试验在过去的第二阶段进行了进展，但进一步发展的潜力令人难以置信。本综述通过评估噬菌体耐药性的风险与其潜在的益处，作为针对细菌耐药机制并提高抗生素易感性的有效产品，评估了美国噬菌体疗法的前景。
使用来自孤立环境细菌的新型回试的噬菌体防御和基因组编辑
反发是细菌免疫系统，可通过杀死受感染的宿主来保护细菌种群免受噬菌体的影响。反击通常包含逆转录酶，一个非编码RNA的模板，该模板被部分转录为RT-DNA和毒性效应子。逆转录酶，非编码RNA和RT-DNA复合物隔离了毒性效应子，直到被噬菌体感染触发为止，此时，毒素被释放出来诱导细胞死亡。由于它们在体内产生单链DNA的能力，还设计了回试以在原核生物和真核生物中生产用于基因组编辑的供体模板。然而，当前的实验表征反元的曲目受到限制，大多数回试来自细菌的临床和实验室菌株。为了更好地了解反逆转录生物学和自然多样性，并扩大了基于反逆转录基因组编辑器的当前工具箱，我们开发了一条管道来分离反替补箱及其细菌宿主与各种环境样品的分离。在这里，我们介绍了这些新颖的反词中的六个，每一个都从不同的宿主细菌中分离出来。我们表征了这些重试的完整操纵子，并测试了它们防御大肠杆菌噬菌体小组的能力。对于其中两个重演，我们通过识别负责触发流产感染的噬菌体基因来进一步揭示其防御机理。最后，我们在大肠杆菌中对这些基因组编辑进行了设计，证明了它们在生物技术应用中的潜在用途。
噬菌体防御系统的丰富度各不相同，随着病毒密度的增加
。CC-BY 4.0国际许可证。根据作者/资助者，它是根据预印本提供的（未经同行评审的认证），他已授予Biorxiv的许可证，以在2025年1月16日发布的此版本中在版权所有者中显示预印本。 https://doi.org/10.1101/2025.01.16.633327 doi：Biorxiv Preprint
噬菌体疗法：一种克服抗生素耐药性的目标方法
a Department of Allied and Public Health, School of Health, Sport and Bioscience, University of East London, London, United Kingdom b Department of Research and Innovation, Medway NHS Foundation Trust, Gillingham, ME7 5NY, United Kingdom c Department of Public Health, York St John University, London, United Kingdom d Department of Chemistry and Biochemistry, University of Arizona, USA e Department of Tissue Engineering and Regenerative Medicine, Faculty of Life Science工程，FH Technikum，维也纳，奥地利，f生物科学系，卫生与生命科学学院，Teesside大学，米德尔斯堡，英国G，美国亚利桑那大学系统与工业工程系，美国尼日利亚尼日利亚大学，尼日利亚纽约市纽约市纽约市纽约市纽约市纽约市纽约市校园和米德尔斯大学，米德尔斯大学，纽约市，
噬菌体 DNA 分离试剂盒产品说明书
噬菌体 DNA 分离试剂盒产品说明书 产品编号 46800 Norgen 的噬菌体 DNA 分离试剂盒提供了一种快速方法，可从在液体培养的细菌中繁殖的噬菌体中分离和纯化总 DNA。无需使用苯酚、氯仿或氯化铯即可分离 DNA。基于旋转柱的程序速度很快，可在 45 分钟内完成。该试剂盒可高效处理少量噬菌体上清液 (1 mL)。纯化的 DNA 具有最高的完整性，可用于多种下游应用，包括南方印迹、限制性片段长度多态性 (RFLP)、测序、克隆和实时 PCR。Norgen 的纯化技术 纯化基于旋转柱层析。无需使用苯酚、氯仿或氯化铯，即可优先从其他细胞成分（如蛋白质）中纯化噬菌体 DNA。该程序的起始材料是澄清的噬菌体上清液，该上清液已从液体培养物中的细菌碎片中分离出来。首先，使用提供的裂解缓冲液 B 通过热和化学裂解过程裂解噬菌体颗粒（请参阅第 4 页的流程图）。将异丙醇添加到裂解物中，然后将溶液加载到旋转柱上。Norgen 的旋转柱以取决于离子浓度的方式结合核酸，因此只有 DNA 会与柱结合，而大多数 RNA 和蛋白质会在流过中被去除。然后用提供的洗涤溶液 A 洗涤结合的 DNA 以去除任何残留杂质，并用洗脱缓冲液 B 洗脱纯化的总 DNA。纯化的总噬菌体 DNA 具有最高的完整性，可用于许多下游应用。试剂盒组件
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噬菌体疗法治疗囊性纤维化伯克霍尔德菌复合肺部感染：前景与挑战
1 西澳大利亚大学健康与医学科学学院生物医学科学学院感染与免疫学部，西澳大利亚州内德兰兹，澳大利亚，2 西澳大利亚大学儿童研究所澳大利亚沃尔-扬呼吸研究中心，西澳大利亚州内德兰兹，澳大利亚，3 科廷大学人口健康学院，西澳大利亚州本特利，4 西澳大利亚大学马歇尔中心生物医学科学学院感染与免疫学部，西澳大利亚州珀斯，澳大利亚，5 珀斯儿童医院呼吸与睡眠医学系，西澳大利亚州内德兰兹，澳大利亚，6 西澳大利亚大学医学与药理学学院细胞治疗与再生医学中心和哈里·珀金斯医学研究所，西澳大利亚州内德兰兹
噬菌体DNA分离试剂盒
图 1. 有效去除宿主基因组 DNA，同时不降低噬菌体 DNA 产量。使用 Norgen 的噬菌体 DNA 分离试剂盒从四种富集噬菌体培养物中分离总 DNA。在添加提供的裂解缓冲液之前进行 DNase I 预处理。简而言之，将 20 单位 DNase I 添加到 1 mL 富集噬菌体培养物中，并将混合物在室温下孵育 20 分钟。DNAase I 处理后，按照程序进行。作为对照，使用 Norgen 的噬菌体 DNA 分离试剂盒从相同 4 种培养物的等分试样中分离 DNA，而无需进行 DNase I 处理。对于 DNA 分析，将每 50 µL 洗脱液中的 10 µL 上样到 1X TAE 琼脂糖凝胶上。可以看出，噬菌体 DNA 被其外壳蛋白安全地保护起来，免受 DNase I 处理的影响，而宿主基因组 DNA 则被 DNase I 有效降解。因此，DNase I 预处理导致最终噬菌体洗脱中宿主 gDNA 污染较少，而不会影响总噬菌体 DNA 产量。M 号泳道为 Norgen 的 Highranger 1 kb DNA Ladder（货号 11900）
噬菌体DNA分离试剂盒
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