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以 miRNA 和其他非编码 RNA 为靶点的治疗方法：最新进展
摘要：自发现第一个微小RNA（miRNA，miR）以来，人们对miRNA生物学的理解已大大扩展。miRNA参与并被描述为癌症主要特征的主要调节器，包括细胞分化、增殖、存活、细胞周期、侵袭和转移。实验数据表明，可以通过靶向miRNA表达来改变癌症表型，并且由于miRNA充当肿瘤抑制因子或致癌基因（oncomiR），它们已成为有吸引力的工具，更重要的是，成为癌症治疗药物开发的新靶点。通过使用miRNA模拟物或靶向miRNA的分子（即小分子抑制剂，如抗miRS），这些疗法在临床前环境中显示出良好的前景。一些以miRNA为靶向的疗法已扩展到临床开发，例如用于治疗癌症的miRNA-34模拟物。在这里，我们讨论了 miRNA 和其他非编码 RNA 在肿瘤发生和抗药性中的作用，并总结了一些最近成功的系统性递送方法以及 miRNA 作为抗癌药物开发靶标的最新进展。此外，我们还全面概述了临床试验中的模拟物和抑制剂，最后列出了基于 miRNA 的临床试验。
非编码 RNA：胰腺癌耐药性的新兴调节剂
胰腺癌是全球第八大癌症死亡原因。包括吉西他滨、5-氟尿嘧啶、阿霉素和顺铂在内的化疗，免疫检查点抑制剂的免疫治疗以及靶向治疗已被证明可以显著改善晚期胰腺癌患者的预后。然而，大多数患者对这些治疗药物产生了耐药性，导致患者生存期缩短。导致胰腺癌耐药性的详细分子机制仍不清楚。越来越多的证据表明，非编码 RNA（ncRNA），包括微小 RNA（miRNA）、长链非编码 RNA（lncRNA）和环状 RNA（circRNA），参与胰腺癌的发病机制和耐药性的发展。在本综述中，我们系统地总结了各种 miRNA、lncRNA 和 circRNA 对胰腺癌耐药性的新见解。这些结果表明，针对肿瘤特异性 ncRNA 可能为胰腺癌治疗提供新的选择。
环状 RNA：特征、生物发生、机制和在肝癌中的功能
摘要背景：肝细胞癌（HCC）是全球最常见的恶性肿瘤之一。尽管有积极的多模式治疗方案，HCC患者的总体生存率仍然很低。主要内容：环状RNA（circRNA）是真核生物中具有共价闭合结构和组织或器官特异性表达模式的非编码RNA（ncRNA）。它们高度稳定并具有重要的生物学功能，包括充当microRNA海绵、蛋白质支架、转录调节剂、翻译模板和与RNA结合蛋白相互作用。最近的进展表明，circRNA在HCC组织中存在异常表达，并且它们的失调会导致HCC的发生和进展。此外，研究人员还发现一些circRNA可能在临床环境中用作诊断生物标志物或药物靶点。在本综述中，我们系统地评估了HCC中circRNA的特征、生物发生、机制和功能，并进一步讨论了肝癌相关circRNA的当前不足和前瞻性研究的潜在方向。结论：circRNA 是一类新型的 ncRNA，在肝癌的发生发展中发挥重要作用，但其内在机制和临床应用仍需进一步研究。关键词：circRNA，特征，生物发生，功能，机制，肝癌
回顾心脏重塑中外泌体非编码RNA的研究进度
心血管疾病（CVD）仍然是全球发病率和死亡率的主要原因。随着CVD的恶化，将发生不可逆的心脏重塑，最终导致心力衰竭（HF）[1]。早期心脏重塑最初被认为是人体的主动补偿性改变，响应压力的增加，最近的研究表明，它与CVD的发病率和死亡率直接相关[2]。人类心脏组织由各种细胞类型组成，包括心肌细胞，心脏成纤维细胞，内皮细胞（EC），平滑肌细胞和一些心脏干细胞。此外，还有许多与CVD相关的暂时细胞，包括肥大细胞，巨噬细胞和淋巴细胞。几个心脏细胞的存在和相互作用形成了一个复杂的细胞间网络，该网络由许多信号通路组成，调节细胞 - 细胞连接和/或细胞 - 细胞细胞基质相互作用以及自分泌，旁分泌，内分泌等[3，4]。外泌体最近被确定为在细胞通信中起重要作用。除了丰富的生理和信号任务外，外泌体对于去除细胞是必需的
癌症中的非编码 RNA：研究基因组“暗物质”的平台和策略
发现非编码 RNA（ncRNA）在恶性肿瘤发生和发展中的作用是癌症遗传学的一个有前途的前沿。很明显，ncRNA 是治疗干预的候选对象，因为它们可以作为生物标志物或癌症基因网络的关键调节器。最近，ncRNA 的分析和测序揭示了人类癌症中的深度失调，这主要是由于 ncRNA 生物发生的异常机制，例如扩增、缺失、异常的表观遗传或转录调控。虽然失调的 ncRNA 可能会促进癌症作为致癌基因的特征或拮抗它们作为肿瘤抑制因子，但这些事件背后的机制仍有待阐明。新的生物信息学工具以及新分子技术的开发为揭示基因组“暗物质”的作用提供了一个具有挑战性的机会。在这篇综述中，我们重点介绍了目前可用的平台、计算分析和实验策略，以研究癌症中的 ncRNA。我们重点介绍了旨在剖析 miRNA 和 lncRNA（研究最多的 ncRNA）的实验方法之间的差异。考虑到这两类 ncRNA 的内在特征（例如长度、结构以及相互作用的分子），它们确实需要进行不同的研究。最后，我们通过考虑从实验室到临床转化的前景和挑战，讨论了 ncRNA 在临床实践中的相关性。
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。CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可，根据 未经同行评审认证）是作者/资助者，他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是 由 此预印本的版权持有者（此版本于 2020 年 5 月 4 日发布。 ; https://doi.org/10.1101/2020.05.04.077750 doi：bioRxiv 预印本
乳腺癌：环状 RNA 在临床前体内模型中介导疗效
摘要。为了确定乳腺癌的新靶点和治疗方式，我们在文献中搜索了在临床前乳腺癌相关体内模型中有效的环状 RNA (circRNA)。通过我们的搜索，我们确定了 26 个上调和 6 个下调的 circRNA，它们在乳腺癌相关的临床前体内模型中起着作用。我们讨论了已确定的 circRNA 的重建和抑制，以及在化学耐药性、增殖抑制和转移背景下确定的靶点的药物性和验证。由细胞因子和高迁移率族蛋白抑制剂、核因子 ĸB 和 Hippo 信号传导驱动的途径成为肿瘤生长和转移的重要驱动因素。三叶因子 1 在雌激素受体阳性乳腺癌转移中的作用也值得进一步研究。此外，粘蛋白 19 已成为乳腺癌治疗的一个未开发的靶点。
基因，基因组，非编码器和生物学复杂性
*注意：估计人类基因数量差异的原因之一是由于在“基因”上使用了不同的概念。概念问题仅从技术的角度干扰基因预测。当前用于基因预测的计算方法并不完全精确，并且通过实验验证和手动基因重新分析不断纠正潜在误差。尽管定义给定物种的确切基因数量很重要，但科学努力却以基因组和生物的进化以及调节和基因功能为中心。进化，调节和功能信息是理解有机发育的不同过程以及因此的生物复杂程度的参数。这些信息范围从基因组和分子组织到细胞多样性（数量，形状，功能）。
循环RNA：参与认知和认知疾病调节的新参与者
圆形RNA（CIRCRNA）是一种共价封闭的内源性单链RNA，被认为是基因异常剪接的副产物，而没有任何生物学功能。最近，随着高通量测序和生物信息学的发展，已经确定了成千上万的CircrNA及其差异性生物学功能。除了确定ciRCRNA在肿瘤进展，诊断和治疗中的巨大进展外，积累的证据表明，ciRCRNA富含大脑，尤其是在突触中，并随着生物体的发展或衰老而动态变化。由于突触在高阶认知功能中的特定作用，Circrnas不仅可能在正常的生理条件下参与认知功能，而且在其表达或位置异常调节后会导致与认知相关的疾病。因此，在这篇综述中，我们总结了研究circrna在认知功能中的作用的研究进步，以及它们参与其发生，发育，预后和治疗认知相关疾病，包括自闭症，抑郁症和阿尔茨海默氏症的救助。
综述文章：设计 CRISPR 引导 RNA 用于可编程 RNA 传感器
作为CRISPR系统最有价值的特性，基于沃森-克里克碱基配对的可编程性已广泛应用于RNA传感器的工程设计。这些系统中的碱基配对提供了目标RNA和CRISPR效应子之间的连接，为体内和体外的RNA检测提供了高度特异性的机制。在过去的十年中，尽管在CRISPR爆炸式增长的时代开发了许多成功的RNA传感方法，但对CRISPR系统特性的深入了解和CRISPR家族成员的不断扩展表明，基于CRISPR的RNA传感器仍然是一个有前途的领域，可以从中设计出各种新功能和应用。在这里，我们系统地概述了设计CRISPR gRNA进行可编程RNA检测的各种策略，旨在阐明gRNA的可编程性在CRISPR支持的RNA传感器的现有局限性和未来发展中的作用。