实际上,2022年的分子纸表明,Thermo Fisher的Invitrogen E-Gel琼脂糖预制凝胶可以通过单个基于电泳的分析3。此方法大大简化了曾经是劳动密集型过程的内容。凝胶电泳中的创新增强了其可用性,使其更安全,更容易获得。预制凝胶消除了对危险化学物质和广泛准备的需求,使研究人员能够在几分钟而不是小时内获得准确的结果。Palaima指出,在其他用于Circrna分析的电泳工作流中,“如果您自己制作,则必须处理甲醛和其他真正令人讨厌的化学物质,因为您必须预防RNases
摘要:长的非编码RNA(LNCRNA)是非编码的RNA分子,超过200个nu螺旋体,在转录,转录后和翻译水平上调节基因表达。在许多人类疾病中已经鉴定出LNCRNA的异常表达。 对诊断,预后和治疗技术的未来改善将通过对疾病病因的深入了解来促进。 心血管疾病(CVD)是全球死亡的主要原因。 心脏发育涉及LNCRNA,它们的异常与许多CVD有关。 本综述研究了LNCRNA在各种CVD中的关系和功能,包括动脉粥样硬化,心肌梗塞,心肌肥大和心力衰竭。 在其中,还将讨论LNCRNA在临床诊断,预后和治疗应用中的潜在利用。在许多人类疾病中已经鉴定出LNCRNA的异常表达。对诊断,预后和治疗技术的未来改善将通过对疾病病因的深入了解来促进。心血管疾病(CVD)是全球死亡的主要原因。心脏发育涉及LNCRNA,它们的异常与许多CVD有关。本综述研究了LNCRNA在各种CVD中的关系和功能,包括动脉粥样硬化,心肌梗塞,心肌肥大和心力衰竭。在其中,还将讨论LNCRNA在临床诊断,预后和治疗应用中的潜在利用。
摘要:随着对各种疾病相关非编码RNA的了解不断加深,ncRNA正成为新的药物和药物靶点。基于不同类型的非编码RNA的核酸药物已被设计和测试。化学修饰已被应用于非编码RNA,如siRNA或miRNA,以增加其对降解的抵抗力,同时尽量减少对其生物功能的影响。化学生物学方法也已被开发来调节各种疾病发生中相关的非编码RNA。设计核糖核酸酶靶向嵌合体以降解内源性非编码RNA等新策略正在成为调节基因表达的有前途的方法,可作为下一代药物。本综述总结了基于非编码RNA的治疗诊断学的现状、开发核酸药物的非编码RNA的主要化学修饰、RNA与不同功能生物分子的结合以及设计和筛选用于调节内源性非编码RNA表达或活性的潜在分子以进行药物开发。最后,讨论了改善非编码RNA传递的策略。
图2核糖开关机制,功能和保护。(a)核糖开关是高度结构化的RNA基序,这些RNA基序嵌入了许多细菌mRNA的5'非翻译区域中,在那里它们可以在共同转文时增强或抑制基因表达,以结合小分子或元素离子离子配体。这样的机制涉及RNA聚合酶(RNAP)对转录产量的调节,而其他机制则更直接地改变了mRNA转化为蛋白质的可能性。(b)上游适体区域结合配体,渲染形成结合口袋(黄色框)的核心段以及侧翼建筑片段(蓝色框),高度保守。[112,113]相比,下游表达平台显示出较少的保护,最可能是因为它在功能上与许多对特定细菌具有特殊性的蛋白质效应子相互作用。使用biorender.com创建。
癌症是对人类健康和寿命的主要威胁。化学疗法是抑制癌细胞增殖的有效方法,但是越来越多的癌症患者容易产生对各种化学治疗剂的抗性,包括铂,紫杉醇,阿德里米霉素和5-氟尿菌等。在过去的几十年中,在化学治疗药物的研究和开发中取得了显着进步,包括靶向治疗药物和免疫检查点抑制剂;但是,耐药性仍然严重限制了这些药物在癌症治疗中的应用和效率。最近,新兴研究强调了循环RNA(CIRCRNA)在通过调节相关miRNA和靶向基因的表达来表达癌细胞在增殖,迁移,侵袭,尤其是化学上的作用。在这篇综述中,我们全面总结了CIRCRNA在癌症耐药性中的潜在作用和机制,包括药物的EF液,凋亡,与TME(肿瘤微环境),自噬和自动噬菌体和DNA损伤修复功能障碍的干预。此外,我们强调了Circrnas作为癌症的新治疗靶标和预后生物标志物的潜在价值。
尽管该领域的进步持续发展,但预测RNA的3D结构是一个显着的挑战。尽管Al-Phafold成功解决了蛋白质的问题,但RNA结构预测由于蛋白质和RNA之间的基础差异而引起了困难,这阻碍了直接适应。Alphafold的最新版本Alphafold 3扩大了其范围,以包括多个不同的分子,例如DNA,配体和RNA。虽然本文讨论了最后一个CASP-RNA数据集的结果,但RNA的性能范围和局限性尚不清楚。在本文中,我们对RNA 3D结构的预测中Alphafold 3的性能进行了全面分析。通过五个不同的测试集的广泛基准测试,我们讨论了Alphafold 3的性能和局限性。我们还将其表现力与十种现有的最新最新的,基于模板和深度学习的方法进行了比较。我们的结果可以在evryrna平台上免费获得:https:// evryrna。ibisc.univ-evry.fr/evryrna/alphafold3/。
摘要。神经胶质瘤是成年中枢神经系统最常见的原发性恶性肿瘤之一,在I -IV之间具有恶性等级。在这四个年级中,胶质母细胞瘤是最恶性和侵略性的肿瘤类型,其特征是预后不良,高复发率和初始诊断后的中位生存时间短。现有的治疗方法,例如放疗,化学疗法和手术切除术,治疗作用差;因此,发现新颖的靶向疗法以增强治疗作用并改善预后是必要的。最近,越来越多的证据表明,长期非编码RNA(LNCRNA)参与了绝大多数关键的生理和病理过程。此外,LNCRNA的异常表达水平与神经胶质瘤和其他恶性表型的发生和发展密切相关。本评论总结了对LNCRNA在表观遗传,转录和转录后水平上的功能和机制的新见解,描述了它们在神经胶质瘤中编码功能肽的能力,并将其临床潜力作为新的生物标志物和前瞻性治疗靶标讨论。
1哥伦比亚Barranquilla 081007大学医学系; mosquerai@uninorte.edu.co(m.i.m.-h.); oorjuela@uninorte.edu.co(O.M.V. div>); bubanoc@uninorte.edu.co(l.c.m. div>); csilvera@uninorte.edu.co(C.S.-R。)2哥伦比亚哥伦比亚研究所,哥伦比亚Barranquilla 080020; erbarcelo@yahoo.com 3 Department of Health Sciences, University of the Costa, Barranquilla 080002, Colombia 4 International Group of Neuro-Conductual Research (Giinco), University of the Costa, Barranquilla 080002, Colombia 5 Institute for Neurological Research Fleni, mountaineers 2325, Buenos Aires C1428aqk, Argentina; rallegri@fleni.org.AR 6心理学家研究小组(GIPSI),梅西尔林大学医学院研究所精神病学系,哥伦比亚梅德基亚大学医学院,哥伦比亚; mauricio.arcos@udea.edu.co 7工业工程系,北北奎拉081007,北部北奎拉 *通信:jvelezv@uninorte.edu.edu.co); mpgaravi@uninorte.edu.co(P.G.G.)†Tohese作者为这项工作做出了同样的贡献。 div>
背景:肉瘤约占所有人类恶性肿瘤的1%;治疗耐药性是肉瘤预后不良的主要原因之一。积累的证据表明,包括miRNA,长NCRNA和圆形RNA在内的非编码RNA(NCRNA)是与化学疗法,靶向治疗和放射疗法之间通过各种途径在串扰之间涉及的重要分子。方法:我们搜索了PubMed(Medline)数据库,以了解有关肉瘤相关的NCRNA的文章,从成立到2022年8月17日。包括研究肉瘤中宿主衍生的miRNA,长NCRNA和圆形RNA的作用的研究。与NCRNA在治疗调控中的作用有关的数据及其作为预测肉瘤治疗反应的生物标志物的适用性。两名独立研究人员使用Würzburg方法论质量评分(W-MEQS)评估了研究的质量。结果:观察性研究揭示了对抗肿瘤治疗反应不同的肉瘤患者NCRNA的异位表达。实验研究已经证实了与化学疗法,靶向治疗和放射疗法的细胞途径之间的串扰。在纳入的研究中,W-MEQS得分范围为3至10(平均得分= 5.42)。 在研究NCRNA作为生物标志物的12篇文章中,没有一个包括验证队列。 选择性报告灵敏度,特异性和接收器工作曲线是常见的。在纳入的研究中,W-MEQS得分范围为3至10(平均得分= 5.42)。在研究NCRNA作为生物标志物的12篇文章中,没有一个包括验证队列。选择性报告灵敏度,特异性和接收器工作曲线是常见的。结论:尽管NCRNA似乎是良好的候选者,作为预测肉瘤的治疗反应和治疗疗法的生物标志物,但它们在组织中的差异表达使它们的应用变得复杂。进一步研究了它们抑制或激活这些调节分子以逆转治疗耐药性的潜力可能是有用的。资金:这项研究的文献检索得到了中国医科大学(M0949 to Tao Zhang)的345人才项目的经济支持。
摘要:目前,有许多改善CRISPR/CAS9活动的策略。一种众所周知的有效方法是指导RNA修饰。已经研究了许多化学指南RNA修饰,而天然发生的RNA修饰基本上没有探索。n1-甲基丙啶(M1ψ)是一种广泛用于mRNA治疗的RNA碱基修饰,并且在基因组编辑系统中应用有很大的希望。本研究的重点是研究N1-甲基甲基苯胺对CRISPR/CAS9功能的影响。体外切割分析有助于确定M1ψ引导RNA修饰的水平,该水平能够裂解目标底物。通过分析被标记的dsDNA底物裂解,我们计算了动力学参数和修饰指南RNA的特定分数。霓虹灯转染和数字PCR使我们能够评估哺乳动物细胞中修饰的指南RNA的活性。我们的研究表明,导向RNA中的M1ψ的存在可以帮助保留靶向基因组编辑,同时显着降低了CRISPR/CAS9在体外的脱靶效应。我们还证明了CAS9与含有M1ψ的引导RNA的复合物允许在人类细胞中进行基因组编辑。因此,将M1ψ的掺入引导RNA中支持CRISPR/CAS9在体外和细胞中的活性。