最近,有报道称,一种独特的非编码 RNA(称为转移 RNA 衍生的小 RNA (tsRNA))具有多种分子功能,包括在介导免疫的细胞中。由于分子量低,tsRNA 以前很难检测,因此一直被忽视,直到现在。在这篇综述中,我们深入研究了 tsRNA 的生物发生及其多种生物学功能,从转录调控到 mRNA 翻译的调节。我们重点介绍了当前证据表明它们参与免疫反应,以及 tsRNA 如何调节免疫以影响肿瘤生长和扩散、自身免疫性疾病病理和病原体感染。我们推测 tsRNA 可能作为细胞稳态和疾病的诊断标记物,并且 tsRNA 的治疗靶向可能对一系列人类疾病有益。更好地了解 tsRNA 在哺乳动物免疫系统中的功能将使我们能够利用 tsRNA 有效地进行临床治疗以应对人类健康问题。
大规模 RNA 测序和全基因组分析项目的最新进展揭示了一组异质性 RNA,统称为长链非编码 RNA (lncRNA),它们在许多不同的生物过程中发挥着核心作用。重要的是,据报道,lncRNA 的异常表达与多种人类病理学有关,包括多种肾脏疾病。这些观察结果提出了 lncRNA 可能代表肾脏疾病尚未开发的潜在治疗靶点的可能性。然而,关于 lncRNA 的功能及其对肾脏疾病的影响的几个重要问题仍有待仔细解决。在这里,我们概述了 lncRNA 的主要功能和作用机制,以及它们作为肾脏疾病治疗靶点的前景,强调了一些最典型的 lncRNA 在糖尿病肾病的发病机制和进展中的作用。
摘要背景和目的:心脏功能缺陷会导致心脏中细胞外基质蛋白的过度积聚。本研究旨在使用机器学习算法研究和分析与心脏纤维化有关的 miRNA。方法:从公共来源和相关临床数据库收集与健康个体和心脏纤维化患者中 miRNA 表达相关的数据集。我们选择了 50 人作为研究对象,其中包括 25 名健康对照者和 25 名心脏纤维化患者。采用不同的机器学习算法,包括支持向量机、随机森林和人工神经网络来分析、分类和预测 miRNA 表达变化在心脏纤维化中的作用。通过留一交叉验证和独立数据集对机器学习模型的验证有效地支持了结果的稳健性。报告的准确性、敏感性和特异性指标令人印象深刻。结果:两组间共发现 78 个 miRNA 存在差异表达(调整 P < 0.05),与对照组相比,心脏纤维化组有 47 个 miRNA 上调,31 个 miRNA 下调。比较每种方法选出的前 10 个 miRNA,并确定一组一致的 5 个 miRNA(miR-21-5p、miR-29a-3p、miR-29c-3p、miR-30b-5p 和 miR-133a-3p)作为区分心脏纤维化和对照样本最具参考价值的特征。结果显示,与对照组相比,心脏纤维化患者的 miR-21-5p、miR-29a-3p 和 miR-29c-3p 表达增加。相反,与患者相比,正常受试者中 miR-30b-5p 和 miR-133a-3p 的表达增加。发现具有径向基函数核的 SVM 算法是性能最佳的模型,其准确率为 92%,灵敏度为 88%,特异性为 96%,受试者工作特征曲线下面积 (AUC-ROC) 为 0.95。结论:总体而言,对患者体内 miRNA 的评估可作为监测患者和应用治疗策略的生物标志物。关键词:miRNA、心脏纤维化、机器学习、网络分析、生物标志物资金:无*本作品已根据 CC BY-NC-SA 许可发表。版权所有 © 作者引用本文为:Amin A、Rashki Ghalehnoo S、Mohajerian A、Samadi P、Torabahmadi A、Ahadi S、Hasanvand A、Nikdoust F。评估与心脏纤维化有关的 miRNA:基于机器学习的方法。伊朗红新月会医学杂志。2024,54.1-10。
收到的原件:10/01/2024出版接受:10/25/2024 Arlan Silva Freitas理解机构:EstacioSãoLuís中心SãoLuís,Maranhão,Brazil e-Mail:Mail e-Mail:Mail:Mail:Mail:Mail:Mail e-Mail:arlanfreitas@gmail.com@gmail.com rozenne kerley collo collo collo copi copi copie copi cairo:教授rozenne@gmail.com摘要Micronor(miRNA)是小的RNA片段,在调节基因表达中起着至关重要的作用,并参与了各种生物学过程,包括神经退行性疾病的发展。它们通过与信使RNA分子(mRNA)结合起作用,从而抑制蛋白质产生,从而影响细胞功能。最近的研究将miRNA与阿尔茨海默氏症和帕金森等疾病等疾病相关联,表明它们在这些疾病的病理中的重要性。本文献综述的工作探讨了miRNA的生物发生,详细介绍了其作用机理,并检查了其在基因调节中的作用。此外,它讨论了DNA甲基化与miRNA的表达之间的相互关系,表明表观遗传变化会影响这些调节剂的活性。miRNA脱颖而出,成为潜在的生物标志物,可能有助于早期诊断和监测神经退行性疾病。还考虑了有希望的治疗靶标,表明操纵其信号通路可以导致更有效的治疗的发展。因此,miRNA成为理解这些疾病基础机制的关键分子,开辟了有关创新和个性化治疗干预措施的新观点,不仅旨在减轻症状,还旨在调节病理学过程
摘要。除了化疗外,靶向疗法已被批准用于治疗局部晚期和转移性胃癌。治疗效果显著,但应实现更持久的反应和生存率的提高。因此,确定新的靶点和新的临床治疗方法至关重要。在这篇综述中,我们在文献中搜索了干扰可用药靶点并在临床前体内疗效模型中表现出疗效的下调 microRNA。作为可用药靶点,我们选择了跨膜受体、分泌因子和酶。我们确定了 38 个符合所述标准的 microRNA。共有 13 个 miR 靶向跨膜受体,9 个抑制分泌蛋白,16 个减弱酶。这些 microRNA 是胃癌重建治疗的靶点。对于所有已确定的 microRNA,必须进行进一步的靶点验证实验。胃癌 (GC) 是全球第三大癌症病因,也是第四大常见癌症,全球每年死亡人数为 700 000 人 (1)。从分子角度来看,已鉴定出以下亚型:Epstein–Barr 病毒、微卫星不稳定性、
摘要:自发现第一个微小RNA(miRNA,miR)以来,人们对miRNA生物学的理解已大大扩展。miRNA参与并被描述为癌症主要特征的主要调节器,包括细胞分化、增殖、存活、细胞周期、侵袭和转移。实验数据表明,可以通过靶向miRNA表达来改变癌症表型,并且由于miRNA充当肿瘤抑制因子或致癌基因(oncomiR),它们已成为有吸引力的工具,更重要的是,成为癌症治疗药物开发的新靶点。通过使用miRNA模拟物或靶向miRNA的分子(即小分子抑制剂,如抗miRS),这些疗法在临床前环境中显示出良好的前景。一些以miRNA为靶向的疗法已扩展到临床开发,例如用于治疗癌症的miRNA-34模拟物。在这里,我们讨论了 miRNA 和其他非编码 RNA 在肿瘤发生和抗药性中的作用,并总结了一些最近成功的系统性递送方法以及 miRNA 作为抗癌药物开发靶标的最新进展。此外,我们还全面概述了临床试验中的模拟物和抑制剂,最后列出了基于 miRNA 的临床试验。
摘要:尽管RNA的下一代测序(NGS)广泛使用,但多个RNA核苷酸修饰的同时直接测序和定量映射仍然具有挑战性。质谱(MS)的测序可以直接序列所有RNA修饰,而无需限于特定的测序,但是它需要很少有TRNA可以提供的完美MS梯子。在这里,我们描述了一种MS梯子互补测序方法(MLC-SEQ),该方法避免了完美的阶梯要求,从而可以在单核苷酸精度下对全长异质细胞TRNA进行全长异质细胞TRNA的测序。与基于NGS的方法(失去RNA修改信息)不同,MLC-Seq保留了RNA序列多样性和修改信息,揭示了新的详细的化学计量tRNA修饰谱及其在使用DealKylating酶ALKB治疗时进行的更改。也可以将其与参考序列结合使用,以提供对总TRNA样品中不同TRNA和修改的定量分析。MLC-Seq可以实现RNA修改的系统,定量和特定于位点的映射,从而揭示了TRNA的真正完整信息内容。■简介
对治疗的抵抗力。例如,LNCRNA和miRNA与LNCRNA相互作用,LNCRNA充当竞争性内膜RNA(CERNAS),以改变miRNA活性并改变癌细胞中的mRNA表达。[5] lncrNA在肿瘤发生,预后结局,口腔癌的前体和相关信号通路中的作用,特别是引起了很多关注。这些分子在一系列生理和病理过程中具有重要功能,包括癌症和基因调节网络的复杂性。与口腔癌相关的识别和特征 - izing lncRNA为他们作为早期检测的生物标志物的潜力和开发成功疗法的靶标提供了重要的见解,同时还解决了使用NCRNA来改善患者结局的挑战。[6,7]三个肿瘤抑制lncRNA(MEG3,POU3F3和PANDAR),两个转移性的LNCRNA(Linc00312和Malat1)和六个LNCRNA(CD-KN2B-AS1,H19,H19,Hotair,Hotair,hotair,ap5m1,linc-linc-rinc-rer and cinterfif)[8] microRNA(miRNA)已成为口腔癌发病机理的关键参与者。microRNA是微小的非编码RNA分子,在转录后控制基因表达,影响各种生物学和病理过程,包括癌症形成和进展。他们参与口腔癌强调了它们作为早期检测生物标志物和新技术的靶标的潜力。研究
包括胃癌在内的癌症已成为危害公众生命的严重疾病,目前主要的治疗方法为手术、放疗和化疗,耐药性是胃癌患者死亡的主要原因之一。目前已报道的抗癌药物耐药机制包括药物转运代谢的改变、药物靶点的突变、DNA修复系统的改变、细胞凋亡和自噬的抑制、胃癌干细胞、侵袭和迁移等。越来越多的研究表明,非编码RNA(如环状RNA)在胃癌治疗药物的耐药性中起着至关重要的作用。环状RNA具有独特的结构和功能,与胃癌耐药性、细胞增殖、凋亡、自噬、DNA修复系统、迁移和侵袭等有关。了解环状RNA介导胃癌药物耐药的分子机制将为胃癌的治疗和管理打开新的窗口。因此,本综述将对目前耐药机制进行总结,并最终讨论circRNA调控胃癌耐药发展的分子机制。
摘要 近年来,接受不同免疫疗法治疗的癌症患者的预期寿命不断增加,这凸显了免疫系统通过诱导免疫细胞介导的细胞毒性来调节肿瘤生长的重要性。然而,肿瘤往往会逃避免疫监视,这是通过不同的机制实现的。最近的研究表明,小型非编码 RNA,如微小 RNA (miRNA),在免疫调节分子的转录后调控中起着重要作用。已经使用了多种方法来识别靶向逃避免疫识别的基因的 miRNA,包括靶向 CTLA-4、PD-L1、HLA-G、主要组织相容性 I 类抗原加工机制 (APM) 的组成部分以及肿瘤中其他免疫反应相关基因的 miRNA。由于其功能,这些免疫调节 miRNA 可用作 (1) 诊断和预后生物标记,用于区分肿瘤阶段并预测患者的预后以及对 (免疫) 疗法的反应和抵抗力,以及 (2) 治疗肿瘤患者的治疗靶点。本综述总结了 miRNA 在肿瘤介导的免疫逃逸中的作用,讨论了它们作为诊断、预后和预测工具的潜力以及它们作为治疗剂的用途,包括替代应用方法,例如嵌合抗原受体 T 细胞。