英国,伦敦大学学院 GOS 2 号儿童健康研究所,英国伦敦基因疗法使用自体离体基因修饰的 CD34 + 造血干细胞 (HSC) 移植作为治疗一系列单基因疾病的方法,现在已通过多项临床研究和监管部门的批准,因其变革潜力而得到认可。尽管基因疗法的商业化取得了重大进展,但患者可及性的主要障碍是目前制造 GMP 级慢病毒 (LV) 载体的能力有限,以及生产基因和细胞疗法所产生的相应高昂成本。此外,还需要为成年患者(例如患有 X 连锁慢性肉芽肿病 (X-CGD) 的患者)制造更多基因修饰的 HSC,以及用于患者群体较大的适应症。因此,降低载体需求和商品成本是基因疗法商业化的关键挑战。转导增强剂的应用使得可以使用更少量的 LV 载体来实现相同的基因修饰细胞产量。几种增强剂化合物已常规应用于临床基因和细胞治疗制造,以改善病毒在不同细胞水平上的转导过程,例如病毒附着、载体进入和基因组整合。为了开发一种优化的 LV 转导 HSC 方案,我们筛选了 20 多种市售和新型候选化合物,以增强活性,单独使用或组合使用以针对不同的病毒转导途径。我们全面调查了这些增强剂可实现的转导效率 (TE) 和载体拷贝数 (VCN) 的改善情况,使用临床级治疗性 LV 载体,通过缩小高通量和临床规模的转导过程进行 HSC 基因治疗药物产品制造。然后评估了最有效的增强剂组合与其他已知转导培养过程修改的兼容性,以开发一种优化的 HSC 转导方案。对增强剂处理的 HSC 进行了广泛的体外和体内表征,包括 RNAseq 转录分析和小鼠竞争性植入研究。我们在此描述了 J-Boost,它是一类新型转导增强剂(二嵌段共聚物,PCT/US20/56123)中的代表性化合物,可促进病毒进入。当与硫酸鱼精蛋白 (PS) 和高密度培养物结合使用时,J-Boost 可使 VCN 增加约 9 倍,TE 增加约 4 倍,使 HSC 转导至 LV 载体减少 50-70%
1加利福尼亚州斯坦福大学医学系胃肠病学和肝病学系2佛蒙特大学拉尔纳大学医学院神经科学系神经科学系§双重第一作者 *同学作者合作作者巨噬细胞(MMS)与遗传群体(MOCTINAL)(ENSINAL GASIRINAL(ENSINAL)(ENSINAL)(ENSINAL)(ENSINAL)(ENSINAL)(ENSINAL)(ENSINAL)(ENSINAL(ENSINAL)(ENSINAL(ENSINAL)(ENSINAL(ENSINAL)(ENSINAL)(ENSINAL)(ENSINAL(ENSINAL)(ENSINAL)(ENSINAL(ENSINAR)道。mms通常表达抗炎性表型,并支持ENS稳态。在衰老中,MM表型转移到与GI失调症相关的促炎状态。在阿尔茨海默氏病中,小胶质细胞发展出一种独特的炎症特征,称为疾病激活的巨噬细胞(DAM)表型。在这里,我们假设老年小鼠中的Muscularis巨噬细胞(MMS)会形成一种促炎状态,该状态与神经变性中观察到的大坝表型相似。为了测试这一点,我们从小肠,结肠和脊髓(3个月)和年龄(16-24 MXONTHS)WT C57BL/6小鼠中分离了免疫细胞。细胞分解并分类,以通过定量实时PCR(QPCR)和单细胞RNASEQ促进基因分析。年轻小鼠和年龄小鼠每人表现出以小胶质细胞基因表达为特征的稳态MMS(P2RY12,TREM2,GPR34)。在表达大坝基因的老年小鼠(CD9,ITGAX,CLEX7A)中鉴定出了老年状态(GS)MMS的种群。gs细胞表现出降低的Phrodo珠的吞噬作用,并降低了 - 突触核蛋白的清除率。总而言之,小鼠和人类MMS表现出类似于小胶质细胞的稳态表型。确认这些发现的临床翻译,我们将细胞与人类结肠样品分离,然后通过FACS对其进行排序,以通过qPCR促进基因分析。我们确定了与表现出稳态小胶质细胞基因的小鼠中观察到的人类群体(mM 1)。在衰老中,人类MM 1细胞会形成与-突触核蛋白积累相关的GS表型。随着衰老的形式,MMS形成了一种促炎的GS表型,类似于在神经退行性疾病中观察到的大坝小胶质细胞。表型的这种转变可能会驱动肠神经元存活的变化,并降低了先前在衰老中观察到的胃肠道运动。
在这个项目中,我们正在研究肾囊肿形成期间上皮组织诱导的纤毛生成过程与转录调节之间的联系。 div>已经表明,上皮的拉伸在肾细胞中诱导FOXJ1A转录因子的快速表达,这是纤毛发生过程的关键电感器,这表明纤毛在肾脏对损伤的体内反应中扮演了作用。 div>通过使用激酶抑制剂库的高性能化学测试(高直通化学筛选),我们确定了细胞信号传导途径,这些途径正在调节上皮的机械拉伸引起的转录反应。 div>我们还开发了一种转基因斑马鱼线,使我们能够识别FOXJ1A基因启动子中介导其对拉伸反应的区域。 div>通过与肾上皮细胞的特定RNSEQ分析结合的生物信息学方法,我们正在研究其他基因中也存在调节序列的鉴定,这些基因也与FOXJ1A共同调节并通过上皮伸展而诱导。 div>为了实现这种方法,我们开发了新的方案来执行大规模的体内测试,并从斑马鱼胚胎中分离肾上皮细胞。 div>为了解决该项目的目标,我们进行了生化,遗传和生物信息学测试,并生成新的转基因斑马线,使我们能够在完整的生物体中进行体内表征。 div>人类分子遗传学,协调员或负责任的设备的基本20小时实验室:Cárdenas-Rodriguez,M,Drummond,关键词:Cilia肾脏质量机械生物学
皮质细胞损失是亨廷顿氏病(HD)的核心特征,从临床运动诊断之前多年开始,在先前阶段之前。但是,尚不清楚遗传形态与皮质细胞损失有何关系。在这里,我们探讨了这种关系的生物学过程和细胞类型,并使用细胞特异性验尸数据验证它们。平均有15年的疾病发作和71个对照的八十个premifest参与者。 使用体积和扩散MRI,我们提取了HD特异性的全脑图,其中较低的灰质体积和较高的灰质平均扩散率相对于对照组,用作皮质细胞损失的代理。 这些地图与来自艾伦人脑图集(AHBA)的基因分类数据相结合,以研究与遗传折叠和皮质细胞损失有关的生物学过程。 皮质细胞损失与发育基因的表达呈正相关(即 较高的表达与更大的萎缩和增加的扩散率相关),并且与已与神经变性有关的突触和代谢基因的表达负相关。 这些发现对于扩散MRI和容积HD特异性脑图是一致的。 作为野生型亨廷汀在神经发育中起着作用,我们探索了整个AHBA野生型亨廷顿(HTT)表达(HTT)表达与发育基因表达之间的关联。 还进行了134个没有神经退行性疾病的人脑中的共表达网络分析。 这些事件导致跨脑细胞类型的年龄相关细胞死亡。八十个premifest参与者。使用体积和扩散MRI,我们提取了HD特异性的全脑图,其中较低的灰质体积和较高的灰质平均扩散率相对于对照组,用作皮质细胞损失的代理。这些地图与来自艾伦人脑图集(AHBA)的基因分类数据相结合,以研究与遗传折叠和皮质细胞损失有关的生物学过程。皮质细胞损失与发育基因的表达呈正相关(即较高的表达与更大的萎缩和增加的扩散率相关),并且与已与神经变性有关的突触和代谢基因的表达负相关。这些发现对于扩散MRI和容积HD特异性脑图是一致的。作为野生型亨廷汀在神经发育中起着作用,我们探索了整个AHBA野生型亨廷顿(HTT)表达(HTT)表达与发育基因表达之间的关联。还进行了134个没有神经退行性疾病的人脑中的共表达网络分析。这些事件导致跨脑细胞类型的年龄相关细胞死亡。htt表达与神经发育中涉及的基因的表达相关,而共表达网络分析还表明,HTT的表达与发育生物学过程有关。表达加权细胞类型富集(EWCE)分析用于探索哪些特定细胞类型与HD皮层细胞损失相关,并使用来自邮政损坏的HD脑的细胞特异性单核RNASEQ(SNRNASEQ)数据验证了这些关联。在星形胶质细胞和内皮细胞中富含皮质细胞损失的发育转录组谱,而神经退行性转录组谱则富含神经元和小胶质细胞。在HD后大脑中相对于使用SNRNASEQ的对照组差异表达的星形胶质细胞特异性基因富集于Devel-Opmental转录组谱,而神经胶质细胞和小胶质细胞特异性基因在神经变性转录组中富集。我们的发现表明,PreHD中的皮质细胞损失可能是由双重病理过程引起的,这是神经发育变化的一种结合,在生命开始时,随后是成年后的神经变性,靶向突触表达和代谢基因表达降低的区域。