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非核苷SARS-COV-2 RDRP抑制剂的新型类似物作为潜在的抗毒素
病毒RNA依赖性RNA聚合酶（RDRP）均编码在所有RNA病毒中，并在病毒RNA复制中起着至关重要的作用。在SARS-COV-2的蛋白质组中，与辅因子NSP7和NSP8一起表达的催化亚基NSP12构成RDRP [8]。RDRP通常由核苷酸类似物抑制剂（NAI）靶向[9]。这类抗病毒药可以通过充当延迟的链终结剂或引起病毒RNA的遗传腐败来抑制复制，其中包括对Covid-19患者治疗的第一个FDA批准的抗病毒药物，Remdesivir [10]和Molnupiravir [11]。NAI的可用性可能在很大程度上取决于代谢激活，并且还与天然核苷三磷酸盐（NTPS）的细胞内池竞争。非核苷酸模拟抑制剂（NNAIS）在与活性的RDRP的活性相结合时不会面临这些挑战，因此它们代表了有希望的NAI替代方案[12]。
瑞德西韦、齐多夫定 (AZT) 和奈韦拉平通过与聚合酶 L 的 RdRp 结构域进行高能相互作用来抑制 Chandipura 病毒复制
1 PDM 大学，巴哈杜尔加尔，哈里亚纳邦 2 德里大学生物物理系，南校区，新德里 3 德里大学南校区生物化学系，新德里 *通信地址：Dibyakanti Mandal 博士 PDM 大学生命科学学院微生物学系，3A 区，巴哈杜尔加尔哈里亚纳邦 - 124507 电子邮件：dkmandal2000@yahoo.com 电话：+918584000652 # 通信地址也可以是：Manish Kumar 博士 德里大学生物物理系，南校区 Benito Jaurez Marg，新德里 - 110021 电子邮件：manish.imt@gmail.com 关键词：Chandipura 病毒 L、瑞德西韦、AZT 和奈韦拉平 标题：瑞德西韦、AZT 和奈韦拉平对 CHPV 复制的抑制
针对SARS-COV-2 RDRP
背景：已证明不同的方法可有效地对抗COVID-19的大流行。在计算机药物重新利用策略中，被高度视为获得快速可靠结果的准确计算工具。 考虑SARS-COV-2的结构蛋白及其相互作用为宿主的细胞特异性受体，该研究调查了一种旨在筛选FDA批准药物对病毒入口受体（ACE2和CD147）的兼容抑制剂的药物重新利用策略和病毒Poly Merase（RDRP）的酶（RDRP）。 方法：通过虚拟筛选和分子动力学（MD）模拟，该研究对ACE2，CD147和RDRP筛选了FDA批准的药物。 结果：这项研究的结果表明，ACE2的五种药物，四种具有RDRP的药物和CD147的七种药物达到了最有利的游离结合能（δG<-10）。 这项研究选择了这些药物进行MD模拟研究，其结果表明，具有ACE2，cD147雌二醇苯甲酸酯的Ledipasvir和带RDRP的Vansomycin代表了最有利的δG。同样，Paritaprevir和Vansomycin与靶标具有良好的结合能（ACE2和RDRP）。 结论：Ledipasvir，雌二醇苯甲酸酯，万古霉素和Paritaprevir可能是合适的候选者，可作为COVID-19和新型药物开发的可能治疗进一步研究。被高度视为获得快速可靠结果的准确计算工具。考虑SARS-COV-2的结构蛋白及其相互作用为宿主的细胞特异性受体，该研究调查了一种旨在筛选FDA批准药物对病毒入口受体（ACE2和CD147）的兼容抑制剂的药物重新利用策略和病毒Poly Merase（RDRP）的酶（RDRP）。方法：通过虚拟筛选和分子动力学（MD）模拟，该研究对ACE2，CD147和RDRP筛选了FDA批准的药物。结果：这项研究的结果表明，ACE2的五种药物，四种具有RDRP的药物和CD147的七种药物达到了最有利的游离结合能（δG<-10）。这项研究选择了这些药物进行MD模拟研究，其结果表明，具有ACE2，cD147雌二醇苯甲酸酯的Ledipasvir和带RDRP的Vansomycin代表了最有利的δG。同样，Paritaprevir和Vansomycin与靶标具有良好的结合能（ACE2和RDRP）。结论：Ledipasvir，雌二醇苯甲酸酯，万古霉素和Paritaprevir可能是合适的候选者，可作为COVID-19和新型药物开发的可能治疗进一步研究。