euglena gracilis是一种单细胞的光养生者,是一种有前途的食物,饲料和生物燃料的材料。但是,该物种中有针对性的诱变方法的发展一直是长期的挑战。在当前的遗传操纵技术中,通过RNP的直接递送进行基因组编辑具有各种优势,包括时间效率,低细胞毒性,高效率和降低距离效应(Jeon等,2017)。在我们的方法,插入和/或缺失(INDEL)突变率为77.7%–90.1%的突变率中,通过在Eggsl2基因中的两个不同靶序列中进行了扩增子测序(Nomura等,2019)。因此,我们在大肠杆菌中开发的基于RNP的基因组编辑开辟了新的途径以揭示基因的功能。
CRISPR 基因组工程已成为一种功能性研究免疫系统调节复杂机制的强大工具。尽管数十年来一直致力于对先天免疫进行遗传重编程,但当前方法的实用性受到体内成熟细胞谱系的敲除效率低或特异性有限的限制。在这里,我们描述了一种优化的非病毒 CRISPR-Cas9 核糖核蛋白 (cRNP) 基因组编辑策略,该策略可对成熟的原代小鼠先天淋巴细胞 (ILC) 和髓系细胞进行基因组编辑,从而导致单次电穿孔导致单或双靶基因表达几乎完全丧失。此外,我们描述了体内过继转移小鼠模型,该模型可用于使用 cRNP 编辑的幼稚自然杀伤 (NK) 细胞和骨髓衍生的常规树突状细胞前体 (cDCP) 筛选病毒感染期间的基因功能。该资源将增强靶基因发现,并为小鼠先天免疫系统中的基因编辑提供一种特定且简化的方法。
摘要 使用 CRISPR-Cas9 对原代人类细胞进行基因组工程改造彻底改变了细胞生物学的实验和治疗方法,但人类髓系细胞在遗传上仍然难以治疗。我们提出了一种通过核转染将 CRISPR-Cas9 核糖核蛋白 (RNP) 复合物直接递送到从外周血纯化的 CD14+ 人类单核细胞中的方法,从而实现高精确基因敲除率。这些细胞可以有效分化为单核细胞衍生的巨噬细胞或树突状细胞。该过程产生的基因编辑细胞保留了髓系分化和吞噬功能的关键标记。限制因子 SAMHD1 的基因消融使 HIV-1 感染增加了 50 多倍,证明了该系统在基因型-表型查询方面的强大功能。这种快速、灵活且可扩展的平台可用于人类髓系细胞在免疫信号、炎症、癌症免疫学、宿主-病原体相互作用等方面的遗传研究,并可促进新型髓系细胞疗法的开发。简介髓系细胞是健康和疾病免疫系统中的关键参与者(Germic 等人,2019 年;Lapenna 等人,2018 年;Worbs 等人,2017 年)。单核细胞和巨噬细胞在先天免疫系统的直接分支中发挥作用,对病原体或组织损伤作出反应,并帮助调节和解决组织炎症。作为专业的抗原呈递细胞,树突状细胞可协调适应性免疫反应。鉴于髓系细胞的核心作用,髓系细胞被确定为从发育和稳态调节到病原体反应、自身炎症性疾病、纤维化和恶性肿瘤等各个方面的关键参与者也就不足为奇了 (Chao 等人,2020 年;Engblom 等人,2016 年;Manthiram 等人,2017 年;Medzhitov 和 Janeway,2000 年、1997 年;Wynn 等人,2013 年)。更好地了解这些细胞的正常行为和致病行为对于进一步加深我们对各种疾病的机制理解至关重要,为发现和发展新疗法带来了希望。我们识别新治疗靶点和构建新细胞干预措施的能力与我们对相关原代细胞类型的基因操作能力同步发展。例如,小鼠基因方法揭示了小鼠巨噬细胞的显著多样性,而骨髓亚群的基因消融为临床中类似细胞的治疗靶向铺平了道路(Wynn 等人,2013 年)。CRISPR-Cas9 介导的基因靶向显著扩展了曾经难以治疗的细胞类型的潜力,促进了重要的发现工作和增强的原代 T 细胞细胞治疗方法(Roth 等人,2018 年;Schumann 等人,2015 年;Simeonov 和 Marson,2019 年;Stadtmauer 等人,2020 年),以及使用编辑的造血干细胞/祖细胞治疗衰弱性遗传疾病(Foss 等人,2019 年;Wu 等人,2019 年)。到目前为止,CRISPR-Cas9 在原代人类髓系细胞中效率低下,限制了人类免疫系统这些关键细胞的功能遗传学研究和基因组工程。已鉴定出 SAMHD1 是髓系细胞中阻止有效慢病毒转导的关键限制因子(Hrecka 等人,2011 年;Laguette 等人,
核糖核酸(RNA)的特征如下:核糖核酸(RNA)是另一种核酸类型。像脱氧核糖核酸(DNA)一样,这是一种多核苷酸,但在其结构中发现了几种差异。
这项研究的主要目的是为组织工程应用开发经济,环保且可延展的生物材料。水和甘油已被用作明胶水凝胶合成的溶剂。这种溶剂混合物导致具有改善热性能的生物材料。确实,达到了16°C的热过渡温度。此外,为了增强机械性能,核黄素被用作交联剂。使用紫外线辐射开始化学交联步,以获得明胶链的核黄素自由基聚合,因此,明胶水凝胶的流变学特性得到了改善。因此,明胶 - 紫外线血凝胶水凝胶显示出良好的肿胀和增加的机械性能,获得了一种新颖的材料,用于药物输送和医疗用途。版权所有©2019 VBRI出版社。关键字:组织工程,生物聚合物,交联。简介
核糖体的肽基转移酶中心(PTC)催化肽基转移和释放。它由23S核糖体RNA的域V组成,它通过RNA修饰酶进行了大量修饰,这表明这些修饰在功能上很重要。然而,酶的单个敲除(KO)对细菌生长的影响很小,除了研究RRNA修饰对细胞活力的重要性外,需要KOS的组合。我们的协作成功地构建了菌株,该菌株表现出迄今为止最严重的表型和致命的表现,这表明RRNA修饰酶的条件重要性。此外,在PTC“关键区域”周围缺乏23S rRNA的早期重构表现出催化惰性50s。但是,我们的合作构建了一个菌株,所有鉴定的关键区域修饰酶KOED。该菌株是可行的,并且在暗示PTC周围修饰的酶的可塑性时表现出最小的生长不足。尽管这些KO菌株的表型已经很好地表征了,但此类缺陷的分子解释仍然不清楚。在这里,基于生化方法,我指出了酶KO会影响核糖体组装和易位,而不是在两个组合的KO菌株中,而不是肽键的形成或释放。这些结果阐明了神秘的rRNA修饰的重要性和作用。尽管建议在生理pH下进行水解速率限制步骤,但证据是间接的。释放也是通过PTC催化的,并且了解限制速率的步骤可以帮助遗传工程,因为终止密码子的读取可以掺入不自然的氨基酸并治疗遗传疾病。在这里,我使用氟修饰的氨基酸激活了酯电力。在较低pHS处与活化酯的释放反应加速度为限制速率水解的直接证据。肽基转移和释放的机械研究主要基于50S亚基的晶体结构。然而,两个模型反应在50年代均显示出比70年代慢的速度速率,从而质疑其相关性。在这里,我优化了肽基的转移和释放模型反应,尽管在有机溶剂中,但对近物生理速率进行了优化。通过用PEG代替有机溶剂来实现的一种更生理的溶液,可以最能加速肽基转移,但不能释放。这些优化的反应应有助于分析合成核糖体/PTC的活性,并深入了解核糖体的演变。