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World File Search SystemSERPINE1
重组人纤溶酶原激活剂抑制剂 1 活性
描述：纤溶酶原激活剂抑制剂 1 ((SERPINE1/PAI1) 是组织纤溶酶原激活剂 (tPA) 和尿激酶 (uPA) 的主要抑制剂，而组织纤溶酶原激活剂和因此而引起的纤维蛋白溶解。它是一种丝氨酸蛋白酶抑制剂 (serpin) 蛋白 (SERPINE1)。PAI1 主要由内皮细胞产生，但也由其他组织类型分泌，例如脂肪组织。SERPINE1 基因缺陷是纤溶酶原激活剂抑制剂 1 缺乏 (PAI1 缺乏) 的原因，而高浓度的 SERPINE1/PAI1 与血栓形成有关。
中风心脏综合征的免疫特征和炎症治疗靶标的鉴定
由中风心脏综合征（SHS）引起的急性心脏功能障碍是中风相关死亡的第二大原因。炎症反应在心脏损伤的病理生理过程中起着重要作用。但是，大脑的基础机制 - 心脏相互作用的理解很少。因此，我们旨在分析免疫学表征并确定SHS的炎症治疗靶标。我们通过MCAO或假手术在基因表达综合（GEO）的公开数据集（GSE102558）中分析了MCAO或假手术诱导局部缺血后的心脏组织的基因表达数据。生物信息学分析显示，与假处理的小鼠相比，MCAO处理的心肌中有138个差异表达的基因（DEG），其中免疫和炎症途径富集。对免疫细胞进行术中的分析表明，两组之间的天然杀伤细胞群显着不同。我们识别了五个diregs，aplnr，ccrl2，cdkn1a，irak2和serpine1，发现它们的表达与心脏组织中填充免疫细胞的特异性种群相关。rt - QPCR和Western印迹方法在MCAO之后证实了APLNR，CDKN1A，IRAK2和SERPINE1的表达水平的显着变化，这可能是预防中风后心血管并发性的治疗靶标。
间充质干细胞女生成体的衰老相关改变
摘要：衰老的过程与组织和细胞水平的改变密切相关。目前，仍在研究衰老细胞在组织微环境中的作用。尽管有共同的特征，但不同的细胞群在衰老过程中会发生独特的形态功能变化。间充质干细胞（MSC）在维持组织稳态中起关键作用。许多研究检查了细胞因子谱的改变，这些变化决定了它们的调节功能。MSC的细胞外基质（ECM）是其生物学研究较少的方面。已显示它可以调节相邻细胞的活性。因此，研究MSC基质组中与年龄相关的变化对于理解组织利基衰老的机制至关重要。这项研究对衰老MSC的分离分数（包括ECM，条件培养基（CM）和细胞裂解物）的分离分数的生长群进行了广泛的蛋白质组学分析。这是第一次进行这种分析。已经确定，生产的转变向调节分子以及ECM的主要结构和粘附蛋白的显着下调，尤其是胶原蛋白，纤维蛋白和纤维蛋白。此外，已经观察到了组织蛋白酶，甘叶蛋白，S100蛋白和其他具有细胞保护，抗炎和抗纤维化特性的降低。但是，抗纤维化途径的炎性蛋白和调节剂的水平增加。此外，还有蛋白质的上调，可以直接对微环境细胞产生衰老的影响（Serpine1，THBS1和GDF15）。这些变化证实，衰老MSC不仅通过细胞因子信号，而且还通过重塑的ECM对组织中的其他细胞产生负面影响。
识别用于治疗 OSCC 的潜在治疗靶点及其配体
癌症生物学领域的最新进展揭示了与致癌作用和化疗暴露相关的分子变化。现有信息正被充分利用来开发针对与癌细胞生长、存活和化学耐药性有关的特定分子的疗法。靶向疗法已显著提高许多癌症的总生存期 (OS)。因此，开发针对口腔鳞状细胞癌 (OSCC) 的此类靶向疗法预计将具有重大的临床意义。在当前的工作中，我们利用基因表达、Cox 比例风险回归和机器学习在 OSCC 中确定了与药物特异性敏感性相关的预后生物标志物 (BOP1、CCNA2、CKS2、PLAU 和 SERPINE1)。这些标志物的失调与许多癌症的总生存期显著相关。它们的表达升高与各种癌症中的细胞增殖和侵袭性恶性肿瘤有关。从机制上讲，抑制这些生物标志物应能显著减少 OSCC 中的细胞增殖和转移，并应能带来更好的 OS。值得注意的是，迄今为止尚未发现针对这些生物标志物的有效小分子候选药物。因此，我们采用了一种综合的计算机药物设计策略，结合同源性建模、广泛的分子动力学 (MD) 模拟和集合分子对接，来识别针对已识别靶标的潜在化合物，并已识别出潜在分子。我们希望这项研究将有助于揭示在化学耐药性中发挥作用并对 OS 产生重大影响的潜在基因。它还将导致识别针对 OSCC 的新靶向疗法。
研究论文鉴定巩膜外基质重塑的关键基因和途径：潜在的治疗剂Discovere
背景：青光眼是不可逆转的失明的主要原因。硬化细胞外基质（ECM）的重塑在青光眼发展中起重要作用。这项研究的目的是通过生物信息学分析来确定巩膜在青光眼中进行ECM重塑的关键基因和途径，并探索青光眼管理的潜在治疗剂。方法：使用文本挖掘工具PubMed2Ensembl检测到与青光眼，巩膜和ECM重塑相关的基因，并使用Genecodis程序分配了基因和基因组（KEGG）途径的京都百科全书。通过弦构建蛋白质 - 蛋白质相互作用（PPI）网络，并在Cytoscape中进行可视化，使用分子复合物检测（MCODE）插件进行模块分析，并使用注释，可视化和集成发现（David（David））平台对基因模块进行GO和KEGG分析。选择了聚集在显着模块中的基因作为核心基因，并使用Cluego和Cluepedia可视化核心基因的功能和途径。最后，使用药物 - 基因相互作用数据库来探索核心基因的药物与果仁相互作用，以找到青光眼的药物候选物。结果：我们通过文本挖掘确定了125个与“青光眼”，“ sclera”和“ ECM重塑”的基因。基因功能富集分析产生了30个富集的GO术语和20个相关的KEGG途径。构建了一个带有249个边缘的60个节点的PPI网络，并使用MCODE获得了三个基因模块。我们选择了13个聚集在模块1中的基因作为主要与ECM降解以及细胞增殖和分裂相关的核心候选基因。发现HIF-1信号通路，FOXO信号通路，PI3K-AKT信号通路和TGFB信号通路被发现富集。我们发现，13个选定基因中的11个可以由26种现有药物瞄准。结论：结果表明，VEGFA，TGFB1，TGFB2，TGFB3，IGF2，IGF1，EGF，EGF，FN1，KNG1，TIMP1，SERPINE1，THBS1，THBS1和VWF是涉及巩膜ECM重塑的潜在关键基因。此外，将26种药物确定为青光眼治疗和管理的潜在治疗剂。