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World File Search SystemSplicing
LDS 2.5
最快的周期时间基于标准融合剪接，光纤锥度和裂解周期时间平均。在<0.01度分辨率的前对齐，光纤与光纤对准，端盖剪接，锥形玻璃剪接和光纤组合仪的<0.01度分辨率对齐，光纤与光纤排列，光纤纤维对齐，光纤上的自动对齐。使用5MP视觉系统的正交视图，具有远伦镜头，可提供4.2毫米宽x 3.5毫米高的视野，每秒最多20帧。实时过程通过完整分辨率的视频成像对熔融光纤玻璃进行全面视频成像，而不会过度暴露或过度暴露。可选的原位切肉刀可支持从20UM到500UM的光纤直径。能够将直径从125UM到2.5mm的融合剪接和缩小光纤逐渐变细。锥度功能需要锥度软件包。能够融合剪接光纤的直径不同至125um至2.5mm。压电驱动的弯曲阶段和软件包，提供130μm无振动的Z轴运动，并具有0.25μm理论分辨率。扫描软件能够在融合接头或光纤锥度之前或之后扫描光纤的直径。将自动捕获Fusion Splice图像在融合剪接之前，之中和之后以及每个接头的剪接数据和程序文件。“热成像”可实时进行光纤融合处理期间的实时观看。
伴有环状铁粒幼细胞的突变型骨髓增生异常综合征
致癌突变会使转录程序失调，导致突变细胞依赖某些分子调节剂或信号通路。癌细胞所依赖的调节剂或通路因细胞类型和受突变影响的细胞状态动态而异 (1)。一些可以诱导基于特定细胞身份的形态学和临床表型的血液学改变的最佳例子是剪接因子 SF3B1 (SF3B1 MT) 中的热点突变。SF3B1 MT 是骨髓增生异常综合征 (MDS) 中高度复发的起始事件，出现在最原始的造血干细胞 (HSC；参考文献 2) 中。尽管在不同的造血细胞类型中发现 (3)，SF3B1 MT 优先使红系祖细胞失调，并且是 MDS 亚型的标志，该亚型的特征是骨髓 (BM) 中环状铁粒幼细胞 (RS) 的积累，即 MDS-RS (4-7)。多项研究已经剖析了 SF3B1 MT 调节 MDS-RS 中 RNA 剪接的分子机制。SF3B1 MT 诱导的与血红素生物合成和线粒体铁转运有关的基因异常剪接导致红系细胞中铁的异常沉积，从而导致
编码淋巴细胞寄托受体CD44的基因组结构至少揭示了12个剪接外显子
摘要CD44分子已知表现出大小的异质性，这既归因于替代剪接和差异糖基在繁殖域内的差异糖基化。尽管从cDNA测序中部分推断出了几个替代外显子的存在，但据我们所知，尚未描述CD44基因的精确内含子外观。在本研究中，我们描述了人类CD44基因的结构，该基因至少包含19个外显子DNA的大约50个基因酶。我们已经确定了10个在细胞外域内的剪接外显子，包括1个以前没有报道的外显子。除了整个外显子的cluson或辩解外，还通过在单个外显子2中的内部剪接供体和受体位点的uztion产生更多的多样性。先前报道的细胞质结构域的变异表明是由2个外显子的替代剪接引起的。CD44的基因组结构揭示了显着的复杂性，我们证实了替代剪接作为CD44分子中结构和功能多样性的基础的作用。
ullrich
简化剪接机制的示意图。（a）由三个外显子（E1，E2和E3）组成的前MRNA的通用图以及具有外显子和内含剪接调节元件（ESE，ESS，ISE，ISE和ISS）的两个内含子（外显子之间）。剪接因子（SF）识别调节元件，然后将内含子插入，并产生连续的编码mRNA序列。（b）包含外显子11和12（E11和E12）和内含子11的Col6a1前MRNA段。内含子11的侧面是5'剪接供体（SD）和3'剪接受体（SA）位点。在正常条件下，在没有改变剪接的变体的情况下，内含子11被剪接，并且E11和E12在结果的转录本中连接在一起。（c）用C.930+189c> t变体（RNA中的C> u）从COL6A1基因转录的Pre-MRNA。该变体创建了一个新颖的5'SD位点，并激活了一个先前休眠的3'SA位点，位于新型SD位点上游的72个核苷酸（NT）。如果这两个新站点被剪接体识别，则在成熟的mRNA中将72 nt长的伪外exon（PE）插入E11和E12之间。只有确认新颖的5'SD位点时，将其上游的72 nt长PE和115 nt长的区域都插入成熟的mRNA中。但是，后一个成绩单不超过框架，而不会被翻译而降级。当两个新地点都没有识别出来时，会产生野生型成熟的转录本。（d）剪接切换ASOS在空间上阻止剪接体识别新颖的5'SD位点，并从成熟的转录本中从整个内含子11中获得正确的剪接
CLK 激酶抑制剂 1C8 和 GPS167 对上皮-间质转化和抗病毒免疫反应的影响揭示了它们的抗癌潜力
二杂芳酰胺基化合物 1C8 和氨基噻唑酰胺相关化合物 GPS167 可抑制 CLK 激酶，并影响多种癌细胞系的增殖。之前使用 GPS167 进行的化学基因组学筛选表明，与有丝分裂纺锤体组装相关的成分的消耗会改变对 GPS167 的敏感性。在这里，使用 1C8 进行的类似筛选也确定了参与有丝分裂纺锤体组装的成分的影响。因此，用 1C8 和 GPS167 处理的细胞的转录组分析表明，编码有丝分裂纺锤体组装成分的转录物的表达和 RNA 剪接受到影响。通过显示影响有丝分裂纺锤体组装的药物的亚毒性浓度会增加对 GPS167 的敏感性，证实了微管连接的功能相关性。1C8 和 GPS167 影响与肿瘤进展相关的通路中转录本的表达和剪接，包括 MYC 靶标和上皮间质转化 (EMT)。最后，1C8 和 GPS167 改变了参与抗病毒免疫反应的转录本的表达和可变剪接。与此观察结果一致，消耗双链 RNA 传感器 DHX33 可抑制 GPS167 介导的 HCT116 细胞细胞毒性。我们的研究揭示了 1C8 和 GPS167 影响癌细胞增殖以及转移关键过程的分子机制。
小鼠视网膜色素变性相关突变 Prpf8 ...
一组患有视网膜色素变性 (RP) 的患者携带多种剪接体成分的突变，包括 PRPF8 蛋白。在这里，我们确定了小鼠 Prpf8 的两个等位基因，它们可复制或模仿 RP 患者中发现的异常 PRPF8——替代 p.Tyr2334Asn 和扩展蛋白质变体 p.Glu2331ValfsX15。表达异常 Prpf8 变体的纯合小鼠在前 2 个月内因大量颗粒细胞丢失而出现小脑进行性萎缩，而其他小脑细胞则不受影响。我们进一步表明，在两种 Prpf8-RP 小鼠品系的小脑中，一组 circRNA 均失调。为了确定使小脑对 Prpf8 突变敏感的潜在风险因素，我们在前 8 周监测了几种剪接蛋白的表达。我们观察到 WT 小脑中所有选定的剪接蛋白均下调，这与神经退化的开始相吻合。在表达突变 Prpf8 的小鼠品系中，剪接蛋白表达的减少更加明显。总之，我们提出了一个模型，其中在出生后组织成熟过程中，剪接体成分的生理性减少使细胞对异常 Prpf8 的表达敏感，随后 circRNA 的失调会引发神经元死亡。
CRISPR基因编辑在多能干细胞中揭示了...
替代剪接已成为时空控制发育的基本机制。更好地了解这种机制的调节，不仅具有阐明基本生物学原理的潜力，而且还具有破译与正常剪接网络不正当调节的疾病有关的病理机制。在这里，我们利用了人类多能干细胞在人类肌发生过程中破译肌肉闪烁（MBNL）蛋白的作用，这是一个组织特异性剪接调节剂，其功能丧失与肌动症1型1型（DM1）相关，是一种遗传性神经肌肉肌肉疾病。多亏了CRISPR/CAS9技术，我们产生了在MBNL蛋白中耗尽的人类诱导的多能干细胞（HIPSC），并评估了它们损失对骨骼肌细胞产生的后果。我们的结果表明MBNL蛋白需要晚期肌源性成熟。此外，MBNL1和MBNL2的丧失概括了在HIPSC衍生的骨骼肌细胞中观察到的DM1的主要特征。比较转录组分析还揭示了由这些蛋白质调节的肌肉相关过程，这些过程通常在DM1中被误导。一起，我们的研究揭示了人类肌发生中MBNL蛋白的时间需求，并应促进能够应对这些MBNL蛋白功能丧失的新的治疗策略。