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特刊大肠杆菌和动物
shiga毒素产生的大肠杆菌（STEC）感染导致疾病症状的无症状运输或发育，这可能会使次要后遗症衰弱。STEC感染已与消耗粪便污染的食物和水有关，尤其是在与受感染动物接触后的手到口水传播。农业食品链中的动物在STEC传播中起着重要作用，并且需要采取有效的控制措施，以防止农场分叉传播这些人类病原体。因此，几项研究旨在在动物宿主的背景下理解STEC生态，并利用洞察力来开发适当的控制和诊断措施。感染/疾病的动物模型也被用作人类疾病的替代物，以更好地了解STEC发病机理。本期特刊的目的是解决：i。动物-Stec相互作用； ii。STEC定植和/或致病性的动物模型； iii。动物中的控制和/或诊断； iv。替代动物模型研究文章，评论文章和与这些主题相关的简短沟通。
扩展数据图1。与rfdiffusion的β链配对支架的设计。利用rfdiffusion的各种生成潜力，而
摘要：这项工作介绍了太阳能，这是一个用于标记BlackBox优化求解器的十个优化问题实例的集合。这些实例呈现出由黑盒数值模型模拟的集中太阳能电厂的不同设计方面。变量的类型（离散或连续），维数以及约束的数量和类型（包括隐藏的约束）在整个实例上有所不同。有些是确定性的，有些是随机性的，有可能执行多种复制以控制随机性。大多数实例都提供可变的替代物，两个是生物主体，一个是不受约束的。太阳能工厂模型考虑了各种子系统：HelioStats场，中央腔接收器（接收器），熔融盐热储能，蒸汽发生器和理想的功率块。在整个太阳代码中实现了几种数值方法，并且大多数执行是耗时的。非常小心，以确保平台之间的可重复性。太阳能工具涵盖了在工业和现实生活中的黑框优化问题中可以找到的大多数特征，这些特征都是在开源和独立代码中。
QH9：QM9分子的量子哈密顿预测基准
监督的机器学习方法已越来越多地用于加速电子结构预测作为第一原理计算方法的替代物，例如密度功能理论（DFT）。虽然许多量子化学数据集都集中在化学性质和原子力上，但实现对汉密尔顿基质的准确有效预测的能力是高度的，因为它是确定物理系统和化学特性的量子状态最重要，最基本的物理量。在这项工作中，我们生成了一个新的量子汉密尔顿数据集，称为QH9，以根据QM9数据集为999分子动力学轨迹的精确汉密尔顿矩阵和130,831个稳定的分子几何形状。通过使用各种分子设计基准任务，我们表明当前的机器学习模型具有预测任意分子的汉密尔顿矩阵的能力。QH9数据集和基线模型均通过开源基准提供给社区，这对于开发机器学习方法以及加速分子和材料设计的科学和技术应用可能非常有价值。我们的基准标有https://github.com/divelab/airs/tree/main/main/opendft/qhbench。
图形卷积网络用于模拟多孔介质中的多相流量和传输
多孔介质中多相流体动力学的数值模拟对于地球地下的许多能量和环境应用至关重要。数据驱动的次要模型为高保真数字模拟器提供了计算廉价的替代方案。虽然常用的卷积神经网络（CNN）在近似部分微分方程解决方案方面具有强大的功能，但CNN处理不规则和非结构化的模拟网格仍然具有挑战性。然而，地球地下的模拟模型通常涉及与复杂的网格网格的非结构化网格，从而限制了CNN的应用。为了应对这一挑战，我们基于图形卷积网络（GCN）构建了替代模型，以近似多孔介质中多相流和传输过程的空间 - 周期解。我们提出了一种适合耦合PDE系统双曲线特征的新GCN体系结构，以更好地捕获传输动力学。2D异质测试案例的结果表明，我们的替代物以高精度预测压力和饱和状态的演变，并且预测的推出对于多个时间步中仍然稳定。此外，基于GCN的模型可以很好地推广到训练数据集中看不见的不规则域几何和非结构化网格。
出版商权利声明：这是作者接受的 Y. Yu 等人的稿件，“最先进的：AI 辅助替代建模和优化
摘要 — 微波滤波器是现代无线通信系统不可或缺的无源器件。如今，基于电磁 (EM) 仿真的设计过程已成为滤波器设计的常态。近年来，出现了许多基于 EM 的微波滤波器设计方法，以实现效率、自动化和可定制性。大多数基于 EM 的设计方法都以各种形式利用低成本模型（即替代模型），人工智能技术则协助替代模型建模和优化过程。本文重点研究替代模型辅助微波滤波器设计，首先分析基于不同设计目标函数的滤波器设计特点。然后，回顾了最先进的滤波器设计方法，包括替代模型建模（机器学习）方法和高级优化算法。其中包括滤波器设计中的三种基本技术：1）智能数据采样技术；2）高级替代模型建模技术。3）高级优化方法和框架。为了获得成功和稳定性，必须对它们进行量身定制或组合，以实现微波滤波器的特定特性。最后，讨论了新兴的设计应用和过滤器设计的未来趋势。
审查了解病变创造生物物理学并改善射频导管消融过程中的病变评估。 ACH
房颤（AF）是一种普遍的心律不齐，而肺静脉分离（PVI）已成为其处理中的基石。耐用病变的产生对于成功和持久的PVI至关重要，因为不一致的病变导致消融后的重新连接和复发。已经开发出各种方法来评估体内病变质量和跨性别的方法，用作改善病变创造的替代物，并利用射频（RF）能量的长期结局。本综述手稿研究了使用RF能量时每天在电生理实验室中每天使用的病变创造和不同病变评估技术的生物物理学。这些方法为病变有效性提供了宝贵的见解，促进了优化的消融程序并减少心律不齐的复发。但是，每种方法都有其局限性，建议在AF导管消融过程中进行全面病变评估的技术组合。成像技术的未来进步，例如磁共振成像（MRI），光学相干断层扫描和光声成像，在进一步增强病变评估和指导治疗策略方面有望。
ICMRA稀有疾病研讨会报告
fda cder建立了加速稀有疾病治疗（ARC）计划，以协同整个CDER的稀有疾病倡议，以更好地界面和在内部（与其他FDA中心和办公室）和外部（与稀有疾病社区）进行罕见疾病药物开发进行沟通。ARC通过其使命来推动科学和监管创新和参与的使命来加速罕见疾病患者的治疗方法，利用可以将信息归还可以恢复到科学和监管创新以及利益相关者外展和教育的信息。是翻译科学团队，该团队已启动，该团队旨在建议使用转化科学来支持新型的替代物和验证性证据方法，此外还有另一个多学科团队，专注于评估和应用创新试验设计和方法论稀有疾病药物开发计划的评估和应用。虽然不直接在ARC之下，但罕见的疾病终点前进（RDEA）试点计划是一项联合CDER和CBER计划，它使赞助商能够与FDA合作，为开发计划创建一个新颖的效率端点，以确立旨在为罕见疾病治疗提供有效性的实质性证据。
全身动态成像和动力学建模
免疫疗法，尤其是检查点抑制剂，例如抗 - 程序性细胞死亡蛋白1（抗 - PD-1）抗体，通过增强免疫系统的capabil-靶向和杀死癌细胞，通过增强了癌症来进行转移癌症治疗。但是，预测免疫疗法反应仍然具有挑战性。18 F-阿拉伯糖基鸟嘌呤（[[18 F] F-arag）是一种靶向活化T细胞的分子成像示踪剂，可以通过非侵袭性定量来促进肿瘤微环境中免疫细胞活性的无创量化疗法的反应评估。这项研究的目的是获得[18 F] F-ARAG的总体药代动力学的初步数据，作为免疫反应评估的潜在定量生物标志物。方法：该研究由90分钟的4个健康受试者和1名非小细胞肺癌患者进行90分钟的总体动态扫描，这些患者在抗-PD-1免疫疗法之前和之后进行了扫描。使用Akaike信息标准模型选择的隔室建模用于分析各种器官中的示踪剂动力学。此外，分析了原发性肺肿瘤和4个纵隔淋巴结的7个子区域。进行了实用的鉴别能力分析，以评估动力学参数估计的可靠性。计算了SUV平均值，组织与血液SUV比（SUVR）和Logan Plot Slope（K Logan）的相关性，并计算了总分布量（V T），以识别动力学建模的潜在替代物。结论：我们的发现强调了[18 f] f-arag动态成像作为量化结果：k logan和suvr与v t之间观察到很强的相关性，这表明它们可以用作V t的有前途的替代物，尤其是在血液量低的器官中。此外，实用的识别能力分析表明，动态[18 f] f-arag PET扫描可能会缩短为60分钟，同时为所有感兴趣的器官保持定量准确性。研究表明，尽管[18 F] F-ARAG SUV图像可以提供有关免疫细胞分布，动力学建模或图形分析方法的见解，以便在治疗后准确定量免疫反应。尽管SUV平均值显示治疗后肿瘤的不同子区域的变化，但SUVR，K Logan和V t在所有分析的肿瘤的分析子区域均具有较高的实用性认同。
医院内空气传播的实验研究
实验研究可以提供有关建筑通风和环境因素对医院空气传播影响的理解、知识和真实案例经验证据。从现有研究中获得的信息有助于制定工程解决方案和管理实践，以对抗医院空气传播感染。进行了系统回顾，总结了实验方法、研究兴趣、有用结果和局限性。实验研究的兴趣呈稳步但缓慢增长的趋势，主要集中在通风系统、策略和配置对空气传播的影响上。研究了在环境因素、排放情景和人类运动的综合影响下生物气溶胶的扩散。还研究了局部通风、空气净化器和消毒技术。总结并强调了实验技术和一些关于最佳通风策略和管理实践的有用见解。实证研究的局限性包括采样困难、规模有限和测试场景数量、不受控制/未考虑的影响因素以及实验媒介。利用基于物联网的采样设备进行实验，实时监测生物气溶胶或其替代品，在医院进行逐案现场调查，开展跨学科研究与合作，可以帮助克服研究挑战，并提供切实有效的解决方案，以最大限度地减少医院内的空气传播。
意识障碍患者研究过程中的伦理问题
在过去十年中，人们对意识障碍 (DoC) 的兴趣大大增加，并强调了提高对意识障碍生物学、护理需求（使用监测、实施干预和提供情感支持）、促进康复的治疗方案和结果预测的理解的重要性。探索这些主题需要意识到与权利和资源相关的许多伦理考虑。治愈昏迷运动伦理工作组利用其在神经重症监护、神经姑息治疗、神经伦理学、神经科学、哲学和研究方面的专业知识，对涉及 DoC 患者的研究过程中的以下方面的伦理考虑进行了非正式审查：（1）研究设计；（2）风险与收益的比较；（3）纳入和排除标准的选择；（4）筛选、招募和入学；（5）同意；（6）数据保护；（7）向代理人和/或法定授权代表披露结果；（8）将研究转化为实践；（9）利益冲突的识别和管理；（10）公平和资源可用性(11) 将患有智力缺陷症的未成年人纳入研究。在计划和进行涉及智力缺陷症患者的研究时，意识到这些伦理考虑将确保参与者的权利得到尊重，同时最大限度地发挥研究的影响和意义、结果的解释和结果的交流。