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CRISPR/Cas 基因组编辑在番茄改良中的应用
番茄的遗传基础狭窄，给育种带来了严峻挑战。因此，随着成簇的规律间隔短回文重复序列 (CRISPR) 相关蛋白 9 (CRISPR/Cas9) 基因组编辑的出现，快速高效的番茄育种已成为可能。番茄的许多性状已使用 CRISPR/Cas9 进行编辑和功能表征，例如植物结构和花的特性（例如叶、茎、花、雄性不育、果实、单性结实）、果实成熟、品质和营养（例如番茄红素、类胡萝卜素、GABA、TSS、花青素、保质期）、抗病性（例如 TYLCV、白粉病、晚疫病）、非生物胁迫耐受性（例如热、旱、盐度）、CN 代谢和除草剂抗性。CRISPR/Cas9 已被证明可用于将野生近缘种的优良性状从头驯化到栽培番茄，反之亦然。 CRISPR/Cas 的创新允许使用在线工具进行单向导 RNA 设计和多路复用、克隆（例如 Golden Gate 克隆、GoldenBraid 和 BioBrick 技术）、强大的 CRISPR/Cas 构建体、高效的转化方案（例如农杆菌）和用于 Cas9-gRNAs 核糖核蛋白 (RNPs) 复合物的无 DNA 原生质体方法、Cas9 变体（例如无 PAM 的 Cas12a 和 Cas9-NG/XNG-Cas9）、基于同源重组 (HR) 的双生病毒复制子基因敲入 (HKI) 以及碱基/引物编辑（Target-AID 技术）。这篇小型评论重点介绍了 CRISPR/Cas 在番茄快速高效育种方面的最新研究进展。
专业培训 - 训练 - 核心训练 - 六月...
ALS Advanced Life Support ARCP Annual Review of Competency Progression BST Basic Specialist Trainee CbD Case-based Discussion CCBST Certificate of Completion of Basic Specialist Training CCST Certificate of Completion of Specialist Training CPD Continuing Professional Development CPGTC Cardiology Postgraduate Training Committee CRT Cardiac Resynchronisation Therapy CS Clinical Supervisor CT Computerised Tomography CTS Cardio-Thoracic Surgery DOPS Direct Observation using a Summative Assessment ECG Electrocardiogram EECC European Examination in Core Cardiology EP Electrophysiology EPA Entrustable Professional Activity ES Educational Supervisor ESC European Society of Cardiology EU European Union GUCH Grown-Up Congenital Heart Disease HST Higher Specialist Trainee ICD Implantable Cardioverter-Defibrillator ITU Intensive Therapy Unit MCQ Multiple Choice Question MCS Maltese Cardiac Society Mini-CEX mini-Clinical Evaluation Exercises MPMTC Malta Postgraduate Medical Training Centre MSF Multi-Source Feedback MRI Magnetic Resonance Imaging OSCE Objective Structured Clinical Examination PGTC Post Graduate Training Centre PSC Public Service Commission SAC Specialist Accreditation Committee STPC Specialist Training Programme in (Adult) Cardiology TD Training Director TC Training Co-ordinator TSS Trainee Support Service UEMS Union of European Medical Specialists UEMS-CS Union of European Medical Specialists -心脏病学部分WBA基于工作的评估
与“精彩”商业品种相比，对某些伊朗本地石榴的定性和定量特征的评估
目的：各种商业品种以及野生石榴基因型在整个伊朗都广泛。这种多样性被认为是育种计划的骨干。这项研究的目的是对八个局部石榴品种的水果特征以及一个著名的商业化，“奇妙”品种的果实特征进行比较分析。研究方法：收集水果并将其转移到实验室。测量了果实，树芳和皮肤参数，并将数据分析为完全随机的设计，并具有三个复制。发现：结果清楚地表明了品种之间的差异。在“ Gavkoshak”中发现了最高的果实重量，长度，宽度，芳族重量，芳族直径，新鲜/干燥重量，皮肤新鲜/干重。在“ Galookandeh”中记录了最高的花萼长度和皮肤厚度。发现“ Torsh Oud”，“ Faroogh”，“ Galookandeh”和“ Rubab”有硬种子。在“奇妙”中发现了最高的TSS，皮肤 /青霉素和蔗糖含量。在“ rubab”中观察到了最大葡萄糖和果糖的量。结果最终表明，“ Gavkoshak”和“ Rubab”品种在其物理水果参数方面具有更大的等级。在化学特性方面，最好的品种是“奇妙”和“ rubab”。“ rubab”，“ gavkoshak”和“奇妙”被建议作为石榴生产或未来繁殖计划的优越品种。限制：没有限制。此外，这些局部品种的曲折特征也没有较早地研究。独创性/价值：“奇妙”是一个引入的，与这种新植物材料同时同时对Fars Origon的石榴材料的比较分析将是有价值的。
评估 - 托马托 - 溶剂 - 透明剂 - l-genotypes- ...
该调查是在2020年夏季的圣雄帕尔·克里希·维迪亚佩（Mahatma Phule Krishi Vidyapeeth）园艺园艺系的番茄改善计划的研究农场进行的。数据在36种番茄基因型中表现出显着变化，对于不同的定性和定量特征。The maximum plant height (124.59cm) was recorded in the genotype RHRT-15-21.The genotypes RHRT-15-4, RHRT-15- 17, RHRT-15-19, RHRT-15-20, RHRT-15-21, RHRT-17-1, RHRT-17-2 and RHRT-17-5 were observed indeterminate plant growth habit.在RHRT-15-4中观察到的最大分支机构植物数量-1。基因型RHRT-15-7和RHRT-15-4的早期开花分别需要30天和31天的开花，分别为50％开花。水果植物的number -1在RHRT-15-4和RHRT-15-23中的记录最高。基因型RHRT-15-3（6.91cm）记录了水果的最大极性直径，其次是RHRT-17-9，RHRT-17-4和RHRT-15-14。RHRT-17-9（5.96厘米）显示的最大赤道直径分别为RHRT-15-23和RHRT-15-4。在36种基因型中评估的番茄的果实产量-1差异很大，范围从0.68至1.93 kg植物-1。基因型的一般平均值为1.15 kg。用基因型RHRT-17-10记录了最低水果产量植物-1，而最大的基因型RHRT-15-4。基因型RHRT-15-4的产量最高为51.57 t ha -1。用基因型RHRT-15-24记录了水果的最高TSS含量。这项研究的发现可能会在夏季季节提供有关作物改善计划，蔬菜专家和蔬菜种植者的番茄基因型的表型特征的宝贵信息。
菲律宾海洋战略
AToN 助航设备 CPA 宿务港务局 COLREG 国际海上避碰规则 DA 农业部 DENR 环境与自然资源部 DICT 信息和通信技术部 DOST 科学技术部 DOTr 交通部 DND 国防部 MARINA 海事局 PAGASA 菲律宾大气、地球物理和天文服务管理局 FSI 船旗国实施 GISIS 全球综合航运信息系统 GMDSS 全球海上遇险和安全系统 ICS 国际航运公会 IALA 国际航标与灯塔管理局协会 IHO 国际水文组织 III 规则 IMO 仪器实施规则 IMDG 国际海上危险货物规则 IMO 国际海事组织 IMSAS 国际海事组织成员国审计机制 ISO 国际标准化组织 KPI 关键绩效指标 MAIIF 海事事故调查员国际论坛 MARPOL 国际防止船舶污染公约 MIDP 海事产业发展计划 MSI 海上安全调查 NAMRIA 国家测绘和资源信息机构 NTC 国家电信委员会 PCG 菲律宾海岸警卫队 PN 菲律宾海军 PPA 菲律宾港务局 PSC 港口国管制 PSCO 港口国管制官员 MRCC 海上救援协调中心 MRSC 海上救援分中心 RO 认可组织 SAR 搜救 SBMA 苏比克湾大都会管理局 SOLAS 国际海上人命安全公约 STCW 海员培训、发证和值班标准国际公约 TSS 分道通航制 VTS 船舶交通系统
基因组 DNA N 水平存在显著差异
DNA N 6 -甲基腺嘌呤（6mA）修饰在生物体中广泛存在，在调控细胞过程方面发挥着重要的功能性作用。作为生物湿法冶金的模式生物，Acidithiobacillus ferrooxidans在酸性条件下可以通过氧化亚铁（Fe 2+ ）和各种还原性无机硫化物（RISC）获取能量。为探讨A. ferrooxidans中基因组DNA甲基化与两种氧化代谢途径切换之间的联系，利用6mA-IP-seq技术评估了不同条件下培养的A. ferrooxidans基因组中的6mA景观。在Fe 2+和RISCs氧化条件下分别鉴定出214个和47个6mA的高置信度峰（P < 10 − 5 ），表明在Fe 2+氧化条件下基因组甲基化程度更高。 6mA在转录起始位点（TSS）处表达下降，并且在两种氧化条件下均频繁出现在基因体中。此外，基因本体论（GO）和京都基因和基因组百科全书（KEGG）分析显示，7条KEGG通路被映射到差异甲基化基因上，大多数差异甲基化基因在氧化磷酸化和代谢途径中富集。选择了14个基因研究甲基化差异对mRNA表达的影响。除petA-1外，13个基因随着甲基化水平的增加表现出mRNA表达下降。整体而言，两种条件下6mA甲基化富集模式相似，但富集的途径有所不同。基因甲基化水平上调与表达下调的现象表明6mA的调控机制与Fe 2+和RISCs氧化途径之间存在潜在关联。
附录 7-F：牛津蓄水池多用途...
首字母缩略词和缩写 Σ 总和 µg 微克 AVS 酸性挥发性硫化物 BHC 六氯苯 BMP 最佳管理实践 BOD 生化需氧量 CAM 加州评估手册 COC 监管链 COD 化学需氧量 COP 加州海洋计划 CTR 加州有毒物质规则 DDD 二氯二苯二氯乙烷 DDE 二氯二苯二氯乙烯 DDT 二氯二苯三氯乙烷 DO 溶解氧 DOC 溶解有机碳 ID 标识 IDW 反距离加权 LARWQCB 洛杉矶区域水控制委员会 MDL 方法检测限 MdRH 马里纳德尔雷港 MPN 最可能数 NDMA N-亚硝基二甲胺 NDPA N-亚硝基二正丙胺 NTU 散射浊度单位 PAH 多环芳烃 PCB 多氯联苯 PCE 四氯乙烯 pH 氢离子浓度 Q-PCR 定量聚合酶链反应 QA 质量保证 QC 质量控制 SAP 采样和分析计划 SEM 同时萃取金属 SM 标准方法 STLC 可溶性阈值极限浓度 SVOC 半挥发性有机碳 SWRCB 州水资源控制委员会 TCLP 毒性特性 浸出程序 TDS 总溶解固体 TKN 总凯氏氮 TMDL 总最大日负荷 TOC 总有机碳 TPH 总石油烃 TSS 总悬浮固体 TTLC 总阈值极限浓度 USEPA 美国环境保护署 VOC 挥发性有机碳 WET 废物提取测试 WQO 水质目标
预测基于 CRISPR-Cas9 的表观基因组编辑的效果
摘要表观遗传调控协调哺乳动物转录，但它们之间的功能联系仍然难以捉摸。为了解决这个问题，我们使用来自 13 种 ENCODE 细胞类型的表观基因组和转录组数据来训练机器学习模型，以预测组蛋白翻译后修饰 (PTM) 的基因表达，对于大多数细胞类型，实现了 ∼0.70 −0.79 的转录组范围相关性。我们的模型重现了组蛋白 PTM 和表达模式之间的已知关联，包括预测转录起始位点 (TSS) 附近的组蛋白亚基 H3 赖氨酸残基 27 (H3K27ac) 的乙酰化会显著提高表达水平。为了通过实验验证这一预测，并研究 H3K27ac 的天然沉积与人工沉积对表达的影响，我们将合成的 dCas9-p300 组蛋白乙酰转移酶系统应用于 HEK293T 细胞系中的 8 个基因和 K562 细胞系中的 5 个基因。此外，为了便于建立模型，我们执行 MNase-seq 来绘制 HEK293T 中全基因组核小体占有水平。我们观察到，我们的模型在准确排序基因对 dCas9-p300 系统的相对倍数变化方面表现良好；然而，与根据其天然表观遗传特征预测跨细胞类型的表达相比，它们对单个基因内倍数变化进行排序的能力明显减弱。我们的研究结果强调，我们需要更全面的基因组规模表观基因组编辑数据集，更好地理解表观基因组编辑工具所做的实际修改，以及改进因果模型，以便更好地从内源性细胞测量转移到扰动实验。这些改进将共同促进理解和可预测地控制动态人类表观基因组的能力，以及对人类健康的影响。
蜡jambu的形态和分子表征（syzygium samarangense）
在孟加拉国农业大学的BAU-GPC和遗传学和植物育种实验室进行了实验，研究了Wax Jambu（Syzygium samarangense）的形态学特征（遗传变异性，遗传变异性，角色的关联，相关性和路径系数分析，均来自Wax JAX jax JAX的辅助，遗传变异性，角色的关联和路径系数分析，BAUIA，并分析BAUIA，bauia fefc and frecor， 2012年3月，2013年。随机扩增多态DNA（RAPD）用于表征分子水平的这些饰品。尽管非常相似，但在水果颜色，形状和TSS百分比具有不同的叶片特征方面，蜡jambu的5个饰面的形态彼此不同。在路径分析，水果宽，干物质和水分百分比方面有助于最大的表型和基因型直接对水果重量的直接影响，表明其作为选择参数的重要性。分子表征，以使用随机扩增的多态性DNA（RAPD）标记来研究5个蜡jambu辅助的变异性。在筛选的4个引物中，选择了2个引物，从而产生了23个清晰明亮的片段。在所使用的两个引物之间，CCAACGTCGG显示出最高水平的多态性（83.33％）。，19（82.7％）是多态性的。NEI（1972）蜡jambu的遗传多样性的估计为0.3339，而香农的信息指数为0.4952。在Bau Jamrul 3和印度尼西亚Jamrul之间观察到最高的遗传距离（0.9861）。另一方面，在Bau Jamrul 1和Bau Jamrul 2之间发现了最低距离（0.1911），这表明辅助之间存在很大的遗传差异。目前在不同形态型和syzygium samarangense的鉴定过程中使用分子标记作为形态学描述的补充的潜力提供了足够的支持
使用Musicx
摘要：绿色屋顶（GR）被称为最有效的水敏化城市设计（WSUD）策略之一，可以处理当今城市化城市面临的许多环境和社会问题。对GRS的研究的总体质量显着改善，并且在过去十年的研究量中观察到了趋势。在几种方法中，建模工具的应用被认为是模拟和评估GRS性能的有效方法。鉴于在集水量表上对GRS的研究是有限的，因此本文旨在提供一个简单但有效的框架来估计GR对径流数量和质量的流域尺度影响。Musicx是具有概念模型优势的澳大利亚开发软件，被选为本研究的建模工具。虽然Musicx拥有澳大利亚地区的内置气象模板，但该工具还支持几种气候输入文件格式，用于世界其他地区的建模者的应用。本文使用Musicx中的土地使用节点和生物味节点介绍了两种不同的建模方法。本文还提供了用于模型校准的步骤。建模结果列出了径流量的年减少，总悬浮固体（TSS），总磷酸盐（TP）和总氮（TN）负载。在径流量和TN负载中观察到最大的减少约30％。本研究中报告的年度降低率接近其他已发表的结果。量化GRS的好处的类似研究结果在促进GRS的广泛实施方面起着重要作用，这是由于对GRS的正面和负面影响的认识。未来的研究建议集中精力建模大规模实施GRS的影响（即超过单个构建量表）以填补研究差距并提高建模精度。