DNA N 6 -甲基腺嘌呤（6mA）修饰在生物体中广泛存在，在调控细胞过程方面发挥着重要的功能性作用。作为生物湿法冶金的模式生物，Acidithiobacillus ferrooxidans在酸性条件下可以通过氧化亚铁（Fe 2+ ）和各种还原性无机硫化物（RISC）获取能量。为探讨A. ferrooxidans中基因组DNA甲基化与两种氧化代谢途径切换之间的联系，利用6mA-IP-seq技术评估了不同条件下培养的A. ferrooxidans基因组中的6mA景观。在Fe 2+和RISCs氧化条件下分别鉴定出214个和47个6mA的高置信度峰（P < 10 − 5 ），表明在Fe 2+氧化条件下基因组甲基化程度更高。 6mA在转录起始位点（TSS）处表达下降，并且在两种氧化条件下均频繁出现在基因体中。此外，基因本体论（GO）和京都基因和基因组百科全书（KEGG）分析显示，7条KEGG通路被映射到差异甲基化基因上，大多数差异甲基化基因在氧化磷酸化和代谢途径中富集。选择了14个基因研究甲基化差异对mRNA表达的影响。除petA-1外，13个基因随着甲基化水平的增加表现出mRNA表达下降。整体而言，两种条件下6mA甲基化富集模式相似，但富集的途径有所不同。基因甲基化水平上调与表达下调的现象表明6mA的调控机制与Fe 2+和RISCs氧化途径之间存在潜在关联。