基因组编辑可以对内源性顺式调控元件进行序列功能分析,从而推动对其机制的理解和基因疗法的发展。然而,这些方法不能与染色质结构和长单分子染色质纤维可及性的直接可扩展读数相结合。在这里,我们利用双链 DNA 胞嘧啶脱氨酶通过靶向 PCR 和长读测序以高深度和分辨率分析内源性目标基因座的染色质可及性,我们将这种方法称为靶向脱氨酶可及染色质测序 (TDAC-seq)。TDAC-seq 凭借目标基因座的高序列覆盖率,可以与 CRISPR 扰动独特地整合,从而实现顺式调控元件的功能解剖,其中遗传扰动及其对染色质可及性的影响叠加在同一单个染色质纤维上并以单核苷酸分辨率解析。我们利用 TDAC-seq 解析了在红细胞分化过程中激活人类 CD34+ 造血干细胞和祖细胞中胎儿血红蛋白的 CRISPR 编辑,以及在合并的 CRISPR 和碱基编辑筛选中平铺控制珠蛋白位点的增强子。总之,TDAC-seq 能够通过基因组编辑实现单分子染色质纤维的高分辨率序列功能映射。
靶向下一代测序可以深度覆盖特定区域,而成本仅为全基因组测序的一小部分。然而,传统的靶向富集引入了额外的工作流程步骤,并且靶分子捕获方法效率低下。在这里,我们提出了一种新型混合捕获靶向富集技术,该技术通过将简化的工作流程与高效且特定的文库制备和捕获相结合来解决这些挑战。与使用长寡核苷酸探针的传统方法不同,安捷伦 Avida 技术使用多个协同结合到目标区域的探针。这种协同结合将捕获效率提高了两到四倍,并确保了高特异性。这项研究重点介绍了该技术在多种应用中的性能,包括靶向 DNA 测序、靶向甲基测序和“Duo”测序,后者在一次测定中独特地结合了 DNA 和甲基测序。使用基因组 DNA 和无细胞样本,Avida 技术实现了从 1 到 100 ng 输入的线性捕获性能,同时捕获了样本中存在的高达 80% 的分子,提供了无与伦比的分子景观视图。
这与“初始条件假设”相一致,该假设认为准备活动设定了动态系统的初始状态,然后演变为产生由初始状态部分定义的时空活动(28)。支持这一观点的是,在视觉和自愿试验中,刺激前和提示前活动状态分别在每次试验的基础上预测了运动过程中的后续群体活动(图 4C)。也许因此,我们 10
1 癌症分子机制项目,癌症研究中心 (CIC),CSIC-萨拉曼卡大学,萨拉曼卡,西班牙 2 生物医学研究所 (IRB 巴塞罗那),巴塞罗那科学技术研究所 (BIST),西班牙巴塞罗那 3 癌症转化和临床研究项目,CSIC-大学癌症研究中心 (CIC)萨拉曼卡,萨拉曼卡,西班牙 4 纳瓦拉大学,应用医学研究中心,实体瘤项目,潘普洛纳,西班牙 5 肿瘤与发育生物学实验室 (LBTD),GIGA-Cancer,列日大学,列日,比利时 6 动物实验服务,萨拉曼卡大学,萨拉曼卡,西班牙 7 分子生物技术和健康科学系,大学分子生物技术中心都灵,都灵,意大利 8 采购计划,加泰罗尼亚肿瘤研究所 (ICO),L'Hospitalet de Llobregat,巴塞罗那,西班牙 9 Departament de Química Inorgànica i Orgànica,Universitat de Barcelona,巴塞罗那,西班牙 # 共同第一作者 * 共同通讯作者:d.santamaria@usal.es & cristina.mayor-ruiz@irbbarcelona.org
智能药丸技术代表了医疗保健领域的一项突破性进步,将微型电子元件集成到可摄取的药丸中,彻底改变了药物输送、诊断和监测。本综合概述深入探讨了智能药丸技术的组件、功能、应用、注意事项和未来发展方向。智能药丸的核心组件包括可摄取的传感器、电子模块和电源,可实现一系列功能。这些功能包括药物依从性监测、诊断成像、生理监测和靶向药物输送。患者口服智能药丸,当它们穿过胃肠道时,它们会将数据无线传输到外部设备,供医疗保健提供者进行分析。智能药丸在各个医疗保健领域都具有众多优势。它们可以增强慢性病的药物依从性和疾病管理,促进胃肠道的非侵入性诊断筛查,并可作为临床研究中的宝贵工具。然而,确保患者数据的安全性、监管批准和隐私是部署智能药丸技术的关键考虑因素。智能药丸技术的未来发展方向侧重于小型化、集成化和扩展应用。持续的进步旨在使智能药丸更加紧凑、高效和用户友好,而跨学科合作则推动创新并解决开发和应用方面的挑战。智能药丸的前景不仅局限于胃肠道诊断和药物输送,还扩展到个性化医疗、靶向癌症治疗和神经病学。
此概况说明了我们的Go Greener计划中的产品包含。该程序标识了Qiagen投资组合中的产品,这些产品与我们的传统产品相比更加环保。与标准面板相比,QIASEQ靶向DNA Pro面板通过切割移液步骤减少塑料废物,从而减少了需要减少68%的移液器尖端。所需的试剂数量也较低,尤其是对于索引板,它已经从两个单独的板转变为一个具有独特双索引(UDIS)的单个板。面板的稳定性有所改善,从7个月的保质期提高到12个月。
非小细胞肺癌 (NSCLC) 是一组异质性癌症,包括除小细胞肺癌 (SCLC) 之外的任何类型的上皮性肺癌,小细胞肺癌起源于肺的上皮细胞,包括鳞状细胞癌、大细胞癌和腺癌 (Thomas, et al., 2023)。最近,NSCLC 中的致癌作用与表皮生长因子受体 (EGFR) 的突变或间变性淋巴瘤激酶 (ALK) 基因或 ROS1 基因的重排有关 (Sequist & Neal, 2024)。有关在 NSCLC 中使用循环肿瘤细胞的指导,请参阅政策 AHS-G2054 液体活检。有关肿瘤突变负荷测试 (TMB) 和/或微卫星不稳定性 (MSI) 分析的指导,请参阅 AHS-M2178 微卫星不稳定性与肿瘤突变负荷测试政策。相关政策:AHS-G2054 液体活检 AHS-M2029 皮肤黑色素瘤分子检测 AHS-M2078 RET 原癌基因种系突变基因检测 AHS-M2160 肺部疾病分子检测 AHS-M2178 微卫星不稳定性与肿瘤突变负荷测试
摘要 鉴于对各种癌症的理解不断进步,以及随后寻求治疗方法,以及癌症患者存活率的提高,发现一种可以有效对抗这种疾病侵袭性机制的治疗方法至关重要。溶瘤病毒 (OV) 已被证明在癌症治疗中非常有利,因为它们能够通过多种机制诱导抗肿瘤作用。病毒可用于感染癌细胞,特别是与正常细胞相比,引入肿瘤相关抗原,触发“危险信号”以产生免疫耐受性较低的肿瘤微环境,并充当释放炎症和免疫调节细胞因子的载体。这些经过修改的 OV 被设计为具有更好的肿瘤靶向能力、更高的溶瘤活性或产生强大的抗肿瘤免疫反应的潜力,在临床前测试和涉及癌症患者的临床试验中在动物模型中进行评估。OV 已被公认为癌症免疫治疗的主要药物之一,因为它们能够通过多种机制靶向肿瘤。然而,鉴于免疫疗法和细胞疗法等创新抗癌疗法的疗效有限,评估使用 OV 进行联合治疗的潜力势在必行。本研究旨在介绍溶瘤病毒,并回顾其诱导抗肿瘤反应的能力、挑战和局限性。