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2012 年区域管理计划修订版
牡蛎 TTF 想感谢罗格斯大学哈斯金贝类研究实验室的 Eric Powell 博士帮助我们进行库存评估和审查可用于评估的可用数据。Tom Soniat 博士提供了其他评估信息和审查。必须向 Mark VanHoose 先生致意，他曾担任该工作组的阿拉巴马州代表，直到 2009 年初从 AMRD 退休。此外，TPWD 执法部门的 Bill Robinson 和 Kris Bishop 都在该过程的早期担任执法代表。佛罗里达州农业部的 David Heil 博士对弧菌和公共卫生信息进行了全面审查，并提出了几项改进建议。特别感谢 Teri Freitas 女士在担任 IJF 员工助理的几年中提供的技术援助和耐心。感谢众多州政府机构工作人员毫无怨言地帮助生成此管理计划的数据。感谢 Lucia Hourihan 提供技术审查，最后感谢 Debbie McIntyre 女士，她在佛罗里达州圣彼得堡与 TTF 一起进行了整整一周的牡蛎 FMP 编辑后加入了委员会。她的帮助再怎么强调也不为过。
用于微生物组分析的生物信息学
1。Delgado，L.F。，Andersson，A.F。评估生物组特异性基因目录的宏基因组装方法。微生物组10，72（2022）。2。Luis F. Delgado，Marco Vicari，Simon Kebede Merid，Gilbert Osena，Samah Abousharieha，Matthias Labrenz，Lasse Riemann，Jarone Pinhassi，Anders F. Anders F. Andersson。袋装闪光：一种基于网络的交互式工具，用于探索波罗的海微生物基因集。手稿。3。Luis F. Delgado，David J. Riedinger，VictorFernández-Juárez，Daniel P. R. Herlemann，Theodor Sperlea，Christian Pansch，Christian Pansch，Marija Katar都史，Marija Katar都Gyraitė，Detlef Schulz-Bull，Heike Benterbusch-Brockmöller，Susann Dupke，Holger Scholz，Sandra Kube，Sandra Kube，Lasse Riemann，Matthias Labrenz，Anders F. Andersson F. Andersson F.基于基于基于颤音的比较基因组的比较基因组将遗传性特征链接到遗传特征性。 手稿。 4。 Jurdzinski KT*，Mehrshad M*，Delgado LF，Deng Z，Bertilsson S，Andersson AF。 水生细菌的大规模系统基因组揭示了适应盐度的分子机制。 科学进步。 2023 5月26日； 9（21）。Luis F. Delgado，David J. Riedinger，VictorFernández-Juárez，Daniel P. R. Herlemann，Theodor Sperlea，Christian Pansch，Christian Pansch，Marija Katar都史，Marija Katar都Gyraitė，Detlef Schulz-Bull，Heike Benterbusch-Brockmöller，Susann Dupke，Holger Scholz，Sandra Kube，Sandra Kube，Lasse Riemann，Matthias Labrenz，Anders F. Andersson F. Andersson F.基于基于基于颤音的比较基因组的比较基因组将遗传性特征链接到遗传特征性。手稿。4。Jurdzinski KT*，Mehrshad M*，Delgado LF，Deng Z，Bertilsson S，Andersson AF。水生细菌的大规模系统基因组揭示了适应盐度的分子机制。科学进步。2023 5月26日； 9（21）。
通过病原体识别和炎症调节参与先天免疫的Litopenaeus Vannamei的甘露糖受体
摘要：作为C型凝集素超家族成员的甘露糖受体是一种非典型的pat-tern识别受体，可以内化与病原体相关的配体并激活细胞内信号传导。在这里，甘露糖受体基因LVMR是从Paci -Paci -files flitopenaeus vannamei中鉴定出来的。LVMR编码了信号肽，纤维蛋白II型（FN II）结构域和两个具有特殊EPS和FND基序的碳水化合物识别域（CRD）。LVMR转录本主要在肝癌中检测到，并在病原体挑战后提出了时间依赖的反应。重组LVMR（RLVMR）可以以Ca 2+依赖性的方式与各种PAMP和凝集的微生物结合，具有强大结合D-甘露糖和N-乙酰糖的能力。LVMR的敲低增强了大多数NF-κB途径基因的表达，炎症和氧化还原基因，而对大多数吞噬作用基因的转录没有明显影响。此外，LVMR的敲低导致活性氧（ROS）含量（ROS）含量和诱导型一氧化氮合酶（INOS）活性在颤动性和溶血感染后的肝癌中的活性增加。所有这些结果表明，LVMR在细菌感染过程中可能会作为免疫识别和炎症的负调节剂作为PRR。
微生物 - 运行
摘要：bola样蛋白家族在原核生物和真核生物中广泛存在。bola最初在大肠杆菌中描述为在固定相和应力条件下诱导的基因。Bola过表达使细胞球形。它的特征是转录因子调节细胞过程，例如细胞渗透率，生物膜产生，运动能力和agella组装。bola在与信号分子C-DI-GMP连接之间的运动和久坐的生活方式之间的切换中很重要。bola被认为是病原体（例如沙门氏菌伤寒和肺炎克雷伯氏菌）的毒力因子，当面对宿主防御引起的应力时，它会促进细菌存活。在大肠杆菌中，Bola同源物IBAG与抗酸性应激的抗性有关，而在弧菌霍乱中，IBAG对于动物细胞的定殖非常重要。最近，已经证明了Bola是磷酸化的，并且这种修改对于Bola的稳定性/周转及其活性作为转录因子很重要。结果表明，在Fe-S簇，铁进行曲线和存储的生物发生过程中，Bola样蛋白与CGFS-type GRX蛋白之间存在物理相互作用。我们还回顾了有关细胞和分子机制的最新进展，这些细胞和分子机制通过这些细胞和分子机制参与了真核生物和原核生物中铁稳态的调节。
质粒消除质粒的分子机制。
原核生物与侵入性移动遗传因素（MGE）之间的进化武器竞赛导致出现了无数的宿主防御系统，这些系统提供了免受入侵MGE的免疫力（1）。这些免疫机制包括限制性修饰（R-M），CRISPR-CAS，ARGONAUTE，CBASS，SHEDU，LAMASSU和WADJET系统（2-10）。防御系统通过限制水平基因转移（HGT）来消除入侵MGE和塑造微生物群落和生态系统的关键作用（11，12）。由于众多分子基因工程工具起源于原核基因组防御系统，因此了解原核生物免疫系统不仅对于揭开原核宿主相互作用的动力学至关重要，而且对于开发具有生物技术和药物中应用的分子工具的动力学。在重要的人类病原体弧菌霍乱中，两个DNA防御模块称为DDMABC和DDMDE合作以消除质粒，并被认为在第七大流行O1 El Tor（7pet）菌株的进化中起着关键作用（13）。ddmabc是一种类似拉马苏的防御系统，已证明质粒和噬菌体激活后会触发流产感染（7、13、14）。相比之下，DDMDE系统直接作用于小质粒，从而导致其降解（13）。结构建模表明DDME是一种核
集成的OMICS方法揭示了渗透压...
抽象的水生膜连续面对渗透应力，ill是感官并应对外部渗透挑战的第一个组织。然而，对吉尔微生物群如何应对渗透压及其潜在的宿主 - 细菌关系的理解受到限制。当前研究的目标是通过转录组测序和16S rRNA基因测序来鉴定g细胞中的低音反应基因，并在淡水传输实验后介绍吉尔微生物群。转录组测序在淡水传递后，鉴定出1,034个差异表达的基因（DEG），例如水通道蛋白和氯化钠共转运蛋白。基因和基因组（KEGG）分析的基因本体论（GO）和京都百科全书进一步强调了g的类固醇生物合成和糖胺聚糖生物合成途径。，将16S rRNA基因测序鉴定为海水中的主要细菌，在淡水传递后变为假单胞菌和cet骨。Alpha多样性分析表明，淡水转移组中的g细菌多样性较低。KEGG和METACYC分析进一步预测了吉尔细菌中糖胺聚糖和几丁质代谢的改变。总的来说，吉尔细胞和吉尔微生物群中的常见糖胺聚糖和几丁质途径都表明gill中的宿主 - 细菌相互作用促进了淡水的适应。
表型和基因型抗生素耐药性，从即食盐的海鲜中分离出来
安全的粮食生产面临着引起疾病的细菌和抗生素耐药细菌面临重大挑战，因为两者都对公共卫生和食品安全构成了严重的风险。这项研究调查了从渔民和鱼类市场获得的盐海鲜（Lakerda）样品中抗生素耐药菌的存在。表型分析表明，从渔民中收集的Lakerda样品中含有具有多抗生素耐药性的细菌，包括荧光假单胞菌，溶血性葡萄球菌和葡萄球菌。玛阳药，肉汤移动性和颤音的Hibernica物种是在鱼类市场出售的Larkerda样品中分离出来的。已经确定，在分离的细菌中，鲁莫尼斯V.不含任何基因型测试的基因。然而，P。荧光菌携带Blatem，QNRB，QNRS，Blaz和MSRA； S. Hemolyticus拥有Blatem，Tetk，DFRD，Blaz，MSRA，MSRB和MECA；玛阳c。具有Blatem，QNRA，QNRB，QNRS，Stra-STRB，Aphai-iab和Meca； C. Mobile包括Blatem，Blaz，MSRA，DFRD和MECA； V. Hibernica携带Blatem，Blaz，Meca和Vana。此外，S。casteuri和Equorum具有MECA抗性基因。总而言之，公共卫生需要提供卫生条件，以准备莱克达，确定传播方式，采取预防措施并提高对生产者和消费者的认识。
WEDCIA SINUELA的组织病理学研究（星期三 dv>
摘要简介：在全球多个位置记录了海胆疾病，据报道发生了细菌，原生动物，真菌和藻类感染的趣味。目的：本研究旨在研究格兰加那利岛（西班牙中部大西洋）沿岸沿着格兰加那岛沿岸的阿尔巴西亚利克拉和paracentrotus lividus种群的病原体。方法：采样是在岛东北侧的圣克里斯托瓦尔海滩进行的，在那里，海胆是在2022年6月，7月和10月的1-3 m深处手动收集的。拭子样品，并在各种培养基上进行培养。结果：鉴定出八种不同的病原体药物，包括细菌和真菌，其中所有患病的海胆样品中最常见的菌群溶解性菌株是最常观察到的细菌。此外，在测试中发现了纤毛的原生动物，可能充当机会性寄生虫。结论：这项研究通过鉴定出大量相关的病原体，包括念珠菌，以前在患病生物中未报告的念珠菌，从而为秃头海胆疾病提供了独特的观点。此外，该研究强调了具有细菌菌落的组织中存在炎症反应，从而为理解这种海胆疾病提供了重要的见解。
细菌清除率和评估虾免疫刺激活性的新鉴别血细胞染色方法
摘要：开发了评估黑虎虾（Penaeus monodon）免疫刺激剂功效的新方法。试验虾饲喂 2% 或 4% 酵母提取物 (YE) 涂层饲料，而对照组饲喂无涂层饲料。喂养 4 周后，对单只虾进行总血细胞计数 (THC)、颗粒血细胞 (GH) 数量和细菌清除率评估。对于血细胞计数，在室温下用 50% 乙醇中的 1.2% 玫瑰红对福尔马林固定的血淋巴染色 20 分钟。一部分混合物用血细胞计数器进行 THC 计数，一部分涂在显微镜载玻片上晾干，然后用苏木精复染进行 GH 计数。通过这种技术，可以获得高质量的涂片以进行准确的分类计数。细菌清除试验用于评估体液和细胞防御机制的总体效果。每只虾肌肉注射 1 × 10 8 个哈维氏弧菌，注射后 0、15、30 和 60 分钟收集抗凝血淋巴，在 TCBS 琼脂上进行四次滴数计数（20 µl）。饲喂 4% YE 的虾的总血细胞计数显著高于（p < 0.05）饲喂无涂层饲料的虾。饲喂 YE 的虾的颗粒细胞百分比和细菌清除率高于饲喂对照饲料的虾。这两种方法可以简单快速地比较虾组抗菌防御能力的差异。
哲学硕士（微生物学）研究生课程
水、食物、奶制品、肉类、蛋类、蔬菜、水果、空气等。• 运用知识控制人群中的微生物疾病。理论：人畜共患病的概念和分类；人畜共患病的病因、宿主范围、流行病学、传播、发病机制、诊断和管理的全面描述。人畜共患病细菌，如芽孢杆菌、梭菌、分枝杆菌、假单胞菌、钩端螺旋体、布鲁氏菌、弯曲杆菌、沙门氏菌、耶尔森氏菌、李斯特菌、葡萄球菌、链球菌、大肠杆菌和弧菌、猫抓病、衣原体、伯氏疏螺旋体等：病毒性人畜共患病的详细描述：流感、狂犬病、蜱传脑炎、肠道病毒、细小病毒、腺病毒、星状病毒、钙化病毒和冠状病毒、媒介传播病毒等。日本脑炎、基亚萨努尔森林病、克里米亚-刚果出血热、登革热、西尼罗河病毒、黄热病、裂谷热、马脑炎、马蹄跳、以及一些罕见和潜在的人畜共患病毒，如新城疫、口蹄疫和痘病毒、食物传播病毒，如轮状病毒和朊病毒。真菌性人畜共患疾病：念珠菌病、皮肤癣菌病、芽生菌病、曲霉病、组织胞浆菌病、癣菌感染、球孢子菌病、隐球菌病、霉菌毒素中毒。微生物性人畜共患疾病的预防和控制措施，特别针对兽医/辅助兽医人员。实践：人畜共患病原体的分离和鉴定，人畜共患疾病的分子诊断程序。基于调查的重要区域性人畜共患病爆发研究 推荐阅读： 1. Burlage, RS, 2011. 公共卫生微生物学原理。Jones and Bartlett Learning，