(未经同行评审认证)是作者/资助者。保留所有权利。未经许可不得重复使用。此预印本的版权所有者此版本于 2021 年 1 月 9 日发布。;https://doi.org/10.1101/2021.01.08.426005 doi:bioRxiv preprint
(未通过同行评审认证)是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此预印版的版权持有人于2021年1月13日发布。 https://doi.org/10.1101/2021.01.08.426005 doi:biorxiv preprint
C9ORF72 基因内含子 1 中的六个核苷酸重复扩增是影响肌萎缩侧索硬化症和额颞叶痴呆症患者的最常见的基因突变。重复扩增的双向转录会产生正义和反义重复 RNA,这些 RNA 随后可以在所有阅读框架中翻译,从而产生具有独特末端的六种不同的二肽重复 (DPR) 蛋白。这些蛋白质在 C9ORF72 重复扩增中的准确翻译起始位点仍然难以捉摸。我们使用 CRISPR-Cas9 基因组编辑和空间阻断反义寡核苷酸 (ASO) 研究反义重复 RNA 中的不同 AUG 密码子对 C9ORF72 扩增载体运动神经元和淋巴母细胞中 DPR 蛋白、poly(GP) 和 poly(PR) 产生的贡献。然后,我们利用针对 C9ORF72 正义重复 RNA 的 ASO 来检查正义或反义 RNA 是否是 poly(GP) 蛋白的主要来源 - 这个问题存在相互矛盾的证据。我们发现这些 ASO 减少了预期的正义 RNA 靶标,但也减少了反义 RNA,从而阻止了 poly(PR) 的产生。我们的数据强调了反义 CCCCGG 重复扩增之前的序列对于反义 DPR 蛋白合成的重要性,并支持使用正义 C9ORF72 ASO 来防止正义和反义依赖性 DPR 蛋白在 C9ORF72 ALS/FTD 中的积累。
摘要:色素性视网膜炎11是一种不可治疗的,主要遗传的视网膜疾病,由MRNA加工因子31 PRPF31中的杂合突变引起。PRPF31的表达水平与受影响家庭的不完全渗透有关;具有较高PRPF31表达的突变载体可以无症状。当前的研究探讨了反义寡核苷酸外显子跳过策略,以治疗由PRPF31外显子12中截断突变引起的RP11,因为它似乎没有编码PRPF31蛋白质功能所必需的任何域。细胞源自携带PRPF31 1205C>的患者,研究了废话突变。由1205C> A编码的PRPF31转录本由于胡说八道介导的mRNA衰变而无法检测到,相对于健康的供体细胞,PRPF31 mRNA降低了46%。反义寡核苷酸诱导的外显子12的跳过,拯救了开放式阅读框,因此在RP11患者成纤维细胞中,prpf31 mRNA上调为1.7倍。PRPF31上调的水平达到了具有相同突变的非探针载体家族成员推断出的预测的表达阈值。这项研究表明,诱导PRPF31同工型的PRPF31表达和核易位能力的保留增加。未来的研究应评估诱导的PRPF31蛋白在视网膜细胞中MRNA剪接上的功能,以验证可依延RP11引起的突变的治疗方法。
RecA/Rad51家族蛋白诱导的DNA结构的内在动态特性:DNA作为基因组材料可能比RNA更具优势”。美国国家科学院院刊98.15(2001):8425-8432。
如果所讨论的蛋白质对于病毒的复制或癌细胞的不受控制的生长很重要,则可以观察到治疗作用。从理论上讲,反义寡核苷酸也可用于阻断正常细胞中蛋白质的合成,以便可以确定特定蛋白质的生物学作用。但是,在此应用程序中,最近开发的RNAi方法更受欢迎。RNA:反义寡核苷酸和靶mRNA之间形成的DNA混合双链体直接干扰蛋白质合成,从而降低了编码蛋白的表达。这种抑制作用可能是由于核糖体与反义寡核苷酸结合和/或杂化无法通过核糖体和直接蛋白质表达的核糖体周围组装的抑制作用。核糖核酸酶H(RNase H)对与反义寡核苷酸杂交的mRNA分子的核酸酶H(RNase H)的内核酸酶活性增强了反义作用。rNase h破坏了mRNA链,RNase H酶和反义寡核苷酸在循环结束时保持完整:因此,反义效应是催化的(图1)。单个反义寡核苷酸可以通过该机制销毁许多mRNA分子。酶RNase H发生在正常细胞中,在正常细胞中,它在去除DNA复制滞后的短链中起着重要作用。
ADAR酶家族的腺苷脱氨酸是一个自然过程,它在通过Messenger RNA时编辑了遗传信息。 腺苷转化为mRNA中的inosine,该基碱在翻译过程中被解释为鸟苷。 意识到这项活动对治疗剂的潜力,许多研究人员开发了将ADAR活动重定向到新目标的系统,该系统通常未进行编辑。 These site-directed RNA editing (SDRE) systems can be broadly classified into two categories: ones that deliver an antisense RNA oligonucleotide to bind opposite a target adenosine, creating an editable structure that endogenously expressed ADARs recognize, and ones that tether the catalytic domain of recombinant ADAR to an antisense RNA oligonucleotide that serves as a targeting mechanism, much like with CRISPR-CAS或RNAi。 迄今为止,SDRE主要用于纠正遗传突变。 在这里,我们认为这些应用不是理想的SDRE,主要是因为RNA编辑是短暂的,遗传突变不是。 相反,我们建议可以使用SDRE来调整细胞生理,以实现治疗上有利的临时结果,尤其是在神经系统中。 这些包括操纵伤害性神经回路中的兴奋性,废除特定的磷酸化事件,以减少与神经变性相关的蛋白质聚集或减少神经性疤痕,从而抑制神经再生或增强G蛋白耦合受体信号的抑制,从而增加象征性障碍性和粘贴性的神经偶联受体信号。ADAR酶家族的腺苷脱氨酸是一个自然过程,它在通过Messenger RNA时编辑了遗传信息。腺苷转化为mRNA中的inosine,该基碱在翻译过程中被解释为鸟苷。意识到这项活动对治疗剂的潜力,许多研究人员开发了将ADAR活动重定向到新目标的系统,该系统通常未进行编辑。These site-directed RNA editing (SDRE) systems can be broadly classified into two categories: ones that deliver an antisense RNA oligonucleotide to bind opposite a target adenosine, creating an editable structure that endogenously expressed ADARs recognize, and ones that tether the catalytic domain of recombinant ADAR to an antisense RNA oligonucleotide that serves as a targeting mechanism, much like with CRISPR-CAS或RNAi。迄今为止,SDRE主要用于纠正遗传突变。在这里,我们认为这些应用不是理想的SDRE,主要是因为RNA编辑是短暂的,遗传突变不是。相反,我们建议可以使用SDRE来调整细胞生理,以实现治疗上有利的临时结果,尤其是在神经系统中。这些包括操纵伤害性神经回路中的兴奋性,废除特定的磷酸化事件,以减少与神经变性相关的蛋白质聚集或减少神经性疤痕,从而抑制神经再生或增强G蛋白耦合受体信号的抑制,从而增加象征性障碍性和粘贴性的神经偶联受体信号。
ADAR酶家族的腺苷脱氨酸是一个自然过程,它在通过Messenger RNA时编辑了遗传信息。 腺苷转化为mRNA中的inosine,该基碱在翻译过程中被解释为鸟苷。 意识到这项活动对治疗剂的潜力,许多研究人员开发了将ADAR活动重定向到新目标的系统,该系统通常未进行编辑。 These site-directed RNA editing (SDRE) systems can be broadly classified into two categories: ones that deliver an antisense RNA oligonucleotide to bind opposite a target adenosine, creating an editable structure that endogenously expressed ADARs recognize, and ones that tether the catalytic domain of recombinant ADAR to an antisense RNA oligonucleotide that serves as a targeting mechanism, much like with CRISPR-CAS或RNAi。 迄今为止,SDRE主要用于纠正遗传突变。 在这里,我们认为这些应用不是理想的SDRE,主要是因为RNA编辑是短暂的,遗传突变不是。 相反,我们建议可以使用SDRE来调整细胞生理,以实现治疗上有利的临时结果,尤其是在神经系统中。 这些包括操纵伤害性神经回路中的兴奋性,废除特定的磷酸化事件,以减少与神经变性相关的蛋白质聚集或减少神经性疤痕,从而抑制神经再生或增强G蛋白耦合受体信号的抑制,从而增加象征性障碍性和粘贴性的神经偶联受体信号。ADAR酶家族的腺苷脱氨酸是一个自然过程,它在通过Messenger RNA时编辑了遗传信息。腺苷转化为mRNA中的inosine,该基碱在翻译过程中被解释为鸟苷。意识到这项活动对治疗剂的潜力,许多研究人员开发了将ADAR活动重定向到新目标的系统,该系统通常未进行编辑。These site-directed RNA editing (SDRE) systems can be broadly classified into two categories: ones that deliver an antisense RNA oligonucleotide to bind opposite a target adenosine, creating an editable structure that endogenously expressed ADARs recognize, and ones that tether the catalytic domain of recombinant ADAR to an antisense RNA oligonucleotide that serves as a targeting mechanism, much like with CRISPR-CAS或RNAi。迄今为止,SDRE主要用于纠正遗传突变。在这里,我们认为这些应用不是理想的SDRE,主要是因为RNA编辑是短暂的,遗传突变不是。相反,我们建议可以使用SDRE来调整细胞生理,以实现治疗上有利的临时结果,尤其是在神经系统中。这些包括操纵伤害性神经回路中的兴奋性,废除特定的磷酸化事件,以减少与神经变性相关的蛋白质聚集或减少神经性疤痕,从而抑制神经再生或增强G蛋白耦合受体信号的抑制,从而增加象征性障碍性和粘贴性的神经偶联受体信号。
摘要目的:磷酸肌醇3-激酶/蛋白激酶AKT/哺乳动物雷帕霉素靶蛋白信号通路对细胞正常代谢和细胞生长至关重要。然而,该通路的异常激活与乳腺癌的进展和转移有关。最近,长链非编码RNA在干扰参与细胞生长和代谢的细胞信号通路中的作用已被发现。HOX反义基因间RNA是一种长链非编码RNA,其异常表达与乳腺癌的发展、治疗耐药和转移有关。本研究旨在调查长链非编码RNA HOX反义基因间RNA是否与乳腺癌细胞中的磷酸肌醇3-激酶/蛋白激酶AKT/哺乳动物雷帕霉素靶蛋白信号通路有关。方法:利用siRNA沉默乳腺癌细胞系MCF-7中的HOX反义基因间RNA。随后,使用实时RT-PCR评估HOX反义基因间RNA、PI3K、AKT和mTOR的基因表达水平。此外,使用3-(4,5-二甲基噻唑-2-基)-2,5-二苯基四唑溴化物)分析法分析细胞增殖。结果:结果显示,与阴性对照相比,HOX反义基因间RNA敲低可以下调MCF-7细胞中PI3K、AKT和mTOR RNA的表达。此外,HOX反义基因间RNA沉默后乳腺癌细胞的增殖显着降低。结论:本研究可能引入HOX反义基因间RNA作为参与乳腺癌细胞中磷酸肌醇3-激酶/蛋白激酶AKT/哺乳动物雷帕霉素靶蛋白信号通路上调的分子,从而可能促进乳腺癌细胞增殖。关键词:MCF-7细胞。HOTAIR长链非编码RNA。RNA。长链非编码。基因表达。
Recquired elements for the transcription process: The transcribed strand of DNA molecule is the 3'-5' (also called antisense strand), which serves as a template for the synthesis of a mRNA molecule having the same nucleotide structure of the sense strand of DNA (the difference is U instead of T) RNA polymerase II: it is the enzyme that adds ribonucleotides,顺序和互补转录因子:旨在募集,引导和固定SST的RNA聚合酶II,以便转录以核苷酸+1开始。激活聚合酶的介质。启动子 + RNA聚合酶II +转录因子=转录起始复合物。