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人类止血系统在形成金黄色葡萄球菌生物膜
该项目将研究纤维蛋白支架的存在如何改变金黄色葡萄球菌生物膜的性质。它将集中于生物膜形状，强度，精确组成，甚至是生物膜抵抗人类细胞攻击或与血小板相互作用的能力（另一种参与血液凝结的细胞）的能力，这都是由生物膜内的纤维蛋白引起的。为此，该项目将研究在存在人血浆和/或纤维蛋白的情况下在实验室生长的生物膜，无论是否添加人类细胞，它将依靠三维显微镜，不同生物膜成分的特异性免疫学染色，以及生物生物物质分析的生物生物物质粘弹性特性。将对从体内金黄色葡萄球菌感染收集的实际生物膜进行类似的分析 - 例如，来自与生物膜相关感染的人类以及体内模型的样本。
血液透析末期肾脏疾病患者的抗稳定金黄色毒菌适应性免疫受损：一年纵向研究
结果：ESRD患者的全血金黄色链球菌的生存率显着高于M0的对照组（P = 0.049），而在所有时间点，ESRD患者在ESRD患者中观察到受损的氧化爆发活性（P <0.001）。ESRD患者的金黄色金黄色金黄色金黄色金黄色葡萄球菌免疫球蛋白G（IgG）对铁表面决定性B（ISDB）和金黄色葡萄球菌A血溶质蛋白（HLA）抗原的反应低于健康供体的M0，在M0的健康供体中（p = 0.003和P = 0.007）（分别是P = 0.007）（分别是P = 0.007）（p = 0.007），并且P = 0.05 = 0.05 = 0.05 M12。此外，金黄色葡萄球菌 - 特异性T-辅助细胞反应与ISDB的对照组相当，但在所有时间点，HLA抗原受损：10％的ESRD患者在M0时对HLA响应，M12在M12时增加到30％，而在M12中，与45％的健康捐助者相比。b细胞和血液中的T细胞浓度显着降低（分别为60％和40％）。最后，人白细胞抗原-DR（HLA-DR）和C-C趋化因子受体2型（CCR2）的上调在M0处受损，但在HD的第一年期间恢复。
印度尼西亚林博托湖芒格拜鱼 (Glossogobius aureus) 的 DNA 条形码、系统发育树和遗传距离
摘要 .芒格拜鱼（Glossogobius aureus）是林博托湖的一种具有经济价值的本地鱼类。随着湖泊生态系统的破坏，当地鱼类面临的压力也越来越大。芒格拜鱼种群的减少说明了这一点。总体而言，当地社区将芒格拜鱼视为特有鱼类。芒格拜鱼的保护工作需要从 DNA 角度进行分析。本研究旨在探索芒格拜鱼物种的身份，分析遗传距离并构建系统发育树。从林博托湖采集鱼样并运送到哥伦打洛州立大学渔业与海洋科学学院的实验室进行形态学和计数分析。对组织取样用 PCR 进行 DNA 条形码分析。DNA 测序基于 PCR。分析表明，从林博托湖采集的所有芒格拜鱼样本都属于同一个物种，即 G. aureus。 DNA 条形码结果得到了与参考序列 99-100% 的相似性测试、单个 manggabai 样本的系统发育树序列以及显示亲缘关系的单个参考鱼序列的支持。关键词：DNA 条形码、鱼类物种身份、林博托湖、相似性指数。简介。林博托湖是位于印度尼西亚哥伦打洛省的生态系统资源，覆盖哥伦打洛县和哥伦打洛市地区。从地理上看，林博托湖位于低地，周围环绕着石灰岩山丘，有 23 条支流作为入口，1 条支流作为出口。林博托湖对该地区至关重要，因为它具有多种生态、社会和经济功能。因此，政府已将林博托湖列为国家战略区。
药用植物对金黄色葡萄球菌的抗菌特性，
抽象草药已经在非洲使用了几个世纪，并且在许多非洲社区中仍然是传统医学的重要方面。虽然Euclea divinorum，Carissa Edulis和Prunus Africana在肯尼亚的传统使用历史悠久，但需要进行更多的研究来确定其用于这些药用目的的安全性和功效。因此，这项研究研究了Euclea divinorum hern（Ebenaceae），Carissa Edulis和Prunus Africana的抗菌功能，以抵抗金黄色葡萄球菌，Escherichia Coli和Candida Albicans细菌，以补充其他研究者的工作。这三种植物的叶子，根和茎树皮是从Elgeyo Marakwet县目的收集的。在肯尼亚的Eldoret生物技术实验室分析了样品。将样品磨碎成粉末，并用己烷，甲醇和丙酮依次提取。提取物的抗菌活性是通过琼脂盘扩散法确定的。在将根，叶子和茎皮提取物引入培养皿上的菌落后，测量了井的抑制直径以测试其抗菌活性。针对金黄色葡萄球菌，大肠杆菌和白色念珠菌的E. divinorum，C。edulis和P. africana的根，叶子和茎皮提取物表现出针对金黄色葡萄球菌和大肠杆菌细菌菌株的抗菌活性的不同程度。最后，非洲疟原虫的甲醇茎树皮提取物仅对大肠杆菌和白色念珠菌具有活性，但是，divinorum和C. edulis的茎树皮提取物并不反对金黄色葡萄球菌，大肠杆菌和白色念珠菌。E。divinorum和C. edulis根提取物表现出针对金黄色葡萄球菌，大肠杆菌和白色念珠菌的抗菌效力，而Divinorum和divinorum和P. africana的叶片则表现出对金黄色葡萄球菌和大肠杆菌细菌菌株的抗菌活性。因此，建议divinorum和C. edulis的根提取物以及非洲疟原虫的茎皮提取物可以为开发替代性抗菌剂的发育提供潜在的来源，而E. divinorum和C. divinorum和C. edulis剂可能会提供潜在的来源，以进一步开发抗真菌药物的疾病治疗疾病。关键词：草药植物，抗菌活性，细菌，真菌，欧几里亚神经，Carissa Edulis和Prunus Africana
在金黄色葡萄球菌中的LineZolid-Analogue L3抗性突变的表征
对于参与研究和发现针对这些病原体的新型且更有效的抗菌剂，革兰氏阳性病原体细菌中的多药耐药性是与研究和发现新的且更有效的抗菌剂有关的科学界最为明显的挑战之一。Linezolid, an oxazolidinone antibiotic, is effective for the treatment of infections caused by Gram- positive pathogens resistant to other antibiotics including methicillin-resistant S. aureus (MRSA), vancomycin-resistant enterococci (VRE), and penicillin-resistant Streptococcus pneumoniae [ 1 ].良好的药代动力学和有毒作用利录，与人类口服或静脉内给药一致，代表了显着特征，这些特征使Linezolid成为巨大成功的抗生素[2]，也显示出适合降低耐药性发生的几种特征。的确，LineZolid是一种完全合成的药物。因此，没有预期的自然且预先存在的抗性基因可以缓解耐药机制的出现。此外，它具有独特的作用机理，该机制在非常早的阶段靶向细菌蛋白质的合成[3]，因此，药物和商业上可用的抗菌药物之间的交叉耐药性将是遥远的。在任何情况下，抗二唑酚耐药细菌的识别[4]已经强调了需要绕开耐药性的不同靶标的新的恶唑烷酮型药物。正在进行结构变化和改进特征的新的恶唑烷酮研究，研究领域非常活跃[5]。在本文中，我们描述了这些linezolid类似物之一，称为10f。在先前的论文[6]中，我们描述了在C-5位置具有尿素和硫库功能的未报告的线索酚类似物的设计，合成和初步抗菌活性。了解这种类似物的作用机理，产生了金黄色葡萄球菌的抗性突变体。
基于配体的针对细菌转录的新型抗金黄色葡萄球菌抗菌药物设计
摘要：金黄色葡萄球菌是一种常见的人类共生病原体，可引起多种传染病。由于抗生素耐药性的产生，病原体对越来越多的抗生素产生耐药性，从而产生了耐甲氧西林金黄色葡萄球菌 (MRSA) 甚至耐多药金黄色葡萄球菌 (MDRSA)，即“超级细菌”。这种情况凸显了对新型抗菌药物的迫切需求。细菌转录负责细菌 RNA 的合成，是开发抗菌药物的有效但未充分利用的靶点。之前，我们报道了一类新型抗菌药物，称为 nusbiarylins，它通过中断两种转录因子 NusB 和 NusE 之间的蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI) 来抑制细菌转录。在这项工作中，我们根据 nusbiarylins 的化学结构及其对金黄色葡萄球菌的活性开发了一种基于配体的工作流程。整合了基于配体的模型（包括药效团模型、3D QSAR、AutoQSAR 和 ADME/T 计算），并用于以下 ChemDiv PPI 数据库的虚拟筛选。结果，四种化合物（包括 J098-0498、1067-0401、M013-0558 和 F186-026）被鉴定为针对金黄色葡萄球菌的潜在抗菌剂，预测的 pMIC 值范围为 3.8 至 4.2。对接研究表明这些分子与 NusB 紧密结合，结合自由能范围为 -58 至 -66 kcal/mol。
耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的鉴定及药物靶点的分子表征
1960 年代，耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）开始出现，并有报道呈波浪式出现（Strausbaugh et al ., 1996）。国家医院感染监测系统的数据报告，重症监护病房中耐甲氧西林金黄色葡萄球菌菌株数量急剧增加，达到 59.5%-64.4%（Klevens et al., 2006）。目前已知的葡萄球菌的药物靶点包括肽聚糖生物合成途径的青霉素结合蛋白。以前，β-内酰胺类抗生素对葡萄球菌非常有效。此外，由于改良型青霉素结合蛋白的生物合成和β-内酰胺酶的生物合成，这些药物现在不再有效 (Kong et al .,2010)。全世界都在关注研究一种以前未曾研究过的抗生素的可能性。
特应性皮炎中金黄色葡萄球菌毒力因子的表达
特应性皮炎（AD）是一种皮肤炎症性疾病，其中机会性病原体金黄色葡萄球菌既普遍又丰富。S.金黄色葡萄球菌具有几种分泌的毒力因子，这些因子在感染模型中具有良好的功能，但尚不清楚这些细胞外微生物因子是否在AD的背景下是否相关。为了解决这个问题，我们设计了一种与文化无关的方法来检测和量化在皮肤部位表达的金黄色葡萄球菌毒力因子。我们利用rnase-h - 依赖性多重PCR进行了从胶带中提取的反转录的RNA的前透明化，这些RNA从具有不同严重程度的皮肤部位采样的患者的胶带条中提取，并评估了使用qPCR使用QPCR的S. aureus毒力因子的表达。我们观察到疾病严重程度增加的位点可行的金黄色葡萄球菌丰度增加，并且在AD皮肤部位表达了许多毒力因子。令人惊讶的是，与非静电对照相比，我们没有观察到病变部位的毒力因子的任何显着性。总体而言，我们利用了一个可靠的测定法直接检测和量化AD皮肤病变部位的可行金黄色葡萄球菌及其相关的毒力因子。该方法可以扩展以研究各种皮肤病学部位的皮肤微生物基因的表达。
定向域间运动使 IsdH 金黄色葡萄球菌受体能够从人体血红蛋白中快速提取血红素
致病性金黄色葡萄球菌利用 IsdH 表面受体主动从人类血红蛋白 (Hb) 中获取铁。血红素提取由受体内的三域单元介导，该单元包含其第二 (N2) 和第三 (N3) NEAT 域，由螺旋连接域连接。提取发生在动态复合体中，其中受体与每个珠蛋白链结合；N2 域与 Hb 紧密结合，而受体内大量的域间运动使其 N3 域能够暂时扭曲珠蛋白的血红素口袋。使用分子模拟结合马尔可夫模型，以及停流实验定量测量血红素转移动力学，我们表明受体内的定向域间运动在提取过程中起着关键作用。N3 域运动的方向性和血红素提取的速率由连接 N2 和连接域的短而灵活的域间系绳内的氨基酸控制。在野生型受体中，源自系链的定向运动使 N3 域能够填充能够扭曲 Hb 口袋的配置，而含有改变的系链的突变受体不太能够采用这些构象异构体并通过间接过程缓慢捕获血红素，其中 Hb 首先将血红素释放到溶剂中。因此，我们的结果表明 IsdH 受体内的域间运动在其能力中起着关键作用
定向域间运动使 IsdH 金黄色葡萄球菌受体能够从人体血红蛋白中快速提取血红素
致病性金黄色葡萄球菌利用 IsdH 表面受体主动从人类血红蛋白 (Hb) 中获取铁。血红素提取由受体内的三域单元介导，该单元包含其第二 (N2) 和第三 (N3) NEAT 域，由螺旋连接域连接。提取发生在动态复合体中，其中受体与每个珠蛋白链结合；N2 域与 Hb 紧密结合，而受体内大量的域间运动使其 N3 域能够暂时扭曲珠蛋白的血红素口袋。使用分子模拟结合马尔可夫模型，以及停流实验来定量测量血红素转移动力学，我们表明受体内的定向域间运动在提取过程中起着关键作用。N3 域运动的方向性和血红素提取的速率由连接 N2 和连接域的短而灵活的域间系绳内的氨基酸控制。在野生型受体中，源自系链的定向运动使 N3 域能够填充能够扭曲 Hb 口袋的配置，而含有改变的系链的突变受体不太能够采用这些构象并通过间接过程缓慢捕获血红素，其中 Hb 首先将血红素释放到溶剂中。因此，我们的结果表明 IsdH 受体内的域间运动在其能力中起着关键作用