摘要:抗菌耐药性(AMR)的出现,尤其是金黄色葡萄球菌(MRSA),构成了重大的全球健康威胁,因为这些细菌越来越多地抵抗最可用的治疗选择。因此,开发一种有效的方法以直接从临床标本中快速筛选MRSA变得至关重要。在这项研究中,我们建立了一个闭合的管环介导的等热放大(LAMP)方法,该方法融合了羟基荷硫醇蓝(HNB)色染料测定法,以直接根据MECA和SPA基因的存在直接从临床样品中检测MRSA。总共有125个预识别的金黄色葡萄球菌分离株和93个含有金黄色葡萄球菌的临床样品来自哈马德综合医院(HGH)的微生物学实验室。根据常规PCR计算敏感性,特异性,正预测值(PPV)和负预测值(NPV)。该测定法显示了100%特异性,91.23%的敏感性,0.90 Cohen Kappa(CK),100%PPV和87.8%的NPV,而临床分离株则表现出100%特异性,97%的敏感性,926 CK,0.926 CK,100%PPV,和889%NPV。与头孢辛蛋白盘扩散相比,LAMP提供了100%的特异性和敏感性,PPV和NPV的1.00 CK和100%。研究表明,闭合管灯(HNB)染料是一种快速技术,其周转时间小于1小时,并且特异性和灵敏度高。
金黄色葡萄球菌中的染色体突变和靶基因缺失和失活通常使用等位基因交换方法产生。然而,近年来,已经开发出更快速的方法,通常使用基于 CRISPR - Cas9 的系统。在这里,我们描述了最近开发的用于金黄色葡萄球菌的基于 CRISPR - Cas9 的质粒系统,并讨论了它们在靶基因突变和失活中的用途。首先,我们描述如何将 CRISPR - Cas9 反选择策略与重组工程策略相结合以在金黄色葡萄球菌中产生基因缺失。然后我们引入死 Cas9 (dCas9) 和 Cas9 切口酶 (nCas9) 酶,并讨论如何使用与不同核苷脱氨酶融合的 nCas9 酶在靶基因中引入特定的碱基变化。然后,我们讨论如何通过引入提前终止密码子或突变起始密码子,使用 nCas9-脱氨酶融合酶来实现靶向基因失活。这些工具共同凸显了基于 CRISPR - Cas9 的方法在金黄色葡萄球菌基因组编辑中的强大功能和潜力。
1莱布尼兹光子技术研究所(IPHT),莱布尼兹感染研究中心(LPI),07745德国耶拿,德国2号耶拿2感染遗传学研究校园,07743德国耶拿,德国耶拿,3 Hygiene, 1220 Vienna, Austria 5 Institute of Microbiology and Epizootics, Centre for Infection, Medicine School of Veterinary Medicine, Freie Universität Berlin, 14163 Berlin, Germany 6 Veterinary Centre for Resistance Research (TZR), School of Veterinary Medicine, Freie Universität Berlin, 14163 Berlin, Germany 7 Institute of Microbiology, University of Veterinary Medicine, 1210奥地利维也纳; igor.loncaric@vetmeduni.ac.at 8 Poultry Clinics and Laboratory Pöppel, 33129 Delbrück, Germany 9 Department of Pathology and Wildlife Disease, National Veterinary Institute (SVA), 75189 Uppsala, Sweden 10 Department of Biomedical Sciences and Veterinary Public Health, Swedish University of Agricultural Sciences (SLU), 75007 Uppsala,瑞典11细菌感染和人畜共患病研究所,弗里德里希·洛夫勒·伊斯蒂特(Friedrich-Loeffler-Institut)(联邦动物健康研究所),07743德国耶拿,德国12个物理化学研究所,弗里德里希·史基勒大学,弗里德里希·史基勒大学,德国jena,07743 jena,jena,jena,jena jena,jena jena jena * sosecence:soneceence:Steence:Steence:Steecectect CortezdeJäckel和Helmut Hotzel已退休。
血素蛋白:TSA + 5%绵羊血凝酶的β-溶性:24小时(父母)阳性。dnase:阳性NaCl:通过生长甘露醇盐琼脂凝血酶的耐受性:24小时内阳性本文档中提供的信息仅出于参考目的,并且可能不是全包。Revvity,Inc。,其子公司和/或分支机构(统称为“ Revvity”)对此处包含的信息的准确性或完整性不承担责任。用户在处理材料时应谨慎行事,因为他们可能会出现未知的危险。对与产品的处理或接触造成的任何损害或损失不承担任何责任,因为Revvity无法控制实际方法,量或使用条件。用户负责确保产品适合其特定应用。revvity明确否认所有担保,包括对特定目的的适销性或适合性的保证,无论是否口头或书面,明示或暗示,据称是由于任何交易或任何交易的用法而引起的,与此处包含的信息或产品本身有关的信息或任何交易过程,
苏格兰抗菌药物处方组 (SAPG) 与苏格兰微生物学和病毒学网络合作制定的指南原始版本。苏格兰抗菌药物处方组 2023 年 2 月 | 审核日期 2026 年 2 月
负载水凝胶显示出再上皮化事件,而负载 CIP 的水凝胶显示出与患病对照相似的感染事件。发现用负载 CIP 的水凝胶治疗的小鼠的感染率较高。在研究结束时测量了脾脏的重量,在感染对照组中观察到体重和长度的增加,这是由于感染期间发生的炎症。此外,在诱导之前和进行尸检之前对动物的体重进行了比较,发现感染对照组的动物体重减轻,而在治疗组中没有观察到由于感染清除而导致的体重减轻,如图 14 所示。本研究是探索和利用新型支架作为外排泵抑制剂和佐剂的开创性一步
葡萄球菌金黄色葡萄球菌菌株是MEC A和PBP2A阳性,但在表观上容易受到奥沙西林的影响,据世界各地的研究变得越来越丰富。 金黄色葡萄球菌(OS-MRSA)的奥沙西林易感性导致了由于常规易感性测试的错误识别而导致的治疗失败。 因此,当前研究的目的是确定位于印度南部迈索尔的三级护理机构中OSMRSA的普遍性。 395个从不同临床样本中收集的MRSA分离株被包括在基于实验室的前瞻性研究中。 这些分离株通过标准盘扩散测试在表型上使用oxacillin1μg椎间盘进行测试,并同时通过Vitek2系统确定MIC至Oxacillin。 此外,将MRSA特异性MEC A基因检测应用于这些分离株,以便在基因型上确认其MRSA状态。 PCR的发现表明65%的分离株是MRSA。 VITEK2系统检测到4.06%OS-MRSA分离株,奥沙西林MIC ≤2µg/ml。 椎间盘扩散方法总共确定了13.75%的分离株,因为阿氧林敏感和10%分离株是阿氧林敏感的。 使用VITEK2和DISC扩散技术显示了1.87%的MEC A阳性MRSA分离株的 oxacillin敏感性。 该分析发现较低的奥沙西林MIC分离株,但OS-MRSA发病率相对降低。 使用奥沙西林盘进行常规实验室MRSA检测可能有时会产生虚假的阴性结果,这可能导致抗生素给药和治疗失败不当。葡萄球菌金黄色葡萄球菌菌株是MEC A和PBP2A阳性,但在表观上容易受到奥沙西林的影响,据世界各地的研究变得越来越丰富。金黄色葡萄球菌(OS-MRSA)的奥沙西林易感性导致了由于常规易感性测试的错误识别而导致的治疗失败。因此,当前研究的目的是确定位于印度南部迈索尔的三级护理机构中OSMRSA的普遍性。395个从不同临床样本中收集的MRSA分离株被包括在基于实验室的前瞻性研究中。这些分离株通过标准盘扩散测试在表型上使用oxacillin1μg椎间盘进行测试,并同时通过Vitek2系统确定MIC至Oxacillin。此外,将MRSA特异性MEC A基因检测应用于这些分离株,以便在基因型上确认其MRSA状态。PCR的发现表明65%的分离株是MRSA。VITEK2系统检测到4.06%OS-MRSA分离株,奥沙西林MIC ≤2µg/ml。椎间盘扩散方法总共确定了13.75%的分离株,因为阿氧林敏感和10%分离株是阿氧林敏感的。oxacillin敏感性。该分析发现较低的奥沙西林MIC分离株,但OS-MRSA发病率相对降低。使用奥沙西林盘进行常规实验室MRSA检测可能有时会产生虚假的阴性结果,这可能导致抗生素给药和治疗失败不当。为了将OS-MRSA与MRSA区分开,结合表型和基因型技术至关重要。
。CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可,根据 提供(未经同行评审认证)是作者/资助者,他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者此版本于 2023 年 7 月 15 日发布。;https://doi.org/10.1101/2022.10.31.514627 doi:bioRxiv 预印本
收到日期:2022 年 10 月 24 日;接受日期:2023 年 5 月 23 日;发布日期:2023 年 6 月 16 日 作者隶属关系:1 澳大利亚南澳大利亚州阿德莱德大学生物科学学院分子与生物医学科学系;2 澳大利亚南澳大利亚州阿德莱德大学传染病研究中心 (RCID);3 澳大利亚南澳大利亚州阿德莱德大学澳大利亚抗菌素耐药性生态学中心 (ACARE);4 澳大利亚南澳大利亚州阿德莱德皇家阿德莱德医院血管外科系;5 昆士兰科技大学 (QUT) 健康学院临床科学学院,昆士兰州凯尔文格罗夫 4059,澳大利亚;6 澳大利亚南澳大利亚州阿德莱德大学阿德莱德医学院外科学科; 7 澳大利亚南澳大利亚州阿德莱德伊丽莎白女王医院巴兹尔·赫泽尔转化健康研究中心;8 西班牙瓦伦西亚省瓦伦西亚 FISABIO 研究所卫生与基因组学系;9 澳大利亚南澳大利亚州阿德莱德伊丽莎白女王医院内分泌科;10 澳大利亚南澳大利亚州阿德莱德阿德莱德大学阿德莱德牙科学院。 *通讯作者:Stephen P. Kidd,stephen.kidd@adelaide.edu.au 关键词:糖尿病;糖尿病足部感染;足部溃疡;小菌落变种;金黄色葡萄球菌。缩写:BMI,身体质量指数;DFI,糖尿病相关足部感染;DFI-OM,糖尿病相关足部感染伴有骨髓炎;DFI-W,糖尿病相关足部感染伴有伤口;DFU,糖尿病相关足部溃疡; nsSCV,不稳定小菌落变体;QEH,伊丽莎白女王医院;RAH,皇家阿德莱德医院;SCV,小菌落变体;sSCV,稳定小菌落变体。当前研究期间生成和/或分析的数据集可在 BioProject 数据库中找到,访问编号为 PRJNA821238。本文的在线版本提供了一个补充图和两个补充表。001716 © 2023 作者
摘要。– 目的:金黄色葡萄球菌引起的中毒性休克综合征 (TSS) 是一种罕见但可能致命的疾病,治疗选择有限。抗生素耐药菌株的出现迫切需要开发有效的治疗方法。本研究旨在通过使用色酮作为先导化合物靶向致病毒素蛋白来识别和优化针对中毒性休克综合征的潜在候选药物。材料和方法:在本研究中,筛选了 20 种色酮以确定它们与目标蛋白的结合能力。通过添加环庚烷和酰胺基团进一步优化最佳化合物,并使用化学吸收、分布、代谢、排泄和毒性 (ADMET) 分析评估所得化合物的类药特性。结果:在筛选的化合物中,7-葡萄糖氧基-5-羟基-2-[2-(4-羟基苯基)乙基]色酮表现出最高的结合亲和力,分子量为341.40 g/mol,结合能为-10.0 kcal/mol。优化后的化合物表现出良好的类药物特性,包括高水溶性、合成可及性、皮肤渗透性、生物利用度和胃肠道吸收。结论:这项研究表明,色酮可以进行工程改造,以开发有效的药物来对抗金黄色葡萄球菌引起的中毒性休克综合征。优化后的化合物有可能成为治疗中毒性休克综合征的一种有前途的治疗剂,为患有这种危及生命的中毒性休克综合征的患者带来新的希望。