显性遗传的脊髓小脑性共济失调 (SCA) 与从纯小脑到多系统的各种表型有关。过去 5 年中,涉及的基因列表不断增加,包括 SCA37/ DAB1 、SCA45/ FAT2 、SCA46/ PLD3 、SCA47/ PUM1 、SCA48/ STUB1 、SCA50/ NPTX1 、SCA25/ PNPT1 、SCA49/ SAM9DL 和 SCA27B/ FGF14 。在某些患者中,多种潜在致病变异同时出现可解释不同的外显率或更严重的表型。鉴于这种极端的临床和遗传异质性,基因组测序应成为首选的诊断工具,但在许多临床环境中仍无法使用。在第 2 阶段和第 3 阶段研究中测试的治疗方法,例如利鲁唑和小脑和脊髓的经颅直流电刺激,得出了相互矛盾的结果。为了能够进行早期干预,应使用生物标志物(例如神经丝轻链和脑 MRI)评估致病变异的共济失调前携带者;鉴于临床结果在共济失调前阶段没有用处,这些生物标志物也可用作结果测量。开发测量突变蛋白(例如,ataxin-3)浓度的生物测定法可能有助于监测基因疗法的靶标参与。
染色体是生物体的遗传信息的载体,可以分为两种主要类型:同种异体体和常染色体。同种体,也称为性染色体,在性别决定和调节与性别相关的特征中起着至关重要的作用。尽管多样性相当多,但它们具有标准特征和基因含量和配对系统的差异。了解性染色体对于农业和疾病控制工作至关重要,在这种工作中,利用性别特异性特征的遗传方法表现出希望。但是,识别同种异体,尤其是在非模型生物中,带来了挑战。在这里,我们探索了监督的机器学习模型的使用,包括逻辑回归,随机森林,支持向量机和K-Nearest邻居,将基于全基因组测序数据基于全基因组测序数据的常染色体或同体分类。评估了覆盖,杂合性和GC含量等特征的预测能力。结果强调了特征组合和模型选择以进行准确分类的重要性。
一名 4 个月大的女婴,最近 2 周出现呼吸窘迫和口服摄入量减少,SpO2 为 84%。开始静脉注射抗生素氨苄西林+氯唑西林和头孢噻肟,并给予补充氧气,使 SpO2 改善至 97%。全血细胞计数显示白细胞计数升高,胸部 X 线摄影显示 RTI 降低。免疫缺陷检查正常。MTB Gene Xpert 和真菌菌丝均为阴性。胸部 HRCT 显示右上叶前段和后段以及双侧下叶上段和基底段呈斑块状亚段/胸膜下肺不张改变。患者的基因研究测试已送往德国。第 21 天,血氧饱和度开始下降。第 38 天,基因研究报告提到 ABCA3 基因中存在纯合的可能致病变异,导致诊断为常染色体隐性 SMDP3。孩子于第45天死亡。
摘要 背景 微染色体维持 (MCM) 复合物成分 2、4、5 和 6 与人类疾病有关,其表型包括小头畸形和智力障碍。MCM 复合物具有 DNA 解旋酶活性,因此对复制叉的起始和延长很重要,并在增殖的神经干细胞中高度表达。 方法 应用全外显子组测序来确定指数家族神经发育疾病的遗传原因。通过定量实时 PCR、原位杂交和免疫染色来表征 Mcm7 的表达模式。为了证明已鉴定的 MCM7 的致病性质,进行了原理验证实验。结果我们报告称,MCM7 中的纯合错义变异 c.793G>A/p.A265T(g.7:99695841C>T,NM_005916.4)与常染色体隐性原发性小头畸形 (MCPH)、严重智力障碍和行为异常有关,该病与三名受影响个体的近亲家系有关。我们发现小鼠中 Mcm7 的时空表达模式与增殖状态一致:Mcm7 在小鼠早期发育阶段和大脑增殖区表达较高。因此,与分化的神经元相比,Mcm7/MCM7 水平在未分化的小鼠胚胎干细胞和人类诱导多能干细胞中尤其可检测到。我们进一步证明,小鼠神经母细胞瘤细胞中 Mcm7 的下调会降低细胞活力和增殖,并且作为概念验证,野生型而非突变型 MCM7 的过度表达可以抵消这种影响。结论我们报告了 MCM7 突变是常染色体隐性 MCPH 和智力障碍的新原因,并强调了 MCM7 在神经系统发育中的重要作用。
淀粉样蛋白β沉积是散发性阿尔茨海默氏病和常染色体主导的阿尔茨海默氏病的标志性病变之一,后者是由淀粉样蛋白β处理中涉及的基因突变引起的。尽管淀粉样蛋白β沉积是散发性阿尔茨海默氏病和常染色体主导的阿尔茨海默氏病的核心,但这些阿尔茨海默氏病亚型的某些差异在与淀粉样ambeta的空间模式方面存在观察到。Previous work has shown that the spatial pattern of amyloid-beta in individuals spanning the sporadic Alzheimer ' s disease spectrum can be reproduced with high ac- curacy using an epidemic spreading model which simulates the diffusion of amyloid-beta across neuronal connections and is constrained by individual rates of amyloid-beta production and clearance.然而,尚未研究是否可以以相同的方式对稀有的常染色体式阿尔茨海默氏病中的淀粉样蛋白-Beta沉积进行建模,如果是这样,如果是这样,淀粉样蛋白贝塔(Alzheimer)的淀粉样蛋白β的传播模式多么一致。我们利用流行病扩散模型作为数据驱动的方法,用于探测淀粉样蛋白β的传播模式在三个不同的大型成像数据集中的淀粉样蛋白β传播模式(2种散发性阿尔茨海默氏病,1个常染色体典型的阿尔茨海默氏病)。我们分别评估了每个数据集中的个体和个体内模型性能,并进一步识别了淀粉样蛋白β扩散的最可能受试者特异性的表述。我们将流行病扩散模型分别应用于阿尔茨海默氏病神经影像学计划(n = 737),开放式成像研究系列(n = 510)和主要遗传的阿尔茨海默氏症网络(n = 249),其中后两个使用相同的管道处理。使用在零星阿尔茨海默氏病的先前作品中定义的epcentres,流行病扩散模型对所有三个数据集中的淀粉样蛋白β沉积的区域模式进行了适度的预测。我们进一步发现,虽然大多数淀粉样蛋白β的最有可能的中心 - 积极对象与默认模式网络重叠,但常染色体占主导地位的13%
超过四个囊肿),有或不少于三个肾囊肿,不包括感染性病因(2)。ADPLD的发生率为1/100,000(1)。一些PCLD患者(23.7-59.4%)患有并发症,例如腹痛,食管反流,呼吸困难和门户高血压(3-5)。ADPLD中囊肿的数量和体积通常高于ADPKD(3)中的囊肿。Sequencing efforts in the last two decades have revealed mutations in at least seven genes that are associated with a high risk of ADPLD, including PRKCSH (in approximately 20% of cases) (6,7), SEC63 (~15%) (8), GANAB (~2%) (9), SEC61B (~1%) (9), ALG8 (~3%) (9), LRP5 (10), and PKHD1(9),强调ADPLD的遗传异质性。尽管如此,所有ADPLD病例中只有不到50%在这些基因中的任何一个中都有突变。ADPLD是否存在新的遗传因素仍有待确定。
1 美国密歇根州大急流城 Spectrum Health 医学遗传学部 49503;2 美国密歇根州大急流城密歇根州立大学人类医学院儿科与人类发育系 49503;3 美国缅因州巴尔港杰克逊实验室 04609;4 美国密歇根州大急流城范安德尔研究所细胞生物学系 49503;5 美国密歇根州大急流城达文波特大学科学系 49512;6 美国密歇根州卡拉马祖布朗森卫理公会医院新生儿重症监护室 49007;7 美国密歇根州东兰辛密歇根州立大学遗传学与基因组科学项目 48824;8 美国密歇根州大急流城 Spectrum Health 研究办公室 49503; 9 美国加利福尼亚州圣地亚哥市雷迪儿童基因组医学研究所,92123;10 美国密歇根州立大学药理学和毒理学系,密歇根州东兰辛市 48824
案例报告社会福利与康复科学大学遗传学诊所的证据。概率具有HL的广泛家族史(图1),伴随着没有其他表型表现。获得知情同意后,从参与成员中收集全血样本,并提取基因组DNA(图1)。受影响的家庭成员接受了临床重新评估,以排除潜在的HL综合症综合症形式。对受影响的个体进行了纯音调测定法,并显示出轻度的倾斜到严重的HL。HL被描述为语言和进步。个体III.3在低频中显示出更严重的HL,并且可能随着年龄的增长而代表低频的某些进展。最初,概率进行了GJB2测试,该测试没有发现因果突变。随后,概率进行了外部测序(ES)以确定遗传原因
利益冲突Langella博士得到了阿尔茨海默氏症协会(AA研究奖学金)的赠款的支持。Vila-Castelar博士得到了阿尔茨海默氏症协会(AA研究奖学金)的赠款的支持。Quiroz博士得到了美国国家老化研究所(R01 AG054671,RF1AG077627),阿尔茨海默氏症协会和马萨诸塞州总医院ECOR的资助。Quiroz博士报告报告了Biogen的咨询费用。Dr. Hansson is by the Swedish Research Council (2016–00906), the Knut and Alice Wallenberg foundation (2017–0383), the Marianne and Marcus Wallenberg foundation (2015.0125), the Strategic Research Area MultiPark (Multidisciplinary Research in Parkinson's disease) at Lund University, the Swedish Alzheimer Foundation (AF-939932), the瑞典大脑基金会(FO2021-0293),瑞典帕金森基金会(1280/20),Konung Gustaf v:Skåne大学医院基金会(2020-O000028)的Skåne大学医院基金会(2020-O000028),forskningstforskningsstöd(2020-020-020-3314) (2018-Projekt0279)。福克斯·富勒先生得到了美国国家老化研究所(1F31AG062158-01A1)的奖学金的支持。Dage博士是Eli Lilly的专利或专利申请的发明者,以及与这项工作中使用的物质的测定,方法,试剂,试剂和 /或组成有关的公司。Dage博士曾担任Karuna Therapeutics的顾问,并获得了ADX Neurosciences,Roche Diagnostics和Eli Lilly and Company的研究支持。Ramirez-Gomez博士报告了阿尔茨海默氏症协会和NIH/NIA的赠款。drs。Zetterberg博士是一名Wallenberg学者,得到了瑞典研究委员会(#2018-02532)的赠款,欧洲研究委员会(#681712和#101053962),临床研究国家支持,#ALFGBG-71320(#ALFGBG-71320),Alzheimer Drugsive Foundation(Alzheimer Defuction Foundation)(#2010)(#)(#)。广告战略基金和阿尔茨海默氏症协会(#ADSF-21–831376-C,#ADSF-21–831381-C和#ADSF-21–831377-C),Olav Thon Foundation,Erling-Persson Family Foundation,StiftelsenFörgamlaTjänarinnor,hjärnor,Hjärnfornfornefe (#fo2019–0228),欧盟的地平线2020年研究与创新计划,玛丽·斯克洛多夫斯卡·弗兰斯·弗兰斯协定协议第860197号(Miriade),欧盟联合联合计划 - 神经退行性疾病疾病研究(JPND2021-00694)(JPND2021-00694),以及UK Dementia dementia Research Instute Instute Institute Institute Institute at ucl(Ucli-ucli-ucli-ucli-ucli-dri-1003)。SU博士报告了NIH/NIBIB,阿尔茨海默氏症协会,Brightfocus Foundation,NIH/NIA,亚利桑那州的NIH/NIA,在提交工作之外的Green Valley Pharmaceutical LLC的个人费用。Lopera博士得到了匿名基金会和科学,技术与创新行政部门的支持(Colciencias Colombia; 111565741185)。Reiman和Lopera是阿尔茨海默氏症预防计划(API)常染色体显性广告试验的主要研究人员,该试验得到了NIA,慈善事业,Genentech和Roche的支持。Reiman博士报告了美国国家老化研究所(R01 AG031581,P30 AG19610),汉纳阿尔茨海默氏症基金会和Nomis基金会的赠款。作者报告没有进一步的潜在利益冲突。Blennow博士得到了瑞典研究委员会(#2017–00915),阿尔茨海默氏症药物发现基金会(ADDF),美国(#RDAPB-201809-2016615)瑞典(#FO2017–0243和#ALZ2022–0006),瑞典政府与瑞典政府与县议会之间协议下的瑞典国家,ALF-gremement(#ALFGBG-715986和#ALFGBG-715986和#ALFGGBG-965240)美国卫生研究院(NIH)(授予1R01AG068398-01)和阿尔茨海默氏症协会2021 Zenith奖(ZEN-21-848495)。报告说,他是Roche Diagnostics的科学顾问(仅旅行费用),MAGQ,AVID放射性药物,并且是Alzpath的共同创始人。此外,他是颁发给Banner Health的专利的发明者,该专利涉及在高危人士中使用生物标志物终点,以加快对阿尔茨海默氏病预防疗法的评估,并且不在提交的工作之外。Blennow博士曾担任ABCAM,Axon Neuroscience,Biioentic,Biogen,Biogen,Lilly,Lilly,Magqu,Novartis,Roche Diagnostics的顾问或咨询委员会,并且是Gothenburg大学的GU Venture Platfort Company的Gothenburg AB的Brain Biomarker Solutions的联合创始人。
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