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危险因素和长期预后，用于共同感染无结核分枝杆菌肺疾病和慢性肺曲霉菌病：日本的多中心观察性研究
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在上流厌氧反应器中的降解细菌群落的变化1,3-丙二醇生产
摘要研究了带有硅胶支持的上流厌氧反应器中细菌群落的演变，该反应堆不断地用纯甘油（第0-293天）和粗甘油（第294-362天）喂食。来自以前甘油降解反应堆的生物量用作接种物。用粗甘油获得了1,3-丙二醇（PDO）（PDO）（PDO）（PDO）（0.62 mol.mol-gly-Gly-1和14.7 G.l -1 .d -1）。接种物的多样性较低，乳酸杆菌（70.6％）和克雷伯氏菌/劳尔特拉（23.3％）的优势占主导地位。在用纯甘油喂养293天后，在附着的生物膜或生物量中生长的悬浮液中，两个分类单元的丰度均下降到小于10％。梭子座属和雷诺罗卡科家族的成员随后成为多数。在用粗甘油进食后的时期，梭状芽胞杆菌仍然是生物膜中的多数属。然而，它在悬浮液中部分替换为非甘油降解细菌的Eubacterium。这一事实以及生物膜中其他甘油降解属的流行率，例如磷酸胶产物和乳酸杆菌，表明附着在硅酮支撑上的细菌负责将甘油转化为1,3-PDO。因此，为了提高1,3-PDO的生产率，一种良好的方法是最大化反应堆支撑量。其他不降解甘油的属，例如厌氧菌和乙美环，以牺牲细胞衰减材料为代价。规范对应分析表明，甘油的起源是生物反应器操作期间要考虑的重要变量，用于产生1,3-PDO，而甘油加载速率却不是。
植物化学分析和抗菌活性的redaudiana bertoni叶提取物针对链球菌（D
abiopuretm基因组DNA方案用于从细菌生长中提取DNA。使用定量荧光计设备测量DNA样品的浓度（20 ng/μl）。宏company提供了冻干状态的引物：S。sanguis-f 5`-ggatagtggctcagggcagccagccagt t-3`，S。sanguis-r 5`-gaacagttgctgctgcttgcttgcttgtgtgtc- 3`为获得储备溶液，通过将冻干的引物分散在300μL无核酸酶的水中，可以实现100 pmol/µl的浓度。通过将10μl的储备底漆与90μl无核酸酶的水混合，制备了浓度为10 pmol/μl的溶液。按照制造商的说明，通过将10μL的主混合与1μl的前向引物，奖励底漆，6μl无核酸酶的无核酸酶水和2μL样品DNA混合，从而产生20μL的最终溶液。
无抗分枝杆菌肺疾病是由分枝杆菌复合物引起的：开发治疗药物
I.引言本指南的目的是协助赞助商进行药物2的临床开发，以治疗由分枝杆菌（MAC）引起的非结核分枝杆菌肺疾病（NTM-PD）。具体来说，本指南涉及食品药物管理局（FDA）关于临床试验设计问题，试验人群的选择以及治疗幼稚和难治性NTM-PD的当前思维。在FDA公共研讨会上讨论了新药治疗NTM-PD的临床试验的设计。3本指南不包含对统计分析或临床试验设计的一般问题的讨论。这些主题在国际统一委员会（ICH）行业E9临床试验统计原理（1998年9月），E9（R1）临床试验的统计原理：附录：附录：临床试验中的估计和敏感性分析（2021年5月2021日），以及对照组和相关问题的临床试验中（5月2001年）（2001年5月2001年）。4此外，该指南并未解决旨在治疗由MAC以外病原体引起的NTM-PD患者的药物，因为这些患者的临床特征可能与MAC引起的NTM-PD患者不同。赞助商对
通过基于 DNA 的监测发现波罗的海地区独特的细菌和原生浮游生物多样性动态
沿海水域的浮游微生物构成了食物网和生物地球化学循环的基础。波罗的海地区具有明显的环境梯度，是典型的沿海环境。然而，迄今为止，对这些环境梯度的微生物多样性评估既缺乏分类范围，也缺乏空间和时间尺度的整合。在这里，我们使用 DNA 宏条形码分析了 398 个样本的原生生物和细菌多样性，这些样本与波罗的海和卡特加特海峡-斯卡格拉克海峡的国家监测同步。我们发现，与其他环境因素不同，盐度对细菌群落组成的影响大于对原生生物群落组成的影响。同样，贝叶斯模型表明，在较低（<9 PSU）和较高（>15 PSU）的咸水盐度中，细菌谱系出现的可能性都小于原生生物。尽管如此，原生生物的 α 多样性还是随着盐度的增加而增加。细菌 α 多样性的变化主要是季节性的，与冬季通过垂直混合引入深水生物群有关。我们认为原生生物在生态上对盐度不太敏感，因为区室化使它们能够将基本代谢过程与细胞膜分离。此外，细菌进一步和更频繁地扩散可能会阻碍局部适应。最终，基于 DNA 的环境监测扩展了我们对微生物多样性模式和潜在因素的理解。40
DNA 修复功能对于细菌应激防御至关重要，但长期治疗后，抗生素耐受亚群对环丙沙星和庆大霉素敏感
。CC-BY 4.0 国际许可证永久有效。它以预印本形式提供（未经同行评审认证），作者/资助者已授予 bioRxiv 许可，可以在该版本中显示预印本。版权所有者于 2025 年 2 月 4 日发布了此版本。；https://doi.org/10.1101/2025.02.03.636342 doi：bioRxiv 预印本
机器学习方法可以防止治疗后抗性细菌复发
hal是一个多学科的开放访问档案，用于存款和传播科学研究文件，无论它们是否已发表。这些文件可能来自法国或国外的教学和研究机构，也可能来自公共或私人研究中心。
uro PATHOGENS：细菌剂的患病率和肯尼亚基苏木县HIV孕妇的尿路感染的抗菌易感性概况
结果：总共包括168位HIV阳性孕妇，其中32.1％（54/168）显示出UTI症状。就怀孕的年龄而言，三个月为34.5％（58/168），在Trime II中为47.6％（80/168），最后是三个月的17.9％（30/168）。约有61.3％（103/168）的参与者是城市居民。从29例（53.7％）临床确认的UTI患者和9.7％（11）非临床确认的患者中分离出细菌。最常见的细菌是大肠杆菌，其占25％（10/40），其中84.4％在革兰氏阴性基组中对四环素具有抗性，而50％（4/8）金黄色葡萄球菌具有抗性，而75％的分离株对革兰氏蛋白易感组敏感。总体而言，22.5％（9/40）细菌分离株对至少一种抗微生物剂具有抗性，而62.5％（25/40）的分离株对≥2种抗微生物剂具有抗性。
深度学习驱动的细菌细胞学分析以确定结核分枝杆菌的抗菌机制
结核病 (TB) 是由结核分枝杆菌引起的，仍然是全球健康的重大威胁，估计 2022 年将影响 1060 万人。耐多药和广泛耐药菌株的出现迫使人们开发新型有效药物。加快确定这些药物的作用机制 (MOA) 对于推进结核病治疗至关重要。本研究介绍了 MycoBCP，这是针对结核分枝杆菌量身定制的独特细菌细胞学分析 (BCP)，利用 BCP 中的卷积神经网络 (CNN) 来克服传统图像分析技术带来的挑战。使用 MycoBCP，我们分析了各种抗菌化合物对结核分枝杆菌的形态学影响，捕捉广泛的模式而不是依赖精确的细胞分割。这种方法避免了结核分枝杆菌中普遍存在的细胞聚集和染色不均匀等问题。在盲测中，MycoBCP 准确识别了 96% 化合物的作用机理，只有一次错误分类，即利福布汀，它被错误地归类为影响翻译而不是转录。转录和翻译抑制产生的相似形态表明需要进一步改进以更有效地区分它们。将 MycoBCP 应用于一系列抗结核药物，成功识别了已知的作用机理并揭示了独特的作用，证明了其在早期药物发现和开发中的实用性。我们的研究结果强调了基于 CNN 的 BCP 在提高作用机理测定的准确性和效率方面的潜力，特别是对于结核分枝杆菌等具有挑战性的病原体。MycoBCP 代表了结核病药物开发的重大进步，为高通量筛选抗菌化合物提供了一种强大且适应性强的方法。
Chapada的Araripe的Araripe的药用掌基的固定油：化学成分和抗菌潜力
这项研究旨在分析从Aculeata，Syagrus Cearensis和Attalea Speciosa果实中提取的固定油的化学成分，此外还评估了它们在打击抗性微生物（例如Escherichia coli and Escherichia coli and Chapherococcus aureus）中的功效。成熟的果实是在巴巴哈，卡拉（Ceara）区域收集的，并通过气相色谱法和质谱法（GC/MS）分析提取的油，以鉴定存在的化合物。使用96孔板中的微稀释法测试了抗菌活性，评估了不同浓度的油脂抑制细菌生长。对Aculeata，Attalea Speciosa和Syagrus cearensis的固定油的色谱分析显示，饱和脂肪酸的占主导地位，lauric Acid是最丰富的（41.71％至47.21％）。油酸和肉豆蔻酸也很重要，而硬脂酸和亚油酸的含量较小。Attalea Speciosa显示出40.17％对大肠杆菌的抑制作用，40.77％对金黄色葡萄球菌（1000μg/ml）的抑制作用。accocomia aculeata抑制了金黄色葡萄球菌的44.76％（1000μg/ml），而塞格鲁斯·塞拉西斯（Syagrus cearensis）对大肠杆菌具有中等活性。