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利用计算机方法鉴定有效的天然肽脱甲酰酶抑制剂以对抗抗生素耐药性
简介抗生素耐药性是现代社会面临的一项重大全球健康挑战 [1,2]，其主要原因是多重耐药 (MDR) 细菌（通常称为“超级细菌”）的出现、传播和持续存在。这些超级细菌是导致对常规治疗干预具有耐药性的感染的罪魁祸首。人类和动物健康中广泛且不加区分地使用抗生素，再加上抗生素研究缺乏创新（新型抗生素的引入减少就是明证），这是导致抗生素耐药性发展和传播的重要因素 [3]。我们必须加快努力，不仅要制定政策遏制抗生素的不当和不合理使用，还要着力开发能够有效对抗细菌感染的新型化学实体 [4]。肽脱甲酰酶 (PDf) 是一种金属酶，它通过将蛋氨酸上的末端 N 残基转化为甲酰基部分来调节蛋白质成熟 [5,6]，作为开发新型抗菌剂的靶标具有巨大的潜力（图 1）。最初人们认为 PDf 只存在于细菌中，而且缺乏针对性药物，因此它被视为开发新型抗菌剂的希望之光 [7-9]。尽管在真核生物中已经鉴定和表征了功能性 PDf 同源物，包括人类的线粒体异构体 [10-14]，这对将该酶明确指定为相关的抗生素靶点提出了挑战，但酶学和结构研究表明，原核细胞和细胞器细胞之间 PDf 配体结合位点存在显著差异 [15-17]，证实了该酶作为引人注目的相关治疗靶点的地位。
通过编辑 OsSWEET14 启动子提高越南主要优良水稻品种 TBR225 的白叶枯病抗性
TBR225 是越南北部最受欢迎的商业水稻品种之一。然而，该品种极易感染细菌性叶枯病 (BLB)，这是一种由水稻白叶枯病 (Xoo) 引起的疾病，会导致严重的产量损失。OsSWEET14 属于编码糖转运蛋白的 SWEET 基因家族。与其他 Clade III 成员一起，它表现为易感性 (S) 基因，该基因由亚洲 Xoo 转录激活因子样效应物 (TALE) 诱导对于疾病是绝对必要的。在本研究中，我们试图在 TBR225 优良品种中引入 BLB 抗性。首先，两种越南 Xoo 菌株被证明在 TBR225 感染后会上调 OsSWEET14。为了研究这种诱导是否与疾病易感性有关，利用 CRISPR/Cas9 编辑系统获得了九个 TBR225 突变体系，这些突变发生在 OsS-WEET14 启动子的 AvrXa7、PthXo3 或 TalF TALEs DNA 靶序列中。T 0 和 T 1 个体的基因分型分析表明，突变是稳定遗传的。三个无转基因 T2 编辑系的所检查农艺性状与野生型 TBR225 的性状均无显著差异。重要的是，其中一个 T 2 系含有最大的纯合 6 bp 缺失，显示 OsSWEET14 表达降低，对越南 Xoo 菌株的易感性显著降低，对另一个菌株完全抗性。我们的研究结果表明，CRISPR/Cas9 编辑赋予了越南商业精英水稻品种更高的 BLB 抗性。
原位产生的细菌脂质对沉积脂质组的实质性贡献
摘要：沉积脂质池由无数个单个成分组成。由于它们对有机碳固换的重要性及其在古气候和地球生物学重建中的应用，因此已经研究了数十年来的构图，但仍缺乏对其组成的总体看法。在某种程度上，这种不确定性与沉积物脂质的不同来源有关，它们都可以通过沉积物从上覆的水柱中传递，但也可以由沉积物居住的生物在原地中产生。另一种不确定性与脂质组之间的保存程度不同，并且相对于其他有机物。在这里，我们使用高分辨率质谱法对黑海中的沉积脂多组进行了不靶向的分析。除了发现了浮游植物衍生的化石脂质外，还发现了一套多种多样的鞘脂，占沉积性脂质体的约20％。这些鞘脂是由沉积性厌氧菌在原位产生的，厌氧菌可能使用鞘脂代替磷脂，这可能是由于缺氧沉积物中磷酸盐的缺乏。我们的结果表明，尽管浮游植物衍生的脂质贡献了50-60％的沉积脂肪组，但可能会忽略了细菌脂质的重要性，尤其是原位产生的鞘脂。
耐多药的革兰氏阴性细菌感染
多药革兰氏阴性细菌感染在全球范围内引起明显的发病率和死亡率。这些病原体很容易获得抗菌耐药性（AMR），进一步强调了它们的临床意义。第三代耐甲状腺孢菌素和耐碳苯甲状腺菌（例如，大肠杆菌和克雷伯斯氏菌SPP），抗多药的铜绿假单胞菌，铜绿假单胞菌，以及耐碳酸苯甲酸杆菌的抗碳酸盐症，并已识别为识别的问题，并且已经识别出了问题。在响应中，已经开发了几种旨在快速检测AMR的新诊断技术，包括生化，分子，基因组和蛋白质组学技术。过去十年还看到了多种抗生素的许可，这些抗生素改变了这些具有挑战性的感染的治疗景观。
分枝杆菌NDH-2的结构结合到2-Mercapto- ...
新西兰奥塔哥大学。4。澳大利亚昆士兰州技术大学生物医学科学学院。5。加拿大多伦多大学医学生物物理学系。摘要分枝杆菌II型NADH脱氢酶（NDH-2）是一个有前途的药物靶标，因为它在结核分枝杆菌和其他病原体中的能量代谢中具有核心作用，并且因为缺乏已知的哺乳动物同种同源物。然而，缺乏有关酶如何结合抑制剂的结构信息，使铅化合物具有挑战性。我们使用电子冷冻显微镜（Cryo-EM）来确定来自Smegmatis分枝杆菌的NDH-2的结构，Smegmatis是单独的结核分枝杆菌呼吸的快速增长的非疾病模型，无论是单独的还是与2- cercapto-quinazolinone抑制剂的复杂性。该结构表明，活性分枝杆菌NDH-2是二聚体的，其二聚化界面通过其他细菌属在NDH-2中未发现的延长的C末端A螺旋稳定。二聚体中单体的排列与其他原核NDH-2二聚体所描述的排列不同，而不是由NDH-2在真核生物中形成的二聚体。在甲氨酸酮结合部位中2-羟基硝基唑酮的密度密度表明，抑制剂通过与黄素腺嘌呤二核苷酸辅助因子直接相互作用来阻止甲喹酮的降低。 这些结果揭示了NDH-2的结构元素，可用于设计分枝杆菌酶的特定抑制剂。密度表明，抑制剂通过与黄素腺嘌呤二核苷酸辅助因子直接相互作用来阻止甲喹酮的降低。这些结果揭示了NDH-2的结构元素，可用于设计分枝杆菌酶的特定抑制剂。
重金属暴露与细菌性阴道病之间的关联：一项横断面研究
1广东省主要产科疾病临床实验室医学系，广东省级临床研究中心妇产科和妇科临床研究中心，广州第三附属医院，广州医学院，广州，临床医学系，临床医学系，临床医学系，临床医学系，北部医学院。中国广州广州医科大学，南广州，临床医学系4，临床医学系，中国广州广州医科大学临床医学院第三学院，5广州临床快速诊断和预警临床快速诊断和预警的临床关键实验室广东省主要产科疾病的主要省级实验室，广东省临床研究中心，广东 - 香港大湾大湾地区高湾地区高等教育联合实验室，母亲医学，第三次分支机构医院
异基因干细胞移植后多重耐药菌定植患者的抗生素降阶梯策略
多重耐药 (MDR) 细菌的定植和相关的血流感染 (BSI) 与血液系统恶性肿瘤患者在强化化疗和异基因干细胞移植 (allo-SCT) 后的高死亡率相关。在这项回顾性研究中，我们分析了异基因 SCT 前定植 MDR 细菌（主要是耐卡巴培南肺炎克雷伯菌，KPC）的患者的预后。我们还研究了在这些患者中采用抗菌降阶梯疗法的可行性和安全性。自 2021 年以来，我们科室已有 106 名患者接受异基因 SCT，其中 34 名（32%）在异基因 SCT 前被 MDR 细菌定植。在植入前期间，84% 的患者接受了针对 MDR 细菌的经验性抗生素疗法 (EAT)，16% 的患者接受了常规 EAT 治疗。 MDR 易位率为零，总的降阶梯治疗率为 79%，其中不明原因发热 (FUO) 患者降阶梯治疗率为 75%。在异基因 SCT 前直肠拭子检测结果为 MDR 阳性的患者队列（n = 18）中，降阶梯治疗率为 100%。整个 MDR 患者群体的 30 天和 100 天全因死亡率分别为 6% (2/34) 和 12% (4/34)。第 +30 天感染相关死亡率为 3%。在本研究中，我们确认了异基因 SCT 后对既往有 MDR 感染的患者采用降阶梯治疗方法的安全性。这可以减少 EAT 抗生素的暴露时间，从而降低选择压力。
BGC地图集：探索细菌基因组中编码的全球化学多样性的网络资源
1天然产品的转化基因组挖掘，培养基和感染医学研究所Tübingen（IMIT）（IMIT），研究学研究所生物医学信息学研究所（IBMI），Tübingen，Auf der Morgenstelle 28，72076Tübingen2 28，72076Tübingendenoker -Nord nord sworkity flative forkitizan of Denok nove nord swiment fin Plads，220，2800 Kongens Lyngby，丹麦3计算生物学，国家农业食品生物技术研究所（NABI），S.A.S.德国6生物信息学中心Saar和Saarland大学，Saarland信息学校园，E2 1，66123Saarbrücken，德国7分子生命科学系和瑞士生物信息学研究所和苏黎世大学，苏黎世大学，苏黎世大学，Winterthurerstrasse，190年Drovendaalsesteeg 1 Radix West，6708pb Wageningen，荷兰9德国感染研究中心（DZIF），合作伙伴Tübingen，Auf der Morgenstelle 28，72076Tübingen，德国，德国
引用：Tan，P。Y.，Kato，Y。和Konishi，M。（2024）一种新型的蓝细菌生长细菌的菌株，Rhodococcus sp
为了增强蓝细菌的生长元有关弹性菌的生长，本研究使用共培养进行了直接筛查氰基细菌生长细菌（CGPB）的直接筛查。分离出四个新型CGPB菌株并在系统发育上鉴定出来：Rhodococcus sp。AF2108，Ancylobacter sp。 GA1226，Xanthobacter sp。 af2111和Shewanella sp。 OR151。 与最有效的CGPB菌株Rhodococcus sp。 af2108，在单一培养物中，蓝细菌细胞的叶绿素含量增加了8.5倍。 流式细胞仪分析显示，与犀牛Sp的共培养中，弹性链球菌细胞的数量增加了3.9倍。 AF2108。 这些结果归因于正向散射和叶绿素荧光强度的增加。 新的犀牛菌株似乎是迄今为止描述的最有效的CGPB之一。AF2108，Ancylobacter sp。GA1226，Xanthobacter sp。 af2111和Shewanella sp。 OR151。 与最有效的CGPB菌株Rhodococcus sp。 af2108，在单一培养物中，蓝细菌细胞的叶绿素含量增加了8.5倍。 流式细胞仪分析显示，与犀牛Sp的共培养中，弹性链球菌细胞的数量增加了3.9倍。 AF2108。 这些结果归因于正向散射和叶绿素荧光强度的增加。 新的犀牛菌株似乎是迄今为止描述的最有效的CGPB之一。GA1226，Xanthobacter sp。af2111和Shewanella sp。OR151。 与最有效的CGPB菌株Rhodococcus sp。 af2108，在单一培养物中，蓝细菌细胞的叶绿素含量增加了8.5倍。 流式细胞仪分析显示，与犀牛Sp的共培养中，弹性链球菌细胞的数量增加了3.9倍。 AF2108。 这些结果归因于正向散射和叶绿素荧光强度的增加。 新的犀牛菌株似乎是迄今为止描述的最有效的CGPB之一。OR151。与最有效的CGPB菌株Rhodococcus sp。af2108，在单一培养物中，蓝细菌细胞的叶绿素含量增加了8.5倍。流式细胞仪分析显示，与犀牛Sp的共培养中，弹性链球菌细胞的数量增加了3.9倍。AF2108。 这些结果归因于正向散射和叶绿素荧光强度的增加。 新的犀牛菌株似乎是迄今为止描述的最有效的CGPB之一。AF2108。这些结果归因于正向散射和叶绿素荧光强度的增加。新的犀牛菌株似乎是迄今为止描述的最有效的CGPB之一。
a verplats论文报告了对抗菌纺织品进行大规模测试的结果
abtract论文报告了对具有极其稳定和持久氧化铜涂层的抗菌纺织品进行大规模测试的结果。使用磁盘扩散方法，ICP-OE和特定的Lux生物传感器，表明涂层不会将铜离子浸入环境中。根据ISO 20743方案进行的实验室实验实验实验表明，产生的涂层的抗菌活性很高，以完全抑制某些菌株的生长抑制作用。 在气候测试站“ HOA LAC”（越南河内城）的热带气候下，长期领域测试是在热带气候下进行的。 与对照样本相比，纺织品材料上的微生物数量保持在1-3％的范围内（12个月）。 k eywords气候测试，复合材料，金属氧化物纳米颗粒，超声气蚀，抗菌活性，场测试。 在俄罗斯科学院的库尔纳科夫一般和无机化学研究所的国家分配中，在国家分配中进行了有关获得材料的纺织涂层和物理化学特征的工作。 在国家研究中心“基尔加托夫研究所”的国家分配的框架内，在纺织材料的抗菌活性的体外表征工作。 cKnowledements这项研究是使用JRC PMR IGIC RAS的设备进行的。 使用FRCCP RAS的核心研究设施进行了 SEM测量（编号 506694）。 在热带气候下涂有铜的棉布织物的长时间抗菌作用。实验实验表明，产生的涂层的抗菌活性很高，以完全抑制某些菌株的生长抑制作用。在气候测试站“ HOA LAC”（越南河内城）的热带气候下，长期领域测试是在热带气候下进行的。与对照样本相比，纺织品材料上的微生物数量保持在1-3％的范围内（12个月）。k eywords气候测试，复合材料，金属氧化物纳米颗粒，超声气蚀，抗菌活性，场测试。在俄罗斯科学院的库尔纳科夫一般和无机化学研究所的国家分配中，在国家分配中进行了有关获得材料的纺织涂层和物理化学特征的工作。在国家研究中心“基尔加托夫研究所”的国家分配的框架内，在纺织材料的抗菌活性的体外表征工作。cKnowledements这项研究是使用JRC PMR IGIC RAS的设备进行的。SEM测量（编号506694）。在热带气候下涂有铜的棉布织物的长时间抗菌作用。使用了2020 - 2024年俄罗斯 - 越南热带研究与技术中心的研究和技术研究计划的设施进行了领域测试（Ecolan T-1.13）。f或引文Veselova V.O.，Kostrov A.N.，Plyuta V.A.，Kamler A.V.，Nikonov R.V.，Melkina O.E.纳米系统：物理。化学。数学。，2024，15（6），910–920。