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细菌基因组组件的指数增加以及研究细菌寿命的全部多样性的越来越重要,导致人们对功能基因组方法的关注越来越大。通过将基因组规模的遗传扰动与高通量表型测定法结合起来,功能基因组学系统地定义了基因 - 表型关系,从而可以对未知功能的基因进行功能推断。存在用于扰动基因功能的几种高吞吐量方法,包括基于转座的方法,例如TN-SEQ和TRADIS,敲除收集和CRISPR方法。这些方法具有独特的优势和劣势,并且通常以互补的方式部署。然而,我们对CRISPR的理解,DNA合成成本的降低以及新的CRISPR模式的进步导致CRISPR广泛采用了整个细菌领域的功能基因组学研究。

基因功能的细菌CRISPR筛选

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