粪便菌群是胃肠道中发现的复杂而多样的细菌群落,对人类的幸福感至关重要。这种微生物包括真菌,细菌,病毒和古细菌,支持许多必不可少的功能,包括作为免疫系统调节,维生素合成和消化。粪便菌群与各种疾病有关,对于维持健康至关重要。生物信息学和测序技术的进步使其对其组成,多样性和功能有了更大的了解。fircITITES和杀菌剂构成了肠道菌群中的大部分细菌,其肌动杆菌,蛋白质细菌,verrucomicrobia和fusobacteria构成了丰度。这些细菌种群受年龄,饮食,遗传学,抗生素使用和环境的影响;较高的多样性通常与改善健康有关。短链脂肪酸(SCFA)是在乳脂杆和梭状芽胞杆菌,消化食品纤维等公司时产生的。SCFA对肠道健康至关重要。prevotella和其他细菌植物家族的成员对于复杂碳水化合物的分解至关重要。类似于双歧杆菌,肌动杆菌对肠道健康有益,尤其是在幼儿中。尽管它们不那么普遍,但蛋白质细菌包括沙门氏菌和大肠杆菌等危险物种,而verrucomicrobia(最值得注意的是,akkkermansia粘膜粘膜)可以维持健康的肠道衬里并具有抗炎质量。益生元和益生菌有能力通过重新建立微生物平衡来改善健康结果。肠道菌群是几种治疗干预措施的靶标,包括抗生素管理,粪便菌群移植(FMT),益生菌和益生元。肠道微生物群可以通过新颖的疗法(例如靶向微生物组的下一代益生菌,合成生物学和药物)来精确改变。肠道微生物脑链接,微生物组 - 脑轴以及微生物在癌症治疗中的作用将是未来研究的重点。针对微生物群的药物的有效性将通过考虑个体微生物模式的个性化药物方法来提高。关键字:粪便菌群,肠道菌群,微生物群 - 健康相互作用,短链脂肪酸(SCFA),粪便菌群移植(FMT),微生物群靶向的疗法。
肠道微生物组成是动态的,直接受多种因素影响,其中饮食是最重要的因素之一。11,12 从分类学上讲,肠道细菌分为门、纲、目、科、属和种。图 1 显示了肠道中六大最主要的细菌门,其中芽孢杆菌门和拟杆菌门(以前称为厚壁菌门和拟杆菌门)占健康人肠道微生物的 90%。13,14 斯坦福大学等人对 CKD 患者肠道微生物组成差异进行了系统评价。15 与健康对照组相比,CKD 患者的普氏菌科和 Roseburia 属的相对丰度较低,而肠杆菌科、链球菌科和肠球菌属的潜在致病菌数量明显较高。 15 由于样本量较小,关于血液透析 (HD) 和腹膜透析 (PD) 患者微生物群差异的研究报告有限。尽管如此,他们还是报告了
摘要:Shaoxing大米葡萄酒是中国米酒的著名典范。它的优质质量与土著自然环境密切相关。结果表明,富公司(75%),肌动杆菌(15%),蛋白质杆菌(5%)和杆菌植物(3%)构成了普遍的细菌组。在主要细菌属中,乳酸杆菌是最丰富的,占49.4%,其次是乳酸菌(11.9%),糖精孢子虫(13.1%),白肿瘤(4.1%)和热乳房(1.1%)。主要的真菌门是Ascomycota和zygomycota。在主要的属中,葡萄糖(59.3%)占据了最丰富的占主导地位,其次是saccharomycopsis(10.7%),曲霉菌(7.1%),温疗(6.2%),根瘤菌(4.9%),梯形(4.9%),梯形(2.2%)和妈妈(1.3%)。发现细菌和真菌群落的结构在环境中保持稳定,其多样性受到气候条件的强烈影响。环境因素(例如温度,气压,湿度,降雨和光线)的连续波动显着影响微生物种群的组成和多样性,尤其是主要的细菌群落。
摘要:将分子分析和培养依赖性分离均组合在一起,以研究硫酸盐还原原核生物的多样性,并探索它们在全尺度厌氧消化体(Marrakech,Morocco)中的作用。在全球尺度上,使用16S rRNA基因测序,蛋白质细菌,杆菌植物,坚果,肌动杆菌,协同效应和euryarchaeota是最主要的门。古细菌的丰度(3.1–5.7%)与温度有关。MCRA基因范围为2.18×10 5到1.47×10 7基因拷贝。含有硫酸盐的总序列的5%的硫酸盐还原性的原核生物是peptococaccaceae,syntrophaceae,desulfobulbaceae,desulfobulbaceae,desulfobulbaceae,desulfovibrionaceaceae,syntrophobacteraceae,symtrophobacteraceae,desulfrophobacteraceae,desulfurellelaceae,desulfurellaceae,desulfobaceae。此外,DSRB基因的范围为2.18×10 5到1.92×10 7基因拷贝。结果表明,在厌氧消化过程中,对硫酸盐还原细菌的多样性和功能的探索可能在减少硫酸盐产量(一种不可能的副产品)中起关键作用。
海洋异养原核物主要使用转运蛋白占据环境底物。靶向特定底物的转移者的模式塑造了异养原核生物在海洋有机循环中的生态作用。在这里,我们报告了由于分类学变化而导致的原核生物转运蛋白表达的大小分级模式,这是由针对ATP结合盒(ABC)转运蛋白和TONB依赖性转运蛋白(TBDTS)的多种“ OMICS”方法揭示的。底物特异性分析表明,海洋SAR11,杜鹃花和大洋螺旋藻使用ABC转运蛋白在自由生活的部分中使用有机氮,而替代词,细菌植物和sphingomonadales和sphingomonadales在碳纤维上使用TBDTS上的有机含量和含碳纤维有机物。转运蛋白的表达还支持深海原核生物的不同生活方式。我们的结果表明,有机物中的转运蛋白差异反映了原核生物介导的有机物循环中明显的小众分离。
心血管疾病(CVD),包括冠状动脉疾病,中风,心力衰竭和高血压,是全球主要的死亡原因,占全球死亡人数的30%以上。尽管已经了解了CVD的危险因素,并且已经建立了各种治疗方法和预防措施,但由于生活方式的变化以及现代一代的预期增加,CVD的死亡率和CVD的财务负担预计会随着时间的推移而成倍增长。宏基因组学和代谢组学分析的最新进展已确定肠道微生物组及其相关代谢物是CVD的潜在危险因素,这表明有可能开发针对CVD的更有效的新型治疗策略。此外,越来越多的证据表明,企业与细菌植物的比率发生了变化以及微生物依赖性代谢产物的失衡,包括短链脂肪酸和三甲胺N氧化物,在CVD的病原体中起着至关重要的作用。然而,到目前为止,确切的作用机理仍未确定。在这篇综述中,我们关注肠道微生物组的组成变化和
摘要:背景:肠易激综合征(IBS)是影响患者生活方式的常见疾病。它与肠道微生物组组成的显着变化有关,但是潜在的微生物机制仍有待完全了解。我们研究了便秘的IBS(IBS-C)和混合型IBS(IBS-M)患者的粪便微生物组。方法:我们在离子Torrent PGM测序平台上对16S rRNA的V3区进行了测序,以研究微生物组。结果:与健康组相比,在IBS-C和IBS-M患者中,发现α多样性的增加,并且还指出了β多样性的差异。在门水平上,两种IBS亚型均显示出企业/杀菌素比的增加,并且肌动杆菌和verrucomicrobobiota的丰度增加。Changes in some types of bacteria were characteristic of only one of the IBS subtypes, while no statistically significant differences in the composition of the microbiome were detected between IBS-C and IBS- M. Conclusions: This study was the first to demonstrate the association of Turicibacter sanguinis , Mitsuokella jalaludinii , Erysipelotrichaceae UCG-003 ,塞内加马群岛厌氧菌,Corynebacterium jeikeium,Bacteroides Faecichinchillae,Leuconostoc carnosum和parabacteroides Merdae具有IBS亚型。
大多数口腔生物都参与共识,这意味着宿主和细菌彼此之间的生物学受益[5]。共生人群不会通过不允许粘膜粘附来对病原物种造成伤害并保持对病原体的检查。细菌只有在破坏了共生障碍后才会成为致病性,从而引起感染和疾病[6]。但是,在这种无害的植物群中,有一些危险的细菌可以传播疾病[5]。即使是通常的良性生物,在存在免疫功能低下的状态下也会变得侵略性,并引起各种问题,例如炎症,退化,癌症或临时疾病[5]。富公司,蛋白质细菌,杆菌,肌动杆菌和梭菌是与口腔肿瘤有关的最普遍和许多类似的门[5-7]。链球菌物种是在健康人中发现的最普遍的口腔细菌,而厌氧prevotella,veillonella,neisseria和haemophilus较不常见。放疗前,口腔癌患者的葡萄球菌物种显着丰富,而白色念珠菌,克雷伯氏菌种类和pediocococcus物种是放疗后从癌症患者中分离出的重要病原体[5-7]。
微生物组或微生物群对于调节哺乳动物的许多生理过程至关重要,包括生殖。与其他器官或组织一样,女性上生殖道曾被认为缺乏微生物;然而,在人类和其他哺乳动物的子宫中发现了一个与感染无关的细菌群落,其组成与生殖成功有关。子宫内膜微生物群失调与良性和恶性子宫疾病有关。因此,本综述讨论了目前关于子宫微生物群改变的知识及其与常见子宫内膜疾病的关系,包括子宫内膜息肉、子宫内膜异位症、子宫肌瘤病、子宫内膜增生和子宫内膜癌。在分析最多的子宫疾病中,子宫内膜中有一个特定的细菌群落。然而,与健康的子宫内膜相比,持续发现的结果是厚壁菌门和乳酸杆菌的丰度减少,而变形菌(如大肠杆菌和肠球菌)、拟杆菌(例如普氏菌)和放线菌(如加德纳菌)的丰度增加。此外,我们还讨论了子宫内膜微生物群成分作为诊断子宫疾病的生物标志物的未来用途及其可能的临床结果。此外,我们还分析了它们作为益生菌的潜在用途,因为它们可以为现有的疗法提供替代方案或补充。生殖 (2022) 163 R81–R96
人类微生物群与宿主免疫相互作用,导致与过敏和哮喘相关的免疫功能障碍。1特别是,许多研究表明,肠道菌群在特应性皮炎的病理生理学(AD)中起重要作用。在AD患者和健康对照组之间的比较分析中,前组显示肠道中双歧杆菌的水平降低。此外,在AD严重程度和双歧杆菌百分比之间确定了反相关。2低肠道菌群多样性(p = 0.004),尤其是细菌门类细菌类细菌的多样性(p = 0.02)和细菌属(p = 0.01),年龄在1个月大时与AD显着相关。3与对照组相比,AD的亚组显示出与宿主免疫发育相关的功能较低,并且这一发现与粘蛋白降解细菌的定殖(Akkkermansia粘液菌,ruminocococcus gnavus gnavus和lachnospiracterium 2_1_1_1_1_58faa)有关。4 6个月大的粪便样品表明,链球菌的比例明显更高,并且在2岁时的AD婴儿中,梭状芽胞杆菌的比例明显降低。5总体而言,AD的发育和持久性与肠道微生物组的改变有关,并且这种作用可能是通过免疫,代谢和神经内分泌途径介导的肠道皮肤轴。6,7