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粘蛋白 - 微生物组相互作用在牲畜呼吸道疾病中的预测能力
抽象复杂的呼吸道疾病是全球牲畜行业的重大挑战。这些疾病极大地影响了动物健康和福利，并造成严重的经济损失。病原体防御的第一线结合了呼吸道粘液，一种主要由粘蛋白组成的高度粘性物质以及繁荣的多象胸部微生物生态系统。微生物组 - 麦氨基蛋白相互作用可保护不需要的物质和生物体，但其功能障碍可能会引起致病性感染和呼吸道疾病的发作。新兴的证据还表明，非编码调节RNA可能会调节微生物组粘膜关系的结构和功能。本意见论文在兽医感兴趣的动物的呼吸道感染背景下发掘了粘蛋白，微生物组和非编码RNA之间三角关系的当前理解。有必要查看这些分子基础，这些基础决定了独特的健康和疾病结果，以实施针对不同流行病学环境量身定制的有效预防，监视和及时的干预策略。
肿瘤内mycobiome如何调节肺...
在导致癌症发病机理和预后的无数因素中，微生物组已成为调节肿瘤发生和对治疗反应的关键参与者。尽管许多研究强调了细菌的作用，并在某种程度上强调了肿瘤进展中的病毒，但真菌或真菌组在这种复杂的景观中的影响仍然是一个很大程度上未知的领域。1尽管与细菌组相比其生物量较低，但对健康和疾病的影响不可否认。不仅真菌在人体内有重要的份额，而且它们也可以表现为机会性病原体，尤其是在具有免疫功能低下的免疫系统（例如癌症患者）的患者中。2值得注意的是，已在广泛的人类癌症中鉴定出了mycobiome。3然而，尽管有这些见解，但深入的研究询问了真菌微生物组和癌症之间的联系。4-6
开发微生物组生物库的要求
1 ryan M.J.*，2 Schloter，M.，3 Berg，G.，4 Kostic，T.，5 Kinkel，L.L.，6 Eversole，K.，7 Macklin，J.A. N.，R.S. 15 McClure，16 Charles，T.C.，17 De Souza，R.S.C.，Seghal 18。K.G.，3 Krug，H.L，3 Taffner，L.，12 Roume，H.，19 Selvin，J.，1 Smith，D.，3 Rybakova，D。K.G.，3 Krug，H.L，3 Taffner，L.，12 Roume，H.，19 Selvin，J.，1 Smith，D.，3 Rybakova，D。
深海：大型语言模型揭示了全球海洋微生物组的隐藏生物合成潜力
图2：在隐性BGC的验证数据集（n = 940）的验证数据集上的现有方法的比较。a，BGC的数量通过每种方法预测至少一个化学有效的结构，并以每种方法（成功率）的至少一个为每种BGC预测的化学有效结构的百分比（成功率）。b，每种方法预测的化学有效SM结构的数量，并用每种方法预测的独特结构的百分比（唯一性）。c，通过每种方法的预测SM结构的化学空间。d，通过每种方法的分子量的分子量分布。e，通过每种方法的综合可访问性（合成可访问性得分）的分布。f，通过每种方法对预测的SM结构的QED分布（药物的定量估计值）。源数据在源数据文件中提供。
急性呼吸衰竭和医院获得性肺炎的强大气道微生物组签名
Emmanuel Montassier，Georgios Kitsios，Josiah Radder，Quentin Le Bastard，Brendan Kelly等。急性呼吸衰竭和医院获得性肺炎中强大的气道微生物组特征。自然医学，2023，29（11），第2793-2804页。10.1038/S41591-023-02617-9。INSERM-04361358V2
在2003 - 2004年发表的非常引用的生物医学论文的出处和资金
此预印本版的版权持有人于2025年3月5日发布。 https://doi.org/10.1101/2025.03.02.25323201 doi：medrxiv preprint
可访问，可再现和协作生物医学分析的星系平台：2018 Update
星系（主页：https：//galaxyproject.org，主要公共服务器：https：//usegalaxy.org）是一个基于Web的科学分析平台，该平台由全球科学家的数十种科学家使用，全世界的科学家都在全球范围内进行了大型生物媒体数据集，例如在基因组学中分析的大型生物学数据集中，并且是基因组学，protolomics和potsoic of potsololomics and Impecol＆Metsoil of Impecol of Metsoil of Metimol of nevem of nevimol of。始于2005年，Galaxy继续专注于数据驱动的生物医学科学的三个主要挑战：所有研究人员都可以访问分析的分析，对分析的分析是完全可重现的，并且可以简单地进行分析，以便可以重复使用并扩展它们。在过去的两年中，Galaxy团队和Galaxy周围的开源社区已为Galaxy的核心框架，用户互间，工具和培训材料做出了实质性的证明。框架和用户界面改进现在使Galaxy可以用于分析数以万计的数据集，并且现在可以从Galaxy工具设置中获得> 5500个工具。Galaxy Community努力创建众多针对常见类型的基因组分析类型的高质量教程。Galaxy De-Veloper和用户社区继续增长，并且是Galaxy的开发不可或缺的一部分。星系公共服务器的数量，开发人员为
微生物组工程
厌氧消化（AD）是将富含碳的生物量（包括木质纤维素废物）转化为能量（富含甲烷的沼气）和增值产品（例如生物肥料）的最先进的技术。富含甲烷的沼气可以通过称为生物甲基化的过程进一步升级为天然气质量。木质纤维素降解。木质纤维素是植物生物量的主要结构成分，但是由于其顽固性，这种天然物质的很大一部分被浪费了。该小组的特征是来自生物质富裕栖息地的微生物群落，目的是进一步使其用于工业应用的木质纤维素分解能力。土壤微生物组。土壤微生物组重生主要是细菌，古细菌，病毒，真菌，生物和其他小真核生物，例如硅藻。土壤微生物通过分解土壤有机物并转化重要的养分来确定农业生态系统的生产率，从而在碳和养分循环中起关键作用。此外，尽管它们在粮食安全和气候变化中的重要性，但大多数土壤微生物在很大程度上都没有表征。废水处理和去除污染物，重点是生物学过程（例如有氧颗粒状污泥反应器）或通过吸附或膜操作去除顽固化合物。
古代人类口腔微生物组研究范围5000年的广泛考古牙科牙科数据集
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