临床前扰动筛选,其中在疾病模型上系统地测试了遗传,化学或环境扰动的影响,由于其规模和因果性质,对机器学习增强的药物发现具有巨大的希望。预测模型可以根据分子特征来推断以前未经测试的疾病模型的扰动反应。这些在计算机标签中可以扩展数据库并指导实验优先级。但是,对扰动特异性效应进行建模并在各种生物环境中产生健壮的预测性能仍然难以捉摸。我们介绍了LEAP(自动编码器和预测变量的分层集合),这是一个新颖的集合框架,可改善稳健性和概括。LEAP利用多个Damae(数据增强蒙版的自动编码器)表示和套索回归器。通过结合从不同随机初始化中学到的多种基因表达表示模型,在预测未见细胞系,组织和疾病模型中基因本质或药物反应方面始终胜过最先进的方法。值得注意的是,我们的结果表明,结合表示模型而不是仅预测模型会产生出色的预测性能。超出其性能增长,LEAP在计算上是有效的,需要最小的高参数调整,因此很容易将其纳入药物发现管道中,以优先考虑有希望的目标并支持生物标志物驱动的分层。这项工作中使用的代码和数据集可公开使用。
图3。km存活曲线(顶部面板)和多元Coxph森林图(底部面板)说明了POL/POLD 1的左侧的RWPF(左侧RWPF,右侧RWOS)的结果(RWOS),用免疫疗法(IO)治疗的患者(IO)以及与化学疗法和IO + IO + IO + IO + IO + IO + IO(IO)组合的结局(左侧),并与IO + IO + IO(IO)组合进行了突变(基因(其他)。在KM图中指定了随着时间的流逝的中位生存时间和处于危险中的患者人数。森林图具有多元COXPH模型的危险比(HR),所有协变量(POL/POLD1突变,TMB,MSI状态和指示)的置信间隔为95%,表明相对的进展或死亡风险。
溶酶体是参与各种生理和病理过程的细胞内消化细胞器,包括调节免疫检查点分子,肿瘤微环境中的免疫细胞功能,抗原呈递,代谢和自噬。溶酶体的异常或功能障碍与肿瘤的发生,发育和耐药性有关。溶酶体起着至关重要的作用,并且在肿瘤免疫疗法中具有潜在的应用。靶向溶酶体或利用其特性是肿瘤免疫疗法的有效策略。然而,目前尚不完全了解与肿瘤免疫疗法中与溶酶体有关的机制和方法,需要进一步的基础和临床研究来为癌症患者提供更好的治疗选择。本综述着重于与溶酶体和肿瘤免疫疗法有关的研究进度
纽约 - 食道癌1(NY-ESO-1)属于癌症抗原(CTA)家族,并被鉴定为家庭成员中最免疫原性肿瘤抗原(TAA)之一。鉴于其能够触发自发的体液和细胞免疫反应以及受限的表达,NY-ESO-1已成为癌症免疫疗法最有希望的靶标之一。癌症疫苗是癌症免疫疗法的重要元素,它通过主要的组织相容性复合物II(MHC-II)(MHC-II)和CD8 + T细胞通过主要的组织相容性I(MHC-I(MHC-I),通过主要的组织相容性复合物II(MHC-II)提出了TAA蛋白,肽和抗原性表位的外源性来源。这些机制进一步增强了对由细胞毒性T淋巴细胞(CTL)和辅助T细胞介导的TAA的免疫反应。ny-Eso-1的癌症疫苗有近二十年的历史,从2003年进行的第一次临床试验开始。目前针对NY-ESO-1的癌症疫苗具有多种类型,包括基于树突状细胞(DC)疫苗,肽疫苗,蛋白质疫苗,病毒疫苗,细菌疫苗,治疗性全肿瘤疫苗,全肿瘤细胞疫苗,DNA疫苗和MRNA疫苗,并促进了他们所在的效果,并构成了效率,并构成了这些疫苗。在这里,我们总结了针对NY-ESO-1进行固体癌症治疗的癌症疫苗的当前进展,旨在为将来的研究提供观点。
结果:最终分析中包括三个RCT(Keynote-671,Nadim II和Aeegean)。PIO group (neoadjuvant platinum-based chemotherapy plus perioperative immunotherapy) exhibited superior ef fi cacy in OS (hazard ratio [HR]: 0.63 [0.49-0.81]), EFS (HR: 0.61 [0.52, 0.72]), objective response rate (risk ratio [RR]: 2.21 [1.91, 2.54]), pathological complete response (RR:4.36 [3.04,6.25]),主要病理反应(RR:2.79 [2.25,3.46]),R0切除率(RR:1.13 [1.00,1.26])和辅助治疗速率(RR:1.08 [1.08 [1.01,1.15])与PP组(NeoAdjuvivant Plasity Plaser Plaser Plaser Planeboers plyoper plyoper plyoper plyoper)相比。在亚组分析中,EFS几乎在所有亚组中都倾向于PIO组。BMI(> 25),T阶段(IV),N阶段(N1-N2)和病理反应(具有病理完全反应)是PIO组的有利因素。在安全评估中,PIO组表现出更高的严重AE(28.96%比23.51%)和AES导致治疗中断(12.84%比5.81%)。同时,尽管总的不良事件,3-5级不良事件和致命的不良事件倾向于有利于PP组,但差异在统计学上并不显着。
蛋白质后翻译修饰(PTMS)代表细胞调节的关键方面,在蛋白质合成mRNA后发生。这些修饰包括磷酸化,泛素化,乙酰化,甲基化,糖基化,糖基化,sumoylation和棕榈酰化,在调节蛋白质功能中起关键作用。PTM会影响蛋白质的定位,稳定性和相互作用,从而响应内部和外部刺激来策划各种细胞过程。失调与一系列疾病,例如癌症,炎症性疾病和神经退行性疾病有关。ufmylation是一种PTMS,最近因其在众多细胞过程中的调节作用而获得了突出的,包括蛋白质稳定性,对细胞应激的反应以及关键信号通路影响细胞功能。本评论强调了ufmylation在肿瘤发展和发展中的关键功能,强调了其作为治疗靶标的潜力。此外,我们讨论了ufmyration在肿瘤发生和恶性进展中的关键作用,并探索其对癌症免疫疗法的影响。本文旨在详细概述ufmylation的生物学功能,并提出靶向ufmylation如何增强癌症免疫疗法策略的有效性。
癌症代谢是阐明肿瘤细胞与免疫细胞之间通信的关键因素。例如,在肿瘤细胞增殖过程中,糖酵解增加导致肿瘤细胞产生大量的L乳酸和TGF-β,从而通过促进肿瘤微环境中的调节性T细胞(TREG)的产生来阻止肿瘤免疫(1)。用2-脱氧葡萄糖(一种糖酵解的抑制剂)治疗可通过减少TREG产生来增强抗肿瘤免疫力。值得注意的是,抗PD-1治疗已被证明可以激活T细胞,同时还促进了肿瘤微环境中的糖酵解。在某些患者中,抗PD-1抗体治疗可能导致肿瘤微环境中Treg的增殖增加,从而限制免疫检查点抑制剂的有效性。Xuekai等。建议,抗PD-1和抗TGF-β疗法的结合可能会提供一种新的解决方案来克服对抗PD-1疗法的抗性。Wang等。 进一步阐明了肿瘤微环境中的TGF-beta如何有助于抵抗抗PD-1治疗。 例如,PD-1在食管癌细胞逃避的免疫中起着至关重要的作用,该细胞表达高水平的TGF-β。 食管癌细胞产生的 TGF-β在与肿瘤相关的巨噬细胞中诱导M2-型,从而减少了通过PD-1/PD-L1途径参与特定抗肿瘤反应的CD8+ T细胞的种群。 此外,TGF-beta间接通过激活肿瘤微环境中的Treg来促进免疫抑制。 )。 Shen等。Wang等。进一步阐明了肿瘤微环境中的TGF-beta如何有助于抵抗抗PD-1治疗。例如,PD-1在食管癌细胞逃避的免疫中起着至关重要的作用,该细胞表达高水平的TGF-β。TGF-β在与肿瘤相关的巨噬细胞中诱导M2-型,从而减少了通过PD-1/PD-L1途径参与特定抗肿瘤反应的CD8+ T细胞的种群。此外,TGF-beta间接通过激活肿瘤微环境中的Treg来促进免疫抑制。)。Shen等。此外,脂质过氧化显着影响肿瘤微环境的调节(Xiao等人。富含脂质的肿瘤微环境可以通过CD36(一种脂肪酸转运蛋白)的上调在肿瘤相关的巨噬细胞中诱导M2型表型。Treg也表达了CD36,使其非常适合富含脂质的环境。在雌激素受体阳性(ER+BR)乳腺癌患者的低风险生存群体和高危生存群体之间的免疫活性,脂质生物合成和药物代谢方面存在差异。分析表明,高危患者表达高水平的ALOX15,一种相关的基因
对妇科癌和宿主免疫力之间的复杂串扰进行了广泛的研究,揭示了对肿瘤发育的迷人见解。包括各种非肿瘤细胞和可溶性介体的肿瘤微环境(TME)在支持妇科癌症发展中起着关键作用(1,2)。在这些元素中,肿瘤 - 纤维化淋巴细胞(TILS)成为捍卫者,配备了识别和消除癌细胞。此外,TME包括与癌症相关的纤维细胞(CAF),内皮细胞,趋化因子,细胞因子,生长因子和抗体,共同调节癌症的启动,进步,甚至治疗反应(3-5)。癌细胞和其他TME成分释放了许多可以抑制或激活免疫细胞功能的免疫调节信号,从而有效地塑造了免疫反应(6-11)。因此,根据其组成,TME有可能将免疫系统从抗肿瘤模式转换为肿瘤状态(图1)。令人鼓舞的是,针对TME成分的治疗方法,包括髓样衍生的抑制细胞(MDSC),与肿瘤相关的巨噬细胞(TAM)和调节性T细胞(Tregs)(Tregs),并在临床前和临床研究中都表现出了令人鼓舞的抗肿瘤活性(12-18)。因此,探索TME的预测和治疗价值是推进妇科癌症治疗的明显希望。在这里,我们发表了一篇研究主题,介绍了六篇文章,重点介绍了针对妇科癌症的TME靶向治疗策略。Yu等人的评论。强调了血管生成在癌症免疫疗法的效率中的关键作用,特别是在卵巢癌的背景下。概述了血管生成,新血管的形成,不仅支持肿瘤的生长和转移,而且显着影响TME,从而影响了免疫疗法(例如免疫检查点抑制剂(ICIS))的成功。通过通过异常肿瘤脉管系统促进血液灌注不足,缺氧和免疫逃避,血管生成为有效的免疫疗法带来了艰巨的障碍。抗血管生成疗法被贝伐单抗等药物示例,其针对这些血管异常,不仅破坏了肿瘤血液供应,而且可以潜在地重塑TME,从而增强了抗肿瘤免疫力。临床和临床前研究表明
胰腺癌是一种高度侵略性的恶性肿瘤,近年来变得越来越普遍。尽管在包括手术,放射疗法,生物疗法和靶向治疗在内的强化治疗方式方面取得了进步,但胰腺癌患者的总生存率并没有明显改善。这可能归因于阴险的发作,未知的病理生理学和疾病预后不良。因此,必须识别和开发对胰腺癌的更有效和更安全的治疗方法。肿瘤免疫疗法是手术,放疗和化学疗法后的新的和第四个抗肿瘤疗法的支柱。近年来对各种恶性肿瘤的免疫疗法的使用取得了显着进步。在治疗胰腺癌方面,也取得了突破。本综述描述了免疫检查点抑制剂,癌症疫苗,收养细胞疗法,溶瘤病毒和基质止血疗法的进展,用于治疗胰腺癌。同时讨论了一些新的潜在生物标志物和胰腺癌的潜在免疫疗法组合。也已经阐明了各种免疫疗法的分子机制,并突出了它们的临床应用。还讨论了与免疫疗法和提议克服这些局限性有望的拟议策略相关的挑战,目的是为胰腺癌的免疫疗法提供新的见解。
摘要 化疗仍然是各种肿瘤的主要治疗方法,由于转移,化疗通常伴有不良预后。含有 CREKA 靶向部分的聚乙二醇化脂质体是众所周知的治疗剂,尤其是在高度转移的实验模型中。CREKA 专门针对存在于原发性和转移性肿瘤部位的肿瘤相关 ECM。为了更好地了解靶向部分的功能,我们决定设计各种脂质体配方,其中不同数量的靶向部分附着在其 DSPE-PEG 分子上。此外,设计了一种新的肿瘤归巢五肽 (SREKA),并设计了一种 SREKA 和 DSPE-PEG 之间的新型结合策略。首先,研究了载药脂质体的体外增殖抑制及其货物的细胞摄取。然后,测量了小鼠血液中的脂质体稳定性和不同组织中的药物积累。此外,还检查了不同脂质体制剂在体内的肿瘤生长和转移抑制效力。根据我们的比较研究,SREKA-脂质体在配制后具有统一的表型,并且具有与 CREKA-脂质体相似的特性和肿瘤归巢能力。然而,在结合过程中将 N 端半胱氨酸交换为丝氨酸可提高产量,并且在与 DSPE-PEG 结合时具有更好的稳定性。我们还表明,SREKA-脂质体对原发性肿瘤生长和转移发生率有显著的抑制作用;此外,还提高了荷瘤小鼠的存活率。此外,我们提供的证据表明,附着在 DSPE-PEG 上的靶向部分的数量在很大程度上决定了脂质体的稳定性,因此它在毒性和靶向性方面起着重要作用。