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肝脏衍生的细胞外囊泡：...
缩写h：人R：啮齿动物（鼠标或大鼠）DUC：差异离心，包括UC SST：血清饥饿UC-DEP：uc n/f：uc n/f：未发现（不可公开或未公开）AFM：AFM：AFM：ATOMIC MICROSC PACY BCA：BICICINCINCINCINCINCINIC DILLID：MOSSICAI LING SOCKINCINIC DLLEC：AFM：AFMICPOPY BCA：动态式：纳米颗粒跟踪分析TEM：透射电子显微镜QRT-PCR：定量实时聚合酶链反应
ProbeInterface：细胞外电生理学中探针处理的统一框架
使用穿透式细胞外多通道电极阵列（通常称为神经探针）记录神经元活动是探测神经元活动最广泛的方法之一。尽管有大量可用的细胞外探针设计，但尖峰分类软件要求的电极通道顺序和相对几何形状的映射这一耗时过程总是留给最终用户。因此，这个手动过程容易出现错误映射，进而导致不良的尖峰分类误差和效率低下。在这里，我们介绍了 ProbeInterface，这是一个开源项目，旨在通过消除在尖峰分类之前手动进行探针映射的步骤来统一神经探针元数据描述，以分析细胞外神经记录。ProbeInterface 首先是一个 Python API，使用户能够以任何所需的复杂度级别创建和可视化探针和探针组。其次，ProbeInterface 有助于以可重现的方式生成任何特定数据采集设置的全面接线描述，这通常涉及使用记录探头、探头、适配器和采集系统。第三，我们与探头制造商合作编译了一个可用探头的开放库，可以使用我们的 Python API 在运行时下载。最后，使用 ProbeInterface，我们定义了一种用于探头处理的文件格式，其中包含 FAIR 探头描述的所有必要信息，并且与神经科学中的其他开放标准兼容且互补。
揭示有益的肠道细菌和健康饮食的作用
肠道菌群与其宿主共同发展，深刻塑造了免疫系统的发育和功能。这种共同进化导致了动态关系，其中微生物代谢产物和分子信号影响免疫成熟，耐受性和防御机制，突出了其在维持宿主健康方面的重要作用。最近，细菌外囊泡（BEV），细菌产生的膜纳米颗粒已成为肠平衡和有效的免疫调节剂的重要参与者。这些囊泡反映了细菌膜的特征，并含有核酸，蛋白质，脂质和代谢物。他们可以调节免疫过程，并参与神经系统和代谢性疾病，因为它们在肠道中局部分布和系统地分布，从而影响两个级别的免疫反应。本综述提供了BEV的特征和功能性概述，详细介绍了营养如何影响这些囊泡的产生和功能，抗生素如何破坏或改变其组成以及这些因素如何集体影响免疫力和疾病的发展。It also highlights the potential of BEVs in the development of precision nutritional strategies through dietary modulation, such as incorporating prebiotic fi bers to enhance bene fi cial BEV production, reducing intake of processed foods that may promote harmful BEVs, and tailoring probiotic interventions to in fl uence speci fi c microbial communities and their vesicular outputs.
细胞串扰在糖尿病肾病进展中的作用
糖尿病性肾病（DN）是糖尿病最常见的并发症之一，其主要表现是进行性蛋白尿和肾功能异常，最终发展出终阶段肾病（ESRD）。DN的发病机理是复杂的，涉及许多信号通路和分子，包括代谢性疾病，遗传因素，氧化应激，炎症和微循环异常策略。随着医学实验技术的开发，例如单细胞转录组测序和单细胞蛋白质组学，肾细胞相互作用引起的病理改变吸引了越来越多的注意力。在这里，我们回顾了肾细胞之间串扰的特征和相关机制，在DN的发育和进展过程中，肾细胞足细胞，内皮细胞，膜细胞，周膜细胞，周细胞和免疫细胞的特征和相关机制，并突出了其潜在的治疗效应
巨噬细胞的细胞外囊泡作为慢性非传染病的新玩家
巨噬细胞是所有组织中存在的先天免疫细胞，并且在生物生物的生物学几乎所有方面都起着重要作用。细胞外囊泡（EV）由细胞释放，并将其含量（微RNA，mRNA，蛋白质和长期非编码RNA）运输到附近或远处的细胞中，以进行细胞间通信。许多研究表明，巨噬细胞衍生的细胞外囊泡（M-EV）及其含量在多种疾病中起着重要作用，并且作为生物标志物，治疗剂和药物输送措施的巨大潜力。本文回顾了M-EV的生物学功能和机制及其在慢性非传染性疾病中的含量，例如心血管疾病，代谢性疾病，癌症，炎症性疾病和骨相关疾病。此外，总结了M-EV作为各种疾病的药物输送系统的潜在应用。
肝细胞癌的治疗进展
肝细胞癌（HCC）仍然是全球与癌症相关死亡的主要原因。免疫疗法，靶向疗法和联合治疗的最新进展已显着改善许多HCC患者的结局。本评论总结了2024年ASCO年度会议的关键发现，重点是新兴疗法，包括免疫检查点抑制剂（ICIS），CAR-T细胞疗法，溶瘤病毒以及局部区域疗法，例如跨性别化学栓塞（TACE）和肝脏肠胃不接受化学疗法（Hapticalial Infife Infife Chemothy）。ICI，尤其是与其他药物结合在一起时，已经显示出有希望的效率，尽管仍然存在诸如免疫相关的不良事件和抵抗机制之类的挑战。CAR-T细胞疗法和溶瘤病毒为晚期HCC提供了新型的治疗途径，但是它们在实体瘤中的长期效率仍在研究中。局部疗法，尤其是与全身治疗的结合，在管理不可切除的HCC和提高外科切除率的转化率方面继续发挥关键作用。此外，正在探索生物标志物（例如缺氧评分和CTNNB1突变）的潜力，以更好地个性化治疗并预测患者反应。这些生物标志物可以为更有针对性和有效的治疗策略铺平道路。总体而言，最近在ASCO遇到的最新研究重点介绍了HCC治疗的进展，强调了持续创新的重要性。未来的研究应集中于克服抗药性机制，优化组合疗法以及整合生物标志物驱动的方法，以改善患者的结果并增强个性化治疗策略。
通过益生菌调节肠道菌群，以改善肝细胞癌的免疫疗法的效率
1 Key Laboratory of Arti fi cial Organs and Computational Medicine of Zhejiang Province, Shulan (Hangzhou) Hospital, Shulan International Medical College, Zhejiang Shuren University, Hangzhou, China, 2 State Key Laboratory for Diagnosis and Treatment of Infectious Diseases, First Af fi liated Hospital, School of Medicine, Zhejiang University, Hangzhou, China, 3 Shulan International Medical中国杭州钟湖大学学院，中国基础医学与癌症研究所（IBMC），中国康甘癌医院4号，中国科学院（IBMC），中国杭州，中国杭州，中国杭州，第5次感染疾病。中国杭州省舒兰国际医学院智省省的干预
通过机器学习和异质性细胞模型的高通量筛选鉴定针对胶质母细胞瘤的候选药物
3爱丁堡大学生物科学学院，Max Born Crescent，Edinburgh，EH9 3BF，英国。 *相应的作者：d.oyarzun@ed.ac.uk; n.carragher@ed.ac.uk摘要胶质母细胞瘤多形（GBM）是一种侵略性的原发性脑肿瘤，由于其复杂的病理和异质性，引起了重大治疗挑战。 缺乏经过验证的分子靶标是发现新的治疗候选者的主要障碍，在二十年中，没有向患者提供新的有效GBM疗法。 在这里，我们报告了针对GBM干细胞存活表型的化合物的鉴定。 我们的方法采用机器学习（ML）的预测指标的细胞存活率，这些细胞存活在高通量，基于图像的，基于图像的表型筛选数据中，用于3,561种化合物，以多个浓度，跨六个异质，患者衍生的GBM干细胞系进行多个浓度。 我们在计算上筛选了跨越各种化学类别的12,000多种化合物。 对GBM干细胞系中ML识别的候选物的实验验证，导致了三种化合物对GBM表型的活性。 值得注意的是，我们经过验证的HSP90抑制剂XL888之一，靶向消除所有六个GBM干细胞系，其IC50在纳莫尔范围内。 其他两种化合物在具有不同细胞系敏感性的多个GBM细胞系中展示了广泛的活动，为将来的个性化医学运动提供了途径。 患者的预后较差，治疗方案有限（通常是手术，然后进行化学放疗），导致抗药性的出现。3爱丁堡大学生物科学学院，Max Born Crescent，Edinburgh，EH9 3BF，英国。*相应的作者：d.oyarzun@ed.ac.uk; n.carragher@ed.ac.uk摘要胶质母细胞瘤多形（GBM）是一种侵略性的原发性脑肿瘤，由于其复杂的病理和异质性，引起了重大治疗挑战。缺乏经过验证的分子靶标是发现新的治疗候选者的主要障碍，在二十年中，没有向患者提供新的有效GBM疗法。在这里，我们报告了针对GBM干细胞存活表型的化合物的鉴定。我们的方法采用机器学习（ML）的预测指标的细胞存活率，这些细胞存活在高通量，基于图像的，基于图像的表型筛选数据中，用于3,561种化合物，以多个浓度，跨六个异质，患者衍生的GBM干细胞系进行多个浓度。我们在计算上筛选了跨越各种化学类别的12,000多种化合物。对GBM干细胞系中ML识别的候选物的实验验证，导致了三种化合物对GBM表型的活性。值得注意的是，我们经过验证的HSP90抑制剂XL888之一，靶向消除所有六个GBM干细胞系，其IC50在纳莫尔范围内。其他两种化合物在具有不同细胞系敏感性的多个GBM细胞系中展示了广泛的活动，为将来的个性化医学运动提供了途径。患者的预后较差，治疗方案有限（通常是手术，然后进行化学放疗），导致抗药性的出现。我们的工作证明了在与ML串联串联中使用表型筛选的使用可以有效地识别具有很少已知分子靶标的高度异质指示中个性化处理的治疗铅。关键字：胶质母细胞瘤，人工智能，药物发现，机器学习简介胶质母细胞瘤多形（GBM）是人类成年人中最常见和最具侵略性的原发性脑肿瘤，其特征是遗传驱动因素的实质异质性和肿瘤微环境1-3。在过去20年中，新诊断的GBM患者的护理标准包括手术，替莫唑胺（TMZ）和电离辐射（IR），延长了12个月至15个月患者的总体生存期4,5。大规模的基因组分析增强了我们对GBM分子生物学的理解，后者支持
社论：对细胞内细菌的先天免疫力
人类免疫系统与细胞内细菌之间的战斗是一种复杂而有趣的生存和破坏舞蹈。先天免疫力，是人体针对入侵微生物的第一条防御线，在这种冲突中起着关键作用。本社论探讨了对抗细胞内细菌的先天免疫的机制和策略，强调了免疫系统在维持人类健康中的关键作用。先天免疫是对传染剂的非特定，快速和有效的反应。它依赖于对微生物（称为病原体相关的分子模式（PAMP）的保守分子模式的识别（1）。这种认可触发了一系列旨在消除威胁的免疫反应。先天性免疫对细胞内细菌的关键策略之一是检测和消除感染细胞的能力。此过程涉及通过模式识别受体（PRR）在吞噬细胞（例如巨噬细胞和树突状细胞（Sankar和Mishra））表面检测PAMP。PRR识别细菌成分并启动信号级联，从而导致细胞因子和其他免疫介质产生。这些细胞因子然后募集并激活其他免疫细胞以消除受感染的细胞。另一个重要的策略是抗菌肽（Duarte-Mata和Salinas-Carmona）靶向和破坏细胞内细菌。这些由各种免疫细胞产生的肽具有破坏细胞膜或干扰必需细胞过程的能力。一些抗菌肽甚至充当信号分子以协调免疫反应（Duarte-Mata和Salinas-Carmona）。凋亡是一种最近发现的机制，其先天免疫与细胞内细菌作斗争。此过程的特征是感染宿主细胞的裂解和细胞内含量的释放，这使免疫系统警告感染的存在（2）。凋亡是通过caspase-1激活引发的，响应于PAMP或与损伤相关的分子模式（DAMP）。caspase-1激活导致加油蛋白D的寡聚化，该dasdermin d在细胞膜中形成毛孔，从而导致细胞裂解。细胞内细菌或其成分通过这些毛孔触发