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在Lynch综合征中识别出的罕见的MLH1重复
结果：在MMR基因中，在DHPLC基因变异筛选中鉴定了三个家族，该家族在MMR基因中具有致病性/可能的致病性种系变体。所有家庭在几代人的几个家庭成员中都有CRC的历史。肿瘤分析表明，与突变基因以及MSI相对应的MMR蛋白IHC染色的丢失。在MLH1中鉴定出a的a family A，一种结构变体，4至13的重复。预计重复将导致氨基酸520的框架和氨基酸539的过早终止密码子。在家庭B中，在MLH1中发现了1个碱基对缺失，从而在氨基酸491中产生移牌和终止密码子。在家庭C中，我们确定了MSH2中的一个剪接位点变体，该变体预计将导致剪接供体部位的损失。结论：我们在19个测序家族中的三个中，在MMR基因中完全确定了三种致病/可能的致病变异。基于洞察力和Clinvar数据库，MLH1变体是外显子4至13的复制和移码变体的新颖。 Clinvar的一个提交者报告了MSH2剪接网站变体。作为一种变体类别，在MMR基因文献中很少报道重复，尤其是涵盖多个外显子的文献。
Siminar_selmi的Lazardine -MRM
2013年，Selmi博士从Modena和Reggio Emilia大学获得了分子和再生医学博士学位，重点是表征癌细胞系中TIS11蛋白家族在转录后调控的致癌mRNA。 2014年，Selmi博士移居英国剑桥大学，加入Michaela Frye的实验室，并在RNA修改的（重新）新兴领域工作。 在那里，Selmi博士的团队制作了全转录组的单核苷酸分辨率，依赖NSUN6依赖性5-甲基环肽（M5C），并研究了M5C和腺苷脱氨酸对转录倍率失误和密码元对人胚胎干细胞中人类胚胎干细胞中的影响（Selmi，Hussain Nar Nar 202222222222222222222222222222222222222222222222222122221222222222222EMTRICT和CODON deamination; 2019年，Selmi博士加入了Horizon Discovery在英国剑桥的创新团队，参与开发模块化CRISPR基础编辑器进行精确基因组编辑（Collantes JC，The CRISPR Journal 2021）。 2021年初，Selmi博士加入了Consiglio Nazionale Delle Ricerche（CNR）的生物医学技术研究所。 在Selmi实验室中，研究重点介绍了两个主要领域：RNA修饰的研究及其对mRNA翻译的影响以及CRISPR基础编辑者的技术发展。 实验室结合了先进的基因组编辑和测序技术，以探索癌症和干细胞细胞模型中的新调节机制。2013年，Selmi博士从Modena和Reggio Emilia大学获得了分子和再生医学博士学位，重点是表征癌细胞系中TIS11蛋白家族在转录后调控的致癌mRNA。2014年，Selmi博士移居英国剑桥大学，加入Michaela Frye的实验室，并在RNA修改的（重新）新兴领域工作。 在那里，Selmi博士的团队制作了全转录组的单核苷酸分辨率，依赖NSUN6依赖性5-甲基环肽（M5C），并研究了M5C和腺苷脱氨酸对转录倍率失误和密码元对人胚胎干细胞中人类胚胎干细胞中的影响（Selmi，Hussain Nar Nar 202222222222222222222222222222222222222222222222222122221222222222222EMTRICT和CODON deamination; 2019年，Selmi博士加入了Horizon Discovery在英国剑桥的创新团队，参与开发模块化CRISPR基础编辑器进行精确基因组编辑（Collantes JC，The CRISPR Journal 2021）。 2021年初，Selmi博士加入了Consiglio Nazionale Delle Ricerche（CNR）的生物医学技术研究所。 在Selmi实验室中，研究重点介绍了两个主要领域：RNA修饰的研究及其对mRNA翻译的影响以及CRISPR基础编辑者的技术发展。 实验室结合了先进的基因组编辑和测序技术，以探索癌症和干细胞细胞模型中的新调节机制。2014年，Selmi博士移居英国剑桥大学，加入Michaela Frye的实验室，并在RNA修改的（重新）新兴领域工作。在那里，Selmi博士的团队制作了全转录组的单核苷酸分辨率，依赖NSUN6依赖性5-甲基环肽（M5C），并研究了M5C和腺苷脱氨酸对转录倍率失误和密码元对人胚胎干细胞中人类胚胎干细胞中的影响（Selmi，Hussain Nar Nar 202222222222222222222222222222222222222222222222222122221222222222222EMTRICT和CODON deamination;2019年，Selmi博士加入了Horizon Discovery在英国剑桥的创新团队，参与开发模块化CRISPR基础编辑器进行精确基因组编辑（Collantes JC，The CRISPR Journal 2021）。2021年初，Selmi博士加入了Consiglio Nazionale Delle Ricerche（CNR）的生物医学技术研究所。在Selmi实验室中，研究重点介绍了两个主要领域：RNA修饰的研究及其对mRNA翻译的影响以及CRISPR基础编辑者的技术发展。实验室结合了先进的基因组编辑和测序技术，以探索癌症和干细胞细胞模型中的新调节机制。
植物生物技术。37（3）：285-292（2020）
摘要细胞质男性不育（CMS）是一种特征，它会产生由线粒体和核基因之间相互作用引起的非功能性花粉。在中国武器（CW）型CMS，CWA，大米（Oryza sativa L.）中，其线粒体增强了核基因逆行调节的男性不育（RMS）的表达，从而导致花粉流产。生育能力在恢复器线中的表达降低时恢复。RMS的表达由位于RMS起始密码子上游的启动子区域的单核苷酸多态性（SNP）控制。然而，在该区域的反向链中预测了编码含有蛋白质的五肽重复域的另一个基因PPR2，并且SNP在CWR中创建了过早的终止密码子。证明RMS直接参与了CW-CMS的生育能力，我们使用CRISPR/CAS9将突变引入了RMS和PPR2。生育力。生育恢复。我们的结果表明，PPR2不负责生育能力的恢复，并且通过降低RMS的表达来恢复生育能力，从而为我们提供了一种新的人工生育修复剂，以供农艺使用。
一种新颖的统计方法预测了...的可变性
SARS-CoV-2 病毒已成为 21 世纪最大的流行病，感染人数达数亿，死亡人数达数千万人。世界各地的科学家都在竞相开发疫苗和新药，以战胜这场流行病并为 COVID-19 疾病提供有效的治疗方法。因此，迫切需要更好地了解 SARS-CoV-2 的发病机制如何受到病毒突变的影响，并确定病毒基因组中可作为新疗法稳定靶点的保守片段。在这里，我们介绍了一种文本挖掘方法，可直接从参考（祖先）全基因组序列估计基因组片段的可变性。该方法依赖于根据基因组片段在整个基因组中的空间分布和频率来计算其重要性。为了验证我们的方法，我们对近 80,000 个公开可用的 SARS-CoV-2 前身全基因组序列中的病毒突变进行了大规模分析，并表明这些结果与用于关键字检测的统计方法预测的片段高度相关。重要的是，这些相关性在密码子和基因水平以及基因编码区都成立。使用文本挖掘方法，我们进一步确定了可能成为基于 siRNA 的抗病毒药物候选者的密码子序列。值得注意的是，这项研究中确定的候选者之一对应于刺突糖蛋白表位的前七个密码子，这是唯一一种与人类蛋白质不匹配的 SARS-CoV-2 免疫原性肽。
利用 TadA 的下一代胞嘧啶碱基编辑器
• 脱氨酶的定向进化 • PAM 变体碱基编辑器 • 定向进化 Cas9 以创建用于 BE 的非 NGG PAM 变体 • 密码子、NLS 和接头优化 • 环状置换体和镶嵌碱基编辑器 • DNA 脱靶评估 • RNA 脱靶评估 • 旁观者编辑最小化 • 引导 RNA 工程 • 离体和体内 BE 递送 • 最小化脱靶活性的工程 BE • HSC、肝细胞和 T 细胞的离体碱基编辑 • ABE 的低温电子显微镜结构 • 小鼠体内碱基编辑 • 非人类灵长类动物体内编辑
利用 CRISPR 技术进行磷酸化无效突变，消除酿酒酵母动粒复合体蛋白 Stu1 上的磷酸化位点
染色体分离需要动粒蛋白复合物和有丝分裂纺锤体的协调，这对于两个子细胞之间的准确遗传分裂至关重要。动粒是一种位于姊妹染色单体着丝粒的蛋白复合物。在有丝分裂过程中，可以观察到动粒实际上是在有丝分裂纺锤体的引导下将姊妹染色单体“引导”到伸长细胞的相反极点。有人提出，动粒复合物中的小蛋白 Stu1 有助于延迟芽殖酵母酿酒酵母的后期，直到每条染色体都附着在有丝分裂纺锤体上。Stu1 与纺锤体相互作用，并在纺锤体伸长时与其同步移动。磷酸化可能在调节 Stu1 功能方面发挥重要作用。在酵母中，MELT 是一种常见的磷酸化位点，因此，去除 Stu1 上 MELT 基序上的苏氨酸氨基酸可能会影响姐妹染色单体正确分离的能力，从而导致酵母活力下降。MELT 是真菌中保存良好的序列，并且已知是 Stu1 其他同源物中的磷酸化位点。利用 CRISPR-Cas9 酶，我们将在芽殖酵母 STU1 基因中引入磷酸化无效突变，以将 MELT 序列中的苏氨酸 719 密码子替换为缬氨酸密码子。我们假设这种突变会导致 Stu1 蛋白发生故障，这可能会阻碍其协调纺锤体和着丝粒附着的能力，并进一步阻止有丝分裂期间染色体分离。
CRISPR/CAS9核糖核蛋白介导的HTERT-RPE1细胞中的敲除蛋白
图1。使用ssDNA或PCR产物作为HDR模板（a）上部的蛋白质标记的策略示例：据报道编码Centriolar远端附属物蛋白SCLT1的C-末端的基因组序列。带下划线的序列代表CrRNA识别位点，PAM序列为黄色，垂直虚线表示切割位点。鉴于距离内源性终止密码子（BOLD大写字母的TAA）距离为14 bp，插入位点被任意定位为距剪切位点1 bp的位置，即在SCLT1的密码子之间的最接近的交界处。在下部，密码子（上图）和相应的氨基酸性残基（下图）构成了插入物：蓝色大写字母是指可易加的链接器，然后是v5-tag（红色）和附加的外源终止密码子（黑色）。50 bp lha或rha = 50碱基对左同源臂或右同源臂。（b）使用PCR产物作为供体DNA生成具有荧光蛋白（FP）的蛋白质（您最喜欢的蛋白质，YFP）的C端标记的示意图。PCR模板由带有FP，2A元件和电阻盒（R）的标准质粒（左侧）组成。使用一对60mer引物进行PCR反应。在右侧代表了目标基因座（您最喜欢的基因，YFG）的编辑。
破译遗传密码：机制、进化和对生物技术的影响
遗传密码研究探索了生命的基本语言，旨在了解 DNA 如何协调蛋白质的合成。本研究探索了遗传密码的各个方面，从广泛使用的三联体密码子系统到转移 RNA (tRNA) 在翻译中的重要作用。本研究揭示了密码子和反密码子之间相互作用的复杂性以及核糖体的协调，阐明了蛋白质合成的起始、延长和终止阶段。此外，它还深入研究了影响翻译过程的调节因素和质量控制机制。在探索遗传密码的进化过程中，本研究仔细研究了它的普遍原则、例外情况以及围绕其起源的令人信服的猜想。tRNA 和密码子的共同进化，以及在不同生物体和细胞器中观察到的密码的适应性，提供了有价值的见解。值得注意的是，这项研究强调了基因工程、密码子优化和蛋白质设计等广泛的生物技术应用。这项研究不仅解决了遗传密码研究中的未知领域，还提出了未来的研究方向。它强调了该领域当前的挑战和机遇，包括密码扩展和基因编辑进步。最终，遗传密码研究仍然是一个充满活力、不断发展的领域，对科学、技术和我们对生命基本过程的理解具有深远的影响。这项研究揭示了遗传密码的迷人故事，揭示了继续吸引和启发人们的新领域和应用。
寡转移和寡进展性疾病的治疗：最新进展和前瞻性临床研究 - 结直肠癌和
所示细胞系用浓度逐渐增加的西妥昔单抗处理 4 天，并通过测量 ATP 含量来评估细胞活力。条形图代表西妥昔单抗对每种细胞系影响的任意指数，如方法中所述。对西妥昔单抗敏感的细胞系显示为负指数。红色条形图代表 KRAS 改变的细胞系；黄色条形图表示 NRAS 突变细胞；蓝色条形图表示影响 BRAF 密码子 V600 的基因改变；黑色条形图表示 RAS/BRAF 野生型细胞。NCIH630 细胞是 KRAS 扩增的46
1740750805.pdf
当Tra2β蛋白水平太高时，UCE会触发基因RNA中的额外外显子，引入了停止蛋白质合成的终止密码子，防止过度生产。突变破坏UCE的蛋白质限制功能会导致不育症，从而阻止遗传。因此，自然选择已在数百万年内保留了整个物种的UCE。超保存的元素：UCE是至少200个碱基对的脱氧核糖核酸（DNA）序列，它们在多种物种中一直保持不变，持续了8000万年或更长时间。