M. genitalium 是一种细胞内泌尿生殖道革兰氏阴性烧瓶状细菌,属于柔膜纲支原体科。它是最小的柔膜纲(直径 0.2 µm),缺乏编码细胞壁的基因,导致其寄生和腐生。M. genitalium 没有细胞壁,而是拥有一个三层膜,其中含有从环境中吸收的固醇。M. genitalium 使用 UGA 密码子而不是终止密码子来编码色氨酸。M. genitalium 代谢葡萄糖。这种内部病原体在含有胎牛血清的培养基中生长得更好。在 SP4 培养基中,M. genitalium 在 50 天后产生具有“煎蛋”外观的菌落。通过添加 0.25 mg/ml 环丙沙星以减少其他微生物的污染,生长速度加快至 14 天。
核糖体将核酸中编码的遗传信息转化为蛋白质。即使将氨基酸逐一组装在一起,这种解码过程也需要mRNA上的三核苷酸密码子与同源氨基酰基-TRNA的相应反密码子之间的watson-Crick相互作用。遗传密码是退化的,由于序列柔韧性主要在第三核苷酸的水平上,因此由一个或多个TRNA识别。1,2另一方面,核酸的合成是由聚合酶介导的,并通过在生长链上组装单个单字母核苷酸来进行进行。由于机制的差异,这些基本生物聚合物的合成涉及的错误率大大差异从非常低的DNA复制到更容易出错的DNA转录到mRNA中,以及将mRNA转换为蛋白质的较小的忠诚度(分别为〜10 -8,〜10 -5,〜10 -5,〜10 -5,〜10 -10 -4,误差率将mRNA转换为蛋白质。3,4
包含机密商业信息 尊敬的副局长 Juarez, CoverCress Inc. (CCI) 谨请求美国农业部动植物卫生检验局生物技术监管服务部 (BRS) 确认我们使用 CRISPR/Cas9 基因组编辑技术开发的基因组编辑菥蓂 (Thlaspi arvense) 植物品系的监管状态。CCI 正在开发可将菥蓂用作新型油籽作物的技术。菥蓂不在美国农业部联邦有害杂草名单上,在多个州被认定为作物。此请求描述了一种通过改变种子成分提高了产品质量的 CCI 产品。由此产生的植物将在 [ ] 基因中具有一个单一的基因修饰,该修饰通过过早的终止密码子导致基因功能丧失,这可以通过常规育种方法获得。
直到最近,尽管 KRAS 突变是最常见的致癌驱动因素之一,但其在实体瘤治疗中仍未得到满足。从历史上看,KRAS 突变很难靶向,这是因为其整体表面结构光滑,缺乏结合位点,尺寸小,且对 GTP/GDP 的亲和力极高。21、22 2013 年,Ostrem 等人首次发现了靶向 KRAS G12C 的潜力,他们发现结合变构口袋可以将 GDP 结合的 KRAS 锁定在其非活性状态。23 研究表明,RAS 蛋白第 12 或 13 个密码子的突变会损害 GTP 水解,使 RAS 处于 GTP 结合的活性状态。24 这导致了 sotorasib 的开发,这是同类中首批 KRASG12C 失活状态抑制剂之一,并最终促使 FDA 批准 sotorasib 用于治疗
与传统转化方式相比,包含预组装的Cas9蛋白和sgRNA的RNP复合物已在动物、植物、人类细胞和微藻等各种宿主中实现了高效的基因组编辑(DiNapoli等,2020;Xing等,2014;Kim等,2014;Liang等,2019)。由于不需要密码子优化或特定启动子,RNP递送可方便、快速地应用于不同物种。此外,由于Cas蛋白在细胞内被内源性蛋白酶降解,RNP可以减少脱靶效应和嵌合现象,对细胞的细胞毒性较小(Nomura等,2019)。同时,由于不存在外来DNA序列,基因编辑的动植物可以免受转基因监管(Kanchiswamy等,2015)。因此,
DNA 引导的 RNA 引导内切酶 (dRGEN) 是高效、经济且方便的基因组编辑实验工具。AccuTool™ dRGEN 可识别长度为 23 bp 并以两个鸟嘌呤 (GG) 结尾的目标序列。定制 sgRNA 表达质粒可与 Cas9 表达质粒(人类密码子优化,WT/Nickase/Sniper 形式可用)一起使用。质粒可以通过任何标准方法(如脂质转染、纳米颗粒或电穿孔)递送到您感兴趣的细胞中,以实现高效递送。sgRNA-GFP 表达质粒是通过将 GFP 构建体插入现有 sgRNA 质粒中构建的。sgRNA-GFP 表达质粒可让您通过荧光显微镜确认细胞中的活性水平。 AccuTool™ dRGEN 是一种定制设计的 sgRNA,以 sgRNA 表达质粒或 sgRNA-GFP 表达质粒的形式提供。应用
SLC16A2-G401R和基因敲除(KO)细胞系是通过转染重组Cas9蛋白和(G401 MUT)的合成GRNA或没有SSODN的HIPSC系列而产生的,从健康的供体(Bibhi001-b)中产生的HIPSC系。使用单个GRNA靶向外显子3生成了两种修饰(图1 A,表2)。SLC16A2-G401R Mu tation是通过使用SSODN模板通过同源性修复(HDR)引入的(图1 A,表2)。SSODN模板包括在AHDS患者中发现的突变:C.1201G> A,静音突变,以破坏PAM序列:C.1200C> T和4个无声突变,以破坏种子序列(C.1185C> T,C.1186C> A,C.1188C> A,C.1188C> A,C.1191C> a,C.1191c>1 a和f)。使用了相同的GRNA指南,并选择了带有框架移动的克隆,从而选择了过早的停止密码子。在两个报道的KO细胞系中(BIHI001-B-7和 - 8)
通过上游开放式阅读框(UORF)的翻译调节已成为控制从下游初级ORF(PORFS)1-5合成的蛋白质量的一般机制。我们发现,植物中内源性UORF的基因组编辑能够调节来自四个porfs的mRNA的翻译,这些porfs涉及发育或抗氧化生物合成。针对具有UORF启动密码子的区域的单个指定RNA可以产生多个突变。UORF编辑后,我们观察到四个porfs中的mRNA翻译数量不同。值得注意的是,编辑了LSGGP2的UORF,该UORF在生菜中编码了维生素C生物合成的关键酶,不仅增加了氧化应激耐受性,而且增加了抗坏血酸含量的含量约150%。这些数据表明,编辑植物UORFS提供了一种可推广,有效的方法来操纵mRNA的翻译,可用于剖析生物学机制并改善农作物。
突变是生物体基因组 DNA 序列的变化。这些改变可能是自然发生的,也可能是由于环境因素造成的,它们在进化和遗传多样性过程中起着至关重要的作用。本文探讨了突变的类型、原因和后果,以及它们在医学、农业和进化生物学等各个领域的意义。突变可以根据其性质和涉及的遗传物质的程度进行分类。这些涉及 DNA 序列中单个核苷酸碱基对的变化。点突变可以更进一步。一个碱基被另一个碱基取代。这可能导致沉默突变(蛋白质没有变化)、错义突变(产生不同的氨基酸)或无义突变(产生过早的终止密码子)。增加或丢失一个或多个核苷酸碱基对,如果它们发生在蛋白质编码区,则可能导致移码突变,通常导致无功能蛋白质 [1,2]。