XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search Systemcolorectal
单细胞和批量 RNA 测序综合分析揭示结直肠癌杯状凋亡相关基因的预后模型和肿瘤微环境重塑机制
背景：最近，人们对铜凋亡（一种由铜介导的程序性细胞死亡形式）产生了浓厚的兴趣。铜凋亡相关基因影响结直肠癌 (CRC) 发展的具体机制尚不清楚。方法：在这里，我们将批量 RNA 测序与 scRNA 测序相结合，以研究 CRG 在 CRC 中的功能。选择了 61 个铜凋亡相关基因进行进一步研究。通过 Lasso-Cox 确定了 9 个预后 CRG。创建了风险评分，并将患者分为两个不同的组，即低风险评分组和高风险评分组。使用 CIBERSORT、ESTIMATE、MCP-counter、TIDE 和 IPS 对 TME 进行评分，并使用 GSVA 和 GSEA 评估两组中的通路。此外，我们使用细胞通讯分析探索基于 scRNA 测序的 COX17 和 DLAT 的肿瘤微环境重塑机制。最后，我们使用 IHC 和 qPCR 来验证 COX17 和 DLAT 的表达。结果：AOC3、CCS、CDKN2A、COX11、COX17、COX19、DLD、DLAT 和 PDHB 被认为是 CRC 中的预后 CRG。高危组预后最差，免疫缺陷表型，并且对 ICB 治疗更具抵抗力。此外，scRNA-seq 分析显示 CD4-CXCL13Tfh 中 COX17 表达升高可能导致免疫逃避，而 DLAT 具有相反的作用，逆转 T 细胞耗竭并诱导细胞焦亡以促进 CD8-GZMKT 浸润。结论：本研究利用杯状凋亡相关基因开发了一个预后框架，该框架可有效预测 CRC 患者的预后、TME 类型和对免疫治疗的反应。此外，我们的研究揭示了一个新发现，即 CRC 中 CD4- CXCL13 T 细胞内 COX17 表达水平升高会介导 T 细胞耗竭和 Treg 浸润，而 DLAT 则被发现通过逆转 T 细胞耗竭和诱导细胞焦亡来促进抗肿瘤免疫激活。
提高分子测试的价值：结直肠癌精密医学的当前状态和机会
结直肠癌（CRC）是全球与癌症相关死亡的第二大原因1。进行辅助化疗的手术自由基切除仍然是CRC的主要治疗方法，但术后5年的生存率仅约60％，大约三分之一的CRC经验患者在手术后的2年内复发。幸运的是，高通量测序的转化加速了精密医学的发展。例如，KRAS突变表明CRC 3中对抗皮肤生长因子受体（EGFR）靶向的疗法的抗性。此外，分子引导的个性化疗法在主要的临床领域和挑战中带来了新的希望，例如，新型生物标志物可以预测对微卫星稳定（MSS）CRC的敏感性和抗性免疫疗法。因此，必须通过分子测试来改善CRC患者的分层并实现CRC的精确治疗，这是必不可少的。从这个角度来看，根据我们以前的研究和经验，我们讨论了CRC的分子测试引导和免疫学疗法的当前状态和未来方向。我们还简要概述了大型癌症中心进行分子测试的基本方面（图1）。
呋喹替尼联合信迪利单抗或 TAS-102 作为转移性结直肠癌患者的三线或以上治疗：一项真实世界临床试验
以抗程序性死亡受体 1（PD-1）为代表的免疫检查点抑制剂已被证明在治疗各种实体恶性肿瘤方面具有显著效果（1-4）。然而，抗 PD-1 在转移性结直肠癌中的作用通常仅限于微卫星不稳定性高（MSI-H）或错配修复缺陷（dMMR）的转移性结直肠癌患者，这类患者仅占转移性结直肠癌患者的 4.6%（5）。大多数转移性结直肠癌患者是微卫星稳定（MSS）或错配修复功能正常（pMMR），可能无法从免疫检查点抑制剂单药治疗中获益。目前，针对血管内皮生长因子（VEGF）或血管内皮生长因子受体（VEGFR）的生物制剂，包括贝伐单抗和瑞戈非尼，用于治疗转移性结直肠癌（6,7）。呋喹替尼是一种 VEGFR 阻断剂，可使肿瘤血管正常化，并与细胞毒药物和抗 PD-1 药物联合使用，产生协同抗肿瘤作用 (8,9)。呋喹替尼已获得中国食品药品监督管理局批准，用于治疗已接受过至少两种标准抗肿瘤疗法的转移性结直肠癌患者 (10)。
肠道菌群和饮食在结直肠癌和乳腺癌发生和发展中的作用以及两种肿瘤之间的相互联系
摘要 结直肠癌 (CRC) 是全球男女成年人死亡的主要原因之一，而乳腺癌 (BC) 是女性死亡的主要原因之一。除了年龄、性别和遗传倾向外，环境和生活方式因素也发挥着重要作用。包括酒精消费在内的全球饮食是影响 CRC 和 BC 风险的最重要可改变因素之一。西方饮食模式提倡大量摄入食品加工和乙醇中的外来生物，这会增加癌症风险，而地中海饮食通常会导致摄入更多的多酚和纤维，具有保护作用。肠道菌群失调是 CRC 的常见特征，其中通常的微生物群逐渐被机会性病原体取代，肠道代谢组发生改变。微生物群与 BC 之间的关系研究较少。雌激素组是来自可以代谢雌激素的肠道细菌的基因集合。在菌群失调的情况下，微生物的去结合酶可以重新激活结合失活的雌激素，从而增加患乳腺癌的风险。相反，肠道微生物可以增加生物活性并
使用偏光光成像
手术切除。3然而，在更晚期疾病的患者中，辅助治疗被证明可以提高生存率。1 - 3在更晚期的肿瘤 - 节点 - 纳特氏症（TNM）阶段（例如TNM阶段III），复发，更具体地说，局部复发（LR）在确定不利的患者预后中起着重要作用。4标准治疗后有LR风险的III期CRC患者的能力为创建更多个性化的护理并有助于避免过度治疗患者的机会。为实现这一目标，预后生物标志物的策展主要集中在分子和遗传指标上。5 - 9近年来，已经出现了各种商业测试套件，以预测II和III期CRC患者（例如Oncotypedx，Coloprint，Coloprint，Cologuideex和Cologuidepro）的远处复发风险。但是，它们的次优准性和/或高昂的成本继续推动寻找替代预后标记的搜索。8，9例如，有越来越多的证据表明，在肿瘤胶原蛋白（肿瘤微环境的关键成分）（TME）的生长模式中存在有价值的预后信息。10 - 13称为脱糖反应（DR），已显示结缔组织的这种生长和结构重塑与5年无复发生存率和LR相关。14 - 17 Dr使用了基质成熟度的三类分类（未成熟，中间和成熟）。然而，鉴于其评估的定性和主观性质，博士并未目睹主要是由于观察者间的可变性而广泛的临床采用。光学技术允许通过各种模式来量化DR和胶原蛋白评估，以供肿瘤，心脏病学和牙科等领域的应用。18当前的黄金标准，第二谐波一代是特定于胶原蛋白的，但其高成本，冗长的成像时间，适度的视野和整体复杂性限制了其用于研究应用程序的使用。19，20个类似考虑的限制技术，例如扫描电子微拷贝和光学相干断层扫描（不包括眼科）。18 - 21更实用的染色技术，例如梅森的三色和picrosirius红色，优先结合胶原蛋白可以轻松地使用当前的病理显微镜来实现。22然而，对加法染色，费用，（in）与当前组织学工作流程，可重现性，定量和评分系统的信息内容的兼容性的担忧阻止了这些染色方法是对组织学部门的常规补充。22，23另外，极化光微拷贝（PLM）提供了一种更简单的方法，具有获得适合从未染色组织样品定量的高对比度图像的能力。24 PLM解决了许多上述问题，因此已应用于乳房，宫颈，前列腺，大脑和结肠罐中。25更具体地说，一种称为Mueller矩阵（MM）极化法的PLM技术已越来越多地与机器学习（ML）算法结合在一起，以将不足的生物学现象与其偏振特性直接相关，以鉴定与预后相关的参数。26 - 31
HAS_CIRC_0071803促进结直肠癌...
摘要。结直肠癌（CRC）是全球第三大常见的癌症。缺乏针对CRC的有效靶向疗法使治疗具有挑战性。在这里，我们报告了一个圆形RNA（circrna），has_circ_0071803，在CRC中充当癌基因。CRIC_0071803在CRC组织和细胞系中上调，其表达水平与CRC患者的预后和存活率成反比。Circ_0071803敲低抑制了CRC中的细胞增殖，迁移和入侵。此外，我们发现Circ_0071803海绵miR-330-5p，从而在CRC细胞中上调有丝分裂原激活的蛋白激酶1（MAPK1）。通过miR-330-5p抑制或MAPK1过表达，通过Circ_0071803敲低抑制细胞活性。总体而言，我们的发现阐明了Circ_0071803通过调节miR-330-5p/mapk1途径促进CRC的进展，从而为设计有效的目标治疗提供了潜在的治疗靶标。关键词：结直肠癌，Circ_0071803，mir-330- 5p/mapk1，增殖，转移简介
转移性结直肠癌中口服酪氨酸激酶抑制剂的神经精神不良药物反应：FDA不良事件报告系统的分析
结果：在4,984例病例中，有1,357例（30.2％）报告至少一个神经精神病学ADR。New potential signals for REG included neuropathy peripheral ( n = 265; reporting odds ratio, ROR = 19.48, 95% con fi dence interval, CI 95% = 17.52-22.47; information component, IC = 2.89, IC 025 -IC 075 = 2.77-3.02), hyperesthesia ( n = 18; ROR = 12.56, CI 95% = 7.90-19.96; IC = 1.74, IC 025 -IC 075 = 1.27-2.20), altered state of consciousness ( n = 15; ROR = 5.50, CI 95% = 3.31-9.14; IC = 1.57, IC 025 -IC 075 = 1.06-2.07), depressed mood ( n = 13; ROR = 1.85, CI 95% = 1.07-3.19; IC = 0.58, IC 025 -IC 075 = 0.04-1.13）和失眠（n = 63; ror = 1.48，CI 95％= 1.15-1.89; IC = 0.38，IC 025 -IC 075 = 075 = 0.13-0.63）。For ENC comprised depressed mood ( n = 4; ROR = 5.75, CI 95% = 2.15-15.39; IC = 1.74, IC 025 -IC 075 = 0.76-2.73) and cognitive disorders ( n = 3; ROR = 4.71, CI 95% = 1.51-14.66; IC = 1.54, IC 025 -IC 075 = 0.41-2.68）。
UC Irvine 患者衍生的结直肠癌的人血管化微肿块模型概括了临床疾病 使用隐藏的Markov建模和揭示设计构想的隐藏模式 在针对CLL/SLL的目标治疗时代认识到未满足的需求：“过去是序言”（莎士比亚） 机器学习辅助高温储层热储能优化
准确地对肿瘤生物学进行建模并测试对患者衍生细胞的新疗法对于开发针对患者特定疾病的个性化治疗方案至关重要。血管化的微肿块（VMT）或“芝士肿瘤”是一种生理性临床前癌模型，它结合了天然人类肿瘤微环境的关键特征，可在透明的微富集平台中，可在体外快速药物筛查。在此，我们优化了使用新鲜的结直肠癌（CRC）活检和手术切除术来生成患者来源的VMT（PVMT）的方法，以测试单个患者水平的药物敏感性。响应标准化疗和TGF-βR1抑制作用，我们观察到来自6例患者活检的PVMT之间的异质反应，PVMT概括了肿瘤的生长，组织学特征，代谢异质性和实际CRC肿瘤的药物反应。我们的结果表明
CRISPR/DCAS9介导的DNA脱甲基化筛查鉴定结直肠癌的功能性表观遗传决定因素
©作者2023，更正的出版物2023。Open Access本文是根据Creative Commons Attribution 4.0 International许可获得许可的，该许可允许以任何媒介或格式使用，共享，适应，分发和复制，只要您对原始作者和来源提供适当的信誉，请提供与创意共享许可证的链接，并指出是否进行了更改。本文中的图像或其他第三方材料包含在文章的创意共享许可中，除非在信用额度中另有说明。如果本文的创意共享许可中未包含材料，并且您的预期用途不受法定法规的允许或超过允许的用途，则您需要直接从版权所有者那里获得许可。要查看此许可证的副本，请访问http：//创建ivecommons。org/licen ses/by/4。0/。Creative Commons公共领域奉献豁免（http：//创建ivecommons。Org/publi cdoma in/Zero/1。0/1。0/）适用于本文中提供的数据，除非在数据信用额度中另有说明。
转移性结直肠癌的分子靶向治疗
结直肠癌（CRC）占所有癌症类型的10%，是全球第三大癌症死亡原因。转移是导致CRC患者死亡的首要因素。约22%的CRC相关死亡病例在诊断时已存在转移，其中约70%的病例复发。近年来，随着新型靶向药物的应用，靶向治疗已成为CRC个体化综合治疗的一线选择。这些患者的管理仍然是一项重大的医学挑战。临床实践中最常见的CRC靶向治疗集中在抗血管内皮生长因子及其受体、表皮生长因子受体（EGFR）和多靶点激酶抑制剂。随着精准诊断技术的进步和第二代测序（NGS）技术的广泛应用，转移性结直肠癌（mCRC）中的BRAF V600E突变、KRAS突变、HER2过表达/扩增、MSI-H/dMMR等罕见靶点越来越多地被发现。同时，针对这些突变的新型治疗药物正在积极研究中。本文结合精准医疗的发展和新型分子靶向药物的发现，综述了CRC靶向治疗的临床研究进展。