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热力学循环预测进化酶的竞争性抑制结果
在分子水平上理解竞争性抑制对于揭示酶-抑制剂相互作用的动力学和预测抗性突变的进化结果至关重要。在本研究中，我们提出了一个框架，将竞争性抑制与炼金术自由能扰动 (FEP) 计算联系起来，重点关注大肠杆菌二氢叶酸还原酶 (DHFR) 及其被甲氧苄啶 (TMP) 抑制的情况。使用热力学循环，我们将实验测得的结合常数 (K i 和 K m ) 与野生型和突变型 DHFR 相关的自由能差异联系起来，平均误差为 0.9 kcal/mol，从而深入了解 TMP 抗性的分子基础。我们的研究结果强调了局部构象动力学在竞争性抑制中的重要性。DHFR 突变对底物和抑制剂结合亲和力的影响不同，从而影响 TMP 选择压力下的适应度景观。我们的 FEP 模拟表明，抗性突变通过特定的结构和/或动力学效应稳定抑制剂结合或底物结合状态。这些效应的相互作用在某些情况下显示出显著的上位性。单独评估底物和抑制剂结合的能力提供了有价值的见解，从而可以更精确地解释突变效应和上位性相互作用。此外，我们确定了 FEP 模拟中的关键挑战，包括由电荷改变突变和长距离变构效应引起的收敛问题。通过整合计算和实验数据，我们提供了一种有效的方法来预测抗性突变的功能影响及其对进化适应度景观的贡献。这些见解为构建强大的突变扫描方案和设计更有效的抗耐药细菌菌株治疗策略铺平了道路。
火鸡母鸡阴道在产卵周期中对人工授精的反应基因表达变化
在基于产卵周期和授精处理的比较中观察到基因表达的差异。在产卵初期，与未受精相比，仅使用稀释剂就会导致抗菌基因表达增加、细胞增殖、分化和重塑。相比之下，精液处理可预测先天免疫细胞通路的激活。在产卵高峰期，与假处理相比，组蛋白去乙酰化酶 7 样 mRNA 的表达更高，同时免疫钙调磷酸酶-NFAT 信号通路预计受到抑制。与产卵初期相比，精液处理导致产卵高峰期精子结合蛋白（包括恶性脑肿瘤 1 样蛋白和透明带 1 中的缺失蛋白）的表达更高。最后，与假手术相比，精液治疗导致产卵结束时尾加压素 2B 表达增加，包括 β-防御素 2、导管素 2 和 3、唾液酸粘附素、吸引素样 1、溶酶体相关膜蛋白 3、白细胞衍生的趋化因子-2 和肝细胞生长因子在内的抗菌基因表达减少。
低成本、有弹性、不易燃的可充电铁离子电池，具有可扩展的制造和较长的循环寿命
更广泛的背景 近年来，水系金属离子电池因其低成本和安全性而备受关注。其中，锌离子电池一直是研究的主要焦点。然而，铁比锌更便宜，在地壳中的储量也更丰富，有望成为替代金属阳极，尽管它仍未得到充分开发。可靠的铁离子电池正极对于推进其研究和商业化至关重要，这需要简单的制备工艺和易于理解的机制。在此，我们介绍了使用聚苯胺作为铁离子电池活性材料的夹层型和圆柱形正极。该正极不含粘合剂，通过简单的低压压制工艺制造而成。它在 5C 倍率下可提供 225 mA hg 1 的高容量（而聚苯胺的理论容量为 300 mA hg 1）。此外，我们的高负载电池在 15C 倍率下表现出 27000 次循环的长循环寿命和 82% 的容量保持率。我们还进行了系统的理论研究，阐明了在充电和放电过程中铁离子与聚苯胺结合后的电化学行为。因此，这项工作为在固定储能应用中使用铁离子电池提供了一种可靠且有前景的解决方案，其性能可能优于铅酸电池和锂离子电池。
cesin是一种短自然变体，尽管缺乏两个C末端大环
摘要尼我们是一种广泛使用的脂肪生物，由于其有效的抗菌活性及其食品级状态。其作用方式包括细胞壁合成抑制和孔形成，分别归因于脂质II结合和形成孔形成域。我们发现了Cesin，这是尼生蛋白的短自然变体，是由精神嗜血杆菌卵巢卵巢卵石产生的。与其他天然尼宁变体不同，Cesin缺少构成孔形成域的两个末端大环。目前的研究旨在异源表达和表征Cesin的抗小胞活性和物理化学特性。在乳酸乳酸球菌在乳酸菌中成功的Heterolo gous表达之后，甘西生酰生物表现出与Nisin相当的广泛而有效的抗菌谱。使用脂质II和Lipoteichoic Acid结合测定法确定其作用方式，将有效的抗菌活性与脂质II结合和与Teichoic Acids的静电相互作用联系起来。荧光显微镜表明Cesin缺乏自然形式的孔形成能力。稳定性测试表明，在不同的pH值和温度条件下，盐脂型在高度稳定，但可以通过胰蛋白酶降解。然而，一种生物工程的类似物Cesin R15G克服了胰蛋白酶降解，同时保持了全抗菌活性。这项研究表明，Cesin是一种新颖的（小）尼生变体，通过抑制细胞壁合成而没有孔隙形成，可以有效地杀死靶细菌。
磁加热激活二氧化碳甲烷化：生命周期评估和成功可再生能源储存的前景
目的 面对温室效应导致的气体排放增加和化石燃料枯竭，需要采用对环境影响小且促进可再生能源的技术来满足能源需求。最近有报道称，磁加热激活的 CO 2 甲烷化是一种高效创新的电转气技术，可以成功储存可再生能源并增值二氧化碳。在这项工作中，我们对该过程进行了生命周期评估 (LCA)，以突出该技术的环境潜力及其与传统加热技术的竞争力。方法 本 LCA 使用 IMPACT 2002+。所研究的过程集成了甲烷化、水电解和 CO 2 捕获与分离。这项“从摇篮到大门”的 LCA 研究不考虑反应产物甲烷的使用。使用的功能单元是产生的 CH.i 的能量含量。 LCA 是使用法国环境与能源管理局 (AD EME) 提供的 2020 年和 2050 年的能源结构数据进行的。消耗数据要么来自文献，要么从 Marbaix (2019) 讨论的 LPCNO 测量中获得。将磁加热激活的 CO 2 甲烷化对环境的影响与使用传统加热 (Helmeth) 并考虑天然气开采对环境影响的电转气厂对环境的影响进行了比较。结果表明，反应物的总流速、CO 2 来源和能源结构对可持续 CH 4 生产的环境影响起着重要作用，而所考虑的催化剂的寿命没有显著影响。由于上述参数可能得到改进，预计到 2050 年，整个过程对环境的影响将减少 75%。这表明，当与工业废气和可再生电力生产相结合时，磁加热激活的甲烷化具有很高的环境潜力。结论与现有的使用外部加热源的类似工艺相比，该技术预计在环境方面具有竞争力，并且具有极强的响应动态性，符合可再生能源生产的间歇性。
用于我们的咨询项目的生命周期清单数据库
关于我们 ESU-services Ltd. 成立于 1998 年。其核心目标是在所有领域（包括能源、土木工程、基础矿物、化学品、包装、电信、食品和生活方式）的生命周期评估 (LCA)、碳足迹、水足迹方面开展研究、咨询、审查和培训。公平、独立和透明是我们咨询理念的重要特征。我们以问题为导向开展工作，并在不带偏见的情况下进行分析。我们记录我们的研究，并以透明和全面的方式开展工作。我们提供公平和专业的咨询，使客户能够监控并不断改进其环境绩效。该公司曾为多家国内外公司、协会和机构工作。在某些领域，ESU-services 团队成员进行了开创性的工作，例如开发和运行基于网络的 LCA 数据库或量化食品和生活方式对环境的影响。
生命周期影响评估方法描述
ESU-services Ltd. 成立于 1998 年。其核心目标是在所有领域（包括能源、土木工程、基础矿物、化学品、包装、电信、食品和生活方式）开展生命周期评估 (LCA)、碳足迹、水足迹方面的研究、咨询、审查和培训。公平、独立和透明是我们咨询理念的重要特征。我们以问题为导向，不带偏见地进行分析。我们记录我们的研究，并以透明和全面的方式开展工作。我们提供公平和专业的咨询，使客户能够监控并不断改进其环境绩效。该公司曾为多家国内外公司、协会和机构工作。在某些领域，ESU-services 团队成员开展了开创性的工作，例如开发和运行基于网络的 LCA 数据库或量化食品和生活方式对环境的影响。
fisica / Physics中的博士学位-40周期< / div>
上述项目ID ID FIS-2023-02406杯D53C24005490001由MUR通过Bando Fis 2（Advanced la Scienza）资助，旨在建造和运营全新的2D量子材料电子光谱实验室。主要的新颖性是在紫外光子能量范围内起作用的角度逆光发射（ARIPES）设备的构造，其前所未有的分辨率优于40 MeV。该系统将与更传统的角度分辨光发射系统（ARPE）耦合，在与参考技术的相同范围内。单色电子源的可用性（ARIPES所需）和电子分析仪（用于ARPES）允许在同一样品和同一设备中实现电子能量损耗光谱（EELS）测量。ARPE，ARIPES和EEL的组合可以使量子材料的量子态在费米水平以下和高于量子状态的量子状态有效2-维电子结构中的完全观察。此外，鳗鱼可以在费米水平上提供2个粒子光谱函数。最后，在同步梁线上以相似分辨率执行的共振非弹性X射线散射（RIX）可以通过确定诸如Phonons和Magnons之类的集体激励来补充在“上面F”实验室中测得的数据。
从跨编码数据中预测生物地球化学周期的粗粒表示
抽象动机：由于DNA测序的进步，现在常规地进行了环境微生物群落的分类学分析。确定这些群落在全球生物地球化学周期中的作用需要鉴定其代谢功能，例如氢氧化，还原和碳固定。这些功能可以直接从宏基因组学数据中推断出来，但是在许多环境应用中，MetabarCoding仍然是选择的方法。从元法编码数据及其整合到地球化学循环的粗粒表示中，代谢功能的重建仍然是当今有效的生物信息学问题。结果：我们开发了一条称为Tabigecy的管道，该管道利用分类学官员来预测构成生物地球化学周期的代谢功能。在第一个步骤中，Tabigecy使用该工具Esmecata从输入液位中预测共识蛋白质组。为了优化此过程，我们生成了一个预先计算的数据库，其中包含来自Uniprot的2,404个分类单元的信息。使用BigeCyhmm搜索了共有的蛋白质组织，BigeCyhmm是一个新开发的Python软件包，依靠隐藏的Markov模型来识别参与生物地球化学周期代谢功能的关键酶。然后将代谢功能投射到周期的粗粒表示上。我们将塔博基（Tabigecy）应用于两个盐洞数据集，并通过对样品进行的微生物活性和水力化学测量结果验证了其预测。结果突出了研究微生物群落对地理化学过程的影响的方法。关键字：微生物群落，生物地球化学周期，代谢功能，分类学官员