结果:CS-SNRK - / - 小鼠对TAC的反应41表现出更差的心脏功能和心脏肥大,并且心脏中DDR Marker PH2AX的增加。此外,体外SNRK 42敲低导致DNA损伤和染色质压实增加,核平整度和3D体积的变化43。磷酸化 - 蛋白质研究确定了一个新型的SNRK靶标,44 DSTN,这是F-肌动蛋白去聚合因子(ADF)蛋白的成员,该蛋白直接与直接结合的F-actin结合,45 dypoletymerize F-肌动蛋白。SNRK与DSTN结合,除了细胞肥大外,DSTN下调还会逆转多余的DNA 46损伤和核参数的变化,而SNRK 47敲低。我们还证明,SNRK敲低促进了过度的肌动蛋白48解聚,该解聚,通过球状(G-)肌动蛋白与F-肌动蛋白的比率增加。最后,F-肌动蛋白的药理学稳定剂Jasplakinolide 49挽救了SNRK中DNA损伤增加和50个异常核形态的稳定剂。51
被新生巨噬细胞吞噬垂死的细胞引发了一种化学链反应,该反应产生了一种称为势盒A2的分子,该反应意外地刺激了心脏肌肉细胞以繁殖并修复损害。此外,新生儿的附近肌肉心脏细胞还需要对血栓烷A2做出反应,这使他们改变了新陈代谢以支持其生长和愈合。
团队成员开发了一种先进的成像技术,以分析在细胞水平上如何调节NF-κB。研究人员能够精确地测量单细胞水平上细胞对受损DNA的反应,并观察到NF-κB激活的新途径。他们发现在特定类型的损伤后,细胞释放IL-1α蛋白。它不作用于细胞本身,而是传播到相邻细胞,在那里它触发了IRAK1蛋白,然后启动NF-κB炎症反应。
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抽象目标。可以通过实验和建模的结合来理解辐射诱导的DNA损伤的机制。当前,大多数生物学实验是通过辐照整个细胞群来进行的,而辐射诱导效应的建模通常是通过蒙特卡洛模拟进行的,其轨道结构代码与单细胞核的逼真的DNA几何形状结合。但是,两种方法之间的尺度差异阻碍了直接比较,因为由于能量沉积的随机性,细胞群中的剂量分布不一定均匀。因此,这项研究提出了Minas Tirith工具,以模拟辐射诱导的DNA损伤在细胞种群中的分布。方法。所提出的方法基于使用Geant4-DNA Monte Carlo Toolkit生成的微渗透参数和DNA损伤分布的预先计算数据库。首先,针对特定吸收的剂量D分配了一个特定的能量Z,在微观法形式主义之后进行了ABS。然后,根据特定能量Z分配了每个细胞的DNA损伤事件,尊重其发生的随机特征。主要结果。这项研究通过将其结果与使用Geant4-DNA轨道结构代码和基于Geant4-DNA的基于GEANT4-DNA的模拟链进行比较的结果来验证了Minas Tirith工具。明显的能力。此外,该工具可以在建模和生物学实验之间进行更直接的比较。在人群中剂量分布以及DNA损伤量计算的情况下,比较的不同元素表明Minas Tirith和Monte Carlo模拟之间的一致性。minas tirith是一种在细胞种群水平上计算辐射诱导的DNA损伤的新方法,与使用轨道结构代码获得的辐射剂量相比,该方法促进了合理的模拟时间。
细胞 DNA 不断暴露于可诱发损伤的内源性或外源性因素。已描述了几种类型的损伤,它们可能是由紫外线/电离辐射、氧化应激或自由基等引起的。为了克服此类损伤的有害影响,即致突变性或细胞毒性,细胞拥有高度复杂的 DNA 修复机制,包括通过专用细胞通路针对特定类型损伤的修复酶。此外,DNA 在细胞核中高度压缩,第一级压缩由约 147 个 DNA 碱基对组成,这些碱基对缠绕在组蛋白核心周围,即所谓的核小体核心颗粒。在这种复杂的环境中,DNA 结构受到高度限制,需要涉及重塑过程的微调机制来将 DNA 暴露给修复酶并促进损伤去除。然而,这些核小体特异性机制仍然不太为人所知,计算方法最近才成为研究核小体等复杂系统中 DNA 损伤的有力工具。在这篇小型评论中,我们总结了该领域计算方法带来的最新进展,为核小体背景下的 DNA 损伤和修复研究开辟了新的令人兴奋的视角。
(未通过同行评审认证)是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此预印本版的版权持有人于2025年2月13日发布。 https://doi.org/10.1101/2025.02.11.637610 doi:Biorxiv Preprint
Malo Gaubert,BenoitCombès,Elise Bannier,Arthur Masson,Vivien Caron等。神经学神经免疫学与神经炎症,2025,12(1),pp.E200333。10.1212/nxi.0000000000200333。hal-04782133