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引用：Sawaki，T。（2020）。互动声音结构文本：对int
引用：Sawaki，T。（2020）。相互作用的声音结构文本：对历史论文介绍性章节中跨结构单元的对话元素的定量研究。语言功能，27（2），174–206。https://doi.org/10.1075/fol.17037.saw这是作者的作品版本，该作品被接受，以发表语言功能。由出版过程产生的变化，例如编辑，校正，结构格式和其他质量控制机制
DNA元素百科全书中的调节性转座元素
转座元素（TES）占我们基因组的约50％，但是对TES如何影响基因组进化的知识仍然不完整。利用Encode4数据，我们提供了迄今为止对监管基因组贡献的最全面研究。我们发现236,181（〜25％）人类候选元素（CCRES）是te衍生的，自人小鼠裂口以来，人群分裂以来，有超过90％的血统特异性，占血统特异性ccr的8-36％。除了罪恶之外，TES中与CCRE相关的转录因子（TF）基序比偶然的预期源自祖先TE序列。我们表明，TE可以在其集成站点附近采用类似的监管活动。自人机差异以来，TE在30个检查的TF中贡献了3 - 56％的TF结合位点周转事件。最后，就MPRA活性和GWAS变体富集而言，TE衍生的CCR与非TE CCR相似。总的来说，我们的结果证实了TE在塑造人类调节基因组中发挥重要作用的观念。
多重、单细胞 CRISPRa 筛选细胞类型特异性调控元件
基于 CRISPR 的基因激活 (CRISPRa) 是一种通过以组织/细胞类型特异性的方式靶向启动子或增强子来上调基因表达的策略。在这里，我们描述了一个实验框架，该框架将高度多路复用的扰动与单细胞 RNA 测序 (sc-RNA-seq) 相结合，以识别细胞类型特异性、CRISPRa 响应的顺式调控元件及其调控的基因。将许多 gRNA 的随机组合引入许多细胞中的每一个，然后对其进行分析并分成测试组和对照组，以测试 CRISPRa 对增强子和启动子的扰动对邻近基因表达的影响。将该方法应用于 493 个 gRNA 文库，这些 gRNA 靶向 K562 细胞和 iPSC 衍生的兴奋性神经元中的候选顺式调控元件，我们识别出能够特异性上调预期靶基因且 1 Mb 内没有其他邻近基因的 gRNA，包括导致神经元中六种自闭症谱系障碍 (ASD) 和神经发育障碍 (NDD) 风险基因上调的 gRNA。一致的模式是，单个增强子对 CRISPRa 的响应受细胞类型的限制，这意味着成功激活基因依赖于染色质景观和/或其他反式因子。本文概述的方法可能有助于大规模筛选以细胞类型特异性方式激活基因的 gRNA。
DOI：https://doi.org/10.48009/2_iis_2024_132 将人工智能 (AI) 融入游戏开发，提升多样化游戏元素 Vasilka Chergarova，佛罗里达国际大学，vchergar@fiu.edu Mel Tomeo，迈阿密戴德学院，mtomeo@mdc.edu Heidi Morgan，南加州大学，hlmorgan@isi.edu Sandra Andrade，迈阿密戴德学院，sandrad1@mdc.edu
本研究考察了人工智能 (AI) 在游戏开发中的变革潜力，旨在解决传统游戏开发方法面临的挑战并增强玩家体验。探讨了游戏中人工智能的历史演变和当前趋势，强调了人工智能的日益融合及其对游戏玩法的影响。确定了传统游戏开发中的关键挑战，包括手工制作内容和静态人工智能行为的局限性。研究了人工智能在游戏开发中的各种应用，例如角色行为建模、对手人工智能、程序内容生成、动态难度调整和自然语言处理。实施策略部分概述了技术考虑因素、开发方法以及将人工智能集成到游戏开发流程中的可用工具和框架。研究了在游戏玩法的不同方面利用人工智能技术的成功游戏案例研究，强调了它们对玩家参与度和留存率的影响。本研究最后总结了主要发现，重申了人工智能在塑造游戏开发未来方面的重要性，并敦促开发人员采用人工智能技术来创造创新和身临其境的游戏体验。关键词：人工智能、游戏开发、游戏玩法增强、对手智能、程序内容生成、交互式体验、游戏创新
使用果蝇种系组织中的长阅读RNA-seq鉴定和定量可转座元件转录本
转座元件（TES）是重复的DNA序列，可能能够在整个基因组中移动。除了它们固有的诱变效果外，TE还可以通过捐赠其内在的调节序列（例如促进细胞基因的异位表达）来破坏附近基因。te转录不仅对于TE换位本身是必需的，而且还可以与Te-Gene Fusion转录本相关，在某些情况下也是普遍转录的产物。因此，正确确定了TE副本的转录状态，是为了理解TE在宿主基因组中的影响。识别和量化TE转录的方法主要依赖于简短的RNA-seq读取以在家庭级别估算TE表达，同时使用特定算法来区分副本特定的转录。但是，将简短的读数分配给其正确的基因组位置，基因组特征并不是微不足道的。在这里，我们检索了果蝇的全长cDNA（远程prime，词汇），并使用牛津纳米孔技术进行了对其进行验证。我们表明，可以使用长阅读RNA-Seq来识别和量化复制级别的转录TE。尤其是，使用长读数比简短读数更好地估计了插入过度插入的注释基因。尽管如此，长TE转录本（> 4.5 KB）并未得到很好的捕获。大多数表达的TE插入对应于失去其转置能力的副本，在家庭中，只有几份副本表示。长阅读测序还允许识别约107个TE副本的剪接转录本。总的来说，睾丸和卵巢之间TE的第一个比较在子类和插入水平上发现其转录景观中的差异。
采用边界元法和 Aifantis 梯度弹性理论进行弹性静力学分析
摘要：微纳结构的应用日益广泛，这引起了人们对包含尺度效应的理论的兴趣，因为经典连续体理论在捕捉依赖于尺寸的效应方面存在局限性。出于这样的动机，本文使用边界元法 (BEM) 进行三维弹性静力学微结构建模。为了解释微结构效应，采用了 Aifantis 提出的简化梯度理论，这是 Mindlin 一般理论的具体化。建立了变分论证来确定问题的控制方程和边界条件。该论证解释了梯度弹性的基本解，并借助倒数恒等式构建了积分轮廓表示。Proriol 谱函数的弯曲三角元素用于近似 BEM 离散化的几何和物理参数。所提出的公式得出的结果与文献中的其他分析一致。
SRIM模拟氢离子与掺杂稀土元素的氧化铋纳米粒子的相互作用 R. Alhathlool, MH Eisa * 部门
SRIM 模拟氢离子与稀土元素掺杂的氧化铋纳米粒子的相互作用 R. Alhathlool、MH Eisa * 物理系，科学学院，伊玛目穆罕默德伊本沙特伊斯兰大学（IMSIU），利雅得 13318，沙特阿拉伯 近年来，模拟方法受到了各个领域的广泛关注。使用 SRIM 程序将稀土钽酸镥（LuTaO 4 ）掺杂的“氧化铋（Bi 2 O 3 ）薄膜沉积到聚合物基底上。” SRIM 程序用于计算能量在 1.0 MeV 至 20 MeV 之间的 Bi 2 O 3 薄膜的一些物理特性。研究了 LuTaO 4 、Bi 2 O 3 、C 10 H 8 O 4 和 LuTaO 4 / Bi 2 O 3 /C 10 H 8 O 4 样品的“电子和核阻止本领”。这些研究结果表明，稀土掺杂可以改善复合材料的性能。离子束与物质的相互作用会产生各种各样的现象。在 C 10 H 8 O 4 上沉积掺杂 LuTaO 4 的 Bi 2 O 3 薄膜会导致材料“电子和核阻止本领”和范围发生变化。将已发表的数据与获得的结果进行了比较，并提供了计算参数。（2024 年 6 月 1 日收到；2024 年 8 月 1 日接受）关键词：阻止本领、氧化铋、钽酸镥、SRIM、聚合物 1. 简介 阿尔法粒子、氘核和质子对物质有显著影响。短程核力与质子和阿尔法粒子相互作用。随着能量下降，带电粒子会失去速度。在电离和激发过程中，重带电粒子都会失去能量。重带电粒子碰撞时传递的能量较少 [1]。
移动遗传元素及其细菌宿主在复杂微生物中的空间映射
移动遗传因素（MGE）的交换促进了功能性状的传播，包括细菌群落内的抗菌抗性。目前缺乏在复杂的微生物群落中绘制MGE和识别其细菌宿主的工具，从而限制了我们对这一过程的理解。在这里，我们将单分子DNA荧光原位杂交（FISH）与多重核糖体RNA-fish相结合，以同时可视化MGE和细菌分类单元。我们在空间映射的噬菌体和抗菌耐药性（AMR）质粒中鉴定了其在人口腔生物膜中的宿主分类群。这揭示了AMR质粒和预言的独特簇，与宿主细菌的密集区域一致。我们的数据表明，细菌分类群中的空间异质性导致社区内部的MGE分布，MGE簇是由水平基因转移热点或MGE携带菌株的扩展产生的。我们的方法可以帮助推进生物膜中AMR和噬菌体生态的研究。
探索原核生物，噬菌体和移动遗传元素的反防御系统的多样性
。cc-by-nd 4.0国际许可证（未经同行评审证明）获得的是作者/资助者，他已授予Biorxiv的许可证，以永久显示预印本。这是该版本的版权持有人，该版本发布于2024年8月21日。 https://doi.org/10.1101/2024.08.21.608784 doi：biorxiv preprint