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子宫内膜上皮细胞中失调的 miR-124-3p...
子宫接受性对于胚胎植入和成功怀孕至关重要。由于子宫接受性受损而导致的植入失败是导致不孕的重要原因，但目前尚无检测方法可以识别子宫内膜引起的不孕症。在这项研究中，我们证明了在接受期，不孕女性的子宫上皮中 microRNA - 124 - 3p 异常升高。我们开发了两种模型：一种基因诱导的子宫上皮特异性 microRNA - 124 - 3p 过表达小鼠模型和一种三维人类胚胎滋养外胚层 - 子宫内膜细胞共培养模型。利用这些模型，我们发现小鼠和人类中升高的 microRNA - 124 - 3p 会破坏子宫内膜上皮细胞的粘附和极性，从而阻止子宫上皮过渡到接受状态。这项研究将 microRNA - 124 - 3p 确定为子宫内膜引起的不孕症的诊断和治疗靶点。
prevotella timonensis通过高糖苷酶和唾液酸酶活性降解阴道上皮糖蛋白
摘要细菌性阴道病（BV）是女性再生产地段的多数菌感染。bv的特征在于通过包括众所周知的gardnerella daginalis在内的多种厌氧菌替代与健康相关的乳杆菌物种。prevotella timonensis和prevotella bivia是在大量BV患者中发现的厌食症，但它们对疾病过程的贡献仍有待确定。定义BV中厌氧过度生长的特征是粘膜表面的依从性，并且在阴道分泌物中粘液降解酶（例如唾液酸酶）的活性增加。我们证明了timonensis，但没有强烈粘附于阴道和宫颈细胞的水平与阴道G. g。Timonensis基因组独特地编码了大量粘液降解酶，包括四种假定的诱导酶和两个假定的唾液酸酶PTNANH1和PTNANH2。酶测定表明，岩藻糖苷酶和唾液酸酶的活性在结合细胞链球菌和分泌的馏分中明显高于其他阴道厌食症。在感染测定中，蒂莫宁SIS有效去除了来自上皮糖蛋白的岩藻糖和α2,3和α2,6和α2,6-链接的唾液酸部分。重组表达的timonensis nanh1和nanh2从上皮表面切割α2,3和α2,6-连接的唾液酸，而在抑制剂上可以阻止timonensis通过抑制剂来阻断唾液酸。我们的结果强调了了解不同厌氧菌在BV中的作用的重要性。这项研究表明，Timonensis具有不同的毒力相关特性，其中包括初始粘附和在阴道上皮粘膜表面粘蛋白降解的高能力。
暴露于Elexacaftor/tezacaftor/ivacaftor（ETI）的CF气道上皮细胞（ETI）的基因表达反应提出了超越改进的CFTR通道功能的好处
Title: Gene expression responses of CF airway epithelial cells exposed to elexacaftor/tezacaftor/ivacaftor (ETI) suggest benefits beyond improved CFTR channel function Authors: Thomas H. Hampton 1 , Roxanna Barnaby 1 , Carolyn Roche 1 , Amanda Nymon 1 , Kiyoshi Ferreira Fukutani 1 , Todd A. MacKenzie 2 ,和Bruce A. Stanton* 1 Thomas H. Hampton博士1美国新罕布什尔州汉诺威市Geisel医学院微生物和免疫学系电子邮件： amandanymon@gmail.com Kiyoshi Ferreira Fukutani，博士电子邮件：kiyoshi.ferreira.fukutani@dartmouth.edu todd A. Mackenzie，博士2美国新罕布什尔州黎巴嫩达特茅斯盖塞尔医学院生物医学数据科学系 *通讯作者：布鲁斯·A·斯坦顿博士。微生物学和免疫学系Geisel医学院，达特茅斯520 Remsen Building Hanover NH 03755电话：603-646-5396电子邮件：bruce.a.stanton@dartmouth.edu摘要：Elexacaftor/tezacaftor/tezacaftor/ivacaftor/ivacaftor（eti fiikectik reigral inibral inibral inibristion conversion intrigry repription intrike）通过改善气道上皮细胞（AEC）分泌CFTR介导的CL-和HCO 3-导致肺功能的改善，频繁的病情较低。然而，研究表明，诸如ETI的组成部分Ivacaftor之类的CFTR调节剂对改善CFTR通道功能的CF细胞具有许多影响。由于对ETI对CF AEC基因表达的影响知之甚少，因此我们将原代人AEC暴露于ETI 48小时，并通过RNA-SEQ和QPCR询问转录组。eti增加了防御素基因表达（DEFB1）的观察结果，与CF患者（PWCF）肺部细菌负担减轻的报道一致。eti还降低了MMP10和MMP12基因表达，这表明ETI可能会减少蛋白水解诱导的肺破坏
正常上皮细胞的高度自信允许鉴定大肠癌微环境中新型的茎状细胞态
图1基于转录组信息的癌细胞调用。（a）样品的解剖位置和突变模式。c，cecum; a，上升的结肠； D，下结肠； S，Sigmoid; R，直肠。突变（在括号中）A：APC，B：BRAF，C：CTNNB1，K：KRAS，P：TP53。（b）所有73,294个细胞的UMAP，由三种主要细胞类型室染色：上皮（蓝色），免疫（橙色）和基质细胞（绿色）。（c，d，f）仅上皮细胞的umaps。（c）颜色代码按样本原点和微卫星状态。癌症样本（MSI），红色；癌症样本（MSS），黄色；正常样本，灰色。（d）ICMS分配的癌症样品颜色代码； ICMS2（黄色），ICMS3（粉红色）或正常（蓝色），正常样品（未评分，灰色）。（f）癌症样品细胞的颜色代码。拷贝数状态异常（CNA; Orange），正常（CNN; Blue）或不适用（Na; Purple）当样本中的克隆不可分割时，样品（未得分，灰色）。（e，g）分别通过癌症样本分别汇总了ICMS和地震信息。（H）量化ICMS和UnderCNV之间的一致性呼吁，作为一个不适的情节，由患者进行了颜色编码，如所示。
单细胞谱系轨迹的重建以及上皮到间质转变期间命运多样性的识别
探索上皮 - 间充质转变（EMT）的复杂性揭示了各种潜在的细胞命运；然而，早期细胞状态差异为不同的EMT轨迹的确切时机和机制尚不清楚。通过单个细胞RNA测序研究这些EMT轨迹，由于需要为每次测量牺牲细胞，因此具有挑战性。在这项研究中，我们采用了最佳运输分析来重建MCF10A细胞系中TGF - β-诱导的EMT期间不同细胞命运的过去轨迹。我们的分析揭示了导致低EMT，部分EMT和高EMT状态的三个不同的轨迹。沿部分EMT轨迹的细胞在EMT特征中显示出很大的变化，并表现出明显的茎。 在整个EMT轨迹中，我们观察到EED和EZH2基因的一致下调。 这一发现得到了EMT调节剂和CRISPR筛查研究的最新抑制剂筛查的验证。 此外，我们将早期 - 相位差异基因表达的分析应用于与干性和增殖相关的基因集，将ITGB4，LAMA3和LAMB3指定为在部分阶段与高EMT轨迹的初始阶段差异表达的基因。 我们还发现CENPF，CKS1B和MKI67在高EMT轨迹中显示出显着的上调。 第一组基因与先前研究的发现保持一致，但我们的工作独特地指出了这些上调的确切时机。 最后，后者基因的鉴定揭示了调节EMT轨迹的潜在细胞周期目标。细胞在EMT特征中显示出很大的变化，并表现出明显的茎。在整个EMT轨迹中，我们观察到EED和EZH2基因的一致下调。这一发现得到了EMT调节剂和CRISPR筛查研究的最新抑制剂筛查的验证。此外，我们将早期 - 相位差异基因表达的分析应用于与干性和增殖相关的基因集，将ITGB4，LAMA3和LAMB3指定为在部分阶段与高EMT轨迹的初始阶段差异表达的基因。我们还发现CENPF，CKS1B和MKI67在高EMT轨迹中显示出显着的上调。第一组基因与先前研究的发现保持一致，但我们的工作独特地指出了这些上调的确切时机。最后，后者基因的鉴定揭示了调节EMT轨迹的潜在细胞周期目标。
从诊断到治疗：探索宫颈上皮内肿瘤的最新管理趋势
宫颈上皮内肿瘤（CIN）是癌前的疾病，有可能发展为侵入性宫颈癌。这项全面的评论探讨了CIN管理的复杂性，从其定义，分类和病因开始。它强调了早期检测的重要性，并概述了诊断的最新趋势，包括子宫颈抹片检查，人乳头瘤病毒（HPV）测试和阴道镜检查。分级和分期，在治疗选择中关键。详细介绍了当前的管理方法，包括注意力等待，手术干预，新兴的侵入性技术和免疫疗法。讨论了影响治疗决策，知情同意和患者教育的因素。治疗后的潜在并发症，长期随访的重要性以及HPV疫苗接种在预防中的作用。最后，评论探讨了未来，讨论了检测的进步，新颖的治疗方法和精确医学的希望。总而言之，早期检测和管理仍然是CIN护理的基石，为宫颈癌是可预防且可治疗状况的未来提供了希望。
使用人类诱导的多能干细胞衍生的感光细胞和视网膜色素上皮细胞
自从发现诱导的多能干细胞（IPSC）技术以来，已经有许多尝试创建遗传性视网膜疾病（IRD）的细胞模型来研究致病过程以促进目标发现和验证活动。一致性仍然是确定这些发现的效用的关键。尽管一致性很重要，但质量控制指标仍未得到广泛使用。在这篇综述中，提供了用于利用IPSC技术生成感光器，视网膜色素上皮细胞和类器官疾病模型的工具包。在开发IPSC衍生的IRD模型（例如IPSC来源）时，讨论了重新编程方法，质量控制指标，控制策略和分化协议时的考虑。剖析了各种IPSC IRD模型，并讨论了基于IPSC的疾病建模的科学障碍，以概述当前方法和未来的方向。
CLK 激酶抑制剂 1C8 和 GPS167 对上皮-间质转化和抗病毒免疫反应的影响揭示了它们的抗癌潜力
二杂芳酰胺基化合物 1C8 和氨基噻唑酰胺相关化合物 GPS167 可抑制 CLK 激酶，并影响多种癌细胞系的增殖。之前使用 GPS167 进行的化学基因组学筛选表明，与有丝分裂纺锤体组装相关的成分的消耗会改变对 GPS167 的敏感性。在这里，使用 1C8 进行的类似筛选也确定了参与有丝分裂纺锤体组装的成分的影响。因此，用 1C8 和 GPS167 处理的细胞的转录组分析表明，编码有丝分裂纺锤体组装成分的转录物的表达和 RNA 剪接受到影响。通过显示影响有丝分裂纺锤体组装的药物的亚毒性浓度会增加对 GPS167 的敏感性，证实了微管连接的功能相关性。1C8 和 GPS167 影响与肿瘤进展相关的通路中转录本的表达和剪接，包括 MYC 靶标和上皮间质转化 (EMT)。最后，1C8 和 GPS167 改变了参与抗病毒免疫反应的转录本的表达和可变剪接。与此观察结果一致，消耗双链 RNA 传感器 DHX33 可抑制 GPS167 介导的 HCT116 细胞细胞毒性。我们的研究揭示了 1C8 和 GPS167 影响癌细胞增殖以及转移关键过程的分子机制。
分析肠上皮细胞对隐孢子虫的反应突出了IFN-γ对寄生虫限制的时间影响
IFN-γ的产生对于控制多种肠道感染至关重要，但是它对肠上皮细胞（IEC）的影响尚不清楚。隐孢子虫寄生虫仅感染上皮细胞，并且干扰素激活IEC中转录因子Stat1的能力是寄生虫清除所必需的。在这里，在感染过程中使用单细胞RNA测序在感染过程中促进IEC，发现在感染过程中，脑海中肠细胞的比例增加，并诱导IFN-γ依赖性基因信号，而未感染和感染细胞之间是可比的。这些分析是通过体内研究补充的，这表明寄生虫对照需要IEC的IEC表达。出乎意料的是，用IFN-γ的IFNG - / - 小鼠的治疗表明对这种细胞因子的IEC反应与寄生虫负担的延迟减少相关，但不会影响寄生虫的发展。这些数据集提供了对IFN-γ对IEC的影响的洞察力，并提出了一个模型，其中IFN-γ信号传导对未感染的肠上皮细胞对于控制隐孢子虫很重要。
gremlin1破坏肠上皮 - 间质串扰，通过基质重塑诱导Wnt依赖的异位干细胞生态位
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