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真核 RNA 引导的核酸内切酶是从一类独特的细菌酶进化而来的
1 加州大学伯克利分校分子与细胞生物学系；美国加利福尼亚州伯克利市；2 加州大学创新基因组学研究所；3 加州大学伯克利分校加州定量生物科学研究所 (QB3)；4 加州大学伯克利分校霍华德休斯医学研究所；美国加利福尼亚州伯克利市；5 加州大学伯克利分校地球与行星科学系；6 加州大学洛杉矶分校分子、细胞和发育生物学系；7 加州大学伯克利分校计算生物学中心；8 加州大学洛杉矶分校霍华德休斯医学研究所；9 格拉德斯通研究所；美国加利福尼亚州旧金山市；10 格拉德斯通-加州大学旧金山分校基因组免疫学研究所； 11 劳伦斯伯克利国家实验室分子生物物理和综合生物成像部；美国加利福尼亚州伯克利市；12 加利福尼亚大学伯克利分校化学系；美国加利福尼亚州伯克利市；
精确可调的，可抑制的真核转录控制器以实现遗传发现
基因的抽象条件表达和表型的观察仍然是生物学发现的核心。当前方法可启用开/关或不确定的分级基因表达。，我们开发了一个“脾气好”的控制器WTC 846，用于精确可调，分级，生长条件在酿酒酵母中基因的独立表达。受控的基因是由核酸脑抑制的强烈半合成启动子表达的，这也抑制了其自身的合成。基础表达被第二秒消除，“零”阻遏物。自动层环降低细胞对细胞的变化，同时通过化学诱导剂对蛋白质表达进行精确调整。WTC 846 allelic strains in which the controller replaced the native promoters recapitulated known null phenotypes ( CDC42, TPI1 ), exhibited novel overexpression phenotypes ( IPL1 ), showed protein dosage-dependent growth rates and morphological phenotypes ( CDC28, TOR2, PMA1 and the hitherto uncharacterized PBR1 ), and enabled cell cycle同步（CDC20）。WTC 846定义了一个“表达夹”，可以通过实验者在细胞蛋白丰度范围内调整蛋白质剂量，而设定点周围的变化有限。
基于CRISPR的测定法，用于研究真核DNA维修的国际空间站
在我们探索地球以外的探索时，宇航员可能会面临因电离辐射引起的有害DNA损害的风险。双链断裂是一种可以通过两种主要的细胞途径来修复的DNA损伤：非同源末端连接，在此期间可以在断裂部位添加插入或插入，并同源重组，其中DNA序列通常保持不变。先前的工作表明，空间条件可能会影响DNA修复途径的选择，从而有可能使太空旅行期间辐射增加的风险增加。但是，我们对这个问题的理解受到技术和安全问题的限制，这些问题阻止了对太空中DNA修复过程的整体研究。CRISPR/CAS9基因编辑系统为真核生物中的双链破裂提供了一个模型。在这里，我们描述了一种基于CRISPR的基于CRISPR的测定法，用于完全在空间中选择双链破裂修复途径的评估。在此过程中必要的步骤中，我们描述了空间中第一个成功的遗传转化和CRISPR/CAS9基因组编辑。这些里程碑代表了国际空间站的分子生物学工具包的显着扩展。
盐度是鱼类废水处理厂中全球真核群落结构的主要驱动力
©2021 Elsevier Ltd.此手稿版本可根据CC-BY-NC-ND 4.0许可（http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nc-nd/4.0/）提供。
靶向敲除真核翻译起始因子4E使冬大麦获得对丝状病毒的抗性
真核翻译起始因子 4E (EIF4E) 是许多植物物种中马铃薯病毒感染的已知易感因子。大麦黄花叶病毒病是由大麦黄花叶病毒 (BaYMV) 和大麦温和花叶病毒 (BaMMV) 引起的，可导致冬大麦产量损失高达 50%。秋季，幼小的大麦植株的根部被土传的根瘤寄生虫 Polymyxa graminis L. 感染，该寄生虫是病毒载体。病毒建立并系统性扩散到植物上部后，叶子上首先出现黄色花叶。在植物进一步发育的过程中，该病会导致叶子坏死，并且更易受霜冻伤害。由于 HvEIF4E 基因的 rym4 和 rym5 等位基因变体，超过三分之二的欧洲冬大麦品种对 BaYMV 和 BaMMV 具有抗性。然而，几种 BaYMV 和 BaMMV 菌株已经克服了 rym4 和 rym5 介导的抗性。因此，大麦育种需要新的抗性等位基因。因此，我们在 BaMMV/BaYMV 易感冬大麦品种“Igri”中通过 Cas9 内切酶对 EIF4E 基因进行了定向诱变。产生了小插入，导致翻译阅读框发生移位，从而导致 EIF4E 功能丧失。突变发生在原代突变体中已经处于纯合状态。它们的后代被证明总是纯合的并且完全抵抗 BaMMV 的机械接种。EIF4E 敲除植物表现出正常的生长习性并产生谷物，但产量受损。
意见：与移动元件的遗传冲突驱动真核基因组进化，也许是真核生态的
通过对各种微核生素的分析，我们先前曾认为，真核基因组是动态系统，依靠表观遗传机制来区分种系（即，DNA要遗传）与SOMA（即DNA）（即DNA）（即经过多倍倍倍化重排等，基因组重排等）），即使在单个核的背景下也是如此。在这里，我们通过包括两个有据可查的观测值来扩展这些论点：（1）真核基因组经常与移动遗传元件（MGE）（如病毒和可替代元素（TES）（TES）（TES），造成遗传冲突，以及（2）表观遗传机制调节MGES。综合这些思想导致了以下假设：在最后一个真核生物共同祖先（LECA）中，遗传冲突有助于动态真核生物基因组的演变，并且可能导致真核生态发生（即，可能是Feca的驱动力，是Feca的驱动力，是第一个真核生物共同的祖先）。性别（即减数分裂）可能是在LECA种系 - 疾病区分的背景下进化的，因为该过程通过调节/消除体细胞（即多倍体，重新排列）遗传物质来重现种系基因组。我们对这些思想的综合，通过整合MGES和表观遗传学的作用来扩展真核生物起源的假设。
建立基于丝氨酸整合酶的平台对真核细胞中的基因开关控制器进行功能验证的协议
1 巴西利亚大学生物科学研究所细胞生物学系，巴西联邦区巴西利亚，2 巴西联邦区巴西利亚国家合成生物学科学技术研究所 (INCT BioSyn)，巴西联邦区巴西利亚，3 Embrapa 遗传资源和生物技术，巴西联邦区巴西利亚，4 癌症转化研究中心，Instituto do Caˆncer do圣保罗州医院，圣保罗大学医学院临床医院，圣保罗，巴西，5 分子致癌计划，研究协调，国家癌症研究所 (INCA)，里约热内卢，巴西，6 D'Or 研究与教育研究所 (IDOR)，里约热内卢，巴西，7 里约联邦大学生物医学科学研究所热内卢, 里约热内卢, 巴西, 8 Cell巴西里约热内卢国家癌症研究所 (INCA) 研究协调和基因治疗项目、9 研究和生物收藏副总裁 (VPPCB)、FIOCRUZ – 奥斯瓦尔多·克鲁兹基金会研究所，巴西里约热内卢
真核陆生Microalga coccomyxa viridis sag 216-4
coccomyxa属的单细胞绿藻以其全球分布和生态多功能性而被认可。迄今为止所描述的大多数物种与各种宿主物种密切相关，例如地衣关联。然而，对驱动这种共生生活方式的分子机制知之甚少。，我们为地衣coccomyxa viridis sag 216-4（相当于粘菌）生成了高质量的基因组组装。使用长阅读的PACBIO HIFI和牛津纳米孔技术与染色质构象捕获（HI-C）测序结合使用，我们将基因组组装成21个SCA效率，总长度为50.9 MB，N50的N50和2.7 MB的N50和BUSCO得分为98.6％。虽然19个sca o olds代表了全长的核染色体，但两个添加的sca o olds代表了线粒体和质体基因组。转录组引导的基因注释导致13,557个蛋白质编码基因鉴定，其中68％的PFAM结构域和962被预测被分泌。
来自致病性和潜在致病真核微生物的DNA序列多样性在受保护的花岗岩山岩中
1GenéActica，生理学和微生物学，生物学学院，马德里大学合格大学，28040西班牙马德里； ismaelve@ucm.es（i.v.-G。）; perezuz@ucm.s（B.P.-U。 div>）; richwill@ucm.es（R.W。） div>2 RoyalJardín ico，Csic Plaza de Murillo 2，28014西班牙马德里； Enrique.lara@rjb.csic.es 3 Changins葡萄栽培与植物学学院，科学与艺术大学瑞士西部，Duillier 60，1260 Nyon，Nyon，瑞士; david.singer.bio@outlook.com 4生物多样性系，生态与进化，马德里大学合并学院的生物科学学院，西班牙马德里28040； amayadec@ucm.s（A.D.C.-G。）; murciano@bio.ucm.s（a.m.）; Abelsanchez@bio.ucm.s（A.S.-J。） div>5肛门科学系，科学学院，远程教育大学，西班牙马德里28040； manu.garo@ccia.uned.es *通信：ceremema@ucm.es;电话： +34-913944967†作者也为这项工作做出了同样的贡献。 div>