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真核ITS和rRNA扩增子的全长HIFI测序
与简短的读数相比，覆盖范围仅限于ITS1或ITS2区域，HIFI读取的读数涵盖了全真菌其区域的全长。这包含800 bp，如果包括18s和/或28S基因以跨越操纵子，则可以提供约5 kb的扩增子。以及更保守的rRNA基因，这些区域允许在物种水平上降低序列相似性和更高分辨率的分类信息（Tedersoo等，2018； Tedersoo等人，2021年，图2）。除了产生更高的分类价值外，HIFI全长扩增子测序的成本与短阅读的部分扩增子测序相当。在本申请注释中，我们提供了从复杂社区DNA样品中扩增全长真核ITS和rRNA区域的一般指导。
真核藻类中的定量元素成像
从根本上讲，所有生物都是由相同的原材料制成的，即元素表的要素。生化多样性是通过如何利用这些元素，用于什么目的以及在哪个物理位置来实现的。确定元素分布，尤其是痕量元素的元素分布，这些元素促进了本质酶活跃中心的代谢，可以确定代谢，营养状况或生物体的发育阶段的状态。光合真核生物，尤其是al-gae，是对元素分布进行定量分析的出色主题。这些微生物利用独特的代谢途径，这些途径需要各种痕量营养素的核心以实现其操作。光合微生物在养分有限或毒素污染的栖息地中也具有重要的环境作用。因此，光合真实的真核生物对生物技术剥削，碳固存和生物修复具有极大的兴趣，许多应用涉及各种痕量元素，因此影响其配额和细胞内分布。为元素成像开发了许多不同的应用，允许亚细胞分辨率，X射线荧光显微镜（XFM，XRF）处于最前沿，可以在非破坏性方法中对完整细胞的定量描述。本教程审查总结了使用XFM对真核藻类的定量单细胞元素分布分析的工作流程。
来自东非裂谷的三个苏打湖的原核和真核微生物多样性，由扩增子测序确定
苏打湖是具有高碱度和盐分的独特聚会环境，尽管具有极端的性质，但仍支持各种微生物群落。在这项研究中，使用Amplicon测序确定了三个苏打湖，阿比亚塔湖，Chitu湖和沙拉湖的样品中的原核和真核微生物多样性。与培养的分析显示，所有三个苏打湖中原核和真核微生物群落的多样性都比以前报道的要高。通过非依赖性的扩增子测序发现了总共3,603个原核生物和898个真核操作分类单元（OTU），而只有134个细菌Otus仅通过丰富的培养物获得3％。这表明在实验室条件下只能培养这些栖息地的微生物的一部分。在三个苏打湖中，来自奇图湖的样品显示出最高的原核多样性，而沙拉湖的样品显示出最低的多样性。Pseudomonadota ( Halomonas ), Bacillota ( Bacillus , Clostridia ), Bacteroidota ( Bacteroides ), Euryarchaeota ( Thermoplasmata , Thermococci , Methanomicrobia , Halobacter ), and Nanoarchaeota ( Woesearchaeia ) were the most common prokaryotic microbes in the three soda lakes.鉴定出高度多样性的真核生物，主要由Ascomycota和basidiomycota代表。与其他两个湖泊相比，在阿比亚塔湖（Lake Abijata）发现了更多的真核OTU。本研究表明，这些独特的栖息地具有多种微生物遗传资源，并可能在生物技术应用中使用，应通过功能性宏基因组学进一步研究。
玉米真核翻译起始因子 (eIF) 的基因组编辑
创新描述：玉米致死性坏死病 (MLN) 是一种病毒性疾病，正在东非肆虐。病毒利用宿主的真核翻译起始因子 (eIF) 将其基因组翻译成蛋白质以供复制。eIF 中的突变使病毒无法识别它们，因此病毒无法复制。我们在东非的 MLN 易感株系中敲除了四个 eIF 基因，以确定哪些基因（如果有的话）赋予了病毒抗性。
精确可调的，可抑制的真核转录控制器以实现遗传发现
基因的抽象条件表达和表型的观察仍然是生物学发现的核心。当前方法可启用开/关或不确定的分级基因表达。，我们开发了一个“脾气好”的控制器WTC 846，用于精确可调，分级，生长条件在酿酒酵母中基因的独立表达。受控的基因是由核酸脑抑制的强烈半合成启动子表达的，这也抑制了其自身的合成。基础表达被第二秒消除，“零”阻遏物。自动层环降低细胞对细胞的变化，同时通过化学诱导剂对蛋白质表达进行精确调整。WTC 846 allelic strains in which the controller replaced the native promoters recapitulated known null phenotypes ( CDC42, TPI1 ), exhibited novel overexpression phenotypes ( IPL1 ), showed protein dosage-dependent growth rates and morphological phenotypes ( CDC28, TOR2, PMA1 and the hitherto uncharacterized PBR1 ), and enabled cell cycle同步（CDC20）。WTC 846定义了一个“表达夹”，可以通过实验者在细胞蛋白丰度范围内调整蛋白质剂量，而设定点周围的变化有限。
基于CRISPR的测定法，用于研究真核DNA维修的国际空间站
在我们探索地球以外的探索时，宇航员可能会面临因电离辐射引起的有害DNA损害的风险。双链断裂是一种可以通过两种主要的细胞途径来修复的DNA损伤：非同源末端连接，在此期间可以在断裂部位添加插入或插入，并同源重组，其中DNA序列通常保持不变。先前的工作表明，空间条件可能会影响DNA修复途径的选择，从而有可能使太空旅行期间辐射增加的风险增加。但是，我们对这个问题的理解受到技术和安全问题的限制，这些问题阻止了对太空中DNA修复过程的整体研究。CRISPR/CAS9基因编辑系统为真核生物中的双链破裂提供了一个模型。在这里，我们描述了一种基于CRISPR的基于CRISPR的测定法，用于完全在空间中选择双链破裂修复途径的评估。在此过程中必要的步骤中，我们描述了空间中第一个成功的遗传转化和CRISPR/CAS9基因组编辑。这些里程碑代表了国际空间站的分子生物学工具包的显着扩展。
盐度是鱼类废水处理厂中全球真核群落结构的主要驱动力
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