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服务描述Stant Cell Iroto.pdf
以评估组织服务，在G组水平上检查了患者的第一个样本和亲戚的供体候选者，并在HLA A，B，C，DRB1，DQB1和DPB1以及ABO和RHD血型中检查。该研究是在EDTA血液样本上进行的，或者在必要时是唾液样本。以确定ABO和RHD血型。HLA1研究还包括用于血液服务的CMV抗体研究，该研究需要单独的血清样品。血液服务的HLA专家正在暂时比较亲戚和患者的HLA-ISDIC或HLA单倍体的结果，并就初步组织性能提供了意见，并在必要时请求合适的人进行HLA2检查的样本。在要求时，在国外组织了组织类型的组织，如果根据HLA1样本，在国外的相对供体居民似乎是HLA-相同的（或者在HLA-iphiphip的供体中，至少是HLA-iphip），至少是他或她的HLA2样品，则在其HLA2样本中进行了验证。
脐带血库自体使用
或2002年4月22日的研究，导演généraldelaSanté提到了由自体索血液（脐带或胎盘）提出的CCNE问题，即实质上是出于私人治疗或用于干细胞的研究。这些自体的脐带血库代表了使用绳索而不是骨髓的TEM细胞的医疗进展的某些承诺，因此可以很好地利用干细胞的多能特性用于恢复性疗法。这种自体保存与“同种异体”用途的保存不同，即第三方，作为对所有人都可以使用的网站的匿名捐赠。I.科学数据1）当前状态I - I骨髓移植。自70年代以来，大量患者受益于造血干细胞的骨髓移植物。自体移植物主要涉及成年人，是对某些迹象进行的，在这种情况下，HLA 1键入显然是不必要的。在2000年，IBMTR（国际骨髓移植注册表）报告的移植物中有62.5％http://www.ibmtr.org/newsletter/newsletter/pdf/2002feb.pdf）是自动细胞的移植物，是自动遗传学细胞的移植物，是毛毛的儿童的自动细胞，是95％的成人和80％。使用生长因子刺激来获取它们。在50％的自体移植物中，患者超过50岁，患者20岁以下占该人群的10％。自体移植物和同种异性2移植物的临床指示是不相同的。同种异体（非自体）骨髓移植物最初是在HLA相同个体之间的家庭中仅在一个家庭中进行的。，特别是在80年代，该程序扩展到无关的个体，随着注册管理的发展，当潜在的捐助者自愿参加时，进行HLA打字。与大量可能的HLA组合相比，与大量的HLA组合相比，Reg Ister的捐赠者数量（2002年在法国举行的〜1.10 000，全球范围约为800万）。但是，同种异体移植受到少量
174 个 SARS-CoV-2 表位的预测与验证
最近爆发的 SARS-CoV-2 (2019-nCoV) 病毒凸显了快速有效疫苗开发的必要性。刺激导致保护的适当免疫反应高度依赖于通过 HLA 复合物向循环 T 细胞呈递表位。SARS-CoV-2 是一种大型 RNA 病毒，体外测试所有重叠肽以反卷积免疫反应是不可行的。因此，通常使用 HLA 结合预测工具来缩小要测试的肽的数量。我们测试了 19 种表位-HLA 结合预测工具，并使用体外肽 MHC 稳定性测定法，我们评估了 777 种预测为 11 种 MHC 同种异型良好结合剂的肽。在这项对潜在 SARS-CoV-2 表位的研究中，我们发现当前的预测工具在评估结合稳定性时的性能各不相同，并且它们高度依赖于所讨论的 MHC 同种异型。因此，设计一种仅包含少数表位靶标的 COVID-19 疫苗是一项非常具有挑战性的任务。在这里，我们展示了 174 个具有高预测结合分数的 SARS-CoV-2 表位，这些表位经验证可与 11 种 HLA 同种型稳定结合。我们的研究结果可能有助于设计一种有效的 COVID-19 疫苗。
针对 Epstein-Barr 病毒的免疫反应的遗传学
有人认为，感染爱泼斯坦-巴尔病毒 (EBV) 是罹患多发性硬化症 (MS) 的先决条件，也可能是该疾病传播的先决条件。然而，这种影响的确切机制仍不清楚。一项大规模研究 EBV 血清学的宿主遗传学和相关临床表现，如传染性单核细胞增多症 (IM)，可能有助于我们更好地了解 EBV 在 MS 发病机制中的作用。本研究评估了影响针对 EBV 的血清学反应和 IM 病史的宿主遗传因素，并将它们与瑞典人群的 MS 风险和遗传易感性进行交叉评估。使用基于珠子的多重血清学方法测量了 8744 例 MS 病例和 7229 例人群匹配对照受试者的血浆 IgG 抗体水平，这些抗体针对 EBV 核抗原 1 [EBNA-1，截短 = 氨基酸 (aa) (325–641)，肽 = aa(385–420)] 和病毒衣壳抗原 p18 (VCAp18)。将高/低 EBV 抗体水平和 IM 病史与 MS 风险的关联与相关临床指标以及性别、取样年龄和相关 HLA 等位基因变异进行了比较。还进行了全基因组和 HLA 等位基因关联分析，以确定 EBV 抗体反应和 IM 病史的遗传风险因素。较高的 VCAp18 抗体水平 [优势比 (OR) = 1.74，95% 置信区间 (CI) = 1.60–1.88] 和 EBNA-1，特别是肽 (OR = 3.13，95% CI = 2.93–3.35)，与 MS 风险增加有关。抗 EBNA-1 IgG 水平升高时风险增加，最高达参考风险的 12 倍。我们还确定了几种与 EBV 血清学相关的独立 HLA 单倍型，与已知的 MS 风险等位基因重叠 (例如 DRB1*15:01)。虽然有几种候选基因，但 HLA 区域之外的变异均未达到全基因组显著性。抗 EBNA-1 IgG 水平 (特别是肽片段) 的累积 HLA 风险与 MS 密切相关。相比之下，高抗 VCAp18 IgG 水平的遗传风险与 MS 风险的相关性并不那么强。 IM 病史与 II 类 HLA 基因无关，但与 A*02:01 呈负相关，而 A*02:01 可预防 MS。我们的研究结果强调，抗 EBNA-1 IgG 水平与 MS 之间的风险关联可能部分归因于重叠的 HLA 关联。此外，随着抗 EBNA-1 水平的增加，MS 风险也随之增加，这与 EBNA-1 免疫反应的致病作用相一致，或许是通过分子模拟。鉴于高抗 EBNA-1 抗体可能反映 T 细胞对病毒的防御控制不佳，我们的研究结果与 DRB1*15:01 是针对 EBV 的免疫防御中较差的 II 类抗原相一致。最后，IM 的基因控制差异支持 EBNA-1 和 IM 在 MS 易感性中的独立作用。
HLA-A/B/C敲除电穿孔套件
说明HLA-A/B/C敲除电穿孔套件适用于通过电穿孔的细胞系和原代T细胞工程。该套件既包含Cas9酶（链球菌）和靶向HLA-A/B/C（人白细胞抗原）的GRNA。该套件足以设计高达500万个原代T细胞。背景HLA（人白细胞抗原）-a，b和c是MHC的三种主要类型（主要的组织相容性复合物）1类跨膜蛋白。它们与β2微球蛋白蛋白（由B2M基因编码）形成异二聚体。MHC 1类分子表现出短多肽，通常在长7-11个氨基酸之间，以识别为“自我”或“非自身”的免疫系统。HLA-C存在于所有细胞中，并且由于HLA-C基因的多样性而作为几种单倍型存在。c*08：02代表一种这样的单倍型。HLA I类将新抗原衍生的肽呈现到细胞表面，从而通过TCR（T细胞受体）识别出T细胞的识别。 癌症免疫疗法一直在使用该机制，方法是表达能够识别特定癌症免疫原子的TCR。 在2016年，HLA-C*08：02限制性TIL（肿瘤浸润淋巴细胞）在肺癌中靶向KRAS（Kirsten大鼠肉瘤病毒）G12D突变，导致阳性结果。 在转移性胰腺癌患者中采用了类似的方法，并导致该疾病的消退。 HLA-C*08：02限制性TIL对其他新抗原的TCR的研究可能对癌症治疗有益。 应用程序HLA I类将新抗原衍生的肽呈现到细胞表面，从而通过TCR（T细胞受体）识别出T细胞的识别。癌症免疫疗法一直在使用该机制，方法是表达能够识别特定癌症免疫原子的TCR。在2016年，HLA-C*08：02限制性TIL（肿瘤浸润淋巴细胞）在肺癌中靶向KRAS（Kirsten大鼠肉瘤病毒）G12D突变，导致阳性结果。在转移性胰腺癌患者中采用了类似的方法，并导致该疾病的消退。HLA-C*08：02限制性TIL对其他新抗原的TCR的研究可能对癌症治疗有益。应用程序K562细胞是HLA I和II类负的，使其成为引入和研究特定单倍型响应的理想细胞模型。hla在供体细胞和个体之间的不匹配可以导致免疫排斥反应，一种选择是敲除内源性HLA，从而使细胞被更广泛地普遍使用。
手稿 - MacBeath
要制定有效的 COVID-19 检测、治疗或预防策略，需要深入了解针对 SARS-CoV-2 的自然免疫反应，包括 T 细胞介导的细胞反应。我们使用了一种无偏倚的全基因组筛选技术（称为 T-Scan），以识别 25 名 COVID-19 康复患者的记忆 CD8+ T 细胞识别的 SARS-CoV-2 中的特定表位，重点关注六种最常见的 HLA 类型所呈现的表位：A*02:01、A*01:01、A*03:01、A*11:01、A*24:02 和 B*07:02。对于每种 HLA 类型，患者的 T 细胞识别 3-8 个在患者中广泛共享的免疫显性表位。值得注意的是，94% 的筛查患者的 T 细胞能够识别特定 HLA 的三个最主要表位中的至少一个，53% 的患者的 T 细胞能够识别所有三个表位。随后对另外 18 名 A*02:01 患者进行的验证研究证实了对前六个 A*02:01 表位有特异性的记忆性 CD8+ T 细胞的存在，单细胞测序表明患者通常具有针对每个表位的许多不同 T 细胞克隆，但相同的 T 细胞受体 V a 区域主要用于识别这些表位，即使在患者之间也是如此。总的来说，我们在所研究的六种 HLA 类型中确定了 29 个共享表位。针对大多数这些表位（29 个中的 27 个）的 T 细胞不会与导致普通感冒的地方性冠状病毒发生交叉反应，并且表位不会出现在突变变异较高的区域。值得注意的是，29 个表位中只有 3 个位于刺突蛋白中，这凸显了设计新类疫苗以重现对 SARS-CoV-2 的天然 CD8 + T 细胞反应的必要性。
精准 COVID-19 疫苗及伴随诊断
摘要 尽管已经描述了冠状病毒和其他病毒的抗体增强疾病的作用，但没有人能够预测疫苗诱导的此类抗体是否有害，尤其是在再次感染不同毒株后。替代疫苗可以在没有抗体的情况下诱导记忆 T 细胞反应，从而杀死新感染的细胞。由于预测与受试者的三种 HLA I 类分子结合的表位以超过 80% 的概率激活细胞毒性 T 细胞反应，因此此类精准疫苗的临床前测试是在没有动物实验的情况下通过计算机模拟进行的。可以利用数据科学从冠状病毒复制酶蛋白中选择免疫原性疫苗肽，并估计 HLA 基因型人群的免疫反应率。利用可访问的平台技术，可以与基于 HLA 基因型的伴随诊断共同开发一组精准疫苗，以确定最有可能在受试者体内引起反应的疫苗。精准疫苗接种的目标是将致命的 COVID-19 转化为无症状疾病，并避免潜在的疾病增强风险。
Hamza Khyari博士学生，自由职业者b''
14 de设置。de 2024 - •使用完全卷积自动编码器和的个性化免疫疗法预测。基于语言模型的大型HLA编码。•Elia Giuseppe ...