Genomic and bioinformatic profiling of mutational neoepitopes reveals new rules to predict anticancer immunogenicity Fei Duan 1 , Jorge Duitama 2 , Sahar Al Seesi 2 , Cory M. Ayres 3 , Steven A. Corcelli 3 , Arpita P. Pawashe 1 , Tatiana Blanchard 1 , David McMahon 1 , John Sidney 4 , Alessandro Sette 4 , Brian M. Baker 3,I. Mandoiu 2和Pramod K. Srivastava 1 1 1 1免疫学和Carole和Ray Neag Neag Neag综合癌症中心,康涅狄格大学医学院,法明顿大学,CT 06030 2计算机科学与工程系,康涅狄格大学,康涅狄格大学,CT 06269 306269 3.巴黎圣母院(Notre Dame),在46556 46556 4 Lajolla过敏和免疫学研究所,La Jolla,CA 92037癌症的突变曲目创造了使癌症免疫原性的新皮特。在这里,我们介绍了两个新型工具,这些工具以相对较高的精度识别了一小部分的新皮特(在数百种潜在的新皮上)通过抗肿瘤T细胞响应保护宿主。这两个工具由(a)突变序列与未分离的对应物之间的NetMHC得分的数值差异称为差分激光指数(DAI),以及(b)MHC I肽相互作用的构象稳定性。从机械上讲,这些工具识别出突变以创建用于MHC结合的新的锚固残基的新皮特,并使整体肽更加刚性。这些结果大大扩展了目标癌抗原的宇宙,并确定了人类癌症免疫疗法的新工具。我们将方法应用于mutliple独立肿瘤。令人惊讶的是,此处鉴定出的保护性新皮肤引起了CD8依赖性免疫力,尽管它们对KD的亲和力是比500 nm的阈值低的数量级,但被认为合理的这种相互作用。实际上,包括DAI算法在内的管道首先是在肿瘤细胞系的甲基甲基细胞系中进行经验得出的,然后在CMS5细胞系上进行了测试。通过DAI算法预测的抗肿瘤活性在CMS5中明显强大。这种变化很可能是甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基苯甲酸酯特有的免疫抑制机制的反映,因此与DAI算法本身的优点无关。此后,DAI算法在另一种小鼠肿瘤B16黑色素瘤和该系中T细胞反应的数据中进行了测试,与仅NETMHC的显着优越性一致。尽管本研究的重点是鉴定CD8 T细胞的MHC I限制表位,但该分析也可以扩展到CD4 T细胞的MHC II限制表位。
1. 一级学位证书(学士学位 - 仅适用于完成毕业的学生); 2. 带有分数和学分的成绩单; 3. 将前几点 1 和 2 中列出的文件翻译成意大利语或英语(如果以意大利语、英语、西班牙语或法语以外的语言发布); 4. 候选人持有的任何被认为有助于评估所选硕士学位课程资格的文件(例如考试计划,即教学大纲); 5. CIMEA 颁发的可比性声明:在与米兰比可卡大学达成的协议框架内(通过链接 https://cimea.diplo-me.eu/unimib/#/portal/home ),可以注册并以较低的成本和时间使用 Diplo-me 服务。另外,学生可以提交由相关意大利大使馆/领事馆出具的 Dichiarazione di Valore in Loco(价值声明)或文凭补充材料(如果由颁发学位的同一所大学出具)。6. B2 级英语认证(请参阅下面有关英语语言认证的部分)。
磨砂鼠伤寒是由革兰氏阴性细菌(Orientia tsutsugamushi)引起的一种威胁生命的,未分化的发热疾病。细菌菌株是应考虑的全球健康问题。尽管为开发有效的免疫原性疫苗开发了数年的努力,但仍未获得成功的许可疫苗。该研究的目的是使用反疫苗学方法来构建表位反应。TSA56和SCAA蛋白合并可能是针对O. tsutsugamushi的最有希望的亚基疫苗。预测了 b细胞,CTL和HTL表位,随后,所有表位分别由KK,AAY和GPGPG接头连接,以及N末端区域的佐剂。此外,进行了分子对接和MD模拟,对TLR-2表现出较高的属性。鉴定并验证了16个线性B细胞,6个CTL和2个HTL表位。最终疫苗构建体显示高抗原性,稳定性和溶解度。分子对接和MD模拟表明与TLR-2和稳定的疫苗受体复合物相互作用。通过在计算机克隆中成功实施了疫苗在PET28A(+)载体中的表达,以及免疫模拟的显着结果表明,在先天性和适应免疫反应过程中,疫苗在免疫细胞相互作用中的效率证明了免疫反应中的效率。总而言之,结果表明,如果通过实验进行进一步研究,新开发的疫苗将是控制和提供针对SCRUB TYPHUS的明确预防措施的有前途的候选人。
•什么是近亲标记重新带?•它如何工作?•优势?•限制?2。涉及的主要考虑因素和步骤3。示例和陷阱4。主要成本5。Cetacean生物学和近亲标记重新带
本文提出的研究通过应用解释过程框架回顾了意大利工业区中网络技术的扩散。我们描述了将地区描述为特殊的社会经济现实的社会过程和背景。在此背景下,我们讨论了过去三年中关于信息和通信技术扩散(ICT)的十二个意大利工业区进行的两项调查。调查记录了支持通信流和基础架构(例如电子邮件,ISDN和ASDL连接)的ICT的广泛扩散,而对ERP系统和电子商务应用程序等业务模型产生影响的技术则不那么分散。我们阐述了这些发现,并认为扩散的不同趋势取决于技术/经济原因和社会文化问题。一方面地区公司拥有低技术专业知识,无法负担高成本技术;另一方面,他们认为ICT是他们数十年来互动中已经建立的丰富关系网络的替代不足。在这种情况下
准确的信息处理在技术和自然界中都是至关重要的。为了实现它,任何信息处理系统都需要初始资源供应远离热平衡。在这里,我们建立了可以通过给定数量的非平衡资源来实现准确性的基本限制。该限制适用于任意信息处理任务和任意信息处理系统受量子力学定律的影响。它很容易计算,并且用熵数量表示,我们将其命名为反向熵,与所考虑的信息处理任务的时间逆转相关。对于所有确定性的经典计算及其所有量子延伸都可以达到极限。作为一种应用程序,我们建立了非quilibrium和准确性之间的最佳权衡,用于存储,传输,克隆和擦除信息的基本任务。我们的结果设定了接近最终效率限制的新设备设计的目标,并提供了一个框架,以证明量子设备的热力学优势比其经典配料。
立场摘要Ifakara Health Institute(IHI)与卫生部通过国家疟疾控制计划,总统办公室,地区管理局和地方政府以及国家医学研究所(NIMR)共同实施了Malararia Malararia在Tanzania内部(MSMT2)项目的第二阶段。同时,IHI正在寻求一名精力充沛,熟练的后博士后研究员,以加入我们的团队,进行一项尖端的研究项目,专注于MSMT项目的第二阶段。成功的候选人将与多学科研究人员,公共卫生专业人员以及本地和国际利益相关者紧密合作,以增强和规模,以增强和扩展本地能力,以基于该项目的目标,以支持分子,遗传,基因组和数据分析,以支持疟疾分子监测和其他要求。该项目最终将支持政策变化,并为坦桑尼亚的疟疾控制和消除提供明智的决策。
液体晶体(LC)是一种出色的电磁材料,在液体和晶体固体之间具有中间结构。它具有较大的光学各向异性,其光学特性可以通过中等外部磁场轻松修饰,从而使光的放大和相位调制。LC显示基于光的幅度或两极分化的模拟,已成为巨大的商业成功。同时,在光子学领域探索了许多LC设备的新型非显示器应用[1-6]。lc光学元素在操纵不同程度的光中发现了新的作用,尤其是在矢量梁的工程中,具有简单配置,方便使用,低成本和高转换效率的优势。向量场[7 - 9],其中横梁横平的光极化是空间变化的,引起了很多关注。矢量梁作为对矢量螺旋方程的自然解决方案。它们经常被生成具有正交极化状态的正交标量场的超级位置,为