摘要。Wijayanti C,Suryadarma P,Mubarik NR。2024。从Simadu菠萝根分离的辅助细菌的整个基因组测序。生物多样性25:4860-4869。铁载体是由细菌合成的有机化合物,可充当铁螯合配体,促进铁进入细胞的溶解和转运。生产细菌在各个研究和应用领域都具有重大好处。最近的一项研究调查了来自印度尼西亚西爪哇省Subang区的Simadu菠萝根的产生铁载细菌M7分离物。这项研究旨在分析M7分离株通过基因组挖掘的完整基因组序列的铁载体生物合成基因簇(BGC)。对菌株型锰氧基lldra6的比较基因组分析表明,M7分离株具有相似的鸟嘌呤 - 酪氨酸(GC)含量,其序列长度较长,总序列总计为4,447,159 bp。使用平均核苷酸同一性(ANI)计算的基因组比较表明,M7分离株的基因组相似性为98.82%,与菌株P. manganoxydans lldra6相似。此外,M7分离株的基因组包含铁采集和代谢的系统,涉及调节铁的机制。M7分离株中的特定区域通过非核糖体肽合成酶合成酶的铁载体(NIS)途径编码负责二级载体生物合成蛋白的IUCA/IUCC家族。这种遗传特征可能会引起并发的蛋白质表达,并有可能增强体力指数的积累。关于铁载体BGC,该分离物显示出与stuartii的最高相似性,遗传冗余含量差异。此外,与Stuartii的P. Stuartii不同,M7分离株的病原体预测结果表明它对人类不是致病性的,该预测是致病性的。新的铁载体产生细菌M7分离物具有核心生物合成基因的复制,代表了支持铁载体生物合成的遗传冗余。
本研究从一种在菲律宾传统上称为 Balao-balao 的发酵米虾混合物中分离出乳酸菌。筛选乳酸菌菌株表明,10 种分离物对测试微生物表现出良好的抑制活性,即金黄色葡萄球菌 BIOTECH 1634、大肠杆菌 BIOTECH 1582、枯草芽孢杆菌 BIOTECH 1679 和哈维氏弧菌 SEAFDEC 010。感兴趣的是分离物 PL12,这是一种产生细菌素的菌株,对测试的病原体表现出最高的抑制活性。分离物 PL12 被鉴定为戊糖片球菌 (GenBank 登录号 MF353992),通过 16S rDNA 序列分析具有 100% 的相似性。排除有机酸和过氧化氢的影响,PL12 分离株的无细胞上清液 (CFS) 在琼脂孔扩散试验中表现出对测试病原体的强拮抗活性。这些结果证实了分离株的蛋白质性质,并表明了细菌素的典型特性。为了进一步浓缩 CFS 中的蛋白质,进行了硫酸铵沉淀,然后进行柱纯化(Sep-Pak C 18 筒式柱)。在测试的革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌中均观察到 PL12 细菌素的阳性拮抗作用。在每个纯化步骤中都发现对大肠杆菌的抑制活性最高。这些结果表明,产生细菌素的 PL12 分离株可以成为食品工业中一种有前途的防腐剂,也可以作为水产养殖中的益生菌,因为它具有对抗哈维氏弧菌的拮抗活性。
致谢:我们感谢Jain Lab的成员提供有用的建议和讨论。我们感谢佛罗里达大学,UF健康癌症中心和临床和转化科学研究所存储库的支持。我们还要感谢David Ostrov博士和Cuong Nguyen博士的支持,并获得了患者样本并进行讨论。 最后,我们感谢惠特尼·斯托佩尔(Whitney Stoppel)博士和她在化学工程系的实验室和佛罗里达大学森林基因组学集团的Chrisopher Dervinis博士使用冻干剂。 通过BEI资源,NIAID,NIH:中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-COV),EMC/2012,NR-45843获得以下试剂。来自Urbani,Urbani,NR-52346的定量PCR(QPCR)控制RNA;来自人类冠状病毒(HCOV)的基因组RNA,NL63,NR-44105;来自SARS相关冠状病毒2的基因组RNA,孤立的香港/VM20001061/2020,NR-52388。 以下试剂是由疾病控制和预防中心沉积的,并通过BEI资源,NIAID,NIH:与SARS相关冠状病毒2,分离的USA-WA1/ 2020,NR-52285的BEI资源:基因组RNA。来自热灭活SARS相关的冠状病毒2,分离株USA-WA1/2020,NR 52347的定量PCR(QPCR)对照RNA;与SARS相关的冠状病毒2,分离的USA-WA1/2020,热灭活,NR-52286。 通过Bei Resources,NIAID,NIH:与SARS相关的冠状病毒2,Inalaly Italy-Inmi1,NR-52498分离出Maria R. Capobianchi博士的基因组RNA。我们还要感谢David Ostrov博士和Cuong Nguyen博士的支持,并获得了患者样本并进行讨论。最后,我们感谢惠特尼·斯托佩尔(Whitney Stoppel)博士和她在化学工程系的实验室和佛罗里达大学森林基因组学集团的Chrisopher Dervinis博士使用冻干剂。通过BEI资源,NIAID,NIH:中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-COV),EMC/2012,NR-45843获得以下试剂。来自Urbani,Urbani,NR-52346的定量PCR(QPCR)控制RNA;来自人类冠状病毒(HCOV)的基因组RNA,NL63,NR-44105;来自SARS相关冠状病毒2的基因组RNA,孤立的香港/VM20001061/2020,NR-52388。以下试剂是由疾病控制和预防中心沉积的,并通过BEI资源,NIAID,NIH:与SARS相关冠状病毒2,分离的USA-WA1/ 2020,NR-52285的BEI资源:基因组RNA。来自热灭活SARS相关的冠状病毒2,分离株USA-WA1/2020,NR 52347的定量PCR(QPCR)对照RNA;与SARS相关的冠状病毒2,分离的USA-WA1/2020,热灭活,NR-52286。通过Bei Resources,NIAID,NIH:与SARS相关的冠状病毒2,Inalaly Italy-Inmi1,NR-52498分离出Maria R. Capobianchi博士的基因组RNA。
从Yucatán和墨西哥的墨西哥州,第二龄Instar fall陆军虫(Spodoptera frugiperda)(J. E. E. e. e. e. smecorea)(lepidopopera)获得了从Yucatán和墨西哥的墨西哥州(墨西哥)墨西哥州(Lepidopera)获得的2种分离物的两种分离物的生物学活性(SF-YUC和SF-CHI)。确定并与尼加拉瓜分离物(SF-NIC)进行比较。也确定了第三龄和第四龄S. frugiperda对最活跃的分离株SF-YUC的响应。solethal效应,并评估了其代际持久性。第二龄S. frugiperda上最致病的分离株是SF-NIC和SF-YUC。在SF-NIC(146 H)和SF-YUC(149 h)分离株之间杀死速度的速度中没有明显差异,而SF-CHI(158 h)隔离株的杀伤速度显着较慢。随着幼体阶段从9.45×10 4到1.25×10 6的昆虫分离株的50%昆虫(LC 50)值杀死50%的致命浓度(LC 50)。在衍生自每毫升SF-Yuc孤立酸酯的第三龄(F 0)的个体中,p型体重,繁殖力,生育力和成人寿命的统计学显着降低是相关的。记录了幼虫的病毒死亡率为15.83±1.43%,并且记录了植物f 1的p pupal重量。总而言之,墨西哥分离株可能被证明是对弗鲁吉帕尔达链球菌区域控制的生物杀虫剂的基础。世代之间持续存在的持续感染可能会产生发育成本并降低宿主昆虫的生殖能力。
Methods This comparative genomic study included extensively drug-resistant Morganella spp isolates collected between Jan 1, 2013, and March 1, 2021, by the French National Reference Center (NRC; n=68) and European antimicrobial resistance reference centres in seven European countries (n=104), as well as one isolate from Canada, two reference strains from the Pasteur Institute collection (Paris, France), and two来自Bicêtre医院(法国克里姆林 - 比卡特)的可菌素敏感分离株。通过全基因组测序,抗菌敏感性测试和生化测试来表征分离株。也包括来自GenBank(n = 103)的完整基因组进行基因组分析,包括系统发育和核心基因组和抗性的测定。不同物种或亚种之间的遗传距离。通过将遗传分析与脂质A上的质谱分析相结合。
9.40 Thoraflex杂交和继电器扩展(扩展)研究:初步结果C. Malaisrie 9.45肋间动脉重建:技术和结果N.Shiiya 9.50我如何做胸腔 - 腹主动脉瘤动脉症修复A.Z. Apaydin 9.55 Homemade fenestrated physician-modified stent grafts for arch aortic degenerative aneurysms L. Canaud 10.00 In-Situ Fenestration for Isolate Left Subclavian Artery Preservation during Thoracic Endovascular Aortic Repair Using an Adjustable Needle Puncturing System G. Piffaretti 10.05 Left subclavian Artery Preservation with Thoracic branched内植体H. Patel 10.10一种新的用于开放胸腹主动脉瘤动脉瘤修复的杂种移植物S. Wipper 10.15稳定概念,以解决急性和亚急性型B主动脉缝隙G. Melissano 10.20讨论
摘要。Rante H,Manggau MA,Alam G,Pakki E,Erviani AE,Hafidah N,Abidin HL,Ali A.2024。在印度尼西亚Maros-Pangkep的卡丁车生态系统中隔离和鉴定具有抗真菌活性的放线菌。 生物多样性25:458-464。 放线菌产生了各种具有抗菌,抗病毒和抗癌作用(例如抗菌,抗病性和抗癌作用)的生物活性二级化合物。 这项研究旨在隔离,鉴定和筛选抗阴茎从印度尼西亚Maros-Pangkep的喀斯特生态系统收集的土壤环境样本中。 然后将活性分离物发酵,以生产次级代谢产物。 发酵过程在150 rpm的搅拌条件下使用M1培养基12天。 根据序列Gen 16S rRNA鉴定了分离株放线菌。 对白色念珠菌ATCC 10231和尼日尔ASPERGILLUS NIGIL ATCC 16404的抗真菌活性进行筛查。 使用纸盘应用扩散方法来评估抗真菌活性。 结果表明,从收集的土壤样品中纯化了8个分离株。 从获得的8种分离菌中,两个放线菌在筛选方法中表现出抗真菌活性,即用代码B11和B 17分离出。在印度尼西亚Maros-Pangkep的卡丁车生态系统中隔离和鉴定具有抗真菌活性的放线菌。生物多样性25:458-464。放线菌产生了各种具有抗菌,抗病毒和抗癌作用(例如抗菌,抗病性和抗癌作用)的生物活性二级化合物。这项研究旨在隔离,鉴定和筛选抗阴茎从印度尼西亚Maros-Pangkep的喀斯特生态系统收集的土壤环境样本中。然后将活性分离物发酵,以生产次级代谢产物。发酵过程在150 rpm的搅拌条件下使用M1培养基12天。根据序列Gen 16S rRNA鉴定了分离株放线菌。对白色念珠菌ATCC 10231和尼日尔ASPERGILLUS NIGIL ATCC 16404的抗真菌活性进行筛查。使用纸盘应用扩散方法来评估抗真菌活性。结果表明,从收集的土壤样品中纯化了8个分离株。从获得的8种分离菌中,两个放线菌在筛选方法中表现出抗真菌活性,即用代码B11和B 17分离出。分离株B11的粗提取物对白色念珠菌和尼日尔的活性为2 mg/纸盘,1.5 mg/paber Disc和0.75 mg/Paper Disc。此外,发现分离物B17仅对白色念珠菌具有活性。对16S rRNA基因序列的系统发育分析表明,B11显示出与链霉菌菌株NBRC 15617的最高相似性。
康普茶是利用 SCOBY(细菌和酵母的共生培养)将茶与糖溶液一起发酵制成的。康普茶发酵分为几个阶段,例如将糖转化为乙醇、将乙醇转化为乙酸以及将乙酸转化为二氧化碳。因此,康普茶发酵过程中必须涉及几种独特的微生物。我们之前的研究报告称,康普茶饮料(液相)中的可培养微生物都是细菌。此外,在本研究中,我们研究了 SCOBY 本身中的可培养微生物。在康普茶发酵过程中,每天使用无菌刀切割 SCOBY 片(约 1×1 厘米)。将 SCOBY 切片在马铃薯葡萄糖肉汤中富集,并在 37°C 下培养 24 小时。将富集的培养物接种到平板计数琼脂中,并在 37°C 下培养 24 小时。在 14 天的康普茶发酵过程中收集了四个不同的菌落,分别命名为分离物 (a)、(b)、(c)、(d)。疑似细菌菌落培养在营养琼脂中,而疑似霉菌或酵母菌落培养在马铃薯葡萄糖琼脂中。表征结果表明,分离物 (a) 具有与醋杆菌属相近的特征(革兰氏阴性、短杆状、不产生内生孢子),而分离物 (b) 为革兰氏阴性、长杆状并产生内生孢子。分离物 (c) 被怀疑为霉菌,分离物 (d) 被鉴定为酵母。关键词:细菌;发酵;康普茶;SCOBY;酵母