Acanthamoeba是一种在水和土壤中的自由活动的变形虫,是一种新兴的病原体,引起严重的眼部感染,称为Acanthamoeba角膜炎。在其自然环境中,Acanthamoeba作为环境异养捕食者的双重功能,并为一系列抵抗消化的微生物提供了双重宿主。我们的目标是表征系统发育不同的acanthamoeba spp的细胞内微生物。在澳大利亚和印度通过直接从变形虫中测序16S rRNA扩增子。通过原位杂交和电子显微镜进一步证实了细胞内细菌的存在。在评估的51个分离株中,有41%的细胞内细菌聚集在四个主要的门中:假单胞菌(以前称为proteobacteria),杆菌(以前称为拟杆菌),拟杆菌菌,放线症(先前称为actinobacteria)和杆菌(先前已知的杆菌)(以前已知)(以前已知)(以前已知)(以前已知)。线性歧视分析效应尺寸分析确定了样本类型之间的不同微生物丰度模式;假单胞菌物种在澳大利亚角膜分离株中丰富(p <0.007),肠杆菌在印度角膜分离株中显示出更高的丰度(p <0.017),而在澳大利亚水分离株中,细菌含量丰富(p <0.019)。来自印度和澳大利亚的角膜炎患者的acanthamoeba分离株的细菌β多样性显着差异(p <0.05),而α多样性并没有根据原产国或隔离来源而变化(p> 0.05)。与临床分离株相比,在水分离株中鉴定出更多样化的细胞内细菌。共聚焦和电子显微镜证实了经历了二进制裂变宿主内二元裂变的细菌细胞,表明存在可行的细菌。这项研究阐明了Acanthamoeba中同胞生活方式的可能性,从而强调了其作为潜在人类病原体的掩体和载体的关键作用。
温血动物(包括鸟类)肠道中自然存在的大肠杆菌是淡水水质监测中粪便污染的常用指标,可作为粪便污染和病原体的替代指标(1)。然而,目前用于计数大肠杆菌的培养方法无法区分粪便大肠杆菌和归化或环境相关的“类大肠杆菌”菌株,也称为大肠杆菌隐蔽进化枝(2-4)。Escherichia whittamii(隐蔽进化枝 2)(5)、Escherichia ruysiae(隐蔽进化枝 3 和 4)(6)和 Escherichia marmotae(隐蔽进化枝 5)(7)是最近描述的类群,但宿主物种和环境持久性仍有待确定。该项目专注于大肠杆菌和大肠杆菌属的全基因组测序。来自环境来源(淡水、河流沉积物、水生生物膜、土壤和鸟类及哺乳动物的粪便)。菌株是在研究对比土地使用对大肠杆菌属的影响的研究中获取的,并按照之前描述的方式进行培养(8)。大肠杆菌和新大肠杆菌属的基因组数据将提供有关这些细菌在环境中存活的信息和更准确的粪便追踪,从而能够识别并迅速解决影响水道的最严重污染源。
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Buchfink等。,2015年; Gotoh,2008年;霍夫等。,2016,2019; Iwata和Gotoh,2012年; Lomsadze等。,177
摘要。镍是具有工业工厂潜在用途的重金属之一。对镍的高需求导致各种努力从废物中恢复镍。通常,金属回收是使用大量化学品进行的,因此成本很高,对环境有害。使用微生物(例如细菌)回收金属是非常有前途的。因此,这项研究将使细菌与煤灰储存中分离并表征细菌,并通过生物介导过程分析这些细菌在镍恢复中的潜力。细菌分离,并将样品接种到选择性培养基中的细菌中,以在生物素料中起作用。已分离的细菌将被选择和表征。此外,这些细菌还测试了它们通过生物渗透过程从煤灰中恢复镍的潜力。生物无能的效率以确定细菌恢复镍的效力。这项研究的结果表明,成功分离了八种细菌。表征结果表明两种革兰氏阴性菌和两个革兰氏阳性细菌。在八种细菌中,与其他细菌相比,八种细菌中有四种通过良好的生长和更高的镍恢复显示了镍恢复的潜力。这些细菌也可能用于其他金属生物素器过程。
摘要。Siahaan P,Mangais RER,Kolondam B,Tangapo A,Mambu S.2023。metarhizium sp。的遗传多样性。与印度尼西亚北苏拉威西东杜莫加的各种寄主分离。生物多样性24:6888-6896。metarhizium tungus是一种已知杀死许多害虫的昆虫病作用真菌。这意味着metarhizium sp。在生态系统中具有重要的生态作用,尤其是在控制昆虫种群和回收养分方面。研究元族种类的遗传多样性及其与昆虫宿主的关系提供了对害虫管理和研究其分类法的见解。这项研究旨在通过检查其各自的宿主类型来研究metarhizium真菌之间的遗传变异性,该类型可以用作分类学研究,种质保护工作和PEST Management的基本数据。探索结果表明,三种昆虫物种被Metarhizium sp真菌,即Scotinophara coarctata,Nilaparvata Lugens和Recilia recilia tosalis感染。系统发育分析的结果表明,与来自Genbank的四个可比较的牛hiasopliae分离株在同一组中,相似性水平为100%,而lugens和R. redorsalis隔离株与四个metarhizium huainamdanmdanmdanmdanmdanmdanmdanmdanmdanmdanmdanmdanmdangense sellige sellimes sellime sellime sellime sellime sellime sellime sellime sellime sellime sellime sellime sellime sellime sellime sellime sellime sally群。99%和三个分离株的表示相似性98%。分子分析证实,从颈链链球菌分离的元族是弧菌菌种,而从lugens和R. dorsalis分离的元则是m。真菌。Huainamdangense物种。已证明宿主昆虫的差异可以为metarhizium sp提供遗传变异。
抽象目的:壁虱是许多病原体的媒介,引起了致命后果的疾病,从单个tick中检测这种病原体至关重要。分子方法(例如聚合酶链反应(PCR))提供了这种可能性。目前,涉及液氮的繁琐方法,用手术刀切割tick虫以及汇总的tick虫已在全球范围内使用。我们的目标是开发一种可靠且快速的方法,从室温下单滴核酸(DNA/RNA)获得核酸(DNA/RNA),以检测各种病原体。方法:我们开发了一种机械粉碎方法,并从一个字母中的邮政或Currier服务在室温下从单个tick中隔离的微型柱核酸隔离。PCR检测是用于伯氏伯氏菌和tick传播脑炎病毒的例子。结果:该方法已成功地用于从单个壁虱中分离核酸,后来用于在17个单滴水样本上检测B. burgdorferi和Tick传播脑炎病毒,作为示例,但在过去的18年中,该方法用于来自德国的250多个tick虫。光谱值表明在分离过程中存在足够的DNA和RNA的产率(每滴度最高900 µg/ml)。结论:这可能是关于一个单个tick病例的第一份报告,这些报告是在室温下以邮政服务的字母发送的,用于隔离带有迷你柱试剂盒的核酸,后来用于PCR检测各种病原体。这种廉价且简单的方法可以在全球任何实验室中用于监测tick传播病原体的存在。关键字:tick,tick虫病原体,核酸隔离,Borrelia burgdorferi,聚合酶链反应
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越来越高的耐多药 (MDR) 病原体水平迫使人们发现新的生物活性化合物。为此,首次从埃及 Kafr El Sheikh 的黑沙滩分离出两种放线菌菌株,即灰红链霉菌和罗氏链霉菌,该地区是几家大型养鱼场的所在地。通过表型、生化和 16S rRNA 序列协议对分离株进行了鉴定。这两种菌株都对三种严重的 MDR 病原体表现出强大的抗菌活性:枯草芽孢杆菌、肠炎沙门氏菌和铜绿假单胞菌。使用气相色谱-质谱 (GC-MS) 鉴定了分离株滤液的生物活性化合物。对于 S. griseorubens ,可检测到的抗菌化合物是己酸、2-乙基-、2-乙基己基酯、正癸烷、十六烷酸甲酯、苯乙酸、蓖麻油酸和对羟基苯甲酸乙酯,而 S. rochei 则分泌十七烷、2,6-二甲基-、苯乙酸、邻苯二甲酸二丁酯、二十八烷、二十六烷和维生素 A 醛。这些结果强烈鼓励使用这些环保分离物作为生物防治剂,以对抗攻击养鱼场的 MDR 病原体。