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基准生物学方法杂志| 2023 |卷。 10 | e99010003 doi：10.14440/jbm.2023.376基准组件免费纳米孔阅读映射
千足片是将叶子回收到热带生态系统中的土壤中的关键参与者。为了阐明其肠道菌群，我们从波多黎各的不同城市收集了千足虫。在这里，我们的目标是基准哪种方法最适合这个高度复杂的千足型微生物组的元基因组脱脂。我们用牛津纳米孔技术（ONT）奴才序列对肠道DNA进行了测序，然后使用Megan-LR，Kraken2蛋白模式，Kraken2核苷酸模式，GraphMap和MiniMAP2分析了数据，以对这些较长的ONT进行分类。从我们的两个样本中，我们分别获得了87,110和99,749个ONT读数。kraken2核苷酸模式与门和类分类级别的所有其他方法相比，读取最多的读取性，对两个样本中的读取中的75％进行了分类，其他方法未能分配足够的读数，以在类似物稀有曲线中产生分类曲线，以表明它们需要对这些进行分类的较大分类，以使这些曲线分为稀有曲线，以完全进行分类以进行分类。社区的各种方法是多种多样的，所有方法将两个样本中的20-50门分类。使用的读取和门类似于五个基准测试的读数和门的明显重叠。我们的结果表明，Kraken2核苷酸模式是应用这个高度复杂群落的宏基因组学脱脂的最合适工具。
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namria.gov.ph › 04_im_jan95 PDF 1995 年 1 月 15 日 - 1995 年 1 月 15 日发展到菲律宾，同时......在飞机上以数字形式使用高清......平移和旋转对准过程。< /div>
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namria.gov.ph › 04_im_jan95 PDF 1995 年 1 月 15 日 - 1995 年 1 月 15 日发展到菲律宾，同时...在飞机上以数字形式使用高清...转换和旋转对准过程。