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新大陆螺旋蝇（Cochliomyia hominivorax）的染色体级参考基因组
摘要 新大陆螺旋蝇，Cochliomyia hominivorax（丽蝇科），是美国最重要的蝇蛆病致病物种。螺旋蝇蝇蛆病是一种人畜共患病，可导致家畜、驯养和野生动物严重病变，偶尔也会在人类身上发生。除了与该物种相关的卫生问题外，这些感染还会对经济部门产生负面影响，例如养牛业。在这里，我们展示了 C. hominivorax 基因组的染色体级组装，该基因组由 6 条染色体长度和 515 个未放置的支架组成，跨度为 534 Mb。果蝇连锁群 A-E 与染色体级支架之间存在明显的对应关系。染色体商 (CQ) 分析确定了来自 X 染色体的单个支架，该支架包含果蝇第四染色体（连锁群 F 或点染色体）上基因的大多数直系同源物。CQ 分析还确定了潜在的 X 和 Y 未放置支架和基因。通过 PCR 用雄性和雌性 DNA 确认了选定区域的 Y 连锁。一些长染色体级支架包括 Y 连锁序列，表明这些区域组装错误。这些资源将为未来旨在了解这种毁灭性专性寄生虫的生物学和进化的研究提供基础。关键词：Cochliomyia hominivorax、HiC 基因组、染色体组装、丽蝇科、外寄生虫
Shane Denecke
1。Vorgia E.，M。Lamprousi，S。Denecke，K。Vogelsang，S。Geibel等，2021年的功能特征和转录组中的中腹细胞系中的中腹细胞系（Lep-Idoptera：noctuidae）。昆虫生物化学。mol。生物。128：103510。https：//doi.org/10.1016/j.ibmb.2020.103510 2。Swevers L.，S。Denecke，K。Vogelsang，S。Geibel和J. Vontas，2020年，哺乳动物类器官技术可以应用于昆虫肠道吗？害虫管理。SCI。 77：55–63。 https://doi.org/10.1002/ps.6067 3。 DENECKE S.* M.，O。DRIVA，H。N. B. Luong，P。Ioannidis，M。Linka等，2020年，溶质载体超家族在节肢动物中的识别和进化趋势。 基因组生物。 Evol。 12：1429–1439。 https://doi.org/10.1093/gbe/evaa153 4。 Samantsidis G.-R.，R。Panteleri，S。Denecke，S。Kounadi，I。Christou等，2020年，“我无法创造的东西，我不理解”：在功能验证的代谢和目标位点昆虫抗药性的协同作用。 proc。 R. Soc。 B Biol。 SCI。 287：20200838。https：//doi.org/10.1098/rspb.2020.0838 5。 douris V.，S。Denecke，T。VanLeeuwen，C。Bass，R。Nauen等，2020年，使用CRISPR/CAS9基因组修饰来理解杀虫剂耐药性的遗传基础：果蝇及以后。 农药。 生物化学。 生理学。 167。https://doi.org/10.1016/j.pestbp.2020.1045956。 昆虫分子。 生物。 29：363–372。 https://doi.org/10.1111/imb.12640 7。SCI。77：55–63。https://doi.org/10.1002/ps.6067 3。 DENECKE S.* M.，O。DRIVA，H。N. B. Luong，P。Ioannidis，M。Linka等，2020年，溶质载体超家族在节肢动物中的识别和进化趋势。 基因组生物。 Evol。 12：1429–1439。 https://doi.org/10.1093/gbe/evaa153 4。 Samantsidis G.-R.，R。Panteleri，S。Denecke，S。Kounadi，I。Christou等，2020年，“我无法创造的东西，我不理解”：在功能验证的代谢和目标位点昆虫抗药性的协同作用。 proc。 R. Soc。 B Biol。 SCI。 287：20200838。https：//doi.org/10.1098/rspb.2020.0838 5。 douris V.，S。Denecke，T。VanLeeuwen，C。Bass，R。Nauen等，2020年，使用CRISPR/CAS9基因组修饰来理解杀虫剂耐药性的遗传基础：果蝇及以后。 农药。 生物化学。 生理学。 167。https://doi.org/10.1016/j.pestbp.2020.1045956。 昆虫分子。 生物。 29：363–372。 https://doi.org/10.1111/imb.12640 7。https://doi.org/10.1002/ps.6067 3。DENECKE S.* M.，O。DRIVA，H。N. B. Luong，P。Ioannidis，M。Linka等，2020年，溶质载体超家族在节肢动物中的识别和进化趋势。基因组生物。Evol。12：1429–1439。https://doi.org/10.1093/gbe/evaa153 4。Samantsidis G.-R.，R。Panteleri，S。Denecke，S。Kounadi，I。Christou等，2020年，“我无法创造的东西，我不理解”：在功能验证的代谢和目标位点昆虫抗药性的协同作用。proc。R. Soc。 B Biol。 SCI。 287：20200838。https：//doi.org/10.1098/rspb.2020.0838 5。 douris V.，S。Denecke，T。VanLeeuwen，C。Bass，R。Nauen等，2020年，使用CRISPR/CAS9基因组修饰来理解杀虫剂耐药性的遗传基础：果蝇及以后。 农药。 生物化学。 生理学。 167。https://doi.org/10.1016/j.pestbp.2020.1045956。 昆虫分子。 生物。 29：363–372。 https://doi.org/10.1111/imb.12640 7。R. Soc。B Biol。 SCI。 287：20200838。https：//doi.org/10.1098/rspb.2020.0838 5。 douris V.，S。Denecke，T。VanLeeuwen，C。Bass，R。Nauen等，2020年，使用CRISPR/CAS9基因组修饰来理解杀虫剂耐药性的遗传基础：果蝇及以后。 农药。 生物化学。 生理学。 167。https://doi.org/10.1016/j.pestbp.2020.1045956。 昆虫分子。 生物。 29：363–372。 https://doi.org/10.1111/imb.12640 7。B Biol。SCI。 287：20200838。https：//doi.org/10.1098/rspb.2020.0838 5。 douris V.，S。Denecke，T。VanLeeuwen，C。Bass，R。Nauen等，2020年，使用CRISPR/CAS9基因组修饰来理解杀虫剂耐药性的遗传基础：果蝇及以后。 农药。 生物化学。 生理学。 167。https://doi.org/10.1016/j.pestbp.2020.1045956。 昆虫分子。 生物。 29：363–372。 https://doi.org/10.1111/imb.12640 7。SCI。287：20200838。https：//doi.org/10.1098/rspb.2020.0838 5。douris V.，S。Denecke，T。VanLeeuwen，C。Bass，R。Nauen等，2020年，使用CRISPR/CAS9基因组修饰来理解杀虫剂耐药性的遗传基础：果蝇及以后。农药。生物化学。生理学。167。https://doi.org/10.1016/j.pestbp.2020.1045956。昆虫分子。生物。29：363–372。https://doi.org/10.1111/imb.12640 7。Koidou V.，S。Denecke*，P。Ioannidis，I。Vlatakis，I。Livadaras等，2020年，有效的CRISPR/CAS9介导的基因组介导的基因组编辑。denecke s*。，P。ioannidis*，B。Buer，A。Ilias，V。Douris等，2020年，Nezara Viridula（杂翅目：五翅目：pentatomidae）中表达的转录组和蛋白质组学图，Midgut提出了心苯基植物的分类性，并表明了心齿植物的分类。BMC基因组学21：129。https：//doi.org/10.1186/S12864-020-6459-6 8。Riga M.，S。Denecke*，I。Livadaras，S。Geibel，R。Nauen等，2020年，在Nezara viridula中开发有效RNAi，用于杀虫剂靶标。拱门。昆虫生物化学。生理学。103：E21650。 https://doi.org/10.1002/arch.21650 9。 Young H. K.，S。M. Denecke，C。Robin和A. Fournier级，2019年，幼虫暴露于咪二藻中的幼虫会影响果蝇中的成人行为。 J. Evol。 生物。 33：151–164。 https://doi.org/10.1111/jeb.13555 10。 Denecke S*。，L。Swevers，V。Douris和J. Vontas，2018年，口腔杀虫化合物如何穿越昆虫中肠上皮？ 昆虫生物化学。 mol。 生物。 103：22–35。 https://doi.org/10.1016/ j.ibmb.2018.10.005 11。 harrop T. W.r§。，S。Denecke§，Y。T。Yang，J。Chan，P。J。Daborn等，2018，通过果蝇中的线粒体细胞色素P450激活Nitenpyram的证据。 害虫管理。 SCI。 74：1616–1622。 https://doi.org/10.1002/ps.4852 12. 昆虫生物化学。 mol。103：E21650。https://doi.org/10.1002/arch.21650 9。Young H. K.，S。M. Denecke，C。Robin和A. Fournier级，2019年，幼虫暴露于咪二藻中的幼虫会影响果蝇中的成人行为。J. Evol。 生物。 33：151–164。 https://doi.org/10.1111/jeb.13555 10。 Denecke S*。，L。Swevers，V。Douris和J. Vontas，2018年，口腔杀虫化合物如何穿越昆虫中肠上皮？ 昆虫生物化学。 mol。 生物。 103：22–35。 https://doi.org/10.1016/ j.ibmb.2018.10.005 11。 harrop T. W.r§。，S。Denecke§，Y。T。Yang，J。Chan，P。J。Daborn等，2018，通过果蝇中的线粒体细胞色素P450激活Nitenpyram的证据。 害虫管理。 SCI。 74：1616–1622。 https://doi.org/10.1002/ps.4852 12. 昆虫生物化学。 mol。J. Evol。生物。33：151–164。https://doi.org/10.1111/jeb.13555 10。Denecke S*。，L。Swevers，V。Douris和J. Vontas，2018年，口腔杀虫化合物如何穿越昆虫中肠上皮？昆虫生物化学。mol。生物。103：22–35。https://doi.org/10.1016/ j.ibmb.2018.10.005 11。harrop T. W.r§。，S。Denecke§，Y。T。Yang，J。Chan，P。J。Daborn等，2018，通过果蝇中的线粒体细胞色素P450激活Nitenpyram的证据。害虫管理。SCI。 74：1616–1622。 https://doi.org/10.1002/ps.4852 12. 昆虫生物化学。 mol。SCI。74：1616–1622。https://doi.org/10.1002/ps.4852 12. 昆虫生物化学。 mol。https://doi.org/10.1002/ps.4852 12.昆虫生物化学。mol。denecke s。，R。Fusetto和P. Batterham，2017年，使用CRISPR-CAS9敲除果蝇Melanogaster ABC转运蛋白在杀虫剂生物学中的作用。生物。91：1-9。 https://doi.org/10.1016/j.ibmb.2017.09.017 13。 DeNecke S.，R。Fusetto，F。Martelli，A。Giang，P。Battlay等，2017，2017年多个P450和神经元基因的变化，这是对果蝇大众群中对杀虫剂咪二酸的反应。 SCI。 Rep。7：11338。https：//doi.org/10.1038/S41598-017-11092-5 14。 Fusetto R.，S。Denecke，T。Perry，R。A。J. O'Hair和P. Batterham，2017年，将CYP6G1和肠道微生物在果蝇中杀虫剂咪二氯吡啶的代谢中的作用分开。 SCI。 Rep。7：11339。https：//doi.org/10.1038/S41598-017-09800-2 15。 DeNecke S.，C。J. Nowell，A。Fournier级，T。Perry和P. Batterham，2015年Wiggle索引：一种开源生物测定，用于评估果蝇中果蝇中的亚致死性杀虫剂反应。 PLOS ONE 10：E0145051。 https://doi.org/10.1371/journal.pone.014505191：1-9。https://doi.org/10.1016/j.ibmb.2017.09.017 13。DeNecke S.，R。Fusetto，F。Martelli，A。Giang，P。Battlay等，2017，2017年多个P450和神经元基因的变化，这是对果蝇大众群中对杀虫剂咪二酸的反应。SCI。 Rep。7：11338。https：//doi.org/10.1038/S41598-017-11092-5 14。 Fusetto R.，S。Denecke，T。Perry，R。A。J. O'Hair和P. Batterham，2017年，将CYP6G1和肠道微生物在果蝇中杀虫剂咪二氯吡啶的代谢中的作用分开。 SCI。 Rep。7：11339。https：//doi.org/10.1038/S41598-017-09800-2 15。 DeNecke S.，C。J. Nowell，A。Fournier级，T。Perry和P. Batterham，2015年Wiggle索引：一种开源生物测定，用于评估果蝇中果蝇中的亚致死性杀虫剂反应。 PLOS ONE 10：E0145051。 https://doi.org/10.1371/journal.pone.0145051SCI。Rep。7：11338。https：//doi.org/10.1038/S41598-017-11092-5 14。 Fusetto R.，S。Denecke，T。Perry，R。A。J. O'Hair和P. Batterham，2017年，将CYP6G1和肠道微生物在果蝇中杀虫剂咪二氯吡啶的代谢中的作用分开。 SCI。 Rep。7：11339。https：//doi.org/10.1038/S41598-017-09800-2 15。 DeNecke S.，C。J. Nowell，A。Fournier级，T。Perry和P. Batterham，2015年Wiggle索引：一种开源生物测定，用于评估果蝇中果蝇中的亚致死性杀虫剂反应。 PLOS ONE 10：E0145051。 https://doi.org/10.1371/journal.pone.0145051Rep。7：11338。https：//doi.org/10.1038/S41598-017-11092-5 14。Fusetto R.，S。Denecke，T。Perry，R。A。J. O'Hair和P. Batterham，2017年，将CYP6G1和肠道微生物在果蝇中杀虫剂咪二氯吡啶的代谢中的作用分开。SCI。 Rep。7：11339。https：//doi.org/10.1038/S41598-017-09800-2 15。 DeNecke S.，C。J. Nowell，A。Fournier级，T。Perry和P. Batterham，2015年Wiggle索引：一种开源生物测定，用于评估果蝇中果蝇中的亚致死性杀虫剂反应。 PLOS ONE 10：E0145051。 https://doi.org/10.1371/journal.pone.0145051SCI。Rep。7：11339。https：//doi.org/10.1038/S41598-017-09800-2 15。 DeNecke S.，C。J. Nowell，A。Fournier级，T。Perry和P. Batterham，2015年Wiggle索引：一种开源生物测定，用于评估果蝇中果蝇中的亚致死性杀虫剂反应。 PLOS ONE 10：E0145051。 https://doi.org/10.1371/journal.pone.0145051Rep。7：11339。https：//doi.org/10.1038/S41598-017-09800-2 15。DeNecke S.，C。J. Nowell，A。Fournier级，T。Perry和P. Batterham，2015年Wiggle索引：一种开源生物测定，用于评估果蝇中果蝇中的亚致死性杀虫剂反应。PLOS ONE 10：E0145051。https://doi.org/10.1371/journal.pone.0145051
Kim，Y.1，静脉，M.2，Kim，j.2,3 想象，设计和解释实验
b [a] p是由有机物（例如燃料和香烟）的燃烧制成的。它通常在空气污染中发现，并且已知会引起癌症。b [a] p对生物体的微生物群的影响尚不清楚。，我们用7天的饮食饮食治疗了两种B剂量的果蝇（果蝇Melanogaster），并以适当的媒介物和阴性对照处理。然后，我们从果蝇中提取了总DNA，并测序了16S基因的V4区域。我们发现，与雄性相比，B [A] P暴露后，雌性蝇的微生物群变得更加多样化。此外，我们还观察到，在媒介物控制中，Providencia的丰度（一种致病细菌的属）增加，在暴露条件下减少。
非哺乳动物模型的脑损伤模型的最新见解
创伤性脑损伤（TBI）是全球主要的健康问题，越来越多地被认为是包括阿尔茨海默氏病（AD）和慢性创伤性脑病（CTE）在内的神经退行性疾病的危险因素。重复TBI（RTBI）通常在接触运动，兵役和亲密伴侣暴力（IPV）中观察到，对长期后遗症构成了重大风险。为了研究TBI和RTBI的长期后果，研究人员通常使用哺乳动物模型来概括脑损伤和神经退行性表型。然而，这些模型有几个局限性，包括：（1）长期观察期，（2）高成本，（3）关于大量哺乳动物的长时间和重复伤害的遗传操作困难和（4）（4）（4）道德问题。水生脊椎动物模型有机体，包括petromyzon Marinus（海lampreys），斑马鱼（Danio Rerio）和无脊椎动物，Caenorhabditis elegrans（C. exkelelans）和Drosophila Melanogaster（果蝇）（Drosophila Melanogaster（Drosophilla）），都是有价值的工具，可作为调查机械和r. r. r. r. r.s rytbi的工具。这些非哺乳动物模型提供了独特的优势，包括遗传障碍性，简单的神经系统，成本效益以及基于发现的快速方法和用于治疗剂的高通量筛选，从而促进了RTBI诱导的神经变性的研究和与TAU相关的病理学。在这里，我们探讨了非掌管和水生脊椎动物模型的使用来研究TBI和神经变性。果蝇特别提供了一个机会，可以探索轻度RTBI及其对内源性tau的纵向影响，从而对RTBI，Tauopathy和NeuroDegeneration之间的复杂相互作用提供了宝贵的见解。这些模型为机械研究和治疗干预提供了一个平台，最终促进了我们对与RTBI相关的长期后果以及潜在的干预途径的理解。
在无脊椎动物中构建和整合神经系统功能的大脑图
抽象的选择和执行适合上下文的行为是由整个大脑中神经回路的综合作用控制的。然而，如何在大脑区域进行活动如何协调，以及神经系统结构如何这些功能相互作用，仍然是开放的问题。最近的技术进步使得构建神经系统结构和功能的大脑范围图，例如大脑活动图，连接组和细胞地图集是可行的。在这里，我们回顾了该领域的最新进展，重点是秀丽隐杆线虫和D. Melanogaster，因为最近的工作已经产生了这些神经系统的全球地图。我们还描述了在特定网络的研究中阐明的神经回路基序，这些神经基序突出了必须捕获的复杂性，以构建全脑功能的准确模型。
最小侵入性3D激光印刷有机体中的微植物
＃同等贡献 *共同贡献的作者（eva.blasco@oci.uni.uni-heidelberg.de和jochen.wittbrodt@cos.uni- Heidelberg.de）隶属关系1隶属关系1）1. Hbigs，海德堡，德国。3 Heika研究生院“功能材料”，德国海德堡。4分子系统工程和高级材料研究所（IMSEAM），海德堡大学，德国海德堡69120。5海德堡大学海德堡大学的有机化学研究所（OCI），德国海德堡69120。6ZentrumFürMolekulareBiologie derUniversitätHeidelberg（ZmbH），海德堡大学，海德堡大学，69120德国海德堡，7 Max Planck医学研究所，69120 Heidelberg，Heidelberg，德国Heidelberg，Dermany 8 8 Hohenheim，Manufitiation of Manductiation，70059，Stuttgart，Stutgart，3岁，激光印刷，两光刻岩石刻板，微植物，生物工程，oryzias latipes，果蝇Melanogaster
果蝇染色体 DNA 复制机制
真核生物染色体中的遗传信息包含在一个双链 DNA 分子中，这一令人欣喜的概念得到了最近对果蝇 (1) 和酵母 (2, 3) 的实验的支持。鉴于这种分子连续性，复制染色体中遗传顺序的问题就简化为复制单个长 DNA 分子的问题，对于果蝇 (Drosophila melanogaster) 来说，该 DNA 分子的最大长度约为 2.1 厘米，即 62,000 kb [参考文献 1；kb（千碱基）是长度单位，等于单链或双链核酸中的 1000 个碱基或碱基对]。我们通过电子显微镜检查快速分裂的裂解核中的 DNA，研究了果蝇中的这种复制问题。在 240 ℃ 时，裂解核每 9.6 分钟分裂一次，中间期只有 3.4 分钟 (4)，在此期间每个染色体 DNA 分子都必须复制。因此，最大染色体中 DNA 的分子复制速率应等于或大于 18,000 kb/min（分子）。由于动物染色体中 DNA 复制叉的移动速率上限估计约为 3 kb/min（复制叉）（5、6），我们预计这种快速的分子复制将需要每个分子 6000 个或更多复制叉的协同作用，或每 10 kb DNA 至少需要一个复制叉。正是这种预期让我们看到了通过电子显微镜观察确定真核染色体 DNA 中复制叉的结构和分布的希望。在本文中，我们表明这种希望已经实现。果蝇卵裂核的 DNA 呈连续排列
蚂蚁社交行为的萌芽神经科学
蚂蚁生理学是由1亿年的社会发展来制作的。蚂蚁执行许多复杂的社会和集体行为，但在示意图和规模上与果蝇果蝇Melanogaster（一种流行的单独模型有机体）相似。蚂蚁是有吸引力的互补受试者，以研究与果蝇中没有的复杂社会行为有关的适应。尽管对蚂蚁行为的研究兴趣和社会性的神经生物学基础，但我们对蚂蚁神经系统的理解是不完整的。最近的技术进步已经以较少依赖模型选择的方式对神经系统进行了尖端调查，为机械社会昆虫神经科学打开了大门。在这篇综述中，我们重新审视了有关蚂蚁神经系统和行为的重要方面，我们期待蚂蚁的功能性电路神经科学如何帮助我们了解如何区分孤独动物与高度社交动物。
Charalambos Savakis，医学博士PhD
minos是果蝇海德（Drosophila Hydei）的TC 1型型2型转座元件，在克里特郡IMBB的Savakis实验室中发现。我小组的工作表明，MINOS可以在各种无脊椎动物，人培养细胞以及小鼠体细胞和生殖线细胞中转置。minos-主要的农业害虫塞拉蒂炎，ceratitis ceratiso ceratitis介导的生殖系转化，是转座子介导的果蝇和米诺斯以外的昆虫中转座介导的转基因的首次演示，用于转化蚊子蚊子和橄榄蝇菌（DACUS）。Minos基于果蝇中基于果蝇中的插入诱变现在被确定为该模型生物体中基因组功能分析的重要工具。
果蝇先天免疫中的效应子特异性和功能
过去五年来，我们对果蝇先天免疫的理解取得了重大进展，这得益于两项变革性技术——基因组编辑和全基因组关联研究——以及从感染后病原体生长和宿主存活的平行研究中获得的见解。因此，研究人员已经鉴定出新的和必要的效应物，改写了抗菌肽的个体和集体作用，并确定了随机变异和持续感染是微生物感染的共同特征。我们在此重点关注果蝇对细菌或真菌病原体的可诱导无细胞反应。鼓励对其他昆虫的先天免疫、肠道和其他器官的防御、细胞免疫或抗病毒机制感兴趣的读者查阅有关这些主题的最新评论 [ 1 – 6 ]。