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World File Search Systemmetagenomics
混合学：OMICS数据集成项目
描述多元方法非常适合大型幻象数据集，其中变量数（例如基因，蛋白质，代谢产物）比样品数量（含量，细胞，小鼠）大得多。它们具有通过使用仪器变量（组件）来降低数据尺寸的吸引力，这些变量定义为所有变量的组合。这些组件随后用于生成有用的图形外，从而可以更好地理解整合的不同数据集之间的关系和相关结构。Mixomics提供了多种多种方法，用于探索和整合生物数据集，并在可变选择上具有特定的fosus。包装提出了几种稀疏的多变量模型，我们已经确定了高度相关的关键变量和/或解释感兴趣的生物学外。可以用混合学分析的数据可能来自高渗透测序技术，例如OMICS数据（转录组学，代谢组学，Promics，temomics，Metagenomics等），但也超出了Omics领域（例如光谱想象）。混合组学中实施的方法还可以处理缺失的值，而无需删除整个行中缺少数据的行。一种非详尽的方法列表包括多种广义规范相关分析，稀疏的部分最小二乘和稀疏分析分析。最近，我们实施了集成方法来结合多PLE数据集：N-N-Integration与广义规范相关分析的变体和P-集成与多组部分最小二乘的变体的变体。
确保人工智能的碳中性未来
病原体和呼吸道中正常菌群的影响是问题，缺乏或无法获得病原体测试也是一个重要原因。近年来，分子诊断的进展，尤其是基于聚生物酶链反应（PCR）技术，临床宏基因组学，群集定期间隔短的短质体重复序列（CRISPR）和Matrix辅助激光质量质量质量的诸如多生物酶链反应（PCR）技术，临床宏基因组学（PCR）技术，临床上的短质重复序列（MALDICLY）（MALD-MALDICLY），诸如分子诊断的进展，尤其是新的方法，例如多种体生物链反应（PCR）技术，临床上的短质体重复序列（CRISPR）和MATRIX辅助激光质量群体，改善了呼吸道感染的病原体检测能力。以基于多重PCR技术为例的GenExpert检测方法，它改善了活性结核病的诊断，其对利福平 - 静脉肺结核的敏感性和特异性分别为92％和98％。2-
肠道微生物的生物多样性在非洲cat鱼中
摘要。本文研究了在水产养殖条件下饲养的年轻和成人carlias gariepinus的肠道微生物组。基因组DNA是从大肠的大肠中分离出来的。该研究是使用16S宏基因组学方案进行的，并在Illumina Miseq上测序了库池。微生物群的特征是一组多种有氧和厌氧菌，其定性和定量组成对每个人来说都是个性化的。年轻cat鱼的微生物群主要由机会性革兰氏阴性细菌和革兰氏阴性厌氧菌细菌组成。在成年cat鱼中，较高的生物多样性和链球菌属的机会性革兰氏阳性细菌的出现被揭示出来。痤疮丙酸丙酸杆菌的物种也很常见。研究结果表明，随着时间的推移，carlias clarias gariepinus的肠道微生物组的多样性会增加。
DHR 项目 - 乔尔哈特
组学技术彻底改变了我们对人类健康和疾病的认识。印度东北地区 (NER) 在生物医学研究方面拥有巨大的潜力，但其医学院和生物医学研究人员缺乏必要的研发知识、技能，以及现代组学技术和工具方面的设施和专业知识，限制了 NER 应对关键健康和疾病挑战的能力。这个特定领域的实践培训计划旨在培养、提升和装备从事生物医学研究的 NER 卫生研究人员、医学院、科学家和年轻研究人员，使他们具备基因组学、宏基因组学和转录组学技术以及生物信息学工具的知识和技能。通过专家指导和先进的基因组学基础设施，该计划将推动转型步伐，促进 NER 地区医疗保健研究和实践中的基因组医学。
云，空气中微生物的绿洲
细菌细胞和真菌孢子可以在大气中雾化并悬浮几天，暴露于水的限制，氧化和缺乏营养素。使用比较宏基因组学/metatranscriptomics，我们表明云与20种空气中微生物（包括真菌孢子发芽）的20种代谢功能的激活相关。整个现象反映了通过雨水重新吹干土壤中微生物活性的快速恢复，称为“桦木效应”。云滴中的营养资源不足会导致饥荒，使细胞结构可以减轻。云中微生物的代谢活性恢复可能有利于沉积后的表面侵袭，但在云蒸发后也可能有25次妥协进一步的生存。在任何情况下，云都显示为浮动生物活性水生系统。
使用细菌代谢物作为免疫调节剂的挑战和局限性
利用细菌代谢物的免疫调节潜力为治疗各种免疫相关疾病的令人兴奋的可能性。但是，将这种潜力变成现实带来了重大挑战。本综述调查了这些挑战，重点是发现，生产，表征，稳定，配方，安全性和个人可变性限制。强调了许多代谢产物的有限生物利用度以及潜在的改进以及脱靶效应的潜力和精确靶向的重要性。此外，研究了肠道细菌代谢物与微生物组之间的复杂相互作用，强调了个性化方法的重要性。我们通过讨论宏基因组学，代谢组学，合成生物学和靶向递送系统的有希望的进步来结束，这对克服这些局限性并为细菌代谢物作为有效免疫调节剂的临床翻译铺平了希望。
亲爱的肯尼迪家庭
Mark Prainito - Mercenaria Mercenaria和Crassostrea virginica幼虫对海洋酸化和联谷二烷多氯泳的毒性的行为反应：对ULVA SPP疗效的新评估。在缓解长岛水中威胁双围幼虫的压力时 - 散焦对对比检测的影响及其对近视开发和预防的影响Jayden Simon的影响 - 对新型微生物的全面分析 - 利用与微生物的相互作用的相互作用的效果 - 用于确定Masson Tso的效果 - Masso note and Massos tone的影响 - 3D打印的磁力计眼镜，我们还要祝贺我们的科学研究老师Barbi Frank女士和Ryan Gendels先生以及科学主席Robert Soel先生。- 散焦对对比检测的影响及其对近视开发和预防的影响Jayden Simon的影响 - 对新型微生物的全面分析 - 利用与微生物的相互作用的相互作用的效果 - 用于确定Masson Tso的效果 - Masso note and Massos tone的影响 - 3D打印的磁力计眼镜，我们还要祝贺我们的科学研究老师Barbi Frank女士和Ryan Gendels先生以及科学主席Robert Soel先生。
特刊 - 卤素微生物，第三版
卤素是适合生活在高盐环境和其他盐水产品中的微生物。它们中的大多数属于细菌和古细菌领域，它们的兴趣既有特殊的相关性，既是其对极端条件的适应机制及其潜在的生物技术应用。近年来，卤素的隔离和分类表征使我们能够详细了解它们的异质性，其代谢和生理多样性，或生态分布和生物多样性。与文化无关的技术，例如宏基因组学和 - 学研究，特别是在这方面提供了激励这些研究，因为在这方面仍然有一个巨大的领域要探索。在本期的微生物特刊中，邀请您发送有关生物学，分类法，生物多样性和生物技术的贡献（原始文章和评论），这些生物学微生物的应用以及使用基因组学和化合物方法研究微生物社区的方法。
o r i g i n a l r e s a r c h thuyang tongbian汤剂在治疗功能便秘中的治疗机制：试点研究的见解
目的：通过观察其对肠道菌群组成的作用，肠道菌群的代谢功能，粪便短链脂肪酸（SCFA）水平和血清浓度TLR4，NF- - ，TLR4，TNF-κB，目的：探索朱正·汤比汤（ZTD）在治疗功能便秘（FC）中的机制。 FC。 患者和方法：40例FC患者被随机分为对照组和治疗组，每组20例。 在同一时期招募了和20名健康志愿者。 对照组给予乳乳糖，而治疗组则用ZTD处理。 16S RNA测序技术用于比较治疗前后患者肠道菌群的结构和多样性的变化。 分析了血清中粪便中SCFA水平的变化以及TLR4，NF-κB，TNF-α和IL-6的水平。 宏基因组学测序评估的微生物群代谢功能。 结果：治疗组显示有益细菌的相对丰度显着增加，包括双歧杆菌，乳酸杆菌和粪便核酸杆菌_prausnitzii（p <0.05），而desulfobacterota和desulfobacterota和ruminococcus显着降低（p <0.05）。 值得注意的是，治疗组的粪便和丙酸水平明显更高（p <0.05）。 血清生物标志物TLR4，NF-κB，TNF-α和IL-6显着降低（P <0.05）。 宏基因组测序表明，碳水化合物的代谢，辅因子和维生素的代谢以及C5分支的二丁二酸代谢代谢的功能丰度显着增加（p <0.05）。目的：探索朱正·汤比汤（ZTD）在治疗功能便秘（FC）中的机制。 FC。患者和方法：40例FC患者被随机分为对照组和治疗组，每组20例。和20名健康志愿者。对照组给予乳乳糖，而治疗组则用ZTD处理。16S RNA测序技术用于比较治疗前后患者肠道菌群的结构和多样性的变化。分析了血清中粪便中SCFA水平的变化以及TLR4，NF-κB，TNF-α和IL-6的水平。宏基因组学测序评估的微生物群代谢功能。结果：治疗组显示有益细菌的相对丰度显着增加，包括双歧杆菌，乳酸杆菌和粪便核酸杆菌_prausnitzii（p <0.05），而desulfobacterota和desulfobacterota和ruminococcus显着降低（p <0.05）。值得注意的是，治疗组的粪便和丙酸水平明显更高（p <0.05）。血清生物标志物TLR4，NF-κB，TNF-α和IL-6显着降低（P <0.05）。宏基因组测序表明，碳水化合物的代谢，辅因子和维生素的代谢以及C5分支的二丁二酸代谢代谢的功能丰度显着增加（p <0.05）。结论：ZTD明显改善了肠道菌群组成和肠道菌群代谢功能，调节SCFA水平，并减少FC患者的炎症标记。菌株Faecalibacterium_prausnitzii在调节肠道炎症方面显示出显着的潜力，并且可能在ZTD对FC的治疗功效中起关键作用。关键字：朱阳汤比汤，功能便秘，肠道菌群，代谢物，肠炎