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人类脑皮质的遗传异常神经元的围产期减少
抽象的长读测序技术（例如牛津纳米孔（ONT））可直接检测DNA碱基修饰。虽然已经开发了几种工具和模型来鉴定纳米孔数据中的DNA甲基化，但它们通常仅限于5-甲基胞嘧啶（5MC）和较老的流循环（FC）化学。新模型的性能和准确性，包括由ONT开发的模型，尤其是对于他们的新FC化学（R10.4.1）和采样率（5KHz）而言。在这里，使用多种细菌和人类数据集，我们系统地评估了5MC（CPG和非CPG环境），6-甲基二氨酸和4-甲基环霉素的现有甲基化模型的性能。我们还展示了其他参数的效果，例如测序深度，读取质量，基本模式，更重要的是，相邻DNA修饰的存在。因此，我们的工作为利用纳米孔测序研究DNA修饰的研究人员提供了重要信息，并在当前一代甲基化检测模型中突出显示了空隙。
157fm.7静脉脉冲甲基泼尼松龙输注……
风湿病学 适应症/给药途径：甲基强的松龙用于治疗需要立即进行免疫抑制的严重炎症（风湿性/自身免疫性）疾病。甲基强的松龙通过静脉输注给药，剂量为 500 毫克 - 1 克。给药频率和持续时间取决于适应症。大剂量应在至少 30 分钟内给药。有关静脉给药的信息，请参阅成人和儿科注射剂指南 入院前检查：禁忌症包括：• 活动性消化性溃疡 • 活动性感染（尿路感染（UTI）、皮肤溃疡等） • 未控制的心力衰竭 • 既往类固醇精神病 • 未控制的糖尿病 • 基线观察：血压（BP）、脉搏、血氧饱和度（O 2 sats）、呼吸
用酒精和聚己二甲基二圭酰胺与Tris-EDTA作为狗术前术前皮肤制备的葡萄糖和聚己二甲基二圭酰葡萄糖的比较评估
1。伴侣动物临床科学系，兽医学院兽医学院研究生，泰国曼谷10900年兽医学院； 2。泰国曼谷10900年兽医学院微生物和免疫学系； 3。泰国曼谷10900年兽医学院药理学系； 4。 泰国曼谷市Kasetsart University农业学院动物科学系； 5。 拉贾曼加拉技术大学托恩 - 托恩 - 2010年，泰国的兽医学院； 6。 伴侣动物临床科学系，兽医学院，卡塞萨特大学兽医学院，曼谷10900，泰国。 Corresponding author: Taksaon Duangurai, e-mail: taksaon.du@ku.th Co-authors: NB: nithida.bw@gmail.com, CY: fvetcny@ku.ac.th, PU: fvetpys@ku.ac.th, SK: saroch.k@ku.th, SS: somchai_so@rmutto.ac.th, NT: ajnaris@yahoo.com收到：29-07-2024，接受：04-10-2024，在线发布：05-11-2024泰国曼谷10900年兽医学院药理学系； 4。泰国曼谷市Kasetsart University农业学院动物科学系； 5。 拉贾曼加拉技术大学托恩 - 托恩 - 2010年，泰国的兽医学院； 6。 伴侣动物临床科学系，兽医学院，卡塞萨特大学兽医学院，曼谷10900，泰国。 Corresponding author: Taksaon Duangurai, e-mail: taksaon.du@ku.th Co-authors: NB: nithida.bw@gmail.com, CY: fvetcny@ku.ac.th, PU: fvetpys@ku.ac.th, SK: saroch.k@ku.th, SS: somchai_so@rmutto.ac.th, NT: ajnaris@yahoo.com收到：29-07-2024，接受：04-10-2024，在线发布：05-11-2024泰国曼谷市Kasetsart University农业学院动物科学系； 5。拉贾曼加拉技术大学托恩 - 托恩 - 2010年，泰国的兽医学院； 6。伴侣动物临床科学系，兽医学院，卡塞萨特大学兽医学院，曼谷10900，泰国。Corresponding author: Taksaon Duangurai, e-mail: taksaon.du@ku.th Co-authors: NB: nithida.bw@gmail.com, CY: fvetcny@ku.ac.th, PU: fvetpys@ku.ac.th, SK: saroch.k@ku.th, SS: somchai_so@rmutto.ac.th, NT: ajnaris@yahoo.com收到：29-07-2024，接受：04-10-2024，在线发布：05-11-2024
DNA甲基化在退出幼稚多能性过程中塑造了多梳景观
在哺乳动物中，5-甲基胞嘧啶 (5mC) 和多梳抑制复合物 2 (PRC2) 沉积的组蛋白 3 赖氨酸 27 三甲基化 (H3K27me3) 在富含 CpG 的区域通常是互斥的。当小鼠胚胎干细胞退出幼稚多能状态时，5mC 大量增加，同时 H3K27me3 被限制在无 5mC 的富含 CpG 的区域。为了正式评估 5mC 如何塑造 H3K27me3 景观，我们在存在和不存在 DNA 甲基化机制的情况下分析了幼稚细胞和分化细胞的表观基因组。令人惊讶的是，我们发现 5mC 积累并不是限制大多数 H3K27me3 域所必需的。相反，这种不依赖 5mC 的 H3K27me3 限制是由 PRC2 拮抗剂 Ezhip（编码 EZH 抑制蛋白）的异常表达介导的。在 5mC 似乎真正取代 H3K27me3 的区域子集中，我们确定了 163 个候选基因，这些基因似乎需要 5mC 沉积和/或 H3K27me3 耗竭才能在分化细胞中激活。使用定点表观基因组编辑直接调节 5mC 水平，我们证明 5mC 沉积足以拮抗 H3K27me3 沉积并赋予单个候选基因基因激活。总之，我们系统地测量了重现早期胚胎动力学的系统中 5mC 和 H3K27me3 之间的拮抗相互作用。我们的结果表明 H3K27me3 抑制直接和间接地依赖于 5mC。我们的研究还表明 5mC 在基因激活中发挥着非规范作用，这不仅对正常发育很重要，而且对癌症进展也很重要，因为致癌细胞经常表现出 5mC 与 H3K27me3 的动态替换，反之亦然。
与牛津纳米孔测序和甲基化诱导的误差的降低的准确细菌爆发
我们的研究调查了牛津纳米孔技术的有效性，通过重新陈述33个长达3年的克雷伯氏菌肺炎爆发的33个分离株，并以Illumina的短阅读测序数据作为参考点。我们通过对牛津纳米孔技术测序的基因组进行CGMLST和系统发育分析检测到相当大的基本误差，从而导致从暴发群集中错误排除某些与暴发有关的菌株。附近的甲基化位点会导致这些误差，也可以在肺炎K. k. tneumoniae以外的其他物种中找到。基于这些数据，我们探讨了基于PCR的测序和掩盖策略，这些策略既成功解决这些不准确性，又可以确保准确的爆发追踪。我们将掩盖策略作为生物信息学工作流（MPOA），以无参考的方式识别和掩盖有问题的基因组位置。我们的研究强调了使用牛津纳米孔技术对原核生物进行测序的局限性，尤其是用于研究暴发。对于牛津纳米孔技术无法等待进一步的技术发展的时间关键项目，我们的研究建议我们基于PCR的测序或使用我们提供的生物信息学工作流。我们建议在发布结果时应提供基于质量的基因组质量基因组。
（羧甲基）聚氨酯的页岩膨胀抑制性能...
摘要 钻探油气井过程中最重要的挑战之一是处理页岩地层和随后的页岩膨胀。在本研究中，我们利用羧甲基三甲基氯化铵 (CTAC) 来抑制页岩膨胀，代表了这种特殊阳离子表面活性剂的一种新应用。我们进行了几项实验来评估 CTAC 在防止页岩膨胀方面的有效性并深入了解其潜在机制。此外，根据结果，CTAC 在低浓度下非常有效，可以与其他常见添加剂一起使用。此外，在膨润土混合物中存在 1 wt.% 的 CTAC、十六烷基三甲基溴化铵 (CTAB) 和氯化钾 (KCl) 时，接触角分别为 77°、75° 和 38°。此外，通过添加 CTAB，简单和完全钻井泥浆中的总页岩回收率分别增加了 5.53% 和 0.94%。同时，在CTAC存在下，增幅分别为12.37%和6.43%。此外，在完整钻井泥浆中加入CTAC和CTAB分别使膨胀减少了9.94%和4.2%。最后，对比研究表明，CTAC作为一种新型抑制剂的效果优于CTAB和KCl作为常规抑制剂。
DNA甲基转移酶DNMT3A的作用机制研究
摘要................................................................................................................................. 8
血浆游离 DNA 中的 5-羟甲基胞嘧啶测序可识别出对雄激素依赖性前列腺癌患者的独特表观基因组特征
血浆游离 DNA 中的 5-羟甲基胞嘧啶测序可识别对雄激素剥夺疗法有耐药性的前列腺癌患者的独特表观基因组特征 李千霞 1,2,* 、黄江青 3,* 、黄沙恩 4 、田一军 1 、黄金勇 1 、Amirreza Bitaraf 1 、董晓伟 3 、Marja T. Nevalanen 5 、Manishkumar Patel 1 、Jodie Wong 1 、张劲松 6 、Brandon J. Manley 6 、Jong Y. Park 7 、Manish Kohli 8 、Elizabeth M. Gore 9 、Deepak Kilari 10,+ 、王亮 1,+ 1. 美国佛罗里达州坦帕市 H. Lee Moffitt 癌症中心和研究中心肿瘤微环境及转移系 2. 华中科技大学同济医院肿瘤科武汉科技大学 3. 美国威斯康星州密尔沃基威斯康星大学 Joseph J. Zilber 公共卫生学院生物统计学系 4. 美国威斯康星州麦迪逊威斯康星大学生物统计学系 5. 美国费城托马斯杰斐逊大学 Sidney Kimmel 癌症中心药理学、生理学和癌症生物学系 6. 美国佛罗里达州坦帕 H. Lee Moffitt 癌症中心和研究所泌尿生殖肿瘤学系 7. 美国佛罗里达州坦帕 H. Lee Moffitt 癌症中心和研究所癌症流行病学系 8. 美国犹他州盐湖城犹他大学亨茨曼癌症中心内科系肿瘤学分部 9. 美国威斯康星州密尔沃基威斯康星医学院放射肿瘤学系 10. 美国威斯康星州密尔沃基威斯康星医学院肿瘤学分部 * 同等贡献(QL 和 CC.H.) + 通讯作者 Liang Wang，医学博士，哲学博士 肿瘤微环境和转移系 莫菲特癌症中心 12902 USF Magnolia Drive Tampa, FL 33612, USA 电子邮件：liang.wang@moffitt.org Deepak Kilari，医学博士 威斯康星医学院肿瘤学系 9200 W. Wisconsin Ave Milwaukee, WI 53226, USA 电子邮件：dkilari@mcw.edu 标题：cfDNA 中的 5hmC 特征可预测对 ADT 的早期耐药性
STAT6融合和基因组范围的DNA甲基化分析
全基因组DNA甲基化分析（n = 80）和靶向TERT促进突变测试（n = 98）。使用NAB2 :: STAT6融合状态（n = 101案例; 51 = ex5-7 :: ex16-17，26 = ex4 :: ex4 :: ex2-3; 12 = ex2-3 :: ex2-3 :: ex2-3 :: ex2-3 :: Ex2-3 :: extany/extany/of fusion and 12 = no fusion）检查的关联。 nab2 :: STAT6融合断点（融合类型）与无转移的表面（MFS）显着相关（P = 0.03），并且在调整级别的CNS时，在多元分析中，疾病特异性生存（DSS）（p = 0.03）。 DNA甲基化分析显示了三个不同的簇：群集1（n = 38），群集2（n = 22）和簇3（n = 20）。 甲基化簇与融合类型（p <0.001）显着相关，其中2个集群携带EX4 :: EX2-3 16中的Ex2-3融合（属于20; 80.0％），几乎所有TERT启动子突变（8; 87.5％），以及主要的“ SFT”“ SFT”“ SFT”“ SFT”组织学现象（15 of 22 of 22; 68.68.68.68.2％）。 簇1和3的区别较小，均由具有EX5-7 :: EX16-17融合的肿瘤（分别为33; 75.8％的25个； 75.8％和12个; 66.7％）和可变的组织学表型。 甲基化簇与MFS显着相关（p = 0.027），但总体存活率（OS）无关。 总而言之，NAB2 :: STAT6融合类型与MFS和DSS显着相关，这表明具有EX5 :: EX16-17融合的肿瘤可能具有较低的患者结局。 甲基化簇与融合类型，TERT启动子的状态，组织学表型和MF显着相关。的关联。nab2 :: STAT6融合断点（融合类型）与无转移的表面（MFS）显着相关（P = 0.03），并且在调整级别的CNS时，在多元分析中，疾病特异性生存（DSS）（p = 0.03）。DNA甲基化分析显示了三个不同的簇：群集1（n = 38），群集2（n = 22）和簇3（n = 20）。甲基化簇与融合类型（p <0.001）显着相关，其中2个集群携带EX4 :: EX2-3 16中的Ex2-3融合（属于20; 80.0％），几乎所有TERT启动子突变（8; 87.5％），以及主要的“ SFT”“ SFT”“ SFT”“ SFT”组织学现象（15 of 22 of 22; 68.68.68.68.2％）。簇1和3的区别较小，均由具有EX5-7 :: EX16-17融合的肿瘤（分别为33; 75.8％的25个； 75.8％和12个; 66.7％）和可变的组织学表型。甲基化簇与MFS显着相关（p = 0.027），但总体存活率（OS）无关。总而言之，NAB2 :: STAT6融合类型与MFS和DSS显着相关，这表明具有EX5 :: EX16-17融合的肿瘤可能具有较低的患者结局。甲基化簇与融合类型，TERT启动子的状态，组织学表型和MF显着相关。
基于淀粉，羧甲基纤维素，亚甲基 - 双酰胺及其施用的水凝胶制备
摘要 - 该文章提供了有关淀粉，羧基甲基纤维素，甲基双酰亚胺的信息，以及根据它们及其应用制造高弹性水凝胶的技术。使用文献给出了有关水凝胶研究水平的简要信息。根据百分比研究了水凝胶，淀粉和羧基甲基纤维素的合成过程，并在MG中表达水凝胶的肿胀，并在ML中表达了吸水。IR光谱，热分析，热重法，罗马光谱和水凝胶的SEM分析并分析。简单地说，10克水凝胶最多可容纳2.5-4升水。正确使用时，水凝胶可以为大多数农作物节省20-40％的灌溉水。最后，总结了水凝胶在农业植物中的重要性。