“ Cell2Fate是一种创新的工具,因为它深入研究了细胞成熟的时间特异性阶段的复杂性,并且在之前尚未实现。较旧的模型倾向于过度简化细胞轨迹的过程,因此,我们很高兴能够共享一个尖端的工具,可以将其应用于新数据集并以更详细,更准确的方式发现发现,” Alexander Aivazidis博士说:“ Alexander Aivazidis博士说:“欧洲分子生物学实验室(EMBL)和以前的Systute sistute sistute sistute sistute sangercome。
sof umer洞穴是一个未开发的极端环境,可容纳新型微生物和潜在的遗传资源。来自洞穴的微生物组已被遗传适应以产生各种生物活性代谢产物,使它们能够生存并耐受苛刻的结合。然而,尚未探索Sof umer Cave微生物中与生物合成相关的基因簇标志。因此,使用高通量shot弹枪测序来探索sof umer Cave的微生物组中与生物合成相关的基因簇(BGC)。Geneall DNA土壤迷你试剂盒用于从均质样品中提取高分子量DNA,并使用Novaseq PE150对纯化的DNA进行测序。根据微-RN数据库,乌默洞穴中最常见的微生物属是原细菌,静脉细菌,verrucomicrobobiota和蓝细菌。对与生物合成相关的基因簇进行了注释并分类,并使用抗石和NAPDOS1预先对BGC进行预令。确定了编码广泛的二级代谢物的BGC的460个推定区域,包括RIPP(47.82%),萜烯(19.57%),NRPS(13.04%),杂种(2.18%)和其他新的注释(10.87%)com punds。此外,NAPDOS管道还从链霉菌素的链霉菌素(链霉菌素基因肌链霉菌素)中鉴定出钙依赖性的抗生素基因簇,来自链霉菌Chrysomallus的放线菌素基因簇和来自链霉菌链霉菌的博霉素基因簇。这些发现突出了Sof Umer Cave微生物组的未开发的生物合成潜力,以及其发现天然产物的潜力。
真核细胞依靠几种机制来确保在每个细胞分裂周期中精确地重复一次基因组,从而防止DNA过度复制和基因组不稳定性。这些机制中的大多数限制了来源许可蛋白的活性,以防止已经使用过的起源。在这里,我们研究了其他控制是否限制了在原点重新激活的情况下重新复制的DNA的扩展。在被迫重新激活起源的细胞中的遗传筛查中,我们发现重新复制受RAD51的限制,并被Rad51拮抗剂FBH1增强。在存在染色质的RAD51的情况下,由重型起源造成的叉子会减慢,从而导致叉子反转的频繁事件。最终通过PRIMPOL介导的DNA合成的重新定型会产生ssDNA间隙,从而促进通过MRE11核酸酶部分消除重复解复的DNA。在不存在RAD51的情况下,这些对照是一个因素,并且重新复制叉的进展时间比正常条件下的时间更长。我们的研究发现了在起源重新激活时保护基因组稳定性的保障机制。
摘要:有人提出,在无氧环境中,最后一个普遍的共同祖先(LUCA)在高温19次下进化,类似于深海通风口和火山斜坡上的环境。20因此,自发性DNA衰变(例如碱基损失和胞嘧啶脱氨酸)是影响卢卡基因组完整性的主要因素21。宇宙辐射是由于弱地球磁场和烷基化的22种代谢自由基所引起的,添加了这些威胁。在这里,我们提出,古代生活形式只有两种不同的23种修复机制:多功能的肾上腺素/肾上腺素(AP)核酸内核酸内核酸内核酸酶,以应对AP位点和24个脱氨基残基,以及酶催化紫外线和烷基化损害的直接逆转。在某些古细菌中,尿素-DNA N-糖基酶的缺失以及AP核酸内切酶的存在,即26可以切割含尿嘧啶的DNA,这表明AP内核酸内核酸酶引起的核苷酸切口修复27(NIR)途径27(NIR)途径从分别从Glycosylase介导的碱基降低层独立于Glycosypiend介导的碱基上的远程摄取。nir可能是28个遗物,出现在早期的嗜热祖先中,以抵消自发的DNA损伤。我们 - 29提出,地球大气中的氧气水平升高〜2 ga触发了狭窄的AP核酸内切酶和DNA糖基酶的狭窄狭窄,以有效地应对氧化量扩大的氧化31碱基损伤和复杂的DNA病变。32
1加州大学伯克利分校的创新基因组学研究所,伯克利,加利福尼亚州94720,美国†这些作者对这项工作也同样做出了贡献:杰米·欧文(Jamie Irvine),吉利亚萨·阿罗拉(Jamie Irvine),吉利亚萨·阿罗拉(Jigyasa Arora),杰纳森·阿罗拉(Jigyasa Arora),乔纳森(Jonathan N.V. Martinson)能够复制。专注于质粒作为最小复制系统,我们开发了Origen,这是一种语言模型,在维持基本功能元素的同时,会产生复制的新质粒起源。我们在实验上验证了Origen创建功能起源的能力,该功能与现有野生类型不同,这表明了该模型捕获生物复制的复杂且经常神秘的机制的能力。
hal是一个多学科的开放访问档案,用于存款和传播科学研究文件,无论它们是否已发表。这些文件可能来自法国或国外的教学和研究机构,也可能来自公共或私人研究中心。
朱利安·兰伯特(Julien Lambert),卡拉·莱特 - 费尔南德斯(Carla Lloret-Fernández),露西·拉普兰(Lucie Laplane),理查德·普尔(Richard Poole),索菲·贾里亚特(Sophie Jarriault)。关于秀丽隐杆线虫中单细胞模型的天然可塑性的起源和概念框架的起源和概念框架。线虫发展与疾病模型,144,Elsevier,第111-159、2021页,当前发育生物学的主题,978-0-0-12-816177-7。10.1016/bs.ctdb.2021.03.004。hal-03450893
Cyril Falentin,A,†,Hadj-Arab,†,Feldia Aissiou B,Claudia Bartoli A,Giuseppe Bazan C,Carvalho的巴斯克国家,Laur'ene Gay,The Virgin Mary和iLardius的圣母玛利亚。 Barbara Pipan Sylvain是Mathieu Tiret A,Imen Tlili D,Marie-Haw Wagner。
1925 年,雷蒙德·亚瑟·达特 (Raymond Arthur Dart) 在《自然》杂志上发表了他对“汤恩儿童”的描述和解读,包括对与面部和下颌骨相关的自然脑腔模型的描述。汤恩儿童脑腔模型中保存的细节引发了一些关键问题和争论,即人类大脑如何进化,以及如何从古人类头骨化石中识别和研究大脑变化的证据。在本文中,我们回顾并综合了汤恩儿童的发现所引发的方法创新(如何研究古人类大脑化石?)和关键概念转变(古人类大脑是如何进化的?)。特别是,我们详细介绍了对南部非洲古人类遗址保存完好的头骨和自然脑腔模型的研究对我们理解大脑进化的影响,以及将新开发的分析工具(如成像技术、3D 建模)整合到古神经学研究中。此外,我们还研究了使用古人类化石内模的数字复制品以及研究现存人类大脑以形成比较平台的必要性如何引发有关研究实践(例如研究和展示化石和现存人类大脑)和此类宝贵遗产资源管理(例如数据共享)的问题。最后,我们考虑了我们对人类大脑进化的看法,特别是古人类大脑的假定独特性,在过去一个世纪发生了怎样的变化。
在所有生命系统中的代谢网络的显着保护表明,代谢的基本结构是在地球上最早的生命阶段建立的,至少在40亿年前出现。在现代生物体中,代谢网络跨越了数百种具有数千种不同代谢物的酶[1]。在该网络中,“分解代谢”和“合成代谢”反应,即累积或分解代谢产物的反应是相互交织的,这意味着早期的代谢含有两种异植物的特征(即,胞外代谢物)和自身植物(即自我自我sysysysessiss)的特征(即对细胞外代谢物)和自身植物的消耗。在关于这种保守的基本结构的起源的竞争假设中,人们越来越多地认为,该网络来自非酶反应序列,至少部分由铁(Fe(II))和其他金属离子催化剂驱动[2-4]。在该模型中,早期酶已经是基于氨基酸的,并且是通过加速和增加非酶反应的特异性来选择的[5-8]。一个模型将非偶氮反应序列放置在代谢网络的根部也克服了“最终产品问题”,它描述了多步骤,酶促反应序列需要一个前体才能进化:形成Intermediate的酶不能直接选择Darwinian进化,因为它们不提供任何优势,因为它们不提供底层步骤,因此选择了9个功能,因此可以选择 - 因此,它可以选择 - 并选择了''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''的确,关于金属离子在代谢进化中作用的证据正在增长。即使在没有酶的情况下,金属离子也会通过互转换反应(例如参与糖酵解的互转换反应,五旬节磷酸盐途径(PPP))以及氧化和还原性的KREBS循环[2,3]。最近的研究表明,大约90%的代谢途径取决于现代生物中的金属离子[10],该铁被回收为最多的